FuNGI

A0A4Q9LQI4

Protein Details

Accession

A0A4Q9LQI4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1053-1072	GTNTPFKKREEIKNGAKNNT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MGRKKNVSSEISKNTKIKAANDAYEVKKCDSGIQKPKHALTCKIVLDTLPSPNTPLPSSVEVSSCEPSYDMTNPCTLAIPEGNRLMALRTIFYSLHRYYNEKFGCTETLEVLKKLAQSEMGKEVKSEENGERRRIATCLADTCTLTDTTEYINLKDKFLSKIKEISMNEIGKVVSITEATYIMQAAQICYDEATRKEKPRSAWKENIESKISKLVLSKDLLEKARKQEKLSISETKSPLVKKNESLNVYEKKITMYESRKQFRKENRMFELFRGLFYRGLSERVESEYVFLVYNVEQNDDTVTYDDYLIPFVSDNHPTTFPSLDEFVNIINWLPNWKAAGIDGIYNFFIKKLTTLHKYIYDIVEVICLKGTTQADWFYCGLTYLIPKGIPRRGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVQIEVERRGLLAENQLGAVRGVQGAKEQALLNIALNKENGNNLKATVIDVKKAYDSIDHAYLTQFIENHNLSDLIMKFIKVIISKWKIDISVGPEKIMSKKIDRGILQGECLSPLLFVLRMDPLSRKLNEKYTKVTVQTDTESHFTNHLLFIDDLKLLAKDSSTLSAMTGEAKEFLEVIGLEINKEKSATNDTCCEDTATLLEGVSVYKYLGIIEDTRGIPTRSLFEEEQSKLISRVERLCHTRLNAKNLFSAINQHAISLINYHIGVRRLEPADFSKLDDVVRAVLVKNKIHLRSRCKERLYLPRTKLGRGLNSVELRSGHILLQFLDCLEKSKDISTRRAAILKVENNNKTYLALIKGFLKIKYRLVEEVTKKSLEEAQLAKLYNEIEKRKLHIKLYNARKNELVSVSDSSRWLKRGNIRPRNEAVNVFWGADGMCQHCGKSGKTVDHLATRCKKMLGHDYTRRHNEVVRCLHLLLLNRYKFKSSKRIRSHSVQEILDNEYAEIRVDTRIKTDVSIRNNRPDMFILDKKKNKITLIEVGITSQDSLQIVENEKLRKYDLLANEFGLIYRCSVEIIPYVMTWDGIVTKYHKSHLKRLEIPMNVEAYIQSIVLEKTVETISSPRLNAEESWERASMGTNTPFKKREEIKNGAKNNTSLISEGETTLEEPTININEELDLEEEKTLVKEVEANA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.58
3	0.55
4	0.49
5	0.5
6	0.49
7	0.45
8	0.47
9	0.51
10	0.5
11	0.52
12	0.52
13	0.44
14	0.4
15	0.37
16	0.4
17	0.41
18	0.47
19	0.51
20	0.57
21	0.63
22	0.66
23	0.72
24	0.73
25	0.7
26	0.67
27	0.62
28	0.62
29	0.56
30	0.52
31	0.46
32	0.37
33	0.38
34	0.34
35	0.34
36	0.29
37	0.26
38	0.28
39	0.3
40	0.32
41	0.28
42	0.27
43	0.25
44	0.27
45	0.29
46	0.27
47	0.27
48	0.26
49	0.29
50	0.29
51	0.25
52	0.21
53	0.19
54	0.18
55	0.21
56	0.23
57	0.23
58	0.22
59	0.24
60	0.24
61	0.25
62	0.25
63	0.21
64	0.2
65	0.22
66	0.23
67	0.25
68	0.26
69	0.25
70	0.24
71	0.24
72	0.22
73	0.2
74	0.18
75	0.15
76	0.14
77	0.17
78	0.17
79	0.19
80	0.25
81	0.24
82	0.29
83	0.3
84	0.34
85	0.34
86	0.44
87	0.44
88	0.38
89	0.37
90	0.34
91	0.35
92	0.32
93	0.31
94	0.24
95	0.28
96	0.29
97	0.28
98	0.26
99	0.25
100	0.25
101	0.25
102	0.23
103	0.22
104	0.21
105	0.25
106	0.33
107	0.34
108	0.32
109	0.31
110	0.33
111	0.32
112	0.32
113	0.32
114	0.31
115	0.38
116	0.43
117	0.47
118	0.47
119	0.43
120	0.43
121	0.39
122	0.35
123	0.3
124	0.3
125	0.3
126	0.29
127	0.3
128	0.28
129	0.28
130	0.27
131	0.22
132	0.18
133	0.15
134	0.12
135	0.12
136	0.18
137	0.18
138	0.17
139	0.26
140	0.26
141	0.27
142	0.3
143	0.3
144	0.31
145	0.37
146	0.4
147	0.35
148	0.4
149	0.41
150	0.47
151	0.45
152	0.46
153	0.47
154	0.44
155	0.4
156	0.35
157	0.32
158	0.24
159	0.23
160	0.16
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.11
178	0.13
179	0.15
180	0.22
181	0.28
182	0.35
183	0.42
184	0.46
185	0.52
186	0.6
187	0.66
188	0.68
189	0.71
190	0.69
191	0.73
192	0.75
193	0.74
194	0.67
195	0.58
196	0.51
197	0.49
198	0.43
199	0.35
200	0.31
201	0.29
202	0.29
203	0.29
204	0.3
205	0.28
206	0.33
207	0.36
208	0.37
209	0.39
210	0.44
211	0.51
212	0.51
213	0.5
214	0.52
215	0.54
216	0.56
217	0.57
218	0.56
219	0.52
220	0.57
221	0.55
222	0.5
223	0.47
224	0.44
225	0.46
226	0.45
227	0.44
228	0.41
229	0.49
230	0.53
231	0.51
232	0.52
233	0.52
234	0.5
235	0.49
236	0.46
237	0.38
238	0.32
239	0.3
240	0.29
241	0.3
242	0.31
243	0.35
244	0.43
245	0.5
246	0.55
247	0.59
248	0.65
249	0.67
250	0.72
251	0.73
252	0.72
253	0.71
254	0.73
255	0.7
256	0.63
257	0.63
258	0.51
259	0.44
260	0.38
261	0.31
262	0.25
263	0.24
264	0.26
265	0.17
266	0.19
267	0.18
268	0.17
269	0.17
270	0.19
271	0.2
272	0.15
273	0.16
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.12
278	0.1
279	0.09
280	0.12
281	0.11
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.11
287	0.11
288	0.09
289	0.1
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.08
299	0.11
300	0.14
301	0.16
302	0.17
303	0.19
304	0.19
305	0.21
306	0.2
307	0.17
308	0.16
309	0.16
310	0.13
311	0.13
312	0.13
313	0.11
314	0.11
315	0.1
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.11
327	0.1
328	0.11
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.09
335	0.09
336	0.07
337	0.08
338	0.11
339	0.17
340	0.22
341	0.25
342	0.27
343	0.3
344	0.32
345	0.33
346	0.3
347	0.24
348	0.19
349	0.17
350	0.18
351	0.15
352	0.13
353	0.1
354	0.09
355	0.09
356	0.13
357	0.13
358	0.11
359	0.12
360	0.16
361	0.15
362	0.18
363	0.18
364	0.14
365	0.13
366	0.13
367	0.11
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.11
374	0.15
375	0.2
376	0.22
377	0.23
378	0.3
379	0.34
380	0.38
381	0.45
382	0.48
383	0.45
384	0.45
385	0.44
386	0.37
387	0.33
388	0.33
389	0.27
390	0.26
391	0.24
392	0.24
393	0.28
394	0.27
395	0.31
396	0.32
397	0.3
398	0.25
399	0.29
400	0.28
401	0.27
402	0.31
403	0.29
404	0.29
405	0.31
406	0.32
407	0.3
408	0.3
409	0.26
410	0.22
411	0.2
412	0.14
413	0.13
414	0.13
415	0.11
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.11
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.1
441	0.13
442	0.14
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.16
450	0.15
451	0.16
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.16
456	0.15
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.14
461	0.13
462	0.13
463	0.13
464	0.14
465	0.13
466	0.12
467	0.09
468	0.07
469	0.12
470	0.12
471	0.12
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.13
476	0.13
477	0.11
478	0.11
479	0.11
480	0.1
481	0.11
482	0.12
483	0.09
484	0.1
485	0.17
486	0.21
487	0.21
488	0.23
489	0.23
490	0.21
491	0.21
492	0.22
493	0.19
494	0.23
495	0.23
496	0.22
497	0.21
498	0.22
499	0.24
500	0.26
501	0.21
502	0.16
503	0.21
504	0.24
505	0.28
506	0.28
507	0.28
508	0.28
509	0.27
510	0.25
511	0.21
512	0.17
513	0.13
514	0.13
515	0.1
516	0.06
517	0.05
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.08
526	0.12
527	0.16
528	0.17
529	0.2
530	0.21
531	0.3
532	0.35
533	0.36
534	0.36
535	0.37
536	0.39
537	0.37
538	0.37
539	0.3
540	0.26
541	0.25
542	0.22
543	0.19
544	0.17
545	0.17
546	0.15
547	0.14
548	0.12
549	0.11
550	0.11
551	0.09
552	0.1
553	0.08
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.07
560	0.06
561	0.06
562	0.05
563	0.05
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.06
574	0.07
575	0.07
576	0.06
577	0.06
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.08
590	0.08
591	0.15
592	0.16
593	0.17
594	0.21
595	0.22
596	0.23
597	0.23
598	0.22
599	0.15
600	0.14
601	0.12
602	0.09
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.1
619	0.1
620	0.11
621	0.12
622	0.12
623	0.12
624	0.12
625	0.13
626	0.12
627	0.16
628	0.15
629	0.16
630	0.21
631	0.21
632	0.22
633	0.2
634	0.19
635	0.16
636	0.18
637	0.17
638	0.14
639	0.18
640	0.2
641	0.24
642	0.28
643	0.3
644	0.31
645	0.31
646	0.37
647	0.37
648	0.42
649	0.41
650	0.38
651	0.37
652	0.35
653	0.34
654	0.26
655	0.27
656	0.2
657	0.21
658	0.2
659	0.18
660	0.18
661	0.17
662	0.17
663	0.12
664	0.11
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.1
669	0.11
670	0.12
671	0.12
672	0.16
673	0.16
674	0.16
675	0.18
676	0.18
677	0.21
678	0.21
679	0.22
680	0.18
681	0.18
682	0.18
683	0.16
684	0.13
685	0.09
686	0.09
687	0.08
688	0.08
689	0.11
690	0.15
691	0.15
692	0.19
693	0.24
694	0.28
695	0.36
696	0.42
697	0.47
698	0.52
699	0.62
700	0.66
701	0.63
702	0.63
703	0.63
704	0.67
705	0.65
706	0.65
707	0.58
708	0.58
709	0.57
710	0.53
711	0.52
712	0.45
713	0.43
714	0.37
715	0.38
716	0.36
717	0.36
718	0.35
719	0.31
720	0.27
721	0.24
722	0.21
723	0.18
724	0.13
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.1
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.1
734	0.11
735	0.12
736	0.12
737	0.15
738	0.21
739	0.24
740	0.3
741	0.31
742	0.35
743	0.36
744	0.38
745	0.35
746	0.34
747	0.38
748	0.37
749	0.4
750	0.44
751	0.44
752	0.42
753	0.43
754	0.39
755	0.31
756	0.26
757	0.22
758	0.17
759	0.15
760	0.15
761	0.16
762	0.2
763	0.22
764	0.23
765	0.25
766	0.25
767	0.28
768	0.31
769	0.31
770	0.29
771	0.31
772	0.37
773	0.38
774	0.41
775	0.4
776	0.37
777	0.34
778	0.33
779	0.33
780	0.26
781	0.25
782	0.2
783	0.21
784	0.24
785	0.25
786	0.23
787	0.21
788	0.2
789	0.2
790	0.24
791	0.24
792	0.26
793	0.27
794	0.31
795	0.37
796	0.41
797	0.42
798	0.41
799	0.47
800	0.51
801	0.6
802	0.65
803	0.6
804	0.57
805	0.53
806	0.5
807	0.45
808	0.38
809	0.28
810	0.23
811	0.24
812	0.23
813	0.23
814	0.23
815	0.22
816	0.23
817	0.23
818	0.22
819	0.25
820	0.33
821	0.42
822	0.52
823	0.59
824	0.61
825	0.66
826	0.68
827	0.67
828	0.61
829	0.53
830	0.44
831	0.39
832	0.35
833	0.28
834	0.24
835	0.19
836	0.16
837	0.14
838	0.14
839	0.09
840	0.12
841	0.12
842	0.12
843	0.16
844	0.19
845	0.19
846	0.26
847	0.3
848	0.3
849	0.33
850	0.38
851	0.36
852	0.41
853	0.42
854	0.43
855	0.46
856	0.45
857	0.44
858	0.41
859	0.4
860	0.38
861	0.46
862	0.46
863	0.48
864	0.54
865	0.6
866	0.67
867	0.72
868	0.69
869	0.61
870	0.57
871	0.53
872	0.53
873	0.53
874	0.48
875	0.43
876	0.4
877	0.4
878	0.37
879	0.37
880	0.35
881	0.37
882	0.37
883	0.38
884	0.39
885	0.42
886	0.44
887	0.46
888	0.49
889	0.51
890	0.57
891	0.64
892	0.71
893	0.74
894	0.78
895	0.79
896	0.78
897	0.74
898	0.64
899	0.56
900	0.5
901	0.47
902	0.4
903	0.31
904	0.22
905	0.16
906	0.15
907	0.13
908	0.12
909	0.09
910	0.12
911	0.14
912	0.14
913	0.16
914	0.19
915	0.19
916	0.21
917	0.28
918	0.31
919	0.37
920	0.47
921	0.5
922	0.56
923	0.6
924	0.59
925	0.54
926	0.49
927	0.45
928	0.43
929	0.46
930	0.44
931	0.49
932	0.55
933	0.58
934	0.61
935	0.61
936	0.56
937	0.53
938	0.52
939	0.5
940	0.48
941	0.46
942	0.4
943	0.35
944	0.33
945	0.28
946	0.22
947	0.14
948	0.11
949	0.08
950	0.09
951	0.11
952	0.13
953	0.16
954	0.19
955	0.24
956	0.26
957	0.27
958	0.27
959	0.27
960	0.26
961	0.26
962	0.3
963	0.33
964	0.36
965	0.36
966	0.35
967	0.34
968	0.33
969	0.29
970	0.24
971	0.17
972	0.12
973	0.11
974	0.11
975	0.1
976	0.11
977	0.12
978	0.12
979	0.13
980	0.13
981	0.12
982	0.14
983	0.13
984	0.13
985	0.11
986	0.1
987	0.09
988	0.09
989	0.12
990	0.13
991	0.19
992	0.22
993	0.28
994	0.35
995	0.39
996	0.48
997	0.55
998	0.62
999	0.63
1000	0.7
1001	0.72
1002	0.68
1003	0.67
1004	0.61
1005	0.54
1006	0.44
1007	0.37
1008	0.28
1009	0.21
1010	0.18
1011	0.13
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.09
1015	0.1
1016	0.1
1017	0.08
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.13
1023	0.18
1024	0.23
1025	0.23
1026	0.22
1027	0.23
1028	0.25
1029	0.24
1030	0.3
1031	0.32
1032	0.3
1033	0.34
1034	0.33
1035	0.32
1036	0.3
1037	0.33
1038	0.27
1039	0.26
1040	0.3
1041	0.34
1042	0.37
1043	0.43
1044	0.47
1045	0.47
1046	0.53
1047	0.55
1048	0.59
1049	0.61
1050	0.67
1051	0.71
1052	0.77
1053	0.82
1054	0.79
1055	0.74
1056	0.64
1057	0.58
1058	0.51
1059	0.41
1060	0.33
1061	0.27
1062	0.24
1063	0.21
1064	0.21
1065	0.18
1066	0.16
1067	0.15
1068	0.15
1069	0.14
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.15
1075	0.15
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.15
1079	0.16
1080	0.14
1081	0.13
1082	0.12
1083	0.12
1084	0.11
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.12
1088	0.1
1089	0.1

A0A4Q9LQI4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer