Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XB22

Protein Details
Accession A0A4V1XB22    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-405SEIREREKARQERRREEERKLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-246EPPKFKHKKIPRGPPSPPPPILRSPPR
340-365QKAREERAKATRRRRSSAGSRDSRSR
386-405REKARQERRREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASIAASLAQALPKPKYTGEEEEIPAHAQQRGPRIVSAGQIDESQIVLRRTGPPPYGQRSGWRPRTQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLEMGKKGSTSNALAIQVDAEGKIKYDAIARQGHSEGRVVQSSFKDLIPLRQRAEAGEIDLSRPDAEKVSETTEKTKNALAALVSGAVAAQKPKNVNVSERKTTFVRYQPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPILRSPPRKLTAEDQEMWKIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFSEALFMADRHAREEVRQRALMQQRLAEKEKAQKEENLRMLAQKAREERAKATRRRRSSAGSRDSRSRSRSPSYSESGSDSEDSEIREREKARQERRREEERKLRQSRMGAERRIQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTTQAESMYDSRLFNQTSGFDSGINEDNPYDKPLFAAQDAISSIYRPRQNMEDDDAEAGDREMAKIQKASRFGDVLGKGTFKGTEDAEAREGPVQFEKDAGNDPFNVDKFLSEVDQSSSSKRGYGLQQEDESRQSKRARVEEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.29
4 0.34
5 0.39
6 0.4
7 0.44
8 0.43
9 0.43
10 0.43
11 0.4
12 0.35
13 0.29
14 0.27
15 0.23
16 0.24
17 0.31
18 0.35
19 0.35
20 0.34
21 0.35
22 0.35
23 0.36
24 0.35
25 0.29
26 0.25
27 0.23
28 0.23
29 0.2
30 0.18
31 0.16
32 0.17
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.23
37 0.25
38 0.31
39 0.32
40 0.35
41 0.43
42 0.49
43 0.52
44 0.47
45 0.52
46 0.56
47 0.64
48 0.67
49 0.65
50 0.62
51 0.61
52 0.68
53 0.64
54 0.58
55 0.52
56 0.44
57 0.37
58 0.35
59 0.3
60 0.22
61 0.19
62 0.15
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.19
78 0.2
79 0.21
80 0.19
81 0.19
82 0.22
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.2
87 0.18
88 0.15
89 0.14
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.13
98 0.15
99 0.19
100 0.25
101 0.26
102 0.28
103 0.3
104 0.31
105 0.28
106 0.27
107 0.24
108 0.21
109 0.23
110 0.2
111 0.22
112 0.22
113 0.25
114 0.24
115 0.22
116 0.24
117 0.21
118 0.3
119 0.34
120 0.38
121 0.36
122 0.37
123 0.38
124 0.34
125 0.37
126 0.29
127 0.22
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.18
141 0.22
142 0.23
143 0.28
144 0.32
145 0.32
146 0.32
147 0.32
148 0.27
149 0.24
150 0.23
151 0.17
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.21
166 0.22
167 0.29
168 0.37
169 0.43
170 0.47
171 0.47
172 0.48
173 0.43
174 0.45
175 0.44
176 0.4
177 0.4
178 0.36
179 0.4
180 0.45
181 0.49
182 0.47
183 0.41
184 0.39
185 0.36
186 0.4
187 0.37
188 0.34
189 0.32
190 0.33
191 0.34
192 0.37
193 0.36
194 0.36
195 0.4
196 0.42
197 0.47
198 0.51
199 0.56
200 0.51
201 0.51
202 0.47
203 0.43
204 0.4
205 0.42
206 0.45
207 0.43
208 0.43
209 0.52
210 0.56
211 0.55
212 0.61
213 0.61
214 0.63
215 0.68
216 0.77
217 0.75
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.66
224 0.58
225 0.53
226 0.49
227 0.51
228 0.52
229 0.53
230 0.52
231 0.55
232 0.56
233 0.53
234 0.51
235 0.5
236 0.49
237 0.46
238 0.42
239 0.37
240 0.35
241 0.34
242 0.32
243 0.28
244 0.21
245 0.16
246 0.18
247 0.19
248 0.28
249 0.3
250 0.38
251 0.42
252 0.48
253 0.52
254 0.49
255 0.48
256 0.42
257 0.41
258 0.35
259 0.39
260 0.34
261 0.35
262 0.37
263 0.34
264 0.3
265 0.3
266 0.29
267 0.19
268 0.18
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.13
298 0.22
299 0.26
300 0.28
301 0.29
302 0.28
303 0.34
304 0.4
305 0.41
306 0.34
307 0.31
308 0.31
309 0.35
310 0.37
311 0.31
312 0.29
313 0.33
314 0.37
315 0.38
316 0.36
317 0.36
318 0.38
319 0.45
320 0.45
321 0.39
322 0.34
323 0.32
324 0.32
325 0.3
326 0.27
327 0.24
328 0.23
329 0.25
330 0.28
331 0.29
332 0.31
333 0.38
334 0.46
335 0.5
336 0.58
337 0.63
338 0.66
339 0.69
340 0.68
341 0.65
342 0.66
343 0.67
344 0.66
345 0.65
346 0.61
347 0.64
348 0.66
349 0.64
350 0.6
351 0.55
352 0.51
353 0.5
354 0.51
355 0.5
356 0.5
357 0.49
358 0.45
359 0.41
360 0.38
361 0.33
362 0.3
363 0.24
364 0.19
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.18
372 0.19
373 0.25
374 0.34
375 0.42
376 0.51
377 0.58
378 0.66
379 0.72
380 0.78
381 0.82
382 0.78
383 0.78
384 0.78
385 0.8
386 0.81
387 0.78
388 0.74
389 0.68
390 0.67
391 0.65
392 0.65
393 0.62
394 0.56
395 0.53
396 0.54
397 0.51
398 0.49
399 0.41
400 0.32
401 0.33
402 0.37
403 0.37
404 0.37
405 0.35
406 0.39
407 0.4
408 0.41
409 0.34
410 0.27
411 0.24
412 0.19
413 0.19
414 0.16
415 0.14
416 0.12
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.13
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.17
427 0.18
428 0.21
429 0.22
430 0.21
431 0.22
432 0.26
433 0.25
434 0.19
435 0.19
436 0.17
437 0.19
438 0.21
439 0.2
440 0.16
441 0.16
442 0.18
443 0.2
444 0.19
445 0.16
446 0.13
447 0.15
448 0.16
449 0.19
450 0.17
451 0.13
452 0.14
453 0.16
454 0.18
455 0.17
456 0.19
457 0.15
458 0.17
459 0.17
460 0.18
461 0.15
462 0.14
463 0.16
464 0.2
465 0.23
466 0.22
467 0.25
468 0.27
469 0.32
470 0.35
471 0.39
472 0.35
473 0.33
474 0.33
475 0.3
476 0.25
477 0.21
478 0.16
479 0.12
480 0.09
481 0.08
482 0.12
483 0.13
484 0.15
485 0.19
486 0.23
487 0.27
488 0.32
489 0.34
490 0.34
491 0.33
492 0.32
493 0.36
494 0.33
495 0.31
496 0.28
497 0.27
498 0.23
499 0.23
500 0.22
501 0.16
502 0.17
503 0.15
504 0.19
505 0.2
506 0.23
507 0.25
508 0.24
509 0.24
510 0.25
511 0.25
512 0.21
513 0.24
514 0.23
515 0.2
516 0.22
517 0.21
518 0.2
519 0.25
520 0.26
521 0.23
522 0.22
523 0.24
524 0.28
525 0.28
526 0.28
527 0.22
528 0.2
529 0.19
530 0.2
531 0.19
532 0.15
533 0.16
534 0.17
535 0.21
536 0.22
537 0.24
538 0.26
539 0.25
540 0.25
541 0.25
542 0.27
543 0.3
544 0.39
545 0.43
546 0.45
547 0.5
548 0.52
549 0.54
550 0.54
551 0.51
552 0.43
553 0.43
554 0.42
555 0.43
556 0.47
557 0.52