Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9PDZ6

Protein Details
Accession A0A4Q9PDZ6    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-286GGRDSRDRSSRGRRPPRPRATQEDLDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-129KKKGAKK
152-155PKRR
261-278GRDSRDRSSRGRRPPRPR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDEGDSPYRDNAILLHGTPISHLPTSNIFAYATHFDAHPLGLEWVDDTTCVLVFDSKSDARTAFRALQKSLAEEPALDDGTVTAKPIPMPIWPAEDRINATLGKGEGLKGILRMRWARLEDVKKKGAKKDSEFYRKYGLNAGKTFEEGPPPPKRRRPQDPDSDAVARAQLDEELDSFLAEGEDAPPPSPPSKMRSDYIGKDGKTLLERTSAIRAHPGTLESRLIAALPRRARSGRDGEDRSWDEGKLGLHGRLSEPGSGGGRDSRDRSSRGRRPPRPRATQEDLDAELDAFLAAKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.17
8 0.16
9 0.16
10 0.15
11 0.18
12 0.22
13 0.22
14 0.21
15 0.18
16 0.17
17 0.21
18 0.21
19 0.19
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.1
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.18
47 0.18
48 0.2
49 0.23
50 0.25
51 0.29
52 0.32
53 0.31
54 0.36
55 0.34
56 0.36
57 0.34
58 0.29
59 0.23
60 0.2
61 0.2
62 0.17
63 0.17
64 0.13
65 0.1
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.09
76 0.13
77 0.13
78 0.19
79 0.19
80 0.21
81 0.22
82 0.23
83 0.24
84 0.21
85 0.22
86 0.16
87 0.15
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.14
100 0.16
101 0.17
102 0.2
103 0.21
104 0.22
105 0.28
106 0.36
107 0.39
108 0.43
109 0.48
110 0.48
111 0.5
112 0.53
113 0.53
114 0.52
115 0.5
116 0.53
117 0.57
118 0.62
119 0.61
120 0.56
121 0.54
122 0.48
123 0.43
124 0.42
125 0.36
126 0.31
127 0.3
128 0.3
129 0.25
130 0.25
131 0.25
132 0.18
133 0.17
134 0.13
135 0.18
136 0.26
137 0.31
138 0.36
139 0.43
140 0.5
141 0.56
142 0.65
143 0.68
144 0.68
145 0.73
146 0.72
147 0.67
148 0.64
149 0.56
150 0.46
151 0.37
152 0.3
153 0.19
154 0.14
155 0.11
156 0.07
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.1
175 0.13
176 0.14
177 0.17
178 0.24
179 0.28
180 0.28
181 0.33
182 0.37
183 0.37
184 0.43
185 0.44
186 0.36
187 0.35
188 0.34
189 0.3
190 0.27
191 0.26
192 0.2
193 0.18
194 0.18
195 0.19
196 0.24
197 0.23
198 0.21
199 0.25
200 0.24
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.19
214 0.22
215 0.24
216 0.28
217 0.29
218 0.32
219 0.36
220 0.41
221 0.41
222 0.47
223 0.5
224 0.47
225 0.54
226 0.54
227 0.52
228 0.45
229 0.37
230 0.28
231 0.26
232 0.25
233 0.21
234 0.21
235 0.18
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.22
240 0.23
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.19
247 0.17
248 0.19
249 0.23
250 0.25
251 0.29
252 0.32
253 0.36
254 0.44
255 0.51
256 0.57
257 0.64
258 0.73
259 0.76
260 0.82
261 0.89
262 0.91
263 0.91
264 0.9
265 0.88
266 0.85
267 0.82
268 0.76
269 0.69
270 0.61
271 0.51
272 0.44
273 0.34
274 0.25
275 0.18
276 0.13