FuNGI

A0A4Q4T3C5

Protein Details

Accession

A0A4Q4T3C5

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-292	PEGSRRSRNKAAKQNNSKED	Hydrophilic
452-471	LERKETKKPAPSQPPSDNKE	Hydrophilic
475-496	TETQTDRPKRGGRGRGRKGGGA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
96-163	EKKANKAKEAANAKSAKHTRHESQGGKTKSTAEDSKKKGKETKAEKSEKPSEKEKDKPKEPVKLLTKK
276-296	SRRSRNKAAKQNNSKEDGKGK
481-494	RPKRGGRGRGRKGG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 15.333, mito_nucl 11.832

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MVQRSNWEDAKRTMNDSALVGPPYVEIAQFQKVPTAKRRTDPRQGTIDQDPEFQAFLQALTQPTPTKEPENEPSLEETATEDTKVTTTPLVQYLKEKKANKAKEAANAKSAKHTRHESQGGKTKSTAEDSKKKGKETKAEKSEKPSEKEKDKPKEPVKLLTKKAAAQEAAEVAKSVAAQAPTNKPAEEPALPKSRRAGIAAAAKILQRDLGLSPGSAHRRARQDAAKAEAAAKSDAGKESKESKESTPAAPPAEAASSSVPPSTPTAPKSQAPEGSRRSRNKAAKQNNSKEDGKGKGGEASGAASKSTPQPTPIILKRKDSAAASAPGAAAAPATAAAPSTPTATPPTGPKASSGKAAASSKPSASASQKKGSSQPSVSAGATRAFVKHANPSQGVTDALLKQAMENFGPVTFVEIDKRKGFAYVDFGDHEGLVKAVAASPVSIAQATVQVLERKETKKPAPSQPPSDNKEKAPTETQTDRPKRGGRGRGRKGGGAQSGTAAATSEPAASSSKAAPAASGDAPRSAAPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.35
4	0.34
5	0.29
6	0.27
7	0.22
8	0.19
9	0.17
10	0.18
11	0.16
12	0.13
13	0.11
14	0.13
15	0.18
16	0.19
17	0.19
18	0.24
19	0.27
20	0.33
21	0.41
22	0.48
23	0.49
24	0.55
25	0.66
26	0.69
27	0.76
28	0.78
29	0.75
30	0.74
31	0.71
32	0.68
33	0.64
34	0.62
35	0.52
36	0.46
37	0.41
38	0.33
39	0.32
40	0.26
41	0.2
42	0.13
43	0.12
44	0.11
45	0.12
46	0.12
47	0.13
48	0.16
49	0.16
50	0.19
51	0.23
52	0.24
53	0.28
54	0.31
55	0.36
56	0.4
57	0.43
58	0.42
59	0.39
60	0.4
61	0.36
62	0.32
63	0.25
64	0.21
65	0.19
66	0.18
67	0.17
68	0.13
69	0.12
70	0.13
71	0.13
72	0.12
73	0.1
74	0.11
75	0.13
76	0.19
77	0.21
78	0.22
79	0.3
80	0.37
81	0.45
82	0.52
83	0.53
84	0.55
85	0.63
86	0.69
87	0.66
88	0.66
89	0.62
90	0.63
91	0.67
92	0.6
93	0.58
94	0.55
95	0.5
96	0.51
97	0.52
98	0.46
99	0.45
100	0.49
101	0.45
102	0.5
103	0.58
104	0.53
105	0.57
106	0.63
107	0.59
108	0.55
109	0.51
110	0.46
111	0.39
112	0.41
113	0.4
114	0.38
115	0.45
116	0.49
117	0.59
118	0.59
119	0.62
120	0.64
121	0.63
122	0.65
123	0.65
124	0.69
125	0.7
126	0.74
127	0.72
128	0.73
129	0.76
130	0.73
131	0.68
132	0.66
133	0.64
134	0.64
135	0.69
136	0.71
137	0.71
138	0.7
139	0.75
140	0.73
141	0.75
142	0.71
143	0.71
144	0.71
145	0.7
146	0.67
147	0.64
148	0.59
149	0.53
150	0.53
151	0.47
152	0.38
153	0.29
154	0.27
155	0.23
156	0.2
157	0.17
158	0.14
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.08
165	0.09
166	0.13
167	0.18
168	0.2
169	0.21
170	0.21
171	0.19
172	0.2
173	0.22
174	0.21
175	0.19
176	0.22
177	0.31
178	0.31
179	0.32
180	0.34
181	0.34
182	0.32
183	0.32
184	0.27
185	0.23
186	0.29
187	0.28
188	0.26
189	0.23
190	0.22
191	0.2
192	0.19
193	0.14
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.14
202	0.17
203	0.19
204	0.21
205	0.24
206	0.29
207	0.31
208	0.36
209	0.36
210	0.38
211	0.38
212	0.4
213	0.36
214	0.31
215	0.3
216	0.26
217	0.22
218	0.17
219	0.14
220	0.1
221	0.1
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.18
227	0.2
228	0.22
229	0.23
230	0.22
231	0.29
232	0.3
233	0.29
234	0.27
235	0.27
236	0.25
237	0.23
238	0.22
239	0.15
240	0.13
241	0.12
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.08
249	0.1
250	0.12
251	0.13
252	0.15
253	0.19
254	0.21
255	0.24
256	0.26
257	0.28
258	0.3
259	0.3
260	0.35
261	0.37
262	0.43
263	0.49
264	0.49
265	0.53
266	0.56
267	0.62
268	0.64
269	0.68
270	0.69
271	0.72
272	0.78
273	0.8
274	0.76
275	0.74
276	0.66
277	0.58
278	0.53
279	0.45
280	0.37
281	0.3
282	0.25
283	0.22
284	0.21
285	0.18
286	0.14
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.07
292	0.08
293	0.12
294	0.14
295	0.14
296	0.14
297	0.15
298	0.17
299	0.24
300	0.3
301	0.35
302	0.35
303	0.38
304	0.38
305	0.38
306	0.39
307	0.32
308	0.29
309	0.23
310	0.23
311	0.19
312	0.19
313	0.17
314	0.14
315	0.13
316	0.1
317	0.06
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.05
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.12
331	0.13
332	0.14
333	0.16
334	0.22
335	0.21
336	0.22
337	0.24
338	0.26
339	0.26
340	0.28
341	0.27
342	0.22
343	0.25
344	0.27
345	0.25
346	0.25
347	0.25
348	0.22
349	0.23
350	0.23
351	0.22
352	0.27
353	0.34
354	0.35
355	0.4
356	0.42
357	0.41
358	0.46
359	0.48
360	0.47
361	0.39
362	0.37
363	0.34
364	0.35
365	0.33
366	0.28
367	0.24
368	0.2
369	0.19
370	0.17
371	0.14
372	0.13
373	0.14
374	0.15
375	0.22
376	0.25
377	0.29
378	0.29
379	0.3
380	0.3
381	0.29
382	0.28
383	0.2
384	0.2
385	0.15
386	0.15
387	0.14
388	0.13
389	0.12
390	0.14
391	0.15
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.11
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.11
401	0.16
402	0.19
403	0.23
404	0.24
405	0.25
406	0.22
407	0.24
408	0.24
409	0.21
410	0.24
411	0.22
412	0.23
413	0.23
414	0.24
415	0.22
416	0.21
417	0.19
418	0.12
419	0.1
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.07
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.13
437	0.16
438	0.17
439	0.2
440	0.26
441	0.27
442	0.33
443	0.39
444	0.43
445	0.49
446	0.57
447	0.64
448	0.69
449	0.74
450	0.77
451	0.78
452	0.81
453	0.77
454	0.78
455	0.72
456	0.64
457	0.65
458	0.59
459	0.54
460	0.51
461	0.49
462	0.48
463	0.5
464	0.55
465	0.57
466	0.62
467	0.61
468	0.63
469	0.65
470	0.67
471	0.71
472	0.73
473	0.73
474	0.76
475	0.81
476	0.83
477	0.8
478	0.75
479	0.71
480	0.69
481	0.64
482	0.55
483	0.46
484	0.38
485	0.36
486	0.31
487	0.25
488	0.17
489	0.11
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.08
494	0.09
495	0.11
496	0.12
497	0.14
498	0.15
499	0.18
500	0.19
501	0.19
502	0.18
503	0.18
504	0.22
505	0.23
506	0.25
507	0.23
508	0.22
509	0.23

A0A4Q4T3C5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer