FuNGI

A0A4Q9LPU4

Protein Details

Accession

A0A4Q9LPU4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-21	GRKKNFSSKISKNTKIRAVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL

Amino Acid Sequences

MGRKKNFSSKISKNTKIRAVNDADEVKKSDSGKQKFPSSVKDYACKPSYDMTNLCTQAISESNRLMALQTIFDSVTANPKERHRIVFFWHTDKLNMYYNEKFSCTLDIDAIERRRIATCLTEQCTLTDTTDKIKEISERQIGKVVVRTRKLPNELVDSKILNLINRKIGEYADSCLPMTRTAVARIIQAAQLGFDEATRKEKPRSAWKENIESKISKLVLSKDLLEKARKQEKLSTSETKSLKKIMREFNLNLSSVTDLSEALVKTNESLNVYEKKITMHESRKQFRKENRMFELFRGRFYHGLSERVKSEHVVSRDETVSFWSTMWNKNDDTVTYDDYLIPFGSDNHPTTFPSLDEFVNIINWLPNWKAAGIDGIYNFFIEKLTTLHKYIYDIVKVICLEGTTQADWFYCGLTYLIPKGIPRRGSDYRPITCMSNLYKLTTKCATKVVQFEGAKEQALLNIAWNKDYGNNLKATWIDVIISKWKIDISVGPEKIMTKKIDRGILQGDSLSPLFFVLCMDPLSRKLNEKYTKVTVQTDAESHSTNHLLFIDDLKLLAKDSSTLSAMTGEAKEFLEVIGLEINKEKSATNDTCCEDTATLLEGVSVYKYLGIIEDSRGIPTRSSFEEVQSKLISRVERLCHTRLNAKNLFSAINQHAISLINYHIGVLRLEPADFSKLDDAVRAVLVKNKI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.82
3	0.8
4	0.73
5	0.71
6	0.67
7	0.61
8	0.6
9	0.58
10	0.51
11	0.45
12	0.45
13	0.39
14	0.37
15	0.35
16	0.36
17	0.4
18	0.44
19	0.51
20	0.54
21	0.59
22	0.63
23	0.65
24	0.66
25	0.63
26	0.65
27	0.61
28	0.6
29	0.57
30	0.59
31	0.58
32	0.49
33	0.45
34	0.43
35	0.44
36	0.44
37	0.41
38	0.35
39	0.4
40	0.4
41	0.37
42	0.31
43	0.25
44	0.22
45	0.26
46	0.27
47	0.21
48	0.21
49	0.22
50	0.22
51	0.22
52	0.19
53	0.18
54	0.15
55	0.13
56	0.13
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.11
62	0.19
63	0.2
64	0.23
65	0.26
66	0.32
67	0.41
68	0.44
69	0.51
70	0.46
71	0.47
72	0.51
73	0.57
74	0.56
75	0.53
76	0.53
77	0.47
78	0.44
79	0.43
80	0.4
81	0.37
82	0.36
83	0.35
84	0.35
85	0.38
86	0.39
87	0.38
88	0.35
89	0.29
90	0.3
91	0.26
92	0.23
93	0.19
94	0.18
95	0.19
96	0.25
97	0.26
98	0.25
99	0.23
100	0.23
101	0.24
102	0.23
103	0.23
104	0.21
105	0.26
106	0.32
107	0.35
108	0.37
109	0.35
110	0.35
111	0.35
112	0.31
113	0.26
114	0.21
115	0.18
116	0.21
117	0.24
118	0.24
119	0.23
120	0.24
121	0.27
122	0.27
123	0.34
124	0.37
125	0.36
126	0.37
127	0.42
128	0.4
129	0.37
130	0.4
131	0.4
132	0.39
133	0.39
134	0.43
135	0.44
136	0.52
137	0.55
138	0.52
139	0.49
140	0.5
141	0.5
142	0.48
143	0.44
144	0.36
145	0.32
146	0.32
147	0.28
148	0.22
149	0.24
150	0.24
151	0.26
152	0.27
153	0.27
154	0.24
155	0.23
156	0.24
157	0.21
158	0.21
159	0.18
160	0.18
161	0.17
162	0.18
163	0.18
164	0.15
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.15
169	0.18
170	0.18
171	0.18
172	0.18
173	0.19
174	0.16
175	0.15
176	0.13
177	0.1
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.14
185	0.17
186	0.2
187	0.23
188	0.28
189	0.34
190	0.43
191	0.51
192	0.54
193	0.6
194	0.62
195	0.69
196	0.71
197	0.69
198	0.62
199	0.53
200	0.46
201	0.44
202	0.39
203	0.3
204	0.26
205	0.25
206	0.24
207	0.25
208	0.26
209	0.23
210	0.28
211	0.3
212	0.31
213	0.32
214	0.37
215	0.44
216	0.45
217	0.44
218	0.47
219	0.49
220	0.52
221	0.54
222	0.52
223	0.47
224	0.52
225	0.53
226	0.49
227	0.45
228	0.46
229	0.43
230	0.42
231	0.46
232	0.46
233	0.48
234	0.51
235	0.5
236	0.51
237	0.5
238	0.44
239	0.37
240	0.29
241	0.24
242	0.18
243	0.17
244	0.1
245	0.07
246	0.07
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.09
251	0.08
252	0.09
253	0.1
254	0.11
255	0.1
256	0.11
257	0.14
258	0.18
259	0.19
260	0.2
261	0.19
262	0.18
263	0.19
264	0.22
265	0.26
266	0.29
267	0.35
268	0.43
269	0.5
270	0.57
271	0.61
272	0.64
273	0.65
274	0.69
275	0.69
276	0.68
277	0.67
278	0.66
279	0.61
280	0.57
281	0.6
282	0.49
283	0.44
284	0.39
285	0.34
286	0.29
287	0.28
288	0.33
289	0.23
290	0.29
291	0.28
292	0.27
293	0.26
294	0.26
295	0.26
296	0.19
297	0.21
298	0.19
299	0.19
300	0.2
301	0.19
302	0.21
303	0.21
304	0.21
305	0.17
306	0.15
307	0.15
308	0.13
309	0.12
310	0.13
311	0.14
312	0.19
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.21
317	0.21
318	0.18
319	0.19
320	0.16
321	0.16
322	0.14
323	0.15
324	0.13
325	0.13
326	0.13
327	0.09
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.08
332	0.1
333	0.11
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.15
338	0.14
339	0.12
340	0.11
341	0.12
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.08
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.09
372	0.1
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.14
377	0.17
378	0.18
379	0.16
380	0.15
381	0.14
382	0.15
383	0.15
384	0.13
385	0.1
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.07
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.1
406	0.14
407	0.19
408	0.21
409	0.22
410	0.29
411	0.33
412	0.36
413	0.44
414	0.47
415	0.44
416	0.43
417	0.43
418	0.36
419	0.32
420	0.32
421	0.26
422	0.25
423	0.24
424	0.24
425	0.28
426	0.27
427	0.31
428	0.32
429	0.3
430	0.25
431	0.3
432	0.29
433	0.28
434	0.32
435	0.31
436	0.34
437	0.33
438	0.33
439	0.33
440	0.32
441	0.28
442	0.24
443	0.21
444	0.13
445	0.14
446	0.13
447	0.1
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.13
453	0.14
454	0.18
455	0.19
456	0.18
457	0.19
458	0.19
459	0.2
460	0.2
461	0.19
462	0.16
463	0.12
464	0.1
465	0.1
466	0.11
467	0.15
468	0.16
469	0.14
470	0.14
471	0.14
472	0.13
473	0.13
474	0.15
475	0.16
476	0.24
477	0.25
478	0.25
479	0.25
480	0.27
481	0.29
482	0.31
483	0.27
484	0.22
485	0.28
486	0.32
487	0.36
488	0.36
489	0.37
490	0.36
491	0.34
492	0.31
493	0.25
494	0.21
495	0.17
496	0.16
497	0.13
498	0.08
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.05
504	0.06
505	0.07
506	0.08
507	0.1
508	0.13
509	0.18
510	0.19
511	0.24
512	0.27
513	0.36
514	0.42
515	0.44
516	0.47
517	0.49
518	0.52
519	0.5
520	0.49
521	0.43
522	0.38
523	0.36
524	0.31
525	0.27
526	0.24
527	0.22
528	0.2
529	0.19
530	0.18
531	0.17
532	0.16
533	0.14
534	0.14
535	0.13
536	0.14
537	0.13
538	0.12
539	0.12
540	0.11
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.12
548	0.12
549	0.12
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.12
555	0.1
556	0.11
557	0.11
558	0.1
559	0.1
560	0.09
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.14
568	0.15
569	0.14
570	0.15
571	0.14
572	0.14
573	0.22
574	0.25
575	0.26
576	0.31
577	0.33
578	0.34
579	0.35
580	0.34
581	0.25
582	0.23
583	0.2
584	0.16
585	0.14
586	0.12
587	0.11
588	0.09
589	0.09
590	0.09
591	0.08
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.07
597	0.09
598	0.1
599	0.11
600	0.16
601	0.16
602	0.18
603	0.21
604	0.21
605	0.2
606	0.21
607	0.23
608	0.22
609	0.27
610	0.26
611	0.29
612	0.37
613	0.37
614	0.39
615	0.37
616	0.35
617	0.32
618	0.35
619	0.31
620	0.27
621	0.33
622	0.34
623	0.4
624	0.44
625	0.45
626	0.47
627	0.5
628	0.55
629	0.55
630	0.58
631	0.56
632	0.53
633	0.52
634	0.48
635	0.46
636	0.37
637	0.38
638	0.31
639	0.33
640	0.3
641	0.27
642	0.26
643	0.25
644	0.24
645	0.19
646	0.17
647	0.12
648	0.12
649	0.13
650	0.14
651	0.14
652	0.13
653	0.12
654	0.16
655	0.14
656	0.15
657	0.15
658	0.16
659	0.19
660	0.18
661	0.21
662	0.19
663	0.2
664	0.2
665	0.21
666	0.2
667	0.17
668	0.19
669	0.17
670	0.15

A0A4Q9LPU4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer