Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Q9PCC6

Protein Details
Accession A0A4Q9PCC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1004-1023LPTRRCSCPRNLPQQAPRSSHydrophilic
1145-1169DDKIVGIRRRPRPPVTRKTGSDPRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1279-1298SGRGPGSPSKPPKEGRNGSA
Subcellular Location(s) plas 17, E.R. 5, mito 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030225  SCAP  
IPR000731  SSD  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0032934  F:sterol binding  
GO:0006629  P:lipid metabolic process  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF12349  Sterol-sensing  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50156  SSD  
Amino Acid Sequences MPSPMSLALQRARLVGTQFFYRFGIHCATHQIRLILVSSVVITSLLFPAIASYYSSQTQYFAGFTLRVLDSFLTPDDISSYFAQHDLRHLWEGDAALRTRADSVARARCGMEGILREERVLVGSVSPEEGLGALDKNTLLATLKLERRISEALSSRSISCLRSRDGSCFALSPSAFWNYNEQALAADDDILDTLNLSQNVTISGLPITPDMVLAGRELHDPSSNHIDAAMFLVLTYFFPEKECFGNDGHFLWLHALEDAGGDAGELVVLAQEPHLIALEYRKNASLRTRFTMLFAFTSITYTAFGVYCFWLFRRMTMVHSRIGLAFTGIVEILVSTITSVSVCALVGFRVTMVPWELFPIIVVFIGVENMYSIVDAVVKTSITLPVKERIAQGLSRAGTSNTLKVVSYNALLGVLAVFSTGAIRQFCAFSIVVLVAHWFLVHTFFVTVVSIDIQRLELDELLRQGSNLTPNVIQDPRKSNPQSSKTKFGSTWSAVRELVRGRPAKNISLFMLLAITAALWYTTTPQAVGHKPTAKPTATRNPLAQLSRVQNMTPDSISPAQRVWQILNPVGDPLIHIRIESPTILVLGDRTNTAALDEMTAESDKHFFRPRVSRYWSRTVRPVVWLLKIFVMPITGTTMLLYGLLLYLLKDAELLEAQRHAAEPESPTVDEPPSVEGGISFTTLPRAFATDVDLIAASEDGKTIATVGLENEFVIWRTDRQSHVVIDPSTSVLGSCASTPSASTTLTAVAMNSLGNICAAGTGAGTIAVFLIGKDQIKPLPHLHLEHLSSGITALHFTGSLKYASGAVTPLRPGTPGIDVEAPTELTCHLYASYENGAVVEWDILSTKNPRYVTPSRAASVVKSMLLPIQADGRLLVGFSLDDGMLELCNVERDNSVFKEECAISAGNPADLVTKVHVCNVELDGTKRIIVGAATQAGIISLWDALSRECLIILDEPFGDINVLKLSPVHTSTCTTCGELPIENFSITFSVGHVVQFYRAYLTLPTRRCSCPRNLPQQAPRSSLLAHRGRSGSNASVASTGTNTPVRPRSRRSSFSSPPTIFPVSGHGVHSRRASEKDSLRRASETFFLNNPDYFEYDMPLGPQDVIPASSFLASAAQPSIWQSLVVVRVSDTTVERGGWDVGHDDKIVGIRRRPRPPVTRKTGSDPRVQQDRSVGLTAAALDRWELWTFDPAESKLQASPLLALNREPPRKRKYEADTSTGSLRMTAPLPKRRGAVPRLHFTRVSPFLCTPGCCLAGFGNTVGLFRFHHLTVRRGSGSGRGPGSPSKPPKEGRNGSAKAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.26
4 0.29
5 0.29
6 0.3
7 0.3
8 0.29
9 0.27
10 0.26
11 0.29
12 0.23
13 0.24
14 0.32
15 0.34
16 0.36
17 0.37
18 0.35
19 0.29
20 0.3
21 0.29
22 0.2
23 0.17
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.14
41 0.17
42 0.19
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.16
59 0.17
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.15
69 0.17
70 0.19
71 0.17
72 0.22
73 0.22
74 0.25
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.25
80 0.23
81 0.24
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.19
88 0.18
89 0.18
90 0.25
91 0.32
92 0.34
93 0.35
94 0.34
95 0.33
96 0.33
97 0.29
98 0.25
99 0.2
100 0.24
101 0.28
102 0.27
103 0.27
104 0.25
105 0.24
106 0.22
107 0.19
108 0.14
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.12
129 0.19
130 0.24
131 0.3
132 0.31
133 0.31
134 0.35
135 0.36
136 0.35
137 0.34
138 0.36
139 0.33
140 0.36
141 0.37
142 0.32
143 0.33
144 0.33
145 0.29
146 0.28
147 0.3
148 0.29
149 0.35
150 0.36
151 0.38
152 0.41
153 0.41
154 0.37
155 0.33
156 0.3
157 0.28
158 0.26
159 0.22
160 0.2
161 0.23
162 0.22
163 0.22
164 0.28
165 0.24
166 0.27
167 0.26
168 0.22
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.12
173 0.11
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.16
207 0.16
208 0.21
209 0.28
210 0.27
211 0.25
212 0.25
213 0.23
214 0.19
215 0.21
216 0.16
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.16
229 0.18
230 0.17
231 0.18
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.12
265 0.18
266 0.19
267 0.2
268 0.23
269 0.24
270 0.26
271 0.35
272 0.36
273 0.36
274 0.4
275 0.42
276 0.4
277 0.41
278 0.41
279 0.34
280 0.27
281 0.22
282 0.18
283 0.14
284 0.16
285 0.14
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.21
301 0.21
302 0.25
303 0.33
304 0.35
305 0.31
306 0.31
307 0.32
308 0.26
309 0.26
310 0.21
311 0.12
312 0.1
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.09
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.12
369 0.12
370 0.14
371 0.16
372 0.21
373 0.23
374 0.24
375 0.24
376 0.22
377 0.23
378 0.22
379 0.22
380 0.22
381 0.21
382 0.19
383 0.19
384 0.17
385 0.19
386 0.19
387 0.19
388 0.15
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.16
393 0.12
394 0.12
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.05
401 0.04
402 0.03
403 0.03
404 0.02
405 0.02
406 0.03
407 0.04
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.12
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.12
457 0.13
458 0.17
459 0.19
460 0.2
461 0.21
462 0.27
463 0.27
464 0.36
465 0.37
466 0.4
467 0.46
468 0.53
469 0.59
470 0.57
471 0.64
472 0.58
473 0.59
474 0.53
475 0.47
476 0.45
477 0.37
478 0.37
479 0.3
480 0.3
481 0.27
482 0.27
483 0.27
484 0.22
485 0.22
486 0.24
487 0.26
488 0.24
489 0.31
490 0.33
491 0.34
492 0.34
493 0.32
494 0.27
495 0.26
496 0.25
497 0.18
498 0.15
499 0.11
500 0.09
501 0.07
502 0.05
503 0.03
504 0.03
505 0.02
506 0.02
507 0.03
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.08
513 0.12
514 0.15
515 0.18
516 0.21
517 0.25
518 0.26
519 0.3
520 0.34
521 0.31
522 0.31
523 0.35
524 0.4
525 0.4
526 0.41
527 0.38
528 0.36
529 0.39
530 0.38
531 0.33
532 0.28
533 0.26
534 0.27
535 0.26
536 0.23
537 0.2
538 0.21
539 0.2
540 0.15
541 0.12
542 0.13
543 0.16
544 0.17
545 0.16
546 0.15
547 0.15
548 0.17
549 0.18
550 0.16
551 0.15
552 0.17
553 0.18
554 0.19
555 0.17
556 0.15
557 0.14
558 0.12
559 0.1
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.1
568 0.08
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.06
578 0.06
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.08
591 0.08
592 0.11
593 0.15
594 0.15
595 0.2
596 0.29
597 0.32
598 0.38
599 0.44
600 0.5
601 0.51
602 0.61
603 0.6
604 0.54
605 0.56
606 0.52
607 0.47
608 0.41
609 0.4
610 0.32
611 0.3
612 0.29
613 0.23
614 0.2
615 0.19
616 0.16
617 0.11
618 0.09
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.02
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.07
