Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9PXN8

Protein Details
Accession A0A4Q9PXN8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
743-762TSPGVRCPRKRKQVETLWVEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 6, extr 5, cyto_nucl 5, nucl 4.5, cyto 4.5, mito 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MTTPSGEAGIPLSFFVELVNAIAKIKPHRASEKQPPDTRYLDTPAYKTFKRWVAALYDRHSPIPPDTTTIVFRFLFPEEDGRRKFGMQEAHLAQHLVRVLGVSSATDGRGERLKNWNDEGAIGCLGDEVSAVMAATDHSQASTTAVSLNQIDALLTELASKCAFSDHSVRASFSVAAPGRTREAILTSIYASLTPAEGAVVTQIILKDLRPLLYPLPLSATHYTAALLQYKSNAVTMLTKEAAMHAWDRTGRMSLIFKSRANLEDAARTFESLKAGESLPAPAFGIPVQIPKCVKGQGAAQALRVMKGADKVWVETKYDGERAQIHVRVDEDGLPCIKIFSKSGRDSTLDRAGVHGIICDALGLPRPSSMSAGGVRPSTGMEPSITKDVILEAEMVAFSETLGRIDEFWRIRSLIASTAIGVRHRTPLPVLSSTQDMMNSQQSLVSNGSDGGTRHLALVFFDILLLNGVSLLSIPYAERRNILERTLHLSPGYAMFAERTCIDMRHTDAEEPLRRAFASLIADRQEGAVLKADAATYNERRWPWVKLKRDYISGHGDTVDLVLVGASWEKDRARELRVPPAAYTTFYFAALANADMISTDPSHKPCFEVIFNSSYGLSREGLEELNFMIKSSDPIPCRPQQAIEGLPYIYNLSPRLSPPAVFLQRPLLAELFGAGFTKAQGNMFYELRFPRIFKIYRPSDRPWVDGTSLAEFQHIAREVVGRDRPGKAEDDWVKRTFRPDEPTSPGVRCPRKRKQVETLWVEKLEVVDGKASGRGSPTKRARIQGPAPTRKSAKTENVAQGQNAENLYRLGGAKGPSVRLGSSRLGSVTNVAASHSPLRQTSGLTTSSPSPSPSPSPSPSPPSALEHNPAHQSAAYLPHPANGLKTPQSSPRQAVLQDPFPPSKQSHGVIQRMATEAISDDSPALPPSTSKPRSGKDGSQVVLSAIPSTLHQYLQDSVVWMARPSGTPRPLWRAPSHAVIPTGSHVNTLDAVAVACGWVDVGPCHWARRGVIFIDDSECDQGCVPQVLAELAKRRAVLSDEDNAGNVRPILVFSTKMLAYDVLDRALTVEDLEARAICRFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.07
4 0.06
5 0.07
6 0.09
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.15
11 0.2
12 0.28
13 0.33
14 0.39
15 0.48
16 0.55
17 0.63
18 0.71
19 0.76
20 0.78
21 0.79
22 0.76
23 0.72
24 0.68
25 0.62
26 0.56
27 0.5
28 0.47
29 0.44
30 0.43
31 0.45
32 0.48
33 0.46
34 0.44
35 0.46
36 0.46
37 0.44
38 0.43
39 0.38
40 0.4
41 0.47
42 0.51
43 0.47
44 0.48
45 0.48
46 0.48
47 0.47
48 0.41
49 0.37
50 0.35
51 0.32
52 0.29
53 0.29
54 0.3
55 0.33
56 0.31
57 0.32
58 0.26
59 0.26
60 0.24
61 0.23
62 0.23
63 0.2
64 0.28
65 0.29
66 0.38
67 0.4
68 0.41
69 0.42
70 0.4
71 0.4
72 0.37
73 0.4
74 0.33
75 0.39
76 0.38
77 0.39
78 0.39
79 0.37
80 0.31
81 0.26
82 0.25
83 0.16
84 0.13
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.19
97 0.2
98 0.23
99 0.32
100 0.38
101 0.41
102 0.44
103 0.45
104 0.39
105 0.4
106 0.37
107 0.29
108 0.24
109 0.19
110 0.15
111 0.12
112 0.11
113 0.09
114 0.07
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.19
153 0.21
154 0.27
155 0.29
156 0.29
157 0.28
158 0.29
159 0.27
160 0.2
161 0.25
162 0.2
163 0.22
164 0.23
165 0.24
166 0.25
167 0.24
168 0.24
169 0.17
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.22
201 0.22
202 0.18
203 0.2
204 0.19
205 0.23
206 0.22
207 0.22
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.17
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.1
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.14
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.26
243 0.29
244 0.28
245 0.28
246 0.31
247 0.3
248 0.3
249 0.29
250 0.23
251 0.26
252 0.26
253 0.3
254 0.27
255 0.26
256 0.24
257 0.22
258 0.23
259 0.16
260 0.16
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.13
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.11
273 0.09
274 0.14
275 0.15
276 0.18
277 0.19
278 0.2
279 0.23
280 0.22
281 0.22
282 0.19
283 0.21
284 0.25
285 0.31
286 0.3
287 0.29
288 0.31
289 0.3
290 0.29
291 0.26
292 0.18
293 0.13
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.2
300 0.21
301 0.22
302 0.2
303 0.23
304 0.22
305 0.24
306 0.22
307 0.2
308 0.21
309 0.23
310 0.28
311 0.28
312 0.25
313 0.24
314 0.25
315 0.23
316 0.22
317 0.21
318 0.17
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.12
327 0.16
328 0.24
329 0.27
330 0.3
331 0.32
332 0.33
333 0.34
334 0.38
335 0.39
336 0.32
337 0.29
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.21
342 0.15
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.11
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.08
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.13
394 0.13
395 0.15
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.12
410 0.15
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.17
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.17
419 0.19
420 0.18
421 0.18
422 0.15
423 0.12
424 0.11
425 0.13
426 0.12
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.13
431 0.13
432 0.11
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.02
460 0.03
461 0.03
462 0.07
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.13
467 0.18
468 0.19
469 0.21
470 0.19
471 0.18
472 0.24
473 0.23
474 0.22
475 0.17
476 0.16
477 0.15
478 0.14
479 0.12
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.15
493 0.16
494 0.14
495 0.16
496 0.21
497 0.22
498 0.23
499 0.21
500 0.18
501 0.17
502 0.18
503 0.16
504 0.13
505 0.14
506 0.12
507 0.13
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.14
512 0.12
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.11
523 0.11
524 0.13
525 0.16
526 0.16
527 0.19
528 0.2
529 0.24
530 0.3
531 0.37
532 0.44
533 0.47
534 0.55
535 0.54
536 0.58
537 0.54
538 0.49
539 0.47
540 0.39
541 0.33
542 0.25
543 0.23
544 0.17
545 0.16
546 0.11
547 0.04
548 0.03
549 0.03
550 0.02
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.05
556 0.06
557 0.07
558 0.1
559 0.12
560 0.16
561 0.22
562 0.24
563 0.32
564 0.34
565 0.34
566 0.32
567 0.33
568 0.29
569 0.24
570 0.22
571 0.16
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.08
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.05
586 0.07
587 0.09
588 0.11
589 0.13
590 0.14
591 0.15
592 0.15
593 0.18
594 0.17
595 0.17
596 0.18
597 0.18
598 0.18
599 0.17
600 0.16
601 0.14
602 0.13
603 0.12
604 0.1
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.07
612 0.09
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.09
619 0.14
620 0.14
621 0.17
622 0.22
623 0.25
624 0.29
625 0.28
626 0.28
627 0.25
628 0.27
629 0.25
630 0.22
631 0.19
632 0.16
633 0.16
634 0.14
635 0.13
636 0.1
637 0.1
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.11
642 0.16
643 0.15
644 0.15
645 0.17
646 0.25
647 0.27
648 0.26
649 0.26
650 0.25
651 0.26
652 0.26
653 0.25
654 0.16
655 0.13
656 0.13
657 0.12
658 0.08
659 0.06
660 0.06
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.08
668 0.1
669 0.13
670 0.13
671 0.13
672 0.16
673 0.16
674 0.19
675 0.19
676 0.17
677 0.18
678 0.24
679 0.25
680 0.25
681 0.33
682 0.39
683 0.45
684 0.51
685 0.52
686 0.54
687 0.55
688 0.54
689 0.48
690 0.42
691 0.35
692 0.31
693 0.29
694 0.22
695 0.22
696 0.19
697 0.16
698 0.13
699 0.13
700 0.15
701 0.14
