FuNGI

A0A4Q9LGS1

Protein Details

Accession

A0A4Q9LGS1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
355-374	LSNLKIRRRIFKNKYNKEYI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, pero 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027652 PRP8 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR019582 RRM_spliceosomal_PrP8
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF10598 RRM_4

Amino Acid Sequences

DKCINNLSRDRCINSECINTNDNTNNNTTNTNNTNNNNNTTNNYILVTSTVSNLYKNIDLTLLYKLLLLIIDETLCDYIISRLRCTLIYKDIKVGVNYGVIKGIPFSCYICCYYSVIVDIMLIGIEGVNSMCNDRGISNRGSVVGGVSNRECMLEGVSNTSGLEGVSNTSGLEGVNNRECMLEGVNSMCKDRGVSNTSGVEGVGKRDSKLEGVSNTSGLEGVSNRDINEGVSNTLDKQQGVSNTLDKQGGVNNNTNSYHPLNNNTNSYHPLNNSTTYHPLNNSTTYDPLNNYTNSYHPLNNSTTYDPFNNYTNSYHPLSTTNNNTNNNTLAHYLRYLDTSYILLRLSDNNIIDLLSNLKIRRRIFKNKYNKEYIIKDKILTALYMEYSSRVLSSVCSIKSKDFSVSKGESLYFSMGGFNCKIVRGVSNKDMLKGVNASRYILEGVNDTSRGLEGVSNMSSRLGDIKGVNDKGRGLEGVSNKDMLEGVSNTTTDQHPYSTSTYNPLNTNTYNQHPLNPNNINTYNQHPLNPNPLNPNNQHPLNPNNINTYNQHPLNPNNINTYNQHPLNP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.5
3	0.45
4	0.44
5	0.43
6	0.39
7	0.42
8	0.42
9	0.4
10	0.35
11	0.36
12	0.35
13	0.33
14	0.36
15	0.32
16	0.34
17	0.36
18	0.39
19	0.42
20	0.42
21	0.5
22	0.51
23	0.55
24	0.51
25	0.48
26	0.45
27	0.43
28	0.41
29	0.33
30	0.29
31	0.24
32	0.21
33	0.2
34	0.18
35	0.13
36	0.13
37	0.15
38	0.15
39	0.16
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.18
44	0.17
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.18
49	0.16
50	0.14
51	0.13
52	0.12
53	0.12
54	0.11
55	0.1
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.07
64	0.07
65	0.1
66	0.16
67	0.18
68	0.18
69	0.2
70	0.22
71	0.24
72	0.27
73	0.27
74	0.32
75	0.37
76	0.37
77	0.39
78	0.43
79	0.44
80	0.41
81	0.38
82	0.29
83	0.27
84	0.26
85	0.22
86	0.18
87	0.15
88	0.15
89	0.15
90	0.14
91	0.1
92	0.11
93	0.12
94	0.12
95	0.15
96	0.17
97	0.17
98	0.17
99	0.18
100	0.18
101	0.17
102	0.17
103	0.15
104	0.13
105	0.11
106	0.09
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.03
111	0.03
112	0.02
113	0.03
114	0.03
115	0.04
116	0.04
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.08
121	0.09
122	0.12
123	0.16
124	0.18
125	0.18
126	0.19
127	0.19
128	0.19
129	0.17
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.14
134	0.13
135	0.13
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.1
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.14
144	0.14
145	0.14
146	0.13
147	0.13
148	0.11
149	0.08
150	0.08
151	0.05
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.05
159	0.07
160	0.07
161	0.11
162	0.14
163	0.15
164	0.15
165	0.15
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.11
170	0.08
171	0.1
172	0.13
173	0.13
174	0.14
175	0.13
176	0.12
177	0.12
178	0.14
179	0.17
180	0.19
181	0.2
182	0.22
183	0.23
184	0.23
185	0.22
186	0.2
187	0.17
188	0.12
189	0.13
190	0.14
191	0.14
192	0.14
193	0.15
194	0.16
195	0.15
196	0.17
197	0.18
198	0.15
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.16
204	0.14
205	0.1
206	0.1
207	0.06
208	0.07
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.1
215	0.12
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.13
222	0.14
223	0.12
224	0.12
225	0.14
226	0.15
227	0.17
228	0.17
229	0.16
230	0.16
231	0.18
232	0.18
233	0.15
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.19
238	0.22
239	0.21
240	0.23
241	0.24
242	0.24
243	0.24
244	0.22
245	0.22
246	0.19
247	0.23
248	0.26
249	0.28
250	0.29
251	0.27
252	0.26
253	0.27
254	0.28
255	0.24
256	0.2
257	0.22
258	0.22
259	0.23
260	0.24
261	0.22
262	0.24
263	0.24
264	0.24
265	0.2
266	0.21
267	0.2
268	0.2
269	0.2
270	0.17
271	0.17
272	0.17
273	0.17
274	0.15
275	0.15
276	0.16
277	0.14
278	0.15
279	0.14
280	0.15
281	0.17
282	0.18
283	0.17
284	0.15
285	0.19
286	0.19
287	0.2
288	0.21
289	0.2
290	0.19
291	0.2
292	0.2
293	0.18
294	0.18
295	0.18
296	0.17
297	0.17
298	0.16
299	0.17
300	0.19
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.18
305	0.19
306	0.22
307	0.26
308	0.29
309	0.33
310	0.36
311	0.36
312	0.35
313	0.34
314	0.3
315	0.26
316	0.21
317	0.16
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.08
331	0.08
332	0.09
333	0.1
334	0.13
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.11
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.08
343	0.11
344	0.11
345	0.14
346	0.2
347	0.22
348	0.31
349	0.38
350	0.47
351	0.54
352	0.63
353	0.71
354	0.75
355	0.81
356	0.79
357	0.75
358	0.7
359	0.68
360	0.66
361	0.63
362	0.54
363	0.47
364	0.41
365	0.39
366	0.34
367	0.27
368	0.19
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.1
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.1
381	0.14
382	0.15
383	0.18
384	0.19
385	0.21
386	0.23
387	0.24
388	0.27
389	0.24
390	0.25
391	0.29
392	0.3
393	0.29
394	0.28
395	0.27
396	0.21
397	0.21
398	0.2
399	0.14
400	0.11
401	0.13
402	0.12
403	0.14
404	0.14
405	0.14
406	0.13
407	0.13
408	0.14
409	0.12
410	0.16
411	0.18
412	0.24
413	0.27
414	0.34
415	0.34
416	0.34
417	0.35
418	0.3
419	0.28
420	0.26
421	0.24
422	0.22
423	0.22
424	0.22
425	0.21
426	0.22
427	0.21
428	0.18
429	0.16
430	0.12
431	0.13
432	0.14
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.11
438	0.09
439	0.08
440	0.07
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.11
448	0.13
449	0.1
450	0.12
451	0.12
452	0.17
453	0.24
454	0.27
455	0.28
456	0.27
457	0.28
458	0.26
459	0.27
460	0.22
461	0.16
462	0.19
463	0.22
464	0.27
465	0.27
466	0.27
467	0.25
468	0.25
469	0.23
470	0.18
471	0.17
472	0.12
473	0.13
474	0.14
475	0.14
476	0.14
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.16
481	0.15
482	0.15
483	0.19
484	0.23
485	0.23
486	0.23
487	0.26
488	0.29
489	0.31
490	0.32
491	0.32
492	0.33
493	0.32
494	0.36
495	0.36
496	0.38
497	0.42
498	0.4
499	0.44
500	0.46
501	0.48
502	0.52
503	0.53
504	0.5
505	0.5
506	0.51
507	0.47
508	0.43
509	0.45
510	0.44
511	0.4
512	0.42
513	0.38
514	0.4
515	0.47
516	0.49
517	0.47
518	0.47
519	0.51
520	0.55
521	0.54
522	0.58
523	0.55
524	0.54
525	0.53
526	0.49
527	0.49
528	0.51
529	0.54
530	0.48
531	0.48
532	0.48
533	0.47
534	0.45
535	0.45
536	0.45
537	0.4
538	0.42
539	0.39
540	0.41
541	0.47
542	0.5
543	0.46
544	0.45
545	0.46
546	0.45
547	0.43
548	0.45
549	0.44

A0A4Q9LGS1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer