FuNGI

A0A4V2JYB8

Protein Details

Accession

A0A4V2JYB8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
848-867	LNRYKFKSSKRIRSHSVQEI	Hydrophilic
945-966	GIVTKYPKKYVKRLQIPMNEEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MGRRKKVDSENIKNEKIKAVKNLKSPGEIFMCDVDVAMLSERLPPLPTFQDTTHQPPSSSCQTSPVCLVETIPSSSGTDATAFGPANGMTNLNTDALLEGNRLMVLHTILDSVTVVEQECPRSAILAVQKRFERMPRNGWPATLRYYNEKFSCTLDIDSFKKLAQNEAEKEMRQEENGERRRIATFLTEPCTLTDTTEYINLRDKFLSKIKEISENEIRKVVVRTRKLPSELVDSKVLDLINRIIGEYADSCVPMTITAVARIIQAAQKPRSAWKENIESKISKLVLSKDLLEKAQFNLNLSSVTDLSEALVKKNESLNVYEKKITMYENNRMFELYRGRFYRGLSKRGESEHVVSRDEIVSFWSTIWNKNDETVTYIIIIFHFWLSNGKAAGIDGIYNFFIKKLTTHHKYIYDIVKVIYLEGTPQVFGIPRRGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVQIEVERRGLLAENQLGAVRGVQGAKEQALLNIALNKEYGNNLKATWIDVKKAYDSIDHAYLTQCIENLNLPDWLLKFIKVIISKWKIYISVGPEKIMSKKIKRGIPQGDSLSPLLFVVCMDPLSRKLNEKYTKVKVQTDAESHSTNQLCFIDDLKLLAKDSSTLSAITDEAKEFLEVIGLEINKEKSATNDTCCEDTATFLEDVSVYKYYRIIEHSRGIPTRSSFEEIHLRPRCKERLYLSRTELGRGLHSIELQSEHMLLQLLDCLEKSKEISTRRAAILKVENNNKTHLALIKGFLKVNYRLVEEVIKKSLEEAQLAKLYNEIEKRKLYSKLYNARKNELVSVTVFCYIQDKNVFWGADGMCQHCNKSGHDYTRRHNEVVRCLHLLLLNRYKFKSSKRIRSHSVQEILDNEIKTDVKIRNNRPDIFLLYKKKNKITLIEVGITSQDSLQIVETEKLRKYDLLANELCLFYKCSVDIIPYVMTWDGIVTKYPKKYVKRLQIPMNEEALYNPYILSVILRAEMHKQPIPPLKEATTVKEPKININEESDLEEDIQVVEEII

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.68
3	0.63
4	0.58
5	0.58
6	0.6
7	0.6
8	0.65
9	0.71
10	0.66
11	0.65
12	0.61
13	0.57
14	0.51
15	0.45
16	0.38
17	0.31
18	0.29
19	0.22
20	0.21
21	0.15
22	0.11
23	0.11
24	0.1
25	0.09
26	0.08
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.15
31	0.15
32	0.18
33	0.23
34	0.26
35	0.26
36	0.27
37	0.34
38	0.37
39	0.44
40	0.48
41	0.45
42	0.42
43	0.4
44	0.46
45	0.47
46	0.47
47	0.39
48	0.39
49	0.39
50	0.41
51	0.42
52	0.37
53	0.3
54	0.26
55	0.27
56	0.22
57	0.23
58	0.23
59	0.2
60	0.19
61	0.18
62	0.18
63	0.17
64	0.14
65	0.12
66	0.12
67	0.11
68	0.14
69	0.13
70	0.12
71	0.13
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.13
76	0.1
77	0.12
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.11
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.09
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.08
103	0.1
104	0.13
105	0.15
106	0.16
107	0.16
108	0.16
109	0.16
110	0.16
111	0.18
112	0.25
113	0.32
114	0.33
115	0.38
116	0.39
117	0.41
118	0.44
119	0.46
120	0.46
121	0.43
122	0.5
123	0.54
124	0.61
125	0.59
126	0.58
127	0.55
128	0.49
129	0.48
130	0.45
131	0.38
132	0.38
133	0.41
134	0.46
135	0.44
136	0.42
137	0.38
138	0.35
139	0.37
140	0.3
141	0.29
142	0.25
143	0.28
144	0.29
145	0.3
146	0.28
147	0.25
148	0.26
149	0.24
150	0.27
151	0.28
152	0.34
153	0.35
154	0.41
155	0.43
156	0.4
157	0.42
158	0.41
159	0.35
160	0.28
161	0.28
162	0.29
163	0.37
164	0.44
165	0.45
166	0.41
167	0.42
168	0.42
169	0.39
170	0.32
171	0.28
172	0.26
173	0.27
174	0.31
175	0.3
176	0.3
177	0.3
178	0.31
179	0.25
180	0.21
181	0.18
182	0.14
183	0.14
184	0.19
185	0.18
186	0.17
187	0.26
188	0.26
189	0.26
190	0.27
191	0.27
192	0.27
193	0.34
194	0.37
195	0.31
196	0.35
197	0.35
198	0.43
199	0.43
200	0.45
201	0.48
202	0.47
203	0.46
204	0.43
205	0.41
206	0.34
207	0.36
208	0.36
209	0.35
210	0.38
211	0.43
212	0.47
213	0.53
214	0.54
215	0.52
216	0.48
217	0.49
218	0.45
219	0.42
220	0.4
221	0.34
222	0.31
223	0.31
224	0.28
225	0.18
226	0.16
227	0.14
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.1
232	0.1
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.11
251	0.11
252	0.14
253	0.21
254	0.22
255	0.24
256	0.26
257	0.32
258	0.39
259	0.42
260	0.42
261	0.42
262	0.5
263	0.54
264	0.58
265	0.55
266	0.48
267	0.44
268	0.47
269	0.4
270	0.31
271	0.28
272	0.26
273	0.26
274	0.26
275	0.27
276	0.24
277	0.26
278	0.25
279	0.24
280	0.22
281	0.19
282	0.24
283	0.22
284	0.2
285	0.19
286	0.18
287	0.17
288	0.16
289	0.16
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.14
299	0.13
300	0.15
301	0.18
302	0.2
303	0.18
304	0.21
305	0.28
306	0.29
307	0.32
308	0.32
309	0.3
310	0.28
311	0.28
312	0.26
313	0.26
314	0.27
315	0.33
316	0.37
317	0.38
318	0.37
319	0.36
320	0.35
321	0.31
322	0.34
323	0.27
324	0.28
325	0.29
326	0.32
327	0.33
328	0.34
329	0.4
330	0.38
331	0.41
332	0.38
333	0.39
334	0.39
335	0.39
336	0.41
337	0.33
338	0.32
339	0.33
340	0.32
341	0.3
342	0.27
343	0.26
344	0.23
345	0.21
346	0.17
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.1
351	0.14
352	0.14
353	0.18
354	0.21
355	0.22
356	0.21
357	0.23
358	0.23
359	0.18
360	0.2
361	0.17
362	0.15
363	0.13
364	0.12
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.07
373	0.08
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.07
381	0.06
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.13
392	0.21
393	0.26
394	0.3
395	0.34
396	0.36
397	0.38
398	0.42
399	0.4
400	0.33
401	0.29
402	0.25
403	0.23
404	0.2
405	0.18
406	0.13
407	0.08
408	0.07
409	0.08
410	0.08
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.08
416	0.14
417	0.13
418	0.14
419	0.19
420	0.2
421	0.22
422	0.29
423	0.35
424	0.31
425	0.32
426	0.33
427	0.29
428	0.28
429	0.3
430	0.24
431	0.23
432	0.22
433	0.22
434	0.25
435	0.24
436	0.28
437	0.29
438	0.27
439	0.22
440	0.27
441	0.26
442	0.25
443	0.28
444	0.26
445	0.26
446	0.28
447	0.29
448	0.27
449	0.27
450	0.23
451	0.19
452	0.18
453	0.13
454	0.11
455	0.11
456	0.09
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.16
491	0.15
492	0.16
493	0.17
494	0.18
495	0.17
496	0.18
497	0.17
498	0.12
499	0.13
500	0.14
501	0.14
502	0.13
503	0.13
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.1
508	0.08
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.07
513	0.08
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.09
