Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9PJ53

Protein Details
Accession A0A4Q9PJ53    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-111LDDAPPKRARGRPRKATSQKKHVAPPPSHydrophilic
145-166RESAAPKRGRGRPRKVLAKTQDBasic
695-718EANKVNKGKSKTKGKERDRENVPEBasic
806-825EDEERLRKRQERLEYFKKLQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-108PKRARGRPRKATSQKKHVAP
145-160RESAAPKRGRGRPRKV
602-629RGKGKAVARDPVPALDKGKGKAGPSKPR
685-711PRRAKKARLEEANKVNKGKSKTKGKER
740-797PKIPARAARGRGRGRGRGRGRAQAIAPTSNGRTSVPASRGRSTSRGRPPTSKGKGKER
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MRTRRRPVLQDKTPGNTPQKPKAKAVLTGKPKLVPVVEIKTKVRRSSRVKHVEAGQPMEVDGAAPAPQEQERGEALPLETGATLDDAPPKRARGRPRKATSQKKHVAPPPSPKAVDFSNGPEDINPDRRAPEEAVQDENATKAARESAAPKRGRGRPRKVLAKTQDPTPPPSPKADIDFGSDTGHDLHGADELVQDENARVLPSPTTPTVGRRAPRPRARPQVSSAPAADRAPLESLPPSSFAVDARPSSPASVPVADEESTASEAVRAILSTPSPARIIRAPIPVESTPLGRLPPLEASLRPFASSIRKWNADVSRTYSSLPPSSPPVQVPVATSSQARYQAEFSDEKEPIRYAKRKTPPSDDDLFGLLAAEKKLKTIRQRRMPVESSRAPGGTRAPLGMLALDEVPSVGVPIPDRLPTPIPSDEHNIDDLYLDVDPVRPGRSHVDEEDDEEDEDKENLPTEDYNLNEDKENMCPPHLVFDDFKENDLPPDGPDEALGDDENDENLASASVAPILLASAKKGFGLDQLLVEPSSSSASPMHALRTPHKHRSAHQRSPLPTPHFSDDGDVLEDSPATVHARSEGLGWHEESPSPVKPSAALRGKGKAVARDPVPALDKGKGKAGPSKPRQPLATLEYEDPYAEPAKVAGKKRTRAQVGAHAGLKESESEESDPRAAVMKLEALLPRRAKKARLEEANKVNKGKSKTKGKERDRENVPESTESGSGSEDEDRGVGSDSSPPKIPARAARGRGRGRGRGRGRAQAIAPTSNGRTSVPASRGRSTSRGRPPTSKGKGKERATGVVDPDEDEERLRKRQERLEYFKKLQDYSLEKEDVYVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.69
3 0.67
4 0.66
5 0.67
6 0.71
7 0.69
8 0.69
9 0.7
10 0.67
11 0.67
12 0.68
13 0.67
14 0.66
15 0.68
16 0.66
17 0.6
18 0.56
19 0.5
20 0.43
21 0.37
22 0.35
23 0.36
24 0.4
25 0.42
26 0.46
27 0.52
28 0.58
29 0.62
30 0.63
31 0.64
32 0.67
33 0.72
34 0.78
35 0.79
36 0.77
37 0.75
38 0.74
39 0.72
40 0.68
41 0.63
42 0.53
43 0.43
44 0.39
45 0.33
46 0.25
47 0.17
48 0.12
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.09
54 0.1
55 0.12
56 0.12
57 0.15
58 0.16
59 0.18
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.16
73 0.18
74 0.22
75 0.25
76 0.29
77 0.36
78 0.42
79 0.52
80 0.55
81 0.64
82 0.71
83 0.76
84 0.83
85 0.86
86 0.91
87 0.9
88 0.9
89 0.88
90 0.84
91 0.84
92 0.8
93 0.78
94 0.74
95 0.75
96 0.72
97 0.71
98 0.65
99 0.56
100 0.53
101 0.46
102 0.42
103 0.34
104 0.31
105 0.29
106 0.29
107 0.28
108 0.25
109 0.27
110 0.29
111 0.34
112 0.31
113 0.26
114 0.28
115 0.29
116 0.32
117 0.32
118 0.32
119 0.33
120 0.33
121 0.34
122 0.33
123 0.33
124 0.3
125 0.26
126 0.22
127 0.15
128 0.12
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.13
133 0.18
134 0.26
135 0.35
136 0.37
137 0.4
138 0.47
139 0.54
140 0.63
141 0.68
142 0.68
143 0.7
144 0.78
145 0.84
146 0.8
147 0.82
148 0.8
149 0.8
150 0.72
151 0.67
152 0.65
153 0.57
154 0.59
155 0.55
156 0.54
157 0.46
158 0.48
159 0.46
160 0.42
161 0.44
162 0.41
163 0.35
164 0.34
165 0.33
166 0.3
167 0.27
168 0.24
169 0.19
170 0.17
171 0.16
172 0.11
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.14
192 0.14
193 0.17
194 0.18
195 0.21
196 0.27
197 0.32
198 0.32
199 0.37
200 0.46
201 0.53
202 0.62
203 0.66
204 0.69
205 0.75
206 0.78
207 0.74
208 0.7
209 0.7
210 0.63
211 0.59
212 0.5
213 0.41
214 0.38
215 0.33
216 0.29
217 0.19
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.16
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.16
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.15
266 0.19
267 0.22
268 0.27
269 0.26
270 0.26
271 0.3
272 0.28
273 0.28
274 0.24
275 0.2
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.16
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.17
291 0.17
292 0.22
293 0.24
294 0.28
295 0.3
296 0.31
297 0.32
298 0.38
299 0.4
300 0.36
301 0.36
302 0.34
303 0.32
304 0.31
305 0.31
306 0.27
307 0.25
308 0.24
309 0.22
310 0.18
311 0.2
312 0.22
313 0.23
314 0.21
315 0.22
316 0.21
317 0.21
318 0.21
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.16
323 0.13
324 0.15
325 0.19
326 0.18
327 0.16
328 0.16
329 0.17
330 0.2
331 0.2
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.19
339 0.26
340 0.3
341 0.29
342 0.37
343 0.46
344 0.53
345 0.58
346 0.63
347 0.59
348 0.59
349 0.59
350 0.5
351 0.43
352 0.35
353 0.3
354 0.21
355 0.17
356 0.11
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.08
362 0.11
363 0.15
364 0.25
365 0.34
366 0.43
367 0.51
368 0.59
369 0.62
370 0.66
371 0.67
372 0.61
373 0.59
374 0.52
375 0.45
376 0.38
377 0.34
378 0.27
379 0.24
380 0.21
381 0.16
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.18
411 0.23
412 0.22
413 0.21
414 0.2
415 0.16
416 0.14
417 0.13
418 0.11
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.07
427 0.06
428 0.08
429 0.12
430 0.16
431 0.17
432 0.18
433 0.22
434 0.21
435 0.23
436 0.23
437 0.2
438 0.16
439 0.15
440 0.14
441 0.1
442 0.1
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.09
450 0.11
451 0.11
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.16
457 0.14
458 0.14
459 0.16
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.15
468 0.17
469 0.24
470 0.23
471 0.24
472 0.2
473 0.2
474 0.18
475 0.19
476 0.17
477 0.09
478 0.12
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.08
484 0.09
485 0.08
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.03
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.1
519 0.08
520 0.06
521 0.07
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.1
527 0.11
528 0.13
529 0.15
530 0.17
531 0.22
532 0.32
533 0.38
534 0.45
535 0.52
536 0.52
537 0.55
538 0.64
539 0.69
540 0.68
541 0.69
542 0.68
543 0.63
544 0.68
545 0.69
546 0.63
547 0.56
548 0.51
549 0.46
550 0.4
551 0.38
552 0.32
553 0.26
554 0.21
555 0.19
556 0.15
557 0.12
558 0.1
559 0.09
560 0.07
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.14
575 0.14
576 0.14
577 0.15
578 0.17
579 0.17
580 0.19
581 0.18
582 0.17
583 0.18
584 0.21
585 0.28
586 0.32
587 0.34
588 0.34
589 0.37
590 0.38
591 0.41
592 0.4
593 0.36
594 0.32
595 0.33
596 0.32
597 0.31
598 0.31
599 0.3
600 0.3
601 0.27
602 0.26
603 0.25
604 0.28
605 0.25
606 0.3
607 0.29
608 0.28
609 0.35
610 0.41
611 0.47
612 0.52
613 0.61
614 0.62
615 0.64
616 0.64
617 0.57
618 0.54
619 0.49
620 0.47
621 0.39
622 0.35
623 0.31
624 0.3
625 0.27
626 0.22
627 0.18
628 0.13
629 0.11
630 0.09
631 0.09
632 0.15
633 0.21
634 0.27
635 0.34
636 0.41
637 0.47
638 0.54
639 0.62
640 0.6
641 0.59
642 0.58
643 0.59
644 0.58
645 0.56
646 0.52
647 0.43
648 0.38
649 0.34
650 0.3
651 0.2
652 0.15
653 0.11
654 0.11
655 0.14
656 0.15
657 0.17
658 0.17
659 0.16
660 0.15
661 0.17
662 0.15
663 0.13
664 0.12
665 0.12
666 0.12
667 0.14
668 0.17
669 0.17
670 0.24
671 0.29
672 0.32
673 0.39
674 0.42
675 0.44
676 0.51
677 0.58
678 0.61
679 0.66
680 0.68
681 0.69
682 0.75
683 0.8
684 0.75
685 0.67
686 0.61
687 0.57
688 0.57
689 0.57
690 0.56
691 0.58
692 0.63
693 0.72
694 0.79
695 0.83
696 0.85
697 0.84
698 0.84
699 0.8
700 0.79
701 0.72
702 0.66
703 0.59
704 0.52
705 0.46
706 0.39
707 0.33
708 0.24
709 0.21
710 0.17
711 0.14
712 0.13
713 0.14
714 0.11
715 0.11
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.12
720 0.1
721 0.09
722 0.16
723 0.18
724 0.21
725 0.23
726 0.25
727 0.25
728 0.29
729 0.33
730 0.34
731 0.4
732 0.46
733 0.53
734 0.59
735 0.66
736 0.69
737 0.73
738 0.72
739 0.73
740 0.71
741 0.74
742 0.72
743 0.73
744 0.72
745 0.72
746 0.68
747 0.64
748 0.58
749 0.55
750 0.51
751 0.43
752 0.39
753 0.34
754 0.32
755 0.29
756 0.28
757 0.22
758 0.21
759 0.23
760 0.29
761 0.3
762 0.36
763 0.4
764 0.44
765 0.47
766 0.49
767 0.54
768 0.53
769 0.57
770 0.6
771 0.64
772 0.66
773 0.69
774 0.72
775 0.75
776 0.78
777 0.78
778 0.75
779 0.76
780 0.8
781 0.77
782 0.78
783 0.72
784 0.7
785 0.65
786 0.62
787 0.55
788 0.49
789 0.45
790 0.37
791 0.35
792 0.3
793 0.25
794 0.22
795 0.25
796 0.25
797 0.31
798 0.37
799 0.42
800 0.47
801 0.55
802 0.64
803 0.69
804 0.74
805 0.78
806 0.8
807 0.79
808 0.77
809 0.74
810 0.64
811 0.56
812 0.55
813 0.51
814 0.48
815 0.5
816 0.45
817 0.39