FuNGI

A0A4V2JX17

Protein Details

Accession

A0A4V2JX17

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-40	EESKKHIKIRIKEYEIQRNN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

RKKQEIYEKHLQEIKKQTEIEESKKHIKIRIKEYEIQRNNLIEEKYKLDSDNFNSIIEAVKKIPISHQTFTMPISLISLLNQVQVNLPKNYQDIDRCIEELFKKKEEFEKKIEPNMLRLNKQIQEIDEKIKEEYKVLEGMPPTEVKVYKEKKIVGVLVGSRGRRVLLGSSNSKTYEIVGSSKTYEIVGSSRKKVDSENIKNEEMKAVNNSEISLKEIKTCDRDVVTIFETLPSQPTIYNNNHSPSSNTFQVTSISLLDSALPSSCLDSSASGISEVQKGLRECLETGGLQFFGTIMGNWVGLEIRQEENGERRRITTCLAEPCSLTDTTLYMNLREKFLCKIKELSEKEIGDVANVSDAARIIQAAQVCYDEITRNEKPRSAWKENIESKISKLVLFKDLLEKARKQEKLSTSETKSLKKIMREFNLNLSSVTDISEALKKITMHESRKQFRKENRMFEFFRGRFYRGLSERVESEHVVNRDEIVITYDDYSIPFASDNHSTTFPLLDELKLTNLYKYLYDIVKVICLEGTPQADWFYCGITYLIPKGTPKTGSDYRPITCMSNLYKITTKCVTKVLQIEVERQGLLSGNQLGAVRGHGNNLNAAWIYVKKAYDSMDHAYLTQCIENFKIDKGIRQEDSLSPLLFGLCMDSLSRKLNENYTKVTVQTDAESHSTNYLLFIDDLKLFAKDSSTMSAMTDEAKEFLEVIALVIYKEKSATNDTCCEDTSTLLEGRSVFKYLGIVEDSKGIPTSKSYEEIQNKLIVQLDDAVRAGCKELLYLPRKELGEGLHSVEFKSEHMLLRAAILKVENINKTHLSLIKNFLKIKYGLEEEVTKKKLEEAQLANLYNEIKNRKLHSKLYSARNNELVSVNDSSRWLKNGSVRPRDEADRNVFWGAEGMCQHCNQSRKTVDHLATRCEKMLGHDYTRRHKEVYDVYIYSC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.54
3	0.52
4	0.47
5	0.52
6	0.57
7	0.56
8	0.55
9	0.56
10	0.58
11	0.63
12	0.65
13	0.62
14	0.65
15	0.66
16	0.67
17	0.71
18	0.69
19	0.72
20	0.77
21	0.81
22	0.78
23	0.73
24	0.68
25	0.59
26	0.54
27	0.52
28	0.45
29	0.38
30	0.35
31	0.35
32	0.34
33	0.33
34	0.33
35	0.31
36	0.35
37	0.36
38	0.41
39	0.37
40	0.34
41	0.33
42	0.31
43	0.33
44	0.28
45	0.25
46	0.18
47	0.21
48	0.21
49	0.22
50	0.27
51	0.32
52	0.36
53	0.36
54	0.38
55	0.37
56	0.38
57	0.38
58	0.35
59	0.26
60	0.19
61	0.19
62	0.17
63	0.14
64	0.14
65	0.16
66	0.13
67	0.16
68	0.16
69	0.15
70	0.18
71	0.24
72	0.28
73	0.27
74	0.28
75	0.27
76	0.29
77	0.3
78	0.31
79	0.3
80	0.31
81	0.32
82	0.34
83	0.32
84	0.31
85	0.34
86	0.34
87	0.38
88	0.38
89	0.39
90	0.38
91	0.41
92	0.5
93	0.55
94	0.56
95	0.55
96	0.6
97	0.6
98	0.66
99	0.7
100	0.62
101	0.59
102	0.63
103	0.61
104	0.53
105	0.52
106	0.52
107	0.48
108	0.5
109	0.46
110	0.38
111	0.4
112	0.41
113	0.43
114	0.39
115	0.37
116	0.35
117	0.36
118	0.34
119	0.28
120	0.27
121	0.22
122	0.22
123	0.21
124	0.23
125	0.2
126	0.2
127	0.21
128	0.19
129	0.18
130	0.19
131	0.2
132	0.2
133	0.29
134	0.33
135	0.37
136	0.43
137	0.44
138	0.43
139	0.47
140	0.46
141	0.37
142	0.36
143	0.31
144	0.33
145	0.35
146	0.31
147	0.27
148	0.26
149	0.24
150	0.2
151	0.2
152	0.17
153	0.19
154	0.26
155	0.31
156	0.33
157	0.35
158	0.35
159	0.35
160	0.3
161	0.25
162	0.22
163	0.18
164	0.18
165	0.17
166	0.18
167	0.19
168	0.19
169	0.18
170	0.15
171	0.13
172	0.12
173	0.14
174	0.2
175	0.23
176	0.28
177	0.31
178	0.32
179	0.33
180	0.35
181	0.4
182	0.43
183	0.48
184	0.54
185	0.55
186	0.56
187	0.56
188	0.54
189	0.5
190	0.39
191	0.31
192	0.25
193	0.22
194	0.21
195	0.2
196	0.2
197	0.17
198	0.17
199	0.19
200	0.18
201	0.17
202	0.19
203	0.21
204	0.24
205	0.26
206	0.27
207	0.27
208	0.25
209	0.26
210	0.24
211	0.25
212	0.23
213	0.2
214	0.19
215	0.16
216	0.15
217	0.14
218	0.15
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.13
223	0.19
224	0.22
225	0.28
226	0.3
227	0.32
228	0.33
229	0.33
230	0.33
231	0.32
232	0.34
233	0.32
234	0.29
235	0.27
236	0.26
237	0.27
238	0.25
239	0.2
240	0.15
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.14
265	0.14
266	0.15
267	0.16
268	0.16
269	0.15
270	0.16
271	0.17
272	0.13
273	0.14
274	0.13
275	0.12
276	0.1
277	0.09
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.11
295	0.19
296	0.26
297	0.28
298	0.26
299	0.28
300	0.29
301	0.29
302	0.3
303	0.27
304	0.26
305	0.3
306	0.33
307	0.31
308	0.29
309	0.29
310	0.3
311	0.25
312	0.2
313	0.13
314	0.1
315	0.1
316	0.14
317	0.13
318	0.12
319	0.18
320	0.19
321	0.2
322	0.2
323	0.21
324	0.22
325	0.28
326	0.29
327	0.26
328	0.29
329	0.32
330	0.41
331	0.43
332	0.43
333	0.43
334	0.41
335	0.39
336	0.38
337	0.33
338	0.23
339	0.2
340	0.15
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.08
359	0.09
360	0.16
361	0.19
362	0.25
363	0.26
364	0.28
365	0.29
366	0.38
367	0.46
368	0.45
369	0.48
370	0.46
371	0.55
372	0.58
373	0.6
374	0.54
375	0.45
376	0.4
377	0.39
378	0.35
379	0.27
380	0.23
381	0.21
382	0.2
383	0.2
384	0.2
385	0.2
386	0.22
387	0.24
388	0.26
389	0.26
390	0.28
391	0.35
392	0.37
393	0.34
394	0.38
395	0.4
396	0.42
397	0.47
398	0.48
399	0.43
400	0.48
401	0.49
402	0.45
403	0.41
404	0.41
405	0.38
406	0.37
407	0.41
408	0.41
409	0.43
410	0.45
411	0.45
412	0.46
413	0.45
414	0.4
415	0.33
416	0.25
417	0.22
418	0.16
419	0.15
420	0.09
421	0.06
422	0.07
423	0.1
424	0.09
425	0.09
426	0.11
427	0.11
428	0.12
429	0.2
430	0.25
431	0.27
432	0.34
433	0.42
434	0.47
435	0.55
436	0.59
437	0.58
438	0.59
439	0.66
440	0.66
441	0.67
442	0.65
443	0.64
444	0.61
445	0.57
446	0.59
447	0.48
448	0.47
449	0.4
450	0.36
451	0.31
452	0.31
453	0.34
454	0.26
455	0.3
456	0.24
457	0.23
458	0.22
459	0.22
460	0.23
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.14
468	0.12
469	0.12
470	0.1
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.07
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.13
491	0.1
492	0.1
493	0.1
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.1
499	0.11
500	0.09
501	0.09
502	0.1
503	0.09
504	0.1
505	0.12
506	0.11
507	0.11
508	0.12
509	0.11
510	0.12
511	0.12
512	0.11
513	0.08
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.1
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.1
524	0.08
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.06
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.11
535	0.13
536	0.14
537	0.14
538	0.2
539	0.25
540	0.27
541	0.32
542	0.34
543	0.32
544	0.33
545	0.33
546	0.27
547	0.22
548	0.23
549	0.2
550	0.23
551	0.23
552	0.23
553	0.27
554	0.25
555	0.29
556	0.31
557	0.29
558	0.24
559	0.28
560	0.27
561	0.27
562	0.3
563	0.28
564	0.29
565	0.29
566	0.31
567	0.29
568	0.28
569	0.24
570	0.2
571	0.18
572	0.13
573	0.12
574	0.1
575	0.08
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.09
580	0.08
581	0.09
582	0.1
583	0.09
584	0.11
585	0.11
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.12
590	0.1
591	0.1
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.13
600	0.15
601	0.18
602	0.19
603	0.19
604	0.19
605	0.19
606	0.18
607	0.18
608	0.17
609	0.14
610	0.11
611	0.1
612	0.1
613	0.13
614	0.13
615	0.13
616	0.19
617	0.18
618	0.22
619	0.27
620	0.31
621	0.3
622	0.3
623	0.32
624	0.26
625	0.31
626	0.29
627	0.23
628	0.18
629	0.17
630	0.15
631	0.13
632	0.11
633	0.07
634	0.05
635	0.05
636	0.06
637	0.07
638	0.09
639	0.13
640	0.14
641	0.16
642	0.18
643	0.26
644	0.32
645	0.34
646	0.36
647	0.37
648	0.37
649	0.34
650	0.33
651	0.27
652	0.22
653	0.2
654	0.16
655	0.15
656	0.15
657	0.16
658	0.15
659	0.14
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.1
664	0.09
665	0.08
666	0.08
667	0.1
668	0.09
669	0.1
670	0.1
671	0.1
672	0.1
673	0.09
674	0.09
675	0.09
676	0.11
677	0.13
678	0.13
679	0.13
680	0.13
681	0.13
682	0.13
683	0.13
684	0.12
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.09
689	0.09
690	0.08
691	0.08
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.08
698	0.08
699	0.07
700	0.09
701	0.09
702	0.11
703	0.18
704	0.21
705	0.24
706	0.29
707	0.31
708	0.31
709	0.31
710	0.31
711	0.25
712	0.22
713	0.2
714	0.18
715	0.17
716	0.15
717	0.16
718	0.14
719	0.16
720	0.17
721	0.17
722	0.14
723	0.13
724	0.14
725	0.13
726	0.14
727	0.14
728	0.13
729	0.12
730	0.16
731	0.16
732	0.15
733	0.16
734	0.14
735	0.12
736	0.14
737	0.18
738	0.17
739	0.2
740	0.21
741	0.3
742	0.35
743	0.38
744	0.38
745	0.37
746	0.35
747	0.33
748	0.35
749	0.25
750	0.2
751	0.21
752	0.2
753	0.17
754	0.17
755	0.16
756	0.12
757	0.13
758	0.13
759	0.1
760	0.09
761	0.09
762	0.13
763	0.22
764	0.27
765	0.3
766	0.3
767	0.34
768	0.35
769	0.35
770	0.32
771	0.25
772	0.24
773	0.24
774	0.25
775	0.23
776	0.23
777	0.22
778	0.22
779	0.2
780	0.16
781	0.18
782	0.17
783	0.16
784	0.17
785	0.18
786	0.17
787	0.2
788	0.23
789	0.19
790	0.18
791	0.17
792	0.16
793	0.2
794	0.25
795	0.26
796	0.23
797	0.27
798	0.26
799	0.27
800	0.3
801	0.31
802	0.29
803	0.29
804	0.36
805	0.39
806	0.44
807	0.45
808	0.42
809	0.42
810	0.4
811	0.38
812	0.35
813	0.32
814	0.27
815	0.27
816	0.32
817	0.32
818	0.4
819	0.39
820	0.34
821	0.31
822	0.34
823	0.36
824	0.36
825	0.39
826	0.35
827	0.42
828	0.48
829	0.49
830	0.44
831	0.41
832	0.37
833	0.31
834	0.32
835	0.28
836	0.26
837	0.31
838	0.37
839	0.44
840	0.49
841	0.54
842	0.55
843	0.61
844	0.65
845	0.7
846	0.73
847	0.7
848	0.69
849	0.67
850	0.6
851	0.53
852	0.46
853	0.38
854	0.33
855	0.31
856	0.27
857	0.23
858	0.24
859	0.25
860	0.25
861	0.26
862	0.23
863	0.25
864	0.33
865	0.41
866	0.49
867	0.55
868	0.56
869	0.59
870	0.62
871	0.64
872	0.61
873	0.59
874	0.57
875	0.5
876	0.5
877	0.46
878	0.41
879	0.34
880	0.33
881	0.25
882	0.21
883	0.2
884	0.2
885	0.21
886	0.22
887	0.26
888	0.27
889	0.33
890	0.31
891	0.38
892	0.43
893	0.45
894	0.51
895	0.57
896	0.57
897	0.61
898	0.61
899	0.6
900	0.59
901	0.58
902	0.52
903	0.44
904	0.39
905	0.35
906	0.41
907	0.39
908	0.39
909	0.43
910	0.49
911	0.59
912	0.66
913	0.64
914	0.57
915	0.51
916	0.53
917	0.55
918	0.55
919	0.52

A0A4V2JX17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer