Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9Q9S4

Protein Details
Accession A0A4Q9Q9S4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
706-763IERERKRKEAEARKKKEEEKRKAKEEKEKRRREEEERRRKASQPKTKRKPFNFEQEKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
708-755RERKRKEAEARKKKEEEKRKAKEEKEKRRREEEERRRKASQPKTKRKP
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002314  aa-tRNA-synt_IIb  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR038425  GAT_sf  
IPR002317  Ser-tRNA-ligase_type_1  
IPR015866  Ser-tRNA-synth_1_N  
IPR042103  SerRS_1_N_sf  
IPR010978  tRNA-bd_arm  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0004828  F:serine-tRNA ligase activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0006434  P:seryl-tRNA aminoacylation  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF02403  Seryl_tRNA_N  
PF00587  tRNA-synt_2b  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MQLSYASTRWMHNACLRRSCCLSLRAYSTGPDRAATSTSLPKPRLDYRDISENVVFKSHNAFNRKAPLPVGAVQTVARLYEEQKDLSQTLNAKRHARSVFGERIRTLAQDPQKKQAVLDEAKALKAEISELEDRVAQLEDELHTLSLAIPNDTHPEVPIGPESVAVTLSTHGPEPIPASPARDHVSICRALDILDLEAGATVTGSSWYYLKNEGALLELALTNYALSIALKYGYMPVTTPDVVRADIARRCGFQPRDPVDGAASQMYHLAHTADPAALPSHGHPELVLAGTAEIPLAGMFANRILSASELPAKVVGLGHAFRAEAGARGADTRGLYRVHQFTKLELFVVSGEESSGAVMEEMRKMQAEIFEGLGLSFRVLEMPTEELGASAYRKYDAEAWMPGRGGWGEISSTSNCTDYQARRLHIRYRRQTPPSTDGSSHPAEQAQAAVPFAHTLNGTAAAVPRLIVALVENGAVFDGSGTVVSLKLPRALQPFWVGGNPRGLVQWDIPGGAPAPAPSSFPPTSICTMTSLYKQAYSAFVNEKPRSSITEWVEILTSSNYDAEAYDGIPEIVESINIQATGPAEASRAIRKKIKHGDPHAQYRALHILKALVENGGPKIQSSFNDHMLIDAIKHLAADPATDSKVKKKLTAVLAGWRRQFADDPSMQYVAKLYDQCKMAQADRISADKRAIEQVNAGIGVDPDYIERERKRKEAEARKKKEEEKRKAKEEKEKRRREEEERRRKASQPKTKRKPFNFEQEKPQILTAIANASQAASNLVNAMTLVNPQQESYESSTRVQECLVNVKQARKQIVRYIQLVENEDMIGVLIETNDRIIAAIENYDLLTKPDTTEAQVKEIQEGLAAAKLSTGELAKLQDKQRAAINRSIGRSGTSSMGPGSGDESPTSPSSPSYVHPDLQDLQFGALGSEQRGLPPPIRPTSARRSSSENDDTYRRGSLSDYSDYQSSDEDTHNRAGPSSSAQPRRGYVDVSDDDSSHDVRRDPKQSLLRDTEDPFADPFAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.55
3 0.55
4 0.55
5 0.57
6 0.57
7 0.55
8 0.52
9 0.5
10 0.46
11 0.5
12 0.48
13 0.45
14 0.43
15 0.43
16 0.42
17 0.38
18 0.32
19 0.28
20 0.26
21 0.27
22 0.25
23 0.25
24 0.28
25 0.35
26 0.42
27 0.42
28 0.43
29 0.48
30 0.55
31 0.57
32 0.53
33 0.52
34 0.49
35 0.58
36 0.56
37 0.55
38 0.5
39 0.46
40 0.41
41 0.38
42 0.32
43 0.23
44 0.29
45 0.3
46 0.34
47 0.37
48 0.39
49 0.43
50 0.52
51 0.53
52 0.49
53 0.44
54 0.41
55 0.39
56 0.4
57 0.38
58 0.29
59 0.28
60 0.26
61 0.26
62 0.22
63 0.18
64 0.15
65 0.12
66 0.13
67 0.19
68 0.22
69 0.22
70 0.23
71 0.27
72 0.26
73 0.27
74 0.29
75 0.28
76 0.35
77 0.4
78 0.45
79 0.47
80 0.48
81 0.55
82 0.52
83 0.5
84 0.46
85 0.46
86 0.5
87 0.51
88 0.54
89 0.46
90 0.47
91 0.44
92 0.41
93 0.35
94 0.33
95 0.36
96 0.41
97 0.44
98 0.49
99 0.54
100 0.53
101 0.51
102 0.49
103 0.49
104 0.42
105 0.42
106 0.41
107 0.36
108 0.37
109 0.36
110 0.3
111 0.21
112 0.18
113 0.16
114 0.1
115 0.14
116 0.16
117 0.16
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.14
142 0.16
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.13
162 0.13
163 0.15
164 0.15
165 0.19
166 0.2
167 0.24
168 0.26
169 0.25
170 0.24
171 0.25
172 0.3
173 0.29
174 0.28
175 0.25
176 0.21
177 0.2
178 0.21
179 0.18
180 0.13
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.19
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.25
238 0.33
239 0.35
240 0.35
241 0.43
242 0.42
243 0.46
244 0.45
245 0.44
246 0.37
247 0.34
248 0.29
249 0.2
250 0.16
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.17
324 0.23
325 0.23
326 0.28
327 0.27
328 0.27
329 0.3
330 0.29
331 0.25
332 0.19
333 0.17
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.07
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.11
383 0.13
384 0.14
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.18
390 0.15
391 0.13
392 0.11
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.09
398 0.08
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.16
405 0.16
406 0.24
407 0.27
408 0.28
409 0.33
410 0.36
411 0.42
412 0.45
413 0.54
414 0.54
415 0.58
416 0.65
417 0.65
418 0.67
419 0.65
420 0.62
421 0.57
422 0.52
423 0.45
424 0.39
425 0.38
426 0.34
427 0.29
428 0.24
429 0.19
430 0.16
431 0.14
432 0.13
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.02
466 0.02
467 0.02
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.08
475 0.08
476 0.12
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.18
481 0.19
482 0.17
483 0.18
484 0.16
485 0.14
486 0.16
487 0.15
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.14
507 0.14
508 0.15
509 0.17
510 0.17
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.14
515 0.15
516 0.16
517 0.15
518 0.15
519 0.14
520 0.14
521 0.13
522 0.12
523 0.13
524 0.12
525 0.13
526 0.14
527 0.18
528 0.24
529 0.25
530 0.25
531 0.24
532 0.24
533 0.26
534 0.25
535 0.28
536 0.24
537 0.28
538 0.27
539 0.26
540 0.25
541 0.21
542 0.2
543 0.13
544 0.1
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.08
574 0.14
575 0.17
576 0.2
577 0.24
578 0.26
579 0.35
580 0.43
581 0.5
582 0.53
583 0.57
584 0.63
585 0.65
586 0.72
587 0.66
588 0.59
589 0.51
590 0.44
591 0.45
592 0.36
593 0.29
594 0.2
595 0.19
596 0.17
597 0.18
598 0.16
599 0.08
600 0.08
601 0.09
602 0.1
603 0.09
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.11
608 0.12
609 0.18
610 0.2
611 0.22
612 0.24
613 0.24
614 0.22
615 0.22
616 0.2
617 0.13
618 0.1
619 0.08
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.09
628 0.1
629 0.12
630 0.13
631 0.18
632 0.25
633 0.26
634 0.28
635 0.28
636 0.34
637 0.36
638 0.41
639 0.37
640 0.39
641 0.44
642 0.45
643 0.43
644 0.37
645 0.34
646 0.29
647 0.29
648 0.23
649 0.23
650 0.21
651 0.23
652 0.25
653 0.26
654 0.24
655 0.22
656 0.21
657 0.15
658 0.16
659 0.16
660 0.15
661 0.18
662 0.2
663 0.2
664 0.23
665 0.24
666 0.22
667 0.25
668 0.25
669 0.23
670 0.23
671 0.27
672 0.24
673 0.23
674 0.24
675 0.19
676 0.19
677 0.22
678 0.21
679 0.18
680 0.18
681 0.17
682 0.17
683 0.16
684 0.14
685 0.08
686 0.07
687 0.08
688 0.07
689 0.06
690 0.05
691 0.08
692 0.09
693 0.14
694 0.18
695 0.25
696 0.29
697 0.34
698 0.39
699 0.45
700 0.54
701 0.61
702 0.68
703 0.72
704 0.76
705 0.8
706 0.82
707 0.82
708 0.82
709 0.82
710 0.81
711 0.81
712 0.82
713 0.83
714 0.85
715 0.84
716 0.85
717 0.85
718 0.85
719 0.85
720 0.87
721 0.83
722 0.84
723 0.83
724 0.83
725 0.83
726 0.83
727 0.83
728 0.82
729 0.82
730 0.76
731 0.76
732 0.76
733 0.75
734 0.75
735 0.75
736 0.77
737 0.82
738 0.88
739 0.92
740 0.89
741 0.88
742 0.84
743 0.84
744 0.83
745 0.76
746 0.76
747 0.73
748 0.68
749 0.6
750 0.53
751 0.43
752 0.32
753 0.28
754 0.2
755 0.15
756 0.12
757 0.11
758 0.11
759 0.1
760 0.1
761 0.1
762 0.11
763 0.08
764 0.07
765 0.08
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.05
771 0.06
772 0.08
773 0.09
774 0.1
775 0.1
776 0.11
777 0.12
778 0.15
779 0.2
780 0.23
781 0.23
782 0.25
783 0.3
784 0.3
785 0.3
786 0.27
787 0.23
788 0.2
789 0.27
790 0.27
791 0.29
792 0.3
793 0.36
794 0.39
795 0.42
796 0.48
797 0.44
798 0.47
799 0.48
800 0.55
801 0.53
802 0.52
803 0.51
804 0.47
805 0.46
806 0.45
807 0.37
808 0.29
809 0.24
810 0.21
811 0.16
812 0.12
813 0.09
814 0.05
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.04
819 0.05
820 0.04
821 0.04
822 0.05
823 0.05
824 0.06
825 0.06
826 0.07
827 0.07
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.08
832 0.09
833 0.1
834 0.1
835 0.11
836 0.14
837 0.15
838 0.17
839 0.24
840 0.24
841 0.27
842 0.3
843 0.29
844 0.28
845 0.28
846 0.24
847 0.17
848 0.16
849 0.12
850 0.11
851 0.11
852 0.09
853 0.08
854 0.09
855 0.08
856 0.09
857 0.09
858 0.07
859 0.09
860 0.13
861 0.15
862 0.22
863 0.25
864 0.29
865 0.3
866 0.31
867 0.36
868 0.41
869 0.43
870 0.42
871 0.47
872 0.47
873 0.49
874 0.49
875 0.43
876 0.36
877 0.33
878 0.3
879 0.25
880 0.19
881 0.18
882 0.16
883 0.16
884 0.14
885 0.12
886 0.13
887 0.12
888 0.13
889 0.12
890 0.13
891 0.15
892 0.17
893 0.18
894 0.15
895 0.14
896 0.16
897 0.17
898 0.19
899 0.24
900 0.27
901 0.28
902 0.28
903 0.32
904 0.33
905 0.32
906 0.32
907 0.24
908 0.21
909 0.2
910 0.18
911 0.14
912 0.12
913 0.12
914 0.11
915 0.13
916 0.13
917 0.13
918 0.18
919 0.2
920 0.21
921 0.26
922 0.33
923 0.35
924 0.4
925 0.41
926 0.44
927 0.52
928 0.6
929 0.58
930 0.53
931 0.56
932 0.56
933 0.62
934 0.63
935 0.56
936 0.5
937 0.5
938 0.5
939 0.45
940 0.43
941 0.34
942 0.27
943 0.25
944 0.26
945 0.27
946 0.3
947 0.3
948 0.3
949 0.32
950 0.32
951 0.3
952 0.26
953 0.22
954 0.2
955 0.21
956 0.22
957 0.24
958 0.28
959 0.31
960 0.3
961 0.29
962 0.27
963 0.25
964 0.27
965 0.33
966 0.38
967 0.43
968 0.47
969 0.5
970 0.51
971 0.55
972 0.51
973 0.44
974 0.37
975 0.37
976 0.35
977 0.37
978 0.35
979 0.29
980 0.3
981 0.3
982 0.29
983 0.24
984 0.24
985 0.22
986 0.28
987 0.37
988 0.4
989 0.42
990 0.49
991 0.55
992 0.6
993 0.65
994 0.65
995 0.61
996 0.6
997 0.6
998 0.56
999 0.49
1000 0.43
1001 0.35