Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9NCJ3

Protein Details
Accession A0A4Q9NCJ3    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
533-560KGKGKGKAKAAPKKKAPAKKGKANESDABasic
564-620EDNQPKKAASKPKAKPKPKTKTKDDDAMDVDEDEKPKPKPKPKPKAKKDDAEEGPAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
533-555KGKGKGKAKAAPKKKAPAKKGKA
568-585PKKAASKPKAKPKPKTKT
598-624KPKPKPKPKPKAKKDDAEEGPAKKKLK
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 13.833, nucl 9, mito_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR000969  SSRP1/POB3  
IPR035417  SSRP1/POB3_N  
IPR024954  SSRP1_DD  
IPR038167  SSRP1_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF17292  POB3_N  
PF08512  Rtt106  
PF03531  SSrecog  
CDD cd13230  PH1_SSRP1-like  
cd13231  PH2_SSRP1-like  
Amino Acid Sequences MTTTQFDGIYHGLSPEVGKFRIAVSGMAWKAEEGDQMVAMQASDIKWAQWIRVARNYQLRVGLKDRSKETFDGFVREDHDRLAHLLKQHFSITLETKEVSFKGWNWGVTDFQGQELAFLVSNKTAFELPLTQVANSNIAGRTEVSLEFATQNRKPSRNAPDEMVEIRFYVPGTQTKSRGSDAGSQKSDVEEDGEEISAAQAFHDLVKEKAELGQVSGDIILSFDEVNVLTPRGRYDVDMYPDFLRLRGRTYDYKIIYSSISKLFLLPKDDLHVLFILGLSIPIRQGQTRYQYLVMQFNREEEITAELNMAEEEIAKYDRLKKNYEDPTYEVVSGVFRALSKKKIIGAGNFQSRDGHPSVKANLKAVQGDLFLLEKYVFFVSKQPTLIELSDIHQVVFSRLGTSMGANAARTFDMKIVTKSGSDLTFTSVNKEEHEVVSAYLQDKKVKTKNEMMEGELAIGVDDEDEEMQSVASSGEEVPKPRRGGDDDDSEDDEDFEASDSDSGSPTESDSDSEGGQTASDASGDRDFLQAAKGKGKGKAKAAPKKKAPAKKGKANESDAEEDEDNQPKKAASKPKAKPKPKTKTKDDDAMDVDEDEKPKPKPKPKPKAKKDDAEEGPAKKKLKTTAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.22
9 0.22
10 0.17
11 0.15
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.23
16 0.18
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.16
34 0.17
35 0.17
36 0.22
37 0.27
38 0.3
39 0.38
40 0.42
41 0.43
42 0.52
43 0.54
44 0.51
45 0.54
46 0.51
47 0.48
48 0.48
49 0.5
50 0.47
51 0.51
52 0.51
53 0.48
54 0.49
55 0.46
56 0.45
57 0.46
58 0.42
59 0.41
60 0.38
61 0.35
62 0.35
63 0.35
64 0.32
65 0.25
66 0.24
67 0.19
68 0.21
69 0.22
70 0.21
71 0.24
72 0.28
73 0.29
74 0.3
75 0.3
76 0.28
77 0.26
78 0.28
79 0.27
80 0.24
81 0.25
82 0.23
83 0.23
84 0.24
85 0.22
86 0.2
87 0.19
88 0.17
89 0.24
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.29
97 0.2
98 0.18
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.13
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.11
114 0.13
115 0.13
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.18
123 0.2
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.16
136 0.21
137 0.21
138 0.3
139 0.34
140 0.37
141 0.39
142 0.46
143 0.53
144 0.55
145 0.55
146 0.5
147 0.47
148 0.47
149 0.46
150 0.39
151 0.29
152 0.22
153 0.2
154 0.17
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.15
159 0.21
160 0.25
161 0.27
162 0.3
163 0.32
164 0.32
165 0.31
166 0.29
167 0.32
168 0.36
169 0.41
170 0.39
171 0.37
172 0.36
173 0.35
174 0.32
175 0.24
176 0.18
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.12
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.15
223 0.19
224 0.23
225 0.23
226 0.24
227 0.23
228 0.25
229 0.24
230 0.21
231 0.19
232 0.15
233 0.18
234 0.19
235 0.22
236 0.25
237 0.3
238 0.36
239 0.34
240 0.35
241 0.33
242 0.31
243 0.27
244 0.23
245 0.21
246 0.15
247 0.15
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.19
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.15
259 0.13
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.06
264 0.04
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.09
273 0.13
274 0.18
275 0.2
276 0.22
277 0.22
278 0.23
279 0.24
280 0.3
281 0.27
282 0.24
283 0.22
284 0.21
285 0.21
286 0.19
287 0.17
288 0.1
289 0.12
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.15
305 0.19
306 0.22
307 0.25
308 0.27
309 0.35
310 0.43
311 0.45
312 0.39
313 0.38
314 0.39
315 0.37
316 0.35
317 0.26
318 0.18
319 0.15
320 0.13
321 0.09
322 0.06
323 0.05
324 0.08
325 0.1
326 0.13
327 0.14
328 0.16
329 0.18
330 0.23
331 0.25
332 0.24
333 0.29
334 0.32
335 0.37
336 0.36
337 0.34
338 0.3
339 0.28
340 0.29
341 0.24
342 0.2
343 0.15
344 0.18
345 0.21
346 0.25
347 0.26
348 0.23
349 0.26
350 0.25
351 0.25
352 0.22
353 0.2
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.12
367 0.14
368 0.17
369 0.18
370 0.17
371 0.18
372 0.19
373 0.19
374 0.16
375 0.14
376 0.13
377 0.16
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.11
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.15
404 0.16
405 0.15
406 0.15
407 0.17
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.17
413 0.17
414 0.2
415 0.22
416 0.22
417 0.21
418 0.24
419 0.22
420 0.18
421 0.2
422 0.17
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.13
427 0.15
428 0.16
429 0.19
430 0.21
431 0.28
432 0.34
433 0.38
434 0.42
435 0.47
436 0.51
437 0.55
438 0.54
439 0.48
440 0.45
441 0.39
442 0.34
443 0.25
444 0.19
445 0.11
446 0.09
447 0.07
448 0.04
449 0.04
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.1
463 0.12
464 0.15
465 0.2
466 0.26
467 0.27
468 0.28
469 0.32
470 0.31
471 0.37
472 0.39
473 0.43
474 0.4
475 0.42
476 0.43
477 0.39
478 0.35
479 0.28
480 0.23
481 0.14
482 0.1
483 0.08
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.12
498 0.13
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.08
510 0.09
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.15
517 0.17
518 0.19
519 0.23
520 0.27
521 0.3
522 0.37
523 0.44
524 0.45
525 0.48
526 0.53
527 0.59
528 0.64
529 0.7
530 0.74
531 0.75
532 0.8
533 0.82
534 0.84
535 0.84
536 0.85
537 0.85
538 0.85
539 0.86
540 0.86
541 0.84
542 0.8
543 0.74
544 0.69
545 0.64
546 0.55
547 0.5
548 0.4
549 0.34
550 0.33
551 0.37
552 0.32
553 0.28
554 0.27
555 0.24
556 0.27
557 0.33
558 0.39
559 0.4
560 0.5
561 0.59
562 0.69
563 0.79
564 0.86
565 0.89
566 0.89
567 0.91
568 0.92
569 0.92
570 0.91
571 0.91
572 0.89
573 0.87
574 0.79
575 0.75
576 0.67
577 0.6
578 0.51
579 0.41
580 0.35
581 0.28
582 0.27
583 0.22
584 0.24
585 0.25
586 0.32
587 0.42
588 0.51
589 0.59
590 0.69
591 0.78
592 0.84
593 0.91
594 0.94
595 0.95
596 0.95
597 0.94
598 0.89
599 0.89
600 0.82
601 0.8
602 0.76
603 0.7
604 0.67
605 0.63
606 0.59
607 0.51
608 0.52