651 0.08
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.11
656 0.11
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.05
668 0.05
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.08
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.13
677 0.11
678 0.11
679 0.1
680 0.1
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.04
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.1
705 0.13
706 0.14
707 0.17
708 0.19
709 0.19
710 0.2
711 0.22
712 0.2
713 0.17
714 0.16
715 0.14
716 0.11
717 0.1
718 0.08
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.06
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.08
732 0.08
733 0.09
734 0.09
735 0.07
736 0.06
737 0.06
738 0.05
739 0.05
740 0.04
741 0.04
742 0.04
743 0.04
744 0.03
745 0.03
746 0.03
747 0.03
748 0.03
749 0.03
750 0.03
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.03
756 0.03
757 0.02
758 0.04
759 0.05
760 0.06
761 0.06
762 0.08
763 0.1
764 0.12
765 0.15
766 0.16
767 0.2
768 0.22
769 0.23
770 0.24
771 0.26
772 0.25
773 0.23
774 0.21
775 0.16
776 0.14
777 0.12
778 0.1
779 0.06
780 0.05
781 0.05
782 0.04
783 0.05
784 0.05
785 0.06
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.08
791 0.08
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.09
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.09
801 0.1
802 0.11
803 0.1
804 0.12
805 0.13
806 0.13
807 0.13
808 0.13
809 0.12
810 0.1
811 0.1
812 0.08
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.06
817 0.07
818 0.07
819 0.1
820 0.11
821 0.1
822 0.09
823 0.09
824 0.09
825 0.08
826 0.08
827 0.05
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.05
832 0.06
833 0.1
834 0.11
835 0.16
836 0.17
837 0.18
838 0.26
839 0.31
840 0.35
841 0.38
842 0.39
843 0.35
844 0.36
845 0.36
846 0.29
847 0.27
848 0.23
849 0.16
850 0.14
851 0.13
852 0.12
853 0.12
854 0.12
855 0.08
856 0.1
857 0.1
858 0.1
859 0.1
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.07
864 0.04
865 0.04
866 0.04
867 0.05
868 0.04
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.04
873 0.04
874 0.04
875 0.03
876 0.05
877 0.05
878 0.06
879 0.06
880 0.08
881 0.12
882 0.13
883 0.17
884 0.16
885 0.16
886 0.2
887 0.2
888 0.19
889 0.17
890 0.16
891 0.12
892 0.17
893 0.17
894 0.12
895 0.11
896 0.11
897 0.1
898 0.1
899 0.11
900 0.09
901 0.12
902 0.12
903 0.15
904 0.15
905 0.14
906 0.16
907 0.16
908 0.18
909 0.16
910 0.18
911 0.18
912 0.18
913 0.17
914 0.15
915 0.14
916 0.11
917 0.09
918 0.09
919 0.09
920 0.09
921 0.09
922 0.09
923 0.09
924 0.08
925 0.08
926 0.06
927 0.04
928 0.03
929 0.03
930 0.04
931 0.05
932 0.05
933 0.07
934 0.08
935 0.07
936 0.07
937 0.07
938 0.08
939 0.1
940 0.11
941 0.1
942 0.09
943 0.1
944 0.1
945 0.1
946 0.09
947 0.06
948 0.07
949 0.06
950 0.06
951 0.06
952 0.07
953 0.08
954 0.1
955 0.12
956 0.14
957 0.14
958 0.17
959 0.19
960 0.22
961 0.22
962 0.21
963 0.19
964 0.19
965 0.19
966 0.18
967 0.17
968 0.18
969 0.18
970 0.16
971 0.15
972 0.14
973 0.13
974 0.11
975 0.11
976 0.07
977 0.07
978 0.08
979 0.08
980 0.09
981 0.09
982 0.1
983 0.1
984 0.1
985 0.11
986 0.11
987 0.11
988 0.13
989 0.2
990 0.26
991 0.29
992 0.32
993 0.35
994 0.4
995 0.44
996 0.46
997 0.48
998 0.52
999 0.58
1000 0.65
1001 0.69
1002 0.73
1003 0.77
1004 0.81
1005 0.76
1006 0.7
1007 0.61
1008 0.52
1009 0.45
1010 0.41
1011 0.41
1012 0.38
1013 0.35
1014 0.34
1015 0.35
1016 0.33
1017 0.35
1018 0.34
1019 0.27
1020 0.25
1021 0.24
1022 0.2
1023 0.19
1024 0.19
1025 0.17
1026 0.14
1027 0.13
1028 0.12
1029 0.14
1030 0.14
1031 0.19
1032 0.27
1033 0.34
1034 0.39
1035 0.46
1036 0.53
1037 0.59
1038 0.65
1039 0.68
1040 0.7
1041 0.71
1042 0.72
1043 0.75
1044 0.67
1045 0.6
1046 0.6
1047 0.53
1048 0.43
1049 0.36
1050 0.32
1051 0.26
1052 0.26
1053 0.26
1054 0.27
1055 0.26
1056 0.3
1057 0.33
1058 0.31
1059 0.31
1060 0.33
1061 0.35
1062 0.37
1063 0.44
1064 0.5
1065 0.56
1066 0.56
1067 0.55
1068 0.54
1069 0.51
1070 0.45
1071 0.41
1072 0.34
1073 0.29
1074 0.27
1075 0.29
1076 0.29
1077 0.28
1078 0.28
1079 0.25
1080 0.23
1081 0.22
1082 0.21
1083 0.18
1084 0.17
1085 0.16
1086 0.15
1087 0.14
1088 0.13
1089 0.11
1090 0.11
1091 0.1
1092 0.1
1093 0.11
1094 0.1
1095 0.1
1096 0.1
1097 0.1
1098 0.1
1099 0.08
1100 0.09
1101 0.08
1102 0.09
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.09
1106 0.11
1107 0.13
1108 0.11
1109 0.11
1110 0.1
1111 0.13
1112 0.16
1113 0.16
1114 0.15
1115 0.13
1116 0.14
1117 0.15
1118 0.17
1119 0.14
1120 0.13
1121 0.14
1122 0.14
1123 0.14
1124 0.14
1125 0.14
1126 0.12
1127 0.12
1128 0.12
1129 0.13
1130 0.15
1131 0.15
1132 0.13
1133 0.13
1134 0.18
1135 0.25
1136 0.27
1137 0.32
1138 0.4
1139 0.49
1140 0.58
1141 0.65
1142 0.7
1143 0.73
1144 0.79
1145 0.83
1146 0.83
1147 0.83
1148 0.78
1149 0.8
1150 0.8
1151 0.74
1152 0.73
1153 0.69
1154 0.67
1155 0.68
1156 0.64
1157 0.57
1158 0.53
1159 0.52
1160 0.46
1161 0.41
1162 0.33
1163 0.23
1164 0.23
1165 0.22
1166 0.17
1167 0.14
1168 0.1
1169 0.08
1170 0.09
1171 0.11
1172 0.12
1173 0.12
1174 0.12
1175 0.17
1176 0.19
1177 0.21
1178 0.24
1179 0.23
1180 0.26
1181 0.27
1182 0.27
1183 0.23
1184 0.22
1185 0.22
1186 0.18
1187 0.19
1188 0.21
1189 0.23
1190 0.23
1191 0.23
1192 0.29
1193 0.37
1194 0.46
1195 0.5
1196 0.53
1197 0.58
1198 0.64
1199 0.68
1200 0.7
1201 0.69
1202 0.71
1203 0.71
1204 0.68
1205 0.63
1206 0.59
1207 0.57
1208 0.49
1209 0.4
1210 0.3
1211 0.25
1212 0.21
1213 0.2
1214 0.25
1215 0.3
1216 0.38
1217 0.43
1218 0.45
1219 0.47
1220 0.51
1221 0.57
1222 0.57
1223 0.59
1224 0.58
1225 0.64
1226 0.66
1227 0.68
1228 0.63
1229 0.56
1230 0.58
1231 0.55
1232 0.49
1233 0.43
1234 0.39
1235 0.4
1236 0.42
1237 0.41
1238 0.35
1239 0.32
1240 0.32
1241 0.27
1242 0.27
1243 0.23
1244 0.23
1245 0.23
1246 0.19
1247 0.18
1248 0.17
1249 0.17
1250 0.16
1251 0.16
1252 0.14
1253 0.16
1254 0.2
1255 0.16
1256 0.23
1257 0.27
1258 0.32
1259 0.36
1260 0.42
1261 0.41
1262 0.38
1263 0.39
1264 0.4
1265 0.42
1266 0.43
1267 0.39
1268 0.34
1269 0.35
1270 0.41
1271 0.44
1272 0.47
1273 0.5
1274 0.5
1275 0.55
1276 0.6
1277 0.66
1278 0.71
1279 0.74
1280 0.71
1281 0.73