702 0.11
703 0.1
704 0.12
705 0.12
706 0.18
707 0.2
708 0.18
709 0.2
710 0.21
711 0.22
712 0.22
713 0.24
714 0.2
715 0.27
716 0.32
717 0.36
718 0.4
719 0.41
720 0.42
721 0.4
722 0.44
723 0.4
724 0.37
725 0.38
726 0.39
727 0.42
728 0.46
729 0.49
730 0.47
731 0.44
732 0.44
733 0.45
734 0.49
735 0.52
736 0.55
737 0.61
738 0.69
739 0.76
740 0.78
741 0.79
742 0.79
743 0.8
744 0.78
745 0.74
746 0.67
747 0.6
748 0.52
749 0.43
750 0.33
751 0.24
752 0.18
753 0.12
754 0.09
755 0.09
756 0.09
757 0.11
758 0.11
759 0.1
760 0.12
761 0.18
762 0.21
763 0.31
764 0.38
765 0.45
766 0.49
767 0.53
768 0.53
769 0.55
770 0.59
771 0.58
772 0.61
773 0.61
774 0.6
775 0.61
776 0.61
777 0.55
778 0.54
779 0.51
780 0.49
781 0.45
782 0.5
783 0.52
784 0.55
785 0.53
786 0.48
787 0.44
788 0.38
789 0.34
790 0.27
791 0.2
792 0.14
793 0.13
794 0.13
795 0.12
796 0.1
797 0.08
798 0.11
799 0.12
800 0.15
801 0.17
802 0.17
803 0.18
804 0.19
805 0.19
806 0.18
807 0.21
808 0.19
809 0.18
810 0.18
811 0.17
812 0.17
813 0.16
814 0.16
815 0.13
816 0.12
817 0.11
818 0.11
819 0.1
820 0.12
821 0.15
822 0.14
823 0.16
824 0.15
825 0.18
826 0.19
827 0.19
828 0.2
829 0.21
830 0.21
831 0.19
832 0.21
833 0.2
834 0.22
835 0.22
836 0.21
837 0.19
838 0.21
839 0.25
840 0.28
841 0.31
842 0.32
843 0.38
844 0.4
845 0.45
846 0.44
847 0.44
848 0.41
849 0.4
850 0.42
851 0.38
852 0.4
853 0.35
854 0.37
855 0.36
856 0.34
857 0.3
858 0.25
859 0.23
860 0.18
861 0.22
862 0.19
863 0.2
864 0.19
865 0.2
866 0.22
867 0.21
868 0.22
869 0.18
870 0.22
871 0.23
872 0.26
873 0.27
874 0.34
875 0.41
876 0.43
877 0.44
878 0.43
879 0.42
880 0.4
881 0.45
882 0.41
883 0.39
884 0.4
885 0.41
886 0.4
887 0.37
888 0.4
889 0.34
890 0.35
891 0.34
892 0.31
893 0.35
894 0.41
895 0.44
896 0.43
897 0.43
898 0.4
899 0.37
900 0.35
901 0.26
902 0.18
903 0.14
904 0.14
905 0.12
906 0.1
907 0.09
908 0.09
909 0.1
910 0.1
911 0.1
912 0.09
913 0.1
914 0.16
915 0.26
916 0.28
917 0.35
918 0.41
919 0.44
920 0.52
921 0.57
922 0.57
923 0.56
924 0.6
925 0.53
926 0.48
927 0.44
928 0.37
929 0.32
930 0.26
931 0.18
932 0.11
933 0.1
934 0.09
935 0.14
936 0.14
937 0.13
938 0.14
939 0.16
940 0.17
941 0.19
942 0.19
943 0.16
944 0.15
945 0.17
946 0.17
947 0.15
948 0.15
949 0.14
950 0.16
951 0.2
952 0.28
953 0.29
954 0.33
955 0.39
956 0.46
957 0.5
958 0.54
959 0.52
960 0.5
961 0.5
962 0.52
963 0.49
964 0.44
965 0.4
966 0.35
967 0.32
968 0.28
969 0.29
970 0.22
971 0.2
972 0.17
973 0.17
974 0.17
975 0.16
976 0.13
977 0.09
978 0.09
979 0.08
980 0.07
981 0.06
982 0.05
983 0.04
984 0.04
985 0.04
986 0.05
987 0.05
988 0.07
989 0.12
990 0.14
991 0.17
992 0.19
993 0.22
994 0.23
995 0.28
996 0.3
997 0.27
998 0.3
999 0.29
1000 0.28
1001 0.28
1002 0.27
1003 0.23
1004 0.22
1005 0.2
1006 0.17
1007 0.16
1008 0.16
1009 0.15
1010 0.16
1011 0.14
1012 0.13
1013 0.14
1014 0.15
1015 0.16
1016 0.19
1017 0.23
1018 0.24
1019 0.27
1020 0.26
1021 0.26
1022 0.27
1023 0.28
1024 0.29
1025 0.27
1026 0.31
1027 0.32
1028 0.32
1029 0.32
1030 0.3
1031 0.28
1032 0.24
1033 0.19
1034 0.14
1035 0.1
1036 0.1
1037 0.13
1038 0.15
1039 0.16
1040 0.15
1041 0.2
1042 0.19
1043 0.19
1044 0.2
1045 0.17
1046 0.17
1047 0.21
1048 0.21
1049 0.18
1050 0.17
1051 0.17
1052 0.17
1053 0.17
1054 0.15
1055 0.1
1056 0.1
1057 0.11
1058 0.12
1059 0.13
1060 0.12
1061 0.12