FuNGI

A0A4Q9LSD4

Protein Details

Accession

A0A4Q9LSD4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	KKDKITHKKIKKKNKSEIQNLLSE	Hydrophilic
891-912	IIYFTHSKSRKINNKNHFISKG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-15	THKKIKKKNK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039340 Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

KKDKITHKKIKKKNKSEIQNLLSEANIFYVKNKLNECIGLLKEIIKKSPQYFQAYYTLGLVYEEKNELENAFNCFYIAAHIKKKDYVLWKKLYEYTFILHDFYIKNDEYNKVEDKFITNERISDTHGFKSNPGLEITSTDRISEIYKERIYFISILQKKYNSPNKIKEKIDLYEILSMKDKILETKLEYIYFYGSGDIKTEGIYEKNSFIDDNFPESNSSENEEFSASNDLNTEFEYNSETNDKIENVSNETNTDFKEELIDQCLLLKEIRNTIKSNSELIRIIRKAIYFTCKCKNKKSISIEFLNSLISFSYELRDFKSLKNAFNNFAPINVKNIFIFFITFISLNRNPKCYFYEKTENINTSNSTMTNYLGNESATFKLENMEDNITNNNYDANRELKNSLDLFFFEKLMIFKESKDFLGFSNFYIIFDLIDTLFKNKNYTLSYEILEVLLQNNFTSHQINIKLEILNRMAGISISRNLKDDGIKFYLEILEILKNKKYFEIYNLKKEFSNEKLEVECFKMANGETKDAHDSNSSFINPMFPFIFNQDRIKAIVSNLYEELGNRDLALQYSLDINDEIGHFVDDLDQSNHEKKNEFSSSECKKIRSLFHKISFFYIENPNDDLERTLMFINTSNQLISDFMNNSYILNPKKYILQQSLGKVYDSNFEKSRLKSLHGLNVDEWFEVMKMNILCHLKLKKYEDSMNLLNRCLKSGVFKQRSDIYIQFLFLGFKYSLLNNNYGDFVNFVKKIVFYYQNASFYFFMYFFSNFFADYNRDKNFGHCQKNLQRLCKRVKENIGWPVSNTTMNSKNTLRNTSTESNNKNIQYQYKKSYYTNEFTSSLYSFNHPNTFLCLFLNSFLPRFLYSETVNYIENVTAVREKDIKTEIALSIIYFTHSKSRKINNKNHFISKGFEILKDLEKNDDYKDCSSNSNDSISIHQNKNLYNFYGCNGKCIIYYNLGRSYHTYGIIGFAEAFYKKVLKCKNAEVRKMAIFNLILIYKKNNSLNLVNEMAKLFNETAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.93
2	0.93
3	0.92
4	0.93
5	0.86
6	0.8
7	0.71
8	0.61
9	0.51
10	0.41
11	0.31
12	0.22
13	0.19
14	0.14
15	0.13
16	0.2
17	0.24
18	0.28
19	0.3
20	0.31
21	0.33
22	0.34
23	0.35
24	0.34
25	0.31
26	0.27
27	0.26
28	0.29
29	0.32
30	0.33
31	0.34
32	0.33
33	0.38
34	0.39
35	0.46
36	0.48
37	0.5
38	0.49
39	0.49
40	0.51
41	0.47
42	0.44
43	0.37
44	0.3
45	0.22
46	0.21
47	0.19
48	0.13
49	0.14
50	0.15
51	0.14
52	0.15
53	0.16
54	0.15
55	0.18
56	0.19
57	0.21
58	0.21
59	0.21
60	0.2
61	0.19
62	0.18
63	0.18
64	0.22
65	0.23
66	0.3
67	0.35
68	0.37
69	0.4
70	0.42
71	0.44
72	0.49
73	0.54
74	0.55
75	0.59
76	0.59
77	0.61
78	0.65
79	0.59
80	0.53
81	0.45
82	0.38
83	0.34
84	0.32
85	0.29
86	0.22
87	0.24
88	0.2
89	0.2
90	0.24
91	0.2
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.27
96	0.31
97	0.34
98	0.3
99	0.32
100	0.31
101	0.31
102	0.32
103	0.34
104	0.36
105	0.31
106	0.31
107	0.33
108	0.33
109	0.34
110	0.35
111	0.33
112	0.31
113	0.36
114	0.35
115	0.33
116	0.39
117	0.38
118	0.34
119	0.32
120	0.29
121	0.23
122	0.26
123	0.3
124	0.27
125	0.24
126	0.22
127	0.21
128	0.2
129	0.22
130	0.24
131	0.23
132	0.25
133	0.28
134	0.29
135	0.31
136	0.31
137	0.32
138	0.27
139	0.25
140	0.29
141	0.31
142	0.34
143	0.36
144	0.38
145	0.39
146	0.48
147	0.55
148	0.53
149	0.57
150	0.63
151	0.69
152	0.75
153	0.74
154	0.7
155	0.66
156	0.59
157	0.55
158	0.47
159	0.4
160	0.39
161	0.37
162	0.32
163	0.3
164	0.28
165	0.23
166	0.24
167	0.22
168	0.17
169	0.2
170	0.21
171	0.21
172	0.28
173	0.29
174	0.27
175	0.27
176	0.24
177	0.23
178	0.2
179	0.17
180	0.12
181	0.11
182	0.11
183	0.12
184	0.12
185	0.1
186	0.1
187	0.11
188	0.11
189	0.12
190	0.15
191	0.15
192	0.16
193	0.16
194	0.17
195	0.16
196	0.15
197	0.19
198	0.18
199	0.22
200	0.21
201	0.21
202	0.21
203	0.21
204	0.23
205	0.18
206	0.21
207	0.16
208	0.16
209	0.16
210	0.16
211	0.15
212	0.14
213	0.18
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.13
218	0.12
219	0.13
220	0.13
221	0.09
222	0.09
223	0.13
224	0.12
225	0.14
226	0.16
227	0.15
228	0.15
229	0.16
230	0.17
231	0.15
232	0.19
233	0.18
234	0.21
235	0.23
236	0.22
237	0.22
238	0.22
239	0.22
240	0.18
241	0.21
242	0.15
243	0.13
244	0.16
245	0.16
246	0.16
247	0.18
248	0.18
249	0.14
250	0.15
251	0.16
252	0.13
253	0.13
254	0.14
255	0.13
256	0.2
257	0.25
258	0.26
259	0.28
260	0.3
261	0.35
262	0.34
263	0.36
264	0.31
265	0.29
266	0.29
267	0.29
268	0.35
269	0.29
270	0.3
271	0.27
272	0.26
273	0.26
274	0.26
275	0.34
276	0.29
277	0.35
278	0.42
279	0.49
280	0.53
281	0.59
282	0.65
283	0.64
284	0.7
285	0.73
286	0.73
287	0.7
288	0.71
289	0.64
290	0.55
291	0.48
292	0.39
293	0.3
294	0.2
295	0.14
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.13
303	0.17
304	0.18
305	0.19
306	0.29
307	0.3
308	0.32
309	0.4
310	0.4
311	0.39
312	0.39
313	0.42
314	0.31
315	0.31
316	0.3
317	0.22
318	0.23
319	0.22
320	0.21
321	0.17
322	0.17
323	0.15
324	0.12
325	0.12
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.14
332	0.18
333	0.25
334	0.26
335	0.3
336	0.3
337	0.32
338	0.37
339	0.35
340	0.34
341	0.35
342	0.43
343	0.42
344	0.48
345	0.49
346	0.46
347	0.43
348	0.42
349	0.34
350	0.26
351	0.24
352	0.18
353	0.15
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.14
372	0.13
373	0.14
374	0.15
375	0.14
376	0.14
377	0.13
378	0.13
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.16
385	0.17
386	0.15
387	0.18
388	0.18
389	0.17
390	0.15
391	0.14
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.12
399	0.13
400	0.11
401	0.11
402	0.14
403	0.15
404	0.15
405	0.16
406	0.14
407	0.12
408	0.18
409	0.17
410	0.14
411	0.18
412	0.17
413	0.17
414	0.17
415	0.16
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.08
423	0.11
424	0.11
425	0.13
426	0.12
427	0.16
428	0.17
429	0.19
430	0.21
431	0.2
432	0.2
433	0.2
434	0.19
435	0.15
436	0.14
437	0.11
438	0.08
439	0.07
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.07
445	0.08
446	0.07
447	0.11
448	0.13
449	0.14
450	0.16
451	0.16
452	0.17
453	0.16
454	0.19
455	0.16
456	0.13
457	0.13
458	0.11
459	0.1
460	0.08
461	0.08
462	0.06
463	0.09
464	0.1
465	0.11
466	0.12
467	0.13
468	0.14
469	0.16
470	0.17
471	0.18
472	0.18
473	0.18
474	0.17
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.11
479	0.08
480	0.09
481	0.11
482	0.12
483	0.15
484	0.15
485	0.16
486	0.17
487	0.18
488	0.15
489	0.2
490	0.29
491	0.31
492	0.4
493	0.41
494	0.41
495	0.39
496	0.41
497	0.38
498	0.31
499	0.34
500	0.25
501	0.24
502	0.25
503	0.25
504	0.24
505	0.22
506	0.19
507	0.12
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.16
512	0.16
513	0.16
514	0.16
515	0.17
516	0.2
517	0.19
518	0.2
519	0.15
520	0.14
521	0.13
522	0.15
523	0.13
524	0.11
525	0.1
526	0.13
527	0.12
528	0.13
529	0.13
530	0.11
531	0.11
532	0.14
533	0.18
534	0.16
535	0.18
536	0.17
537	0.17
538	0.18
539	0.18
540	0.16
541	0.13
542	0.15
543	0.13
544	0.14
545	0.13
546	0.13
547	0.12
548	0.11
549	0.13
550	0.1
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.09
557	0.06
558	0.05
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.07
575	0.09
576	0.11
577	0.15
578	0.18
579	0.17
580	0.18
581	0.18
582	0.25
583	0.27
584	0.26
585	0.24
586	0.31
587	0.35
588	0.43
589	0.43
590	0.37
591	0.37
592	0.4
593	0.45
594	0.43
595	0.48
596	0.47
597	0.52
598	0.55
599	0.53
600	0.5
601	0.46
602	0.39
603	0.34
604	0.32
605	0.26
606	0.24
607	0.24
608	0.22
609	0.19
610	0.19
611	0.16
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.1
620	0.11
621	0.11
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.1
626	0.09
627	0.1
628	0.09
629	0.09
630	0.11
631	0.11
632	0.11
633	0.12
634	0.16
635	0.16
636	0.17
637	0.17
638	0.16
639	0.21
640	0.24
641	0.28
642	0.27
643	0.31
644	0.33
645	0.35
646	0.4
647	0.36
648	0.33
649	0.28
650	0.25
651	0.26
652	0.25
653	0.25
654	0.21
655	0.25
656	0.29
657	0.29
658	0.36
659	0.31
660	0.31
661	0.34
662	0.36
663	0.39
664	0.38
665	0.38
666	0.31
667	0.33
668	0.3
669	0.23
670	0.2
671	0.13
672	0.1
673	0.09
674	0.08
675	0.09
676	0.08
677	0.08
678	0.13
679	0.14
680	0.15
681	0.21
682	0.24
683	0.24
684	0.29
685	0.35
686	0.35
687	0.38
688	0.43
689	0.41
690	0.43
691	0.45
692	0.46
693	0.43
694	0.39
695	0.39
696	0.34
697	0.32
698	0.27
699	0.22
700	0.2
701	0.28
702	0.38
703	0.4
704	0.4
705	0.42
706	0.46
707	0.47
708	0.47
709	0.39
710	0.33
711	0.28
712	0.27
713	0.24
714	0.2
715	0.19
716	0.14
717	0.16
718	0.11
719	0.1
720	0.11
721	0.12
722	0.18
723	0.19
724	0.22
725	0.19
726	0.2
727	0.21
728	0.2
729	0.19
730	0.14
731	0.13
732	0.16
733	0.15
734	0.15
735	0.14
736	0.14
737	0.16
738	0.2
739	0.23
740	0.19
741	0.25
742	0.29
743	0.32
744	0.32
745	0.34
746	0.29
747	0.26
748	0.25
749	0.2
750	0.17
751	0.15
752	0.15
753	0.12
754	0.14
755	0.14
756	0.12
757	0.13
758	0.13
759	0.15
760	0.18
761	0.24
762	0.23
763	0.26
764	0.26
765	0.29
766	0.38
767	0.43
768	0.46
769	0.44
770	0.52
771	0.57
772	0.67
773	0.7
774	0.69
775	0.67
776	0.68
777	0.74
778	0.74
779	0.72
780	0.7
781	0.72
782	0.69
783	0.69
784	0.7
785	0.66
786	0.57
787	0.52
788	0.47
789	0.4
790	0.35
791	0.29
792	0.25
793	0.26
794	0.27
795	0.31
796	0.31
797	0.36
798	0.39
799	0.44
800	0.41
801	0.37
802	0.43
803	0.44
804	0.49
805	0.51
806	0.49
807	0.49
808	0.53
809	0.51
810	0.48
811	0.46
812	0.48
813	0.47
814	0.5
815	0.53
816	0.53
817	0.55
818	0.53
819	0.58
820	0.56
821	0.52
822	0.5
823	0.47
824	0.42
825	0.39
826	0.4
827	0.32
828	0.26
829	0.23
830	0.2
831	0.19
832	0.21
833	0.24
834	0.22
835	0.22
836	0.26
837	0.25
838	0.24
839	0.21
840	0.19
841	0.17
842	0.17
843	0.21
844	0.16
845	0.16
846	0.16
847	0.17
848	0.16
849	0.18
850	0.18
851	0.17
852	0.17
853	0.2
854	0.22
855	0.21
856	0.21
857	0.19
858	0.19
859	0.15
860	0.14
861	0.12
862	0.11
863	0.13
864	0.13
865	0.16
866	0.19
867	0.2
868	0.24
869	0.27
870	0.26
871	0.24
872	0.26
873	0.23
874	0.21
875	0.2
876	0.15
877	0.14
878	0.13
879	0.13
880	0.11
881	0.12
882	0.19
883	0.23
884	0.28
885	0.34
886	0.45
887	0.54
888	0.64
889	0.73
890	0.74
891	0.81
892	0.83
893	0.83
894	0.77
895	0.69
896	0.63
897	0.56
898	0.53
899	0.44
900	0.38
901	0.33
902	0.31
903	0.36
904	0.35
905	0.33
906	0.3
907	0.3
908	0.32
909	0.32
910	0.35
911	0.32
912	0.32
913	0.35
914	0.31
915	0.33
916	0.36
917	0.37
918	0.34
919	0.33
920	0.3
921	0.28
922	0.31
923	0.36
924	0.4
925	0.36
926	0.38
927	0.39
928	0.41
929	0.45
930	0.44
931	0.38
932	0.33
933	0.32
934	0.3
935	0.36
936	0.33
937	0.3
938	0.28
939	0.26
940	0.24
941	0.28
942	0.29
943	0.27
944	0.31
945	0.33
946	0.39
947	0.39
948	0.4
949	0.4
950	0.43
951	0.38
952	0.35
953	0.3
954	0.23
955	0.25
956	0.24
957	0.2
958	0.14
959	0.11
960	0.13
961	0.13
962	0.13
963	0.12
964	0.16
965	0.17
966	0.26
967	0.34
968	0.38
969	0.44
970	0.54
971	0.63
972	0.67
973	0.74
974	0.71
975	0.69
976	0.68
977	0.64
978	0.54
979	0.49
980	0.39
981	0.32
982	0.3
983	0.26
984	0.21
985	0.21
986	0.25
987	0.24
988	0.3
989	0.33
990	0.33
991	0.37
992	0.4
993	0.43
994	0.44
995	0.45
996	0.39
997	0.37
998	0.34
999	0.3
1000	0.25
1001	0.24

A0A4Q9LSD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer