Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TS02

Protein Details
Accession A0A4Q4TS02    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1098-1119QPVNGRRGRVGHPHNRKKSPRPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1103-1119RRGRVGHPHNRKKSPRP
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5.5, cyto_mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGVINPSSKMAGTTRSGAGSPSHEAPGSSRLFSKRAREIQAQEGVNSLPSYPWGGPPTSGNSTPLRENIPESPTDGFPDFVALPTPDSLPSTRRARAGTVPSRFPAGAVGNGQPNIPSVASQSSRPTPSQSPFKSPSPNLGENPDAPRSSTLLSRLRAGSMPQRSPFSQIPGTSSPFGPSVFSTWNPTGRERGNTLASIASVGSNGPSSPAQSALSKEGPGDNDVHMRTLDYLGLAETPQPARAQLATPYLPGLADFTKQANRFRSYSVNNKDKYAEEEDDEYEQTLALDYAQQLQDQLAATNAAIHNHNLAVQAFASQASVTRPRARTAGVLELQGAGSRLLRNYYPTPSRLDSSITAADLQLSDEKGFDDLPGAVAAMSLNRSNSRRDNGLLTAEEAGLEGPTSALWLGSIPTSTTTSTLTEMFKSYGPILSARVLTHKNCGFVNFERVDSAIAAKASMNGKEIFPGAGPIRINFAKPPSASNTPGPEGAFPSPSPDPFGKNQDAAASGVTASATDQSTAANGASKTPTIQPLREMTGDILQIVKSFGATDDDTFRISHSLQQAIQYNAFVDEIPPIREPTHTRVHDAPKLRDIRKRIDNQSLSQAEIENIAVDMLPEIAELSSDYLGNTVVQKLFEHCSDDLRNAMLAEIAPHMAEIGVHKNGTWAAQKIIDVCKTPHQMSLIVENLRPYTIPLFLDQYGNYVLQGCLKFGSPFNDFIFETMLSKMWEVGQGRYGARAMRACLESHHATKDQQRMLAAAIALHSVQLATNANGALLLTWFLDTCTFPQRRSVLAPQLVPYLVHLCTHKVAYLTVLKVINQKAEPEARDTILKALFFTPNDQTLEAILSDHACGATLIFKVLTTPFFDESIRAQVVENVKNVLIRIKAQPNQGYKRLMDEVGLATRSGGGGGNGGSRDHSVSRNAPGERQRPVSRQAQANAAAAQQNSQYSNQYMNPLNPTNNTGNYDMGGFAVPRNDAESAMQPFPSYGGQGPMYNANNGSMPPMNMQQLQYQQSMMSRGTPPMNYMPPMQSGFGGFNGANPSVDQYRNQNVANGSPSQPSGAPAGFGAPPGFGMPMGMGGYGYGGNMPYMQEQPVNGRRGRVGHPHNRKKSPRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.26
4 0.26
5 0.25
6 0.26
7 0.24
8 0.26
9 0.25
10 0.25
11 0.23
12 0.24
13 0.25
14 0.3
15 0.29
16 0.26
17 0.29
18 0.3
19 0.35
20 0.4
21 0.46
22 0.49
23 0.54
24 0.59
25 0.62
26 0.63
27 0.66
28 0.69
29 0.61
30 0.52
31 0.45
32 0.38
33 0.32
34 0.27
35 0.19
36 0.11
37 0.11
38 0.15
39 0.14
40 0.19
41 0.2
42 0.21
43 0.22
44 0.25
45 0.31
46 0.32
47 0.33
48 0.31
49 0.32
50 0.35
51 0.37
52 0.37
53 0.34
54 0.3
55 0.33
56 0.35
57 0.34
58 0.32
59 0.31
60 0.31
61 0.27
62 0.3
63 0.26
64 0.21
65 0.18
66 0.21
67 0.18
68 0.15
69 0.17
70 0.14
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.14
75 0.16
76 0.18
77 0.18
78 0.25
79 0.3
80 0.32
81 0.36
82 0.37
83 0.39
84 0.45
85 0.52
86 0.54
87 0.53
88 0.54
89 0.51
90 0.53
91 0.48
92 0.4
93 0.34
94 0.27
95 0.24
96 0.23
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.25
101 0.21
102 0.19
103 0.18
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.18
108 0.19
109 0.21
110 0.26
111 0.3
112 0.34
113 0.35
114 0.38
115 0.38
116 0.44
117 0.52
118 0.51
119 0.54
120 0.55
121 0.6
122 0.63
123 0.58
124 0.6
125 0.58
126 0.59
127 0.52
128 0.52
129 0.5
130 0.45
131 0.48
132 0.43
133 0.35
134 0.31
135 0.3
136 0.27
137 0.26
138 0.25
139 0.27
140 0.29
141 0.3
142 0.33
143 0.32
144 0.32
145 0.32
146 0.32
147 0.34
148 0.36
149 0.4
150 0.39
151 0.43
152 0.42
153 0.46
154 0.45
155 0.43
156 0.39
157 0.34
158 0.37
159 0.36
160 0.4
161 0.36
162 0.33
163 0.29
164 0.25
165 0.25
166 0.2
167 0.17
168 0.16
169 0.18
170 0.19
171 0.23
172 0.25
173 0.3
174 0.32
175 0.33
176 0.36
177 0.36
178 0.39
179 0.36
180 0.37
181 0.35
182 0.32
183 0.31
184 0.26
185 0.22
186 0.18
187 0.15
188 0.1
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.2
203 0.22
204 0.2
205 0.21
206 0.21
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.17
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.18
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.2
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.17
239 0.16
240 0.14
241 0.14
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.13
246 0.19
247 0.22
248 0.28
249 0.32
250 0.35
251 0.36
252 0.38
253 0.43
254 0.43
255 0.5
256 0.54
257 0.56
258 0.54
259 0.54
260 0.53
261 0.47
262 0.46
263 0.42
264 0.34
265 0.27
266 0.29
267 0.28
268 0.28
269 0.26
270 0.21
271 0.15
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.09
309 0.14
310 0.17
311 0.25
312 0.26
313 0.28
314 0.3
315 0.3
316 0.3
317 0.28
318 0.32
319 0.26
320 0.24
321 0.23
322 0.22
323 0.2
324 0.17
325 0.15
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.1
331 0.1
332 0.14
333 0.17
334 0.23
335 0.25
336 0.26
337 0.31
338 0.31
339 0.32
340 0.29
341 0.29
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.19
346 0.17
347 0.15
348 0.14
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.1
372 0.12
373 0.17
374 0.21
375 0.24
376 0.25
377 0.26
378 0.28
379 0.27
380 0.28
381 0.25
382 0.21
383 0.19
384 0.16
385 0.14
386 0.11
387 0.09
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.06
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.13
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.12
424 0.15
425 0.17
426 0.17
427 0.23
428 0.23
429 0.23
430 0.22
431 0.24
432 0.24
433 0.22
434 0.28
435 0.23
436 0.22
437 0.2
438 0.2
439 0.19
440 0.15
441 0.14
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.13
454 0.1
455 0.08
456 0.1
457 0.09
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.14
465 0.16
466 0.17
467 0.17
468 0.19
469 0.2
470 0.24
471 0.26
472 0.27
473 0.28
474 0.26
475 0.27
476 0.25
477 0.2
478 0.18
479 0.17
480 0.15
481 0.12
482 0.15
483 0.14
484 0.14
485 0.17
486 0.15
487 0.17
488 0.19
489 0.25
490 0.23
491 0.22
492 0.23
493 0.2
494 0.2
495 0.18
496 0.15
497 0.09
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.05
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.06
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.1
518 0.17
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.2
523 0.22
524 0.21
525 0.21
526 0.15
527 0.15
528 0.14
529 0.12
530 0.1
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.1
548 0.13
549 0.12
550 0.14
551 0.13
552 0.16
553 0.19
554 0.19
555 0.19
556 0.15
557 0.13
558 0.12
559 0.11
560 0.08
561 0.06
562 0.07
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.11
568 0.13
569 0.16
570 0.19
571 0.27
572 0.26
573 0.29
574 0.33
575 0.38
576 0.41
577 0.43
578 0.4
579 0.38
580 0.45
581 0.45
582 0.44
583 0.43
584 0.45
585 0.49
586 0.54
587 0.52
588 0.54
589 0.53
590 0.5
591 0.55
592 0.48
593 0.4
594 0.33
595 0.28
596 0.19
597 0.16
598 0.15
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.02
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.09
625 0.11
626 0.11
627 0.14
628 0.13
629 0.16
630 0.17
631 0.18
632 0.16
633 0.15
634 0.14
635 0.11
636 0.11
637 0.07
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.04
646 0.04
647 0.05
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.1
654 0.12
655 0.13
656 0.11
657 0.11
658 0.12
659 0.13
660 0.15
661 0.18
662 0.17
663 0.17
664 0.17
665 0.22
666 0.25
667 0.26
668 0.25
669 0.23
670 0.24
671 0.23
672 0.26
673 0.24
674 0.21
675 0.2
676 0.19
677 0.18
678 0.16
679 0.15
680 0.12
681 0.09
682 0.1
683 0.1
684 0.1
685 0.13
686 0.13
687 0.15
688 0.14
689 0.14
690 0.13
691 0.13
692 0.12
693 0.1
694 0.09
695 0.12
696 0.12
697 0.11
698 0.1
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.17
703 0.15
704 0.17
705 0.18
706 0.2
707 0.19
708 0.18
709 0.19
710 0.15
711 0.14
712 0.12
713 0.12
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.08
718 0.12
719 0.12
720 0.12
721 0.14
722 0.17
723 0.17
724 0.17
725 0.18
726 0.14
727 0.16
728 0.17
729 0.15
730 0.16
731 0.17
732 0.16
733 0.17
734 0.22
735 0.22
736 0.23
737 0.25
738 0.23
739 0.25
740 0.31
741 0.37
742 0.33
743 0.32
744 0.3
745 0.28
746 0.27
747 0.25
748 0.19
749 0.11
750 0.1
751 0.08
752 0.08
753 0.07
754 0.06
755 0.04
756 0.04
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.05
772 0.06
773 0.06
774 0.09
775 0.17
776 0.18
777 0.19
778 0.25
779 0.26
780 0.28
781 0.33
782 0.37
783 0.36
784 0.39
785 0.4
786 0.35
787 0.35
788 0.32
789 0.27
790 0.22
791 0.16
792 0.13
793 0.13
794 0.13
795 0.13
796 0.14
797 0.15
798 0.15
799 0.13
800 0.13
801 0.15
802 0.18
803 0.17
804 0.19
805 0.19
806 0.2
807 0.24
808 0.26
809 0.26
810 0.22
811 0.23
812 0.23
813 0.27
814 0.27
815 0.26
816 0.26
817 0.24
818 0.24
819 0.24
820 0.23
821 0.21
822 0.2
823 0.17
824 0.17
825 0.18
826 0.18
827 0.2
828 0.19
829 0.21
830 0.22
831 0.21
832 0.19
833 0.16
834 0.17
835 0.14
836 0.11
837 0.08
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.06
842 0.06
843 0.05
844 0.05
845 0.07
846 0.07
847 0.08
848 0.07
849 0.07
850 0.08
851 0.1
852 0.11
853 0.11
854 0.14
855 0.15
856 0.16
857 0.17
858 0.17
859 0.18
860 0.22
861 0.19
862 0.17
863 0.16
864 0.19
865 0.25
866 0.26
867 0.25
868 0.22
869 0.22
870 0.22
871 0.22
872 0.21
873 0.17
874 0.17
875 0.23
876 0.29
877 0.34
878 0.4
879 0.46
880 0.51
881 0.57
882 0.59
883 0.56
884 0.49
885 0.49
886 0.45
887 0.39
888 0.31
889 0.26
890 0.23
891 0.21
892 0.22
893 0.16
894 0.13
895 0.13
896 0.12
897 0.11
898 0.08
899 0.05
900 0.06
901 0.07
902 0.09
903 0.09
904 0.09
905 0.1
906 0.1
907 0.13
908 0.14
909 0.16
910 0.19
911 0.21
912 0.27
913 0.33
914 0.33
915 0.37
916 0.43
917 0.47
918 0.47
919 0.52
920 0.52
921 0.5
922 0.54
923 0.56
924 0.54
925 0.55
926 0.52
927 0.51
928 0.48
929 0.45
930 0.41
931 0.35
932 0.31
933 0.24
934 0.23
935 0.18
936 0.17
937 0.17
938 0.18
939 0.18
940 0.17
941 0.21
942 0.22
943 0.26
944 0.26
945 0.27
946 0.32
947 0.33
948 0.34
949 0.32
950 0.36
951 0.35
952 0.35
953 0.36
954 0.31
955 0.28
956 0.26
957 0.25
958 0.19
959 0.16
960 0.13
961 0.1
962 0.09
963 0.1
964 0.1
965 0.1
966 0.12
967 0.12
968 0.12
969 0.14
970 0.19
971 0.22
972 0.23
973 0.22
974 0.2
975 0.19
976 0.21
977 0.19
978 0.15
979 0.12
980 0.14
981 0.16
982 0.17
983 0.19
984 0.24
985 0.25
986 0.25
987 0.24
988 0.21
989 0.2
990 0.19
991 0.21
992 0.16
993 0.16
994 0.17
995 0.2
996 0.22
997 0.24
998 0.25
999 0.27
1000 0.31
1001 0.34
1002 0.32
1003 0.3
1004 0.27
1005 0.27
1006 0.28
1007 0.24
1008 0.22
1009 0.2
1010 0.23
1011 0.26
1012 0.25
1013 0.27
1014 0.31
1015 0.34
1016 0.32
1017 0.33
1018 0.31
1019 0.32
1020 0.33
1021 0.3
1022 0.24
1023 0.22
1024 0.22
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.18
1030 0.18
1031 0.17
1032 0.15
1033 0.19
1034 0.21
1035 0.23
1036 0.23
1037 0.26
1038 0.33
1039 0.38
1040 0.38
1041 0.38
1042 0.35
1043 0.38
1044 0.39
1045 0.36
1046 0.3
1047 0.28
1048 0.28
1049 0.25
1050 0.24
1051 0.22
1052 0.22
1053 0.18
1054 0.17
1055 0.14
1056 0.17
1057 0.15
1058 0.16
1059 0.14
1060 0.1
1061 0.11
1062 0.11
1063 0.11
1064 0.08
1065 0.08
1066 0.07
1067 0.08
1068 0.08
1069 0.08
1070 0.07
1071 0.06
1072 0.08
1073 0.07
1074 0.07
1075 0.06
1076 0.06
1077 0.06
1078 0.07
1079 0.09
1080 0.11
1081 0.13
1082 0.14
1083 0.15
1084 0.17
1085 0.26
1086 0.33
1087 0.38
1088 0.36
1089 0.38
1090 0.4
1091 0.44
1092 0.48
1093 0.5
1094 0.52
1095 0.57
1096 0.67
1097 0.75
1098 0.81
1099 0.87