518	0.11
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.13
524	0.13
525	0.14
526	0.2
527	0.23
528	0.24
529	0.25
530	0.25
531	0.22
532	0.21
533	0.24
534	0.2
535	0.24
536	0.24
537	0.23
538	0.23
539	0.24
540	0.25
541	0.28
542	0.28
543	0.24
544	0.31
545	0.37
546	0.41
547	0.44
548	0.51
549	0.52
550	0.5
551	0.5
552	0.46
553	0.41
554	0.38
555	0.34
556	0.25
557	0.18
558	0.14
559	0.09
560	0.06
561	0.06
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.05
566	0.06
567	0.09
568	0.12
569	0.13
570	0.17
571	0.19
572	0.28
573	0.34
574	0.38
575	0.42
576	0.46
577	0.52
578	0.51
579	0.52
580	0.47
581	0.45
582	0.44
583	0.39
584	0.35
585	0.31
586	0.29
587	0.26
588	0.27
589	0.24
590	0.2
591	0.19
592	0.16
593	0.15
594	0.14
595	0.14
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.08
609	0.08
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.08
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.1
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.09
632	0.17
633	0.19
634	0.2
635	0.24
636	0.25
637	0.26
638	0.26
639	0.26
640	0.18
641	0.17
642	0.15
643	0.13
644	0.11
645	0.1
646	0.1
647	0.08
648	0.09
649	0.1
650	0.11
651	0.09
652	0.09
653	0.11
654	0.12
655	0.13
656	0.18
657	0.2
658	0.22
659	0.27
660	0.3
661	0.33
662	0.34
663	0.34
664	0.32
665	0.29
666	0.28
667	0.26
668	0.27
669	0.22
670	0.24
671	0.32
672	0.3
673	0.39
674	0.42
675	0.42
676	0.41
677	0.47
678	0.5
679	0.44
680	0.49
681	0.46
682	0.49
683	0.53
684	0.57
685	0.53
686	0.54
687	0.52
688	0.47
689	0.42
690	0.33
691	0.27
692	0.22
693	0.21
694	0.15
695	0.15
696	0.13
697	0.12
698	0.13
699	0.12
700	0.11
701	0.09
702	0.08
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.1
715	0.12
716	0.18
717	0.22
718	0.28
719	0.31
720	0.36
721	0.38
722	0.4
723	0.36
724	0.36
725	0.4
726	0.4
727	0.42
728	0.46
729	0.47
730	0.45
731	0.48
732	0.44
733	0.36
734	0.32
735	0.28
736	0.23
737	0.2
738	0.22
739	0.23
740	0.24
741	0.24
742	0.23
743	0.25
744	0.24
745	0.27
746	0.26
747	0.24
748	0.23
749	0.24
750	0.29
751	0.28
752	0.28
753	0.26
754	0.24
755	0.22
756	0.23
757	0.26
758	0.21
759	0.2
760	0.19
761	0.2
762	0.23
763	0.24
764	0.23
765	0.19
766	0.19
767	0.21
768	0.26
769	0.25
770	0.26
771	0.29
772	0.32
773	0.36
774	0.41
775	0.42
776	0.44
777	0.51
778	0.56
779	0.64
780	0.69
781	0.68
782	0.67
783	0.65
784	0.59
785	0.53
786	0.45
787	0.36
788	0.29
789	0.27
790	0.23
791	0.21
792	0.19
793	0.14
794	0.16
795	0.14
796	0.17
797	0.19
798	0.18
799	0.19
800	0.24
801	0.24
802	0.21
803	0.26
804	0.22
805	0.23
806	0.24
807	0.23
808	0.23
809	0.24
810	0.25
811	0.25
812	0.27
813	0.25
814	0.32
815	0.37
816	0.42
817	0.52
818	0.56
819	0.58
820	0.67
821	0.69
822	0.62
823	0.6
824	0.56
825	0.56
826	0.58
827	0.54
828	0.45
829	0.41
830	0.41
831	0.38
832	0.38
833	0.36
834	0.38
835	0.38
836	0.39
837	0.41
838	0.43
839	0.45
840	0.47
841	0.51
842	0.52
843	0.58
844	0.65
845	0.72
846	0.75
847	0.79
848	0.8
849	0.79
850	0.75
851	0.65
852	0.57
853	0.5
854	0.49
855	0.44
856	0.36
857	0.27
858	0.22
859	0.22
860	0.19
861	0.24
862	0.24
863	0.29
864	0.39
865	0.47
866	0.55
867	0.63
868	0.64
869	0.62
870	0.61
871	0.57
872	0.55
873	0.55
874	0.54
875	0.56
876	0.61
877	0.63
878	0.65
879	0.66
880	0.63
881	0.61
882	0.58
883	0.57
884	0.54
885	0.51
886	0.45
887	0.38
888	0.35
889	0.29
890	0.23
891	0.14
892	0.11
893	0.09
894	0.09
895	0.09
896	0.1
897	0.12
898	0.15
899	0.18
900	0.21
901	0.24
902	0.25
903	0.26
904	0.25
905	0.27
906	0.32
907	0.33
908	0.37
909	0.35
910	0.36
911	0.36
912	0.36
913	0.33
914	0.26
915	0.24
916	0.16
917	0.18
918	0.15
919	0.14
920	0.15
921	0.16
922	0.16
923	0.16
924	0.17
925	0.14
926	0.16
927	0.14
928	0.14
929	0.11
930	0.11
931	0.1
932	0.09
933	0.13
934	0.16
935	0.23
936	0.28
937	0.35
938	0.43
939	0.49
940	0.59
941	0.66
942	0.72
943	0.76
944	0.8
945	0.82
946	0.83
947	0.81
948	0.75
949	0.69
950	0.58
951	0.48
952	0.4
953	0.34
954	0.25
955	0.2
956	0.15
957	0.11
958	0.1
959	0.1
960	0.1
961	0.08
962	0.08
963	0.1
964	0.11
965	0.13
966	0.18
967	0.23
968	0.28
969	0.31
970	0.31
971	0.38
972	0.46
973	0.5
974	0.48
975	0.48
976	0.45
977	0.5
978	0.51
979	0.49
980	0.5
981	0.51
982	0.5
983	0.5
984	0.49
985	0.5
986	0.55
987	0.52
988	0.44
989	0.45
990	0.45
991	0.4
992	0.43
993	0.35
994	0.28
995	0.24
996	0.22
997	0.16
998	0.13
999	0.13

A0A4V2JYB8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer