Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9QDD1

Protein Details
Accession A0A4Q9QDD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-308ASPQERVQKPSKSKRRQPGIKQDPYADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-298ARQARPPSPPPTPPPRSPSPEPPSSPPPASPQERVQKPSKSKRRQ
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR040260  RFA2-like  
IPR014892  RPA_C  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF08784  RPA_C  
Amino Acid Sequences MSPTVDQRDETLNNAGAQSLPNGSREKTRPVTIRQLLDAKRDHSEAPFKIDDHEINRISLVAHAVDVHRYESTVVYTLEDGTSLGRIDARHYPTGSSFEELSDSDQGTSQLYVHVLGTLDLKVKLGSRNVIRVLHMYRVTDPNQLFFHILEAAFVTLSLERGPPPAAALKSGAPRIPTEPASPVIRRTAPSVSPLPRSPVKASVPAPGPSRRVLTARTAEPGPATPSPTRPSAPSTPTSWTPTPLASARRATPARQARPPSPPPTPPPRSPSPEPPSSPPPASPQERVQKPSKSKRRQPGIKQDPYADLTVLQRSIILQLMKATHSKAGMNVDAICHAVGHHYSTQQDVSGAIDVLLDLGLIENTIDEAHYAVKTIHYPRSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.18
9 0.21
10 0.22
11 0.3
12 0.33
13 0.4
14 0.42
15 0.49
16 0.52
17 0.56
18 0.65
19 0.63
20 0.63
21 0.59
22 0.62
23 0.57
24 0.58
25 0.55
26 0.47
27 0.44
28 0.42
29 0.38
30 0.35
31 0.41
32 0.35
33 0.38
34 0.37
35 0.34
36 0.35
37 0.37
38 0.36
39 0.31
40 0.37
41 0.31
42 0.29
43 0.29
44 0.26
45 0.23
46 0.2
47 0.17
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.11
75 0.18
76 0.23
77 0.26
78 0.26
79 0.27
80 0.27
81 0.32
82 0.3
83 0.25
84 0.2
85 0.17
86 0.18
87 0.17
88 0.18
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.11
111 0.14
112 0.15
113 0.19
114 0.2
115 0.24
116 0.27
117 0.27
118 0.26
119 0.28
120 0.28
121 0.27
122 0.26
123 0.23
124 0.23
125 0.26
126 0.27
127 0.29
128 0.27
129 0.25
130 0.24
131 0.24
132 0.22
133 0.18
134 0.17
135 0.12
136 0.12
137 0.09
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.18
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.18
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.17
177 0.2
178 0.24
179 0.23
180 0.25
181 0.25
182 0.27
183 0.26
184 0.29
185 0.27
186 0.27
187 0.27
188 0.29
189 0.29
190 0.3
191 0.3
192 0.3
193 0.32
194 0.29
195 0.29
196 0.25
197 0.26
198 0.23
199 0.22
200 0.21
201 0.23
202 0.24
203 0.23
204 0.24
205 0.23
206 0.21
207 0.2
208 0.19
209 0.17
210 0.14
211 0.17
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.23
216 0.23
217 0.2
218 0.25
219 0.27
220 0.29
221 0.29
222 0.29
223 0.3
224 0.32
225 0.36
226 0.31
227 0.28
228 0.26
229 0.24
230 0.24
231 0.24
232 0.24
233 0.22
234 0.25
235 0.24
236 0.3
237 0.31
238 0.3
239 0.36
240 0.42
241 0.44
242 0.49
243 0.52
244 0.49
245 0.57
246 0.62
247 0.59
248 0.54
249 0.54
250 0.53
251 0.59
252 0.61
253 0.57
254 0.57
255 0.59
256 0.61
257 0.62
258 0.65
259 0.62
260 0.63
261 0.6
262 0.59
263 0.58
264 0.55
265 0.51
266 0.42
267 0.42
268 0.42
269 0.43
270 0.42
271 0.44
272 0.49
273 0.52
274 0.56
275 0.57
276 0.58
277 0.64
278 0.71
279 0.74
280 0.75
281 0.79
282 0.84
283 0.88
284 0.9
285 0.9
286 0.9
287 0.9
288 0.88
289 0.82
290 0.74
291 0.67
292 0.6
293 0.5
294 0.39
295 0.3
296 0.23
297 0.23
298 0.2
299 0.15
300 0.13
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.13
305 0.11
306 0.14
307 0.16
308 0.17
309 0.19
310 0.19
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.23
316 0.22
317 0.22
318 0.21
319 0.2
320 0.19
321 0.19
322 0.15
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.13
328 0.15
329 0.17
330 0.18
331 0.2
332 0.21
333 0.19
334 0.18
335 0.15
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.05
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.11
361 0.17
362 0.23