Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TGC1

Protein Details
Accession A0A4Q4TGC1    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-417EQELEEKLRRQKEERKKRLNQGHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-218PVGKKDREPAKA
305-315ARNGKPQPPLR
400-417KLRRQKEERKKRLNQGHR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MPIGDLLAEISGERPSPVANTPPPSGIKRKADELNGDPTKVAKARHTDVSTSKITRDLQGSAIGPSRSDSCTAAKTVYTGTSARRRSPQPHQTSSPFTNGRSSKPTATNGQHTSGSVVNGRPAPSSASSSAQRKPASDVASRPKLNPPSLSASKMPPAKPSPTTPTASDPGKAPKKGSFAEIMARGAKAQQVMGKVGVIQHKAIEKPVGKKDREPAKAGVKTPTGKPYLGNARPGVMPSRDGTRPAGQGANAQRNGVGKDGKQRPGTSGGDVQEKