FuNGI

A0A4Q9PND8

Protein Details

Accession

A0A4Q9PND8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1001-1028	FTEPEKPNARSRKKEPRWKKEQMTSVVW	Hydrophilic
1211-1237	TEVEQEKPKKVVRKRGPRKIKSEADIE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1008-1020	NARSRKKEPRWKK
1217-1231	KPKKVVRKRGPRKIK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MPSPSGSEKRPSSIHADMHGFLNRRSPYTILPTPTPEDVISQPGDIFFTDSPTQDQVSVIEACLRGLHDVPRAKGIFERLRSTRQGDPILEARMYNSFIEAYLEMAHREELNRPNWLEDAWALYNDMERGHEKVDPTPNTYALMLQAWLRYNPDSSRQPVYISGAEVHDPVSLLRNIIGRQISPALVVSDRAFTSNEEATEAIKALSKAAAEMGLASVVNELGLTEFLGKQIEDPLEDVPEVVPVMRPKKIEVVQHDDGRVTQLATDEPLPERAQGEVPFNLETLRRHLSQVVLARRVLSEDVAARQRLLEQSVYSVAVERMKHQAEMMDQLGLPSKGLQSNDLKSWMWEWHQKLQQRIKAEVENLIVEERILARMKRRSTKSEEILLSPFLRMLSPEKLSLITIMEMMNLHGSGGVQDGMKTARALLSVGRAVEAEHKAEICKKNNISIPVPAVNAPRAGVQNIFTGDGYKDLYARRVTAAKYMEDAEEWTSDWSQLIRVKVGSFLLDCIMDVATVSRTIQDPRTGEKFTEEQPAFSHSYEYQRGRKLGVIKFNPAVADRMSKDPIADTLHPRHLPMLVKPKPWLSYNNGGYLYSRSWAMRFKDSREQEIYLRHASEAGRLELVFAGLDVLGSTPWQINRRVFDVVLQVWNSGERFAKIPPAIPDEPEPVRPENMDTDNKAKVVYLERQRQWMQNKAANHSDRCSVNYKVEIARAFLGDTIYLPHNVDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLLIFEEKKPLGTRGLRWLKIHLANLYGYDKASFDERVEYVHKHLEDIFDSADKPLEGRRWWTKADDPWQCLATCMELTSALRSPDPEAYECGLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDAQGAAQVNLAAADRPSDVYTYVANMVEKQIEEDIKKDDPIAKLLEGKVSRKVVKQTVMTTVYGVTYVGARDQIERQLKDRGDIPAEMCWSASAYLAKNVLASIGDLFKGAKDIQNWLNLCARLIAKAIPQDRLVQSFTEPEKPNARSRKKEPRWKKEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRAVKRKQVMTSIQTVFISDPTSPSTVNAQKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRARGLTFASVHDSYWTHASSIDQMSEIIRDTFIALHSSDVLKGLYDEFRERYADYKIPLVSLRGNAFKKLNLAPEQLGLTSEDTKLLTEGVAEDEEMLDEDALALDEDEDELEALTEVEQEKPKKVVRKRGPRKIKSEADIEARLAGRFINLVDVLPPLPEKGKFDVKAIKESQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.44
3	0.45
4	0.4
5	0.42
6	0.44
7	0.39
8	0.33
9	0.37
10	0.34
11	0.32
12	0.34
13	0.32
14	0.32
15	0.38
16	0.44
17	0.41
18	0.42
19	0.44
20	0.46
21	0.45
22	0.42
23	0.33
24	0.31
25	0.27
26	0.28
27	0.25
28	0.21
29	0.2
30	0.18
31	0.18
32	0.15
33	0.17
34	0.12
35	0.17
36	0.18
37	0.19
38	0.21
39	0.23
40	0.23
41	0.21
42	0.21
43	0.16
44	0.18
45	0.18
46	0.15
47	0.17
48	0.16
49	0.15
50	0.16
51	0.16
52	0.14
53	0.16
54	0.2
55	0.23
56	0.29
57	0.3
58	0.38
59	0.37
60	0.36
61	0.37
62	0.43
63	0.43
64	0.43
65	0.49
66	0.45
67	0.51
68	0.55
69	0.56
70	0.54
71	0.52
72	0.53
73	0.46
74	0.47
75	0.45
76	0.44
77	0.4
78	0.33
79	0.28
80	0.25
81	0.25
82	0.2
83	0.17
84	0.13
85	0.13
86	0.15
87	0.14
88	0.12
89	0.13
90	0.13
91	0.13
92	0.14
93	0.15
94	0.13
95	0.15
96	0.2
97	0.24
98	0.27
99	0.33
100	0.33
101	0.34
102	0.33
103	0.32
104	0.27
105	0.21
106	0.23
107	0.19
108	0.18
109	0.17
110	0.16
111	0.18
112	0.16
113	0.16
114	0.13
115	0.14
116	0.15
117	0.16
118	0.19
119	0.19
120	0.25
121	0.34
122	0.34
123	0.37
124	0.38
125	0.37
126	0.36
127	0.35
128	0.29
129	0.21
130	0.19
131	0.15
132	0.13
133	0.16
134	0.16
135	0.17
136	0.19
137	0.18
138	0.21
139	0.23
140	0.29
141	0.32
142	0.34
143	0.39
144	0.37
145	0.37
146	0.36
147	0.39
148	0.32
149	0.28
150	0.26
151	0.22
152	0.22
153	0.2
154	0.18
155	0.14
156	0.12
157	0.11
158	0.13
159	0.12
160	0.12
161	0.14
162	0.16
163	0.16
164	0.21
165	0.22
166	0.18
167	0.2
168	0.22
169	0.2
170	0.18
171	0.18
172	0.15
173	0.14
174	0.15
175	0.13
176	0.14
177	0.14
178	0.15
179	0.15
180	0.14
181	0.18
182	0.19
183	0.18
184	0.16
185	0.16
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.12
219	0.13
220	0.12
221	0.13
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.1
231	0.14
232	0.18
233	0.21
234	0.22
235	0.23
236	0.31
237	0.35
238	0.39
239	0.41
240	0.46
241	0.49
242	0.52
243	0.51
244	0.43
245	0.38
246	0.34
247	0.28
248	0.19
249	0.14
250	0.11
251	0.11
252	0.12
253	0.13
254	0.12
255	0.13
256	0.16
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.15
261	0.17
262	0.18
263	0.2
264	0.18
265	0.19
266	0.19
267	0.18
268	0.18
269	0.17
270	0.16
271	0.18
272	0.21
273	0.2
274	0.21
275	0.23
276	0.23
277	0.26
278	0.33
279	0.34
280	0.33
281	0.32
282	0.31
283	0.3
284	0.3
285	0.25
286	0.18
287	0.13
288	0.12
289	0.16
290	0.19
291	0.2
292	0.18
293	0.18
294	0.19
295	0.19
296	0.19
297	0.16
298	0.13
299	0.14
300	0.16
301	0.16
302	0.14
303	0.13
304	0.12
305	0.15
306	0.15
307	0.15
308	0.2
309	0.21
310	0.21
311	0.2
312	0.21
313	0.18
314	0.22
315	0.2
316	0.15
317	0.14
318	0.14
319	0.17
320	0.14
321	0.13
322	0.1
323	0.11
324	0.13
325	0.13
326	0.17
327	0.2
328	0.23
329	0.25
330	0.27
331	0.25
332	0.23
333	0.24
334	0.23
335	0.22
336	0.26
337	0.29
338	0.34
339	0.4
340	0.43
341	0.5
342	0.56
343	0.56
344	0.53
345	0.52
346	0.48
347	0.46
348	0.43
349	0.37
350	0.3
351	0.26
352	0.22
353	0.19
354	0.15
355	0.11
356	0.1
357	0.07
358	0.09
359	0.1
360	0.11
361	0.17
362	0.24
363	0.31
364	0.39
365	0.44
366	0.48
367	0.55
368	0.63
369	0.61
370	0.63
371	0.58
372	0.51
373	0.48
374	0.43
375	0.35
376	0.26
377	0.21
378	0.13
379	0.12
380	0.11
381	0.13
382	0.15
383	0.16
384	0.16
385	0.17
386	0.17
387	0.17
388	0.16
389	0.14
390	0.09
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.14
422	0.15
423	0.13
424	0.12
425	0.13
426	0.13
427	0.21
428	0.26
429	0.26
430	0.32
431	0.32
432	0.37
433	0.4
434	0.44
435	0.39
436	0.35
437	0.35
438	0.29
439	0.29
440	0.26
441	0.23
442	0.2
443	0.18
444	0.15
445	0.14
446	0.13
447	0.13
448	0.12
449	0.12
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.13
462	0.13
463	0.14
464	0.15
465	0.17
466	0.17
467	0.21
468	0.23
469	0.19
470	0.2
471	0.2
472	0.18
473	0.15
474	0.16
475	0.12
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.09
484	0.12
485	0.13
486	0.13
487	0.13
488	0.13
489	0.14
490	0.14
491	0.12
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.07
507	0.09
508	0.11
509	0.14
510	0.15
511	0.2
512	0.24
513	0.24
514	0.23
515	0.24
516	0.24
517	0.22
518	0.3
519	0.26
520	0.22
521	0.22
522	0.25
523	0.24
524	0.22
525	0.22
526	0.14
527	0.19
528	0.24
529	0.28
530	0.29
531	0.31
532	0.32
533	0.31
534	0.33
535	0.35
536	0.33
537	0.38
538	0.35
539	0.35
540	0.35
541	0.34
542	0.32
543	0.25
544	0.22
545	0.14
546	0.15
547	0.14
548	0.16
549	0.17
550	0.16
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.16
555	0.16
556	0.18
557	0.21
558	0.26
559	0.26
560	0.26
561	0.25
562	0.24
563	0.23
564	0.24
565	0.3
566	0.29
567	0.31
568	0.32
569	0.34
570	0.33
571	0.33
572	0.32
573	0.27
574	0.32
575	0.33
576	0.35
577	0.33
578	0.31
579	0.29
580	0.27
581	0.22
582	0.14
583	0.13
584	0.09
585	0.1
586	0.15
587	0.17
588	0.23
589	0.25
590	0.29
591	0.37
592	0.38
593	0.42
594	0.4
595	0.39
596	0.33
597	0.35
598	0.33
599	0.26
600	0.25
601	0.2
602	0.19
603	0.17
604	0.18
605	0.16
606	0.13
607	0.12
608	0.11
609	0.12
610	0.1
611	0.1
612	0.06
613	0.04
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.02
618	0.03
619	0.02
620	0.03
621	0.03
622	0.04
623	0.06
624	0.09
625	0.12
626	0.14
627	0.16
628	0.19
629	0.2
630	0.19
631	0.18
632	0.18
633	0.16
634	0.16
635	0.15
636	0.12
637	0.11
638	0.12
639	0.1
640	0.09
641	0.08
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.12
646	0.12
647	0.14
648	0.15
649	0.21
650	0.21
651	0.21
652	0.22
653	0.22
654	0.23
655	0.23
656	0.23
657	0.17
658	0.18
659	0.17
660	0.16
661	0.16
662	0.19
663	0.19
664	0.19
665	0.21
666	0.21
667	0.21
668	0.2
669	0.16
670	0.14
671	0.16
672	0.21
673	0.26
674	0.33
675	0.34
676	0.39
677	0.41
678	0.45
679	0.46
680	0.47
681	0.44
682	0.4
683	0.41
684	0.39
685	0.45
686	0.42
687	0.39
688	0.33
689	0.32
690	0.28
691	0.29
692	0.29
693	0.24
694	0.22
695	0.22
696	0.23
697	0.2
698	0.22
699	0.2
700	0.17
701	0.16
702	0.14
703	0.13
704	0.11
705	0.1
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.1
715	0.11
716	0.1
717	0.11
718	0.13
719	0.14
720	0.14
721	0.14
722	0.18
723	0.21
724	0.25
725	0.24
726	0.24
727	0.25
728	0.25
729	0.24
730	0.21
731	0.19
732	0.13
733	0.13
734	0.1
735	0.08
736	0.07
737	0.07
738	0.05
739	0.04
740	0.06
741	0.09
742	0.09
743	0.13
744	0.13
745	0.15
746	0.16
747	0.17
748	0.21
749	0.21
750	0.23
751	0.3
752	0.37
753	0.39
754	0.39
755	0.4
756	0.39
757	0.4
758	0.4
759	0.3
760	0.24
761	0.21
762	0.23
763	0.22
764	0.16
765	0.12
766	0.11
767	0.1
768	0.09
769	0.1
770	0.09
771	0.08
772	0.1
773	0.1
774	0.13
775	0.15
776	0.16
777	0.16
778	0.2
779	0.19
780	0.18
781	0.18
782	0.17
783	0.16
784	0.16
785	0.15
786	0.11
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.09
791	0.08
792	0.1
793	0.13
794	0.13
795	0.19
796	0.25
797	0.28
798	0.29
799	0.32
800	0.35
801	0.38
802	0.46
803	0.47
804	0.43
805	0.42
806	0.42
807	0.39
808	0.34
809	0.28
810	0.2
811	0.14
812	0.11
813	0.09
814	0.08
815	0.08
816	0.1
817	0.12
818	0.11
819	0.11
820	0.11
821	0.13
822	0.15
823	0.17
824	0.16
825	0.17
826	0.18
827	0.18
828	0.17
829	0.16
830	0.13
831	0.11
832	0.11
833	0.1
834	0.08
835	0.09
836	0.09
837	0.13
838	0.14
839	0.14
840	0.14
841	0.13
842	0.13
843	0.12
844	0.12
845	0.08
846	0.07
847	0.06
848	0.06
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.04
853	0.04
854	0.05
855	0.04
856	0.04
857	0.04
858	0.04
859	0.04
860	0.05
861	0.04
862	0.04
863	0.05
864	0.06
865	0.07
866	0.07
867	0.08
868	0.08
869	0.09
870	0.09
871	0.1
872	0.11
873	0.11
874	0.1
875	0.1
876	0.11
877	0.11
878	0.11
879	0.1
880	0.11
881	0.13
882	0.13
883	0.14
884	0.17
885	0.17
886	0.17
887	0.17
888	0.2
889	0.18
890	0.21
891	0.21
892	0.19
893	0.21
894	0.22
895	0.27
896	0.24
897	0.25
898	0.29
899	0.32
900	0.33
901	0.34
902	0.39
903	0.38
904	0.42
905	0.43
906	0.39
907	0.41
908	0.41
909	0.37
910	0.32
911	0.27
912	0.21
913	0.17
914	0.15
915	0.08
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.07
920	0.08
921	0.1
922	0.12
923	0.19
924	0.26
925	0.27
926	0.29
927	0.35
928	0.35
929	0.35
930	0.36
931	0.32
932	0.27
933	0.28
934	0.26
935	0.22
936	0.23
937	0.22
938	0.18
939	0.15
940	0.13
941	0.11
942	0.12
943	0.11
944	0.1
945	0.13
946	0.14
947	0.14
948	0.13
949	0.13
950	0.11
951	0.09
952	0.09
953	0.07
954	0.07
955	0.07
956	0.07
957	0.08
958	0.07
959	0.1
960	0.1
961	0.12
962	0.12
963	0.17
964	0.2
965	0.27
966	0.28
967	0.28
968	0.32
969	0.29
970	0.28
971	0.27
972	0.24
973	0.18
974	0.18
975	0.17
976	0.15
977	0.22
978	0.24
979	0.23
980	0.24
981	0.28
982	0.29
983	0.3
984	0.28
985	0.23
986	0.22
987	0.25
988	0.27
989	0.3
990	0.31
991	0.32
992	0.38
993	0.41
994	0.49
995	0.53
996	0.6
997	0.6
998	0.68
999	0.75
1000	0.78
1001	0.85
1002	0.88
1003	0.88
1004	0.89
1005	0.9
1006	0.9
1007	0.87
1008	0.86
1009	0.81
1010	0.75
1011	0.68
1012	0.61
1013	0.51
1014	0.42
1015	0.34
1016	0.27
1017	0.22
1018	0.17
1019	0.14
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.17
1023	0.2
1024	0.18
1025	0.19
1026	0.21
1027	0.31
1028	0.38
1029	0.41
1030	0.42
1031	0.48
1032	0.55
1033	0.58
1034	0.62
1035	0.58
1036	0.55
1037	0.6
1038	0.54
1039	0.48
1040	0.4
1041	0.37
1042	0.3
1043	0.24
1044	0.21
1045	0.13
1046	0.12
1047	0.13
1048	0.14
1049	0.13
1050	0.14
1051	0.21
1052	0.26
1053	0.3
1054	0.35
1055	0.33
1056	0.35
1057	0.36
1058	0.37
1059	0.33
1060	0.34
1061	0.3
1062	0.28
1063	0.29
1064	0.29
1065	0.29
1066	0.27
1067	0.26
1068	0.18
1069	0.2
1070	0.18
1071	0.19
1072	0.16
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.12
1076	0.12
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.1
1080	0.11
1081	0.11
1082	0.12
1083	0.13
1084	0.13
1085	0.13
1086	0.13
1087	0.17
1088	0.18
1089	0.19
1090	0.24
1091	0.23
1092	0.23
1093	0.25
1094	0.23
1095	0.2
1096	0.21
1097	0.2
1098	0.14
1099	0.15
1100	0.16
1101	0.19
1102	0.2
1103	0.19
1104	0.16
1105	0.16
1106	0.16
1107	0.16
1108	0.16
1109	0.12
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.12
1116	0.1
1117	0.11
1118	0.12
1119	0.13
1120	0.13
1121	0.13
1122	0.12
1123	0.1
1124	0.11
1125	0.12
1126	0.13
1127	0.15
1128	0.19
1129	0.2
1130	0.22
1131	0.23
1132	0.23
1133	0.24
1134	0.27
1135	0.28
1136	0.26
1137	0.29
1138	0.27
1139	0.28
1140	0.28
1141	0.28
1142	0.26
1143	0.27
1144	0.29
1145	0.32
1146	0.34
1147	0.36
1148	0.37
1149	0.36
1150	0.38
1151	0.37
1152	0.4
1153	0.37
1154	0.39
1155	0.36
1156	0.37
1157	0.36
1158	0.31
1159	0.28
1160	0.22
1161	0.19
1162	0.17
1163	0.16
1164	0.15
1165	0.14
1166	0.14
1167	0.14
1168	0.13
1169	0.1
1170	0.08
1171	0.09
1172	0.1
1173	0.1
1174	0.09
1175	0.09
1176	0.09
1177	0.09
1178	0.09
1179	0.09
1180	0.06
1181	0.06
1182	0.06
1183	0.06
1184	0.06
1185	0.06
1186	0.05
1187	0.05
1188	0.05
1189	0.05
1190	0.05
1191	0.05
1192	0.05
1193	0.05
1194	0.05
1195	0.05
1196	0.05
1197	0.05
1198	0.08
1199	0.08
1200	0.13
1201	0.2
1202	0.22
1203	0.25
1204	0.31
1205	0.38
1206	0.45
1207	0.53
1208	0.6
1209	0.64
1210	0.73
1211	0.81
1212	0.86
1213	0.91
1214	0.91
1215	0.91
1216	0.9
1217	0.88
1218	0.82
1219	0.76
1220	0.71
1221	0.67
1222	0.6
1223	0.52
1224	0.46
1225	0.38
1226	0.33
1227	0.27
1228	0.21
1229	0.15
1230	0.13
1231	0.12
1232	0.12
1233	0.11
1234	0.12
1235	0.12
1236	0.14
1237	0.13
1238	0.14
1239	0.14
1240	0.12
1241	0.16
1242	0.18
1243	0.21
1244	0.26
1245	0.35
1246	0.35
1247	0.41
1248	0.48
1249	0.48
1250	0.55
1251	0.54
1252	0.55
1253	0.5

A0A4Q9PND8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer