Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9Q341

Protein Details
Accession A0A4Q9Q341    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23SQTVEAHKTKKRKHVAVVEETSHydrophilic
25-58AGEPSTKRSKKEKDAKKHKKAKHDKGKARATDDABasic
319-345RAAQEAETRKEKKRKRREPKAYEDATSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-53STKRSKKEKDAKKHKKAKHDKGKAR
327-341RKEKKRKRREPKAYE
345-357SDAAARKKSKKKS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.666, cyto 13.5, nucl 11.5, cyto_mito 8.499, mito_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSQTVEAHKTKKRKHVAVVEETSGAGEPSTKRSKKEKDAKKHKKAKHDKGKARATDDAFRIVRASLNVSVPPVFAGDLRGGVEELLDSMLMRYIPALQGVVLAHDRLEFLDKVASIKADSPFANCRIAFDATVWSPQVGMKLSGKINLCSPDHISLLVHRTFNASIPRHHITTDSYGFEYGPAENDPEFGARQEGKAEGEAAEEGVDGGGRWVHKITGTKLGDADGSLEFTVVGLTVANQMLSLVGSIQPDPFSPEHVPKAPITTVSTVAARNLATSRPSSALQSEREVDAMIGDDDDSDMDPFGKLGKLADDAERQARAAQEAETRKEKKRKRREPKAYEDATSDAAARKKSKKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.81
3 0.82
4 0.82
5 0.79
6 0.71
7 0.61
8 0.53
9 0.43
10 0.33
11 0.24
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.18
16 0.29
17 0.31
18 0.37
19 0.47
20 0.57
21 0.65
22 0.74
23 0.77
24 0.78
25 0.86
26 0.92
27 0.93
28 0.94
29 0.9
30 0.91
31 0.91
32 0.91
33 0.91
34 0.91
35 0.89
36 0.89
37 0.92
38 0.86
39 0.8
40 0.76
41 0.69
42 0.65
43 0.58
44 0.56
45 0.46
46 0.4
47 0.36
48 0.29
49 0.26
50 0.2
51 0.22
52 0.16
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.17
58 0.16
59 0.12
60 0.1
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.09
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.16
108 0.19
109 0.21
110 0.24
111 0.21
112 0.21
113 0.22
114 0.22
115 0.2
116 0.17
117 0.18
118 0.14
119 0.16
120 0.14
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.14
129 0.15
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.2
134 0.22
135 0.21
136 0.19
137 0.21
138 0.19
139 0.18
140 0.18
141 0.15
142 0.13
143 0.17
144 0.18
145 0.15
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.23
151 0.2
152 0.19
153 0.25
154 0.27
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.19
159 0.23
160 0.23
161 0.18
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.13
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.08
202 0.12
203 0.14
204 0.22
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.23
209 0.21
210 0.18
211 0.18
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.12
239 0.12
240 0.15
241 0.17
242 0.21
243 0.25
244 0.28
245 0.3
246 0.26
247 0.3
248 0.26
249 0.25
250 0.24
251 0.21
252 0.2
253 0.19
254 0.2
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.16
265 0.17
266 0.18
267 0.18
268 0.22
269 0.25
270 0.26
271 0.28
272 0.28
273 0.26
274 0.25
275 0.23
276 0.19
277 0.14
278 0.12
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.13
297 0.15
298 0.19
299 0.21
300 0.24
301 0.27
302 0.27
303 0.26
304 0.25
305 0.24
306 0.22
307 0.19
308 0.19
309 0.23
310 0.28
311 0.34
312 0.41
313 0.45
314 0.52
315 0.62
316 0.68
317 0.71
318 0.77
319 0.83
320 0.85
321 0.92
322 0.93
323 0.94
324 0.95
325 0.94
326 0.88
327 0.79
328 0.71
329 0.62
330 0.53
331 0.43
332 0.34
333 0.28
334 0.27
335 0.3
336 0.34
337 0.41