Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V2K8U6

Protein Details
Accession A0A4V2K8U6    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-30GPDAAPVVNKNKRHRKDKPWDTDDIDHydrophilic
307-332FLKAHQKEAREAKKRKEKQEEVTAERBasic
345-386EDAAPTIEEKRKRKHTREHGDNHGQDESAKKKKKKKRVEAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-283KFRKRHLKTSEKTARKNERVQEKNEARKAAGLPTLEEAKKERKEKK
314-324EAREAKKRKEK
354-382KRKRKHTREHGDNHGQDESAKKKKKKKRV
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MSAEGPDAAPVVNKNKRHRKDKPWDTDDIDQWKVDPFKPDDNKAGPFTEESSFATLFPKYREKYLREVWSAVTQALDPHGIACTLDLIHGSMAVRTTRKTYDPYIILKARDMIKLLARGVAVAQAVKILNDDVACDIIKIGNIVRNKERFVKRRQRIIGPDGSTLKAIELLTQCYVLVQGNTVSVMGPYKGLKEVRRIVLDCMKNIHPIYRIKELMIKRELAKDPQLATESWDRFLPKFRKRHLKTSEKTARKNERVQEKNEARKAAGLPTLEEAKKERKEKKVYTPFPPPQQPRKVDLQLESGEYFLKAHQKEAREAKKRKEKQEEVTAERQAKRAEAFVAPEEDAAPTIEEKRKRKHTREHGDNHGQDESAKKKKKKKRVEAEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.58
3 0.67
4 0.76
5 0.82
6 0.84
7 0.88
8 0.91
9 0.92
10 0.87
11 0.84
12 0.8
13 0.76
14 0.72
15 0.67
16 0.58
17 0.47
18 0.42
19 0.4
20 0.38
21 0.33
22 0.33
23 0.32
24 0.4
25 0.47
26 0.51
27 0.53
28 0.54
29 0.56
30 0.52
31 0.49
32 0.4
33 0.35
34 0.33
35 0.27
36 0.24
37 0.21
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.19
44 0.22
45 0.29
46 0.27
47 0.35
48 0.43
49 0.45
50 0.51
51 0.58
52 0.62
53 0.56
54 0.56
55 0.5
56 0.47
57 0.44
58 0.36
59 0.27
60 0.19
61 0.16
62 0.16
63 0.14
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.16
84 0.18
85 0.21
86 0.24
87 0.26
88 0.31
89 0.34
90 0.37
91 0.41
92 0.41
93 0.39
94 0.36
95 0.37
96 0.32
97 0.29
98 0.27
99 0.21
100 0.21
101 0.23
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.16
106 0.15
107 0.14
108 0.11
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.1
129 0.12
130 0.16
131 0.22
132 0.24
133 0.26
134 0.35
135 0.43
136 0.45
137 0.54
138 0.62
139 0.63
140 0.7
141 0.73
142 0.71
143 0.68
144 0.67
145 0.64
146 0.55
147 0.51
148 0.43
149 0.39
150 0.32
151 0.26
152 0.2
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.09
162 0.1
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.09
178 0.12
179 0.14
180 0.2
181 0.24
182 0.26
183 0.29
184 0.29
185 0.29
186 0.34
187 0.34
188 0.28
189 0.27
190 0.25
191 0.25
192 0.24
193 0.24
194 0.2
195 0.23
196 0.27
197 0.29
198 0.28
199 0.26
200 0.32
201 0.32
202 0.34
203 0.32
204 0.3
205 0.26
206 0.31
207 0.33
208 0.29
209 0.31
210 0.27
211 0.26
212 0.26
213 0.26
214 0.19
215 0.21
216 0.25
217 0.23
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.2
222 0.29
223 0.35
224 0.35
225 0.43
226 0.5
227 0.6
228 0.63
229 0.73
230 0.74
231 0.76
232 0.71
233 0.74
234 0.77
235 0.73
236 0.75
237 0.75
238 0.76
239 0.71
240 0.76
241 0.71
242 0.72
243 0.69
244 0.67
245 0.68
246 0.66
247 0.69
248 0.66
249 0.6
250 0.5
251 0.48
252 0.45
253 0.37
254 0.32
255 0.23
256 0.19
257 0.2
258 0.26
259 0.22
260 0.22
261 0.22
262 0.27
263 0.34
264 0.41
265 0.47
266 0.51
267 0.6
268 0.66
269 0.74
270 0.77
271 0.76
272 0.75
273 0.78
274 0.75
275 0.74
276 0.76
277 0.73
278 0.72
279 0.75
280 0.73
281 0.67
282 0.69
283 0.66
284 0.61
285 0.55
286 0.51
287 0.43
288 0.41
289 0.37
290 0.28
291 0.23
292 0.19
293 0.16
294 0.13
295 0.19
296 0.16
297 0.22
298 0.26
299 0.29
300 0.37
301 0.47
302 0.55
303 0.58
304 0.65
305 0.7
306 0.77
307 0.82
308 0.85
309 0.85
310 0.83
311 0.82
312 0.85
313 0.83
314 0.8
315 0.77
316 0.74
317 0.7
318 0.64
319 0.59
320 0.49
321 0.43
322 0.37
323 0.33
324 0.29
325 0.24
326 0.25
327 0.24
328 0.26
329 0.23
330 0.22
331 0.2
332 0.17
333 0.16
334 0.13
335 0.11
336 0.1
337 0.16
338 0.22
339 0.3
340 0.38
341 0.47
342 0.58
343 0.67
344 0.75
345 0.8
346 0.85
347 0.88
348 0.92
349 0.9
350 0.89
351 0.89
352 0.82
353 0.75
354 0.65
355 0.54
356 0.45
357 0.43
358 0.42
359 0.41
360 0.48
361 0.53
362 0.62
363 0.72
364 0.82
365 0.86
366 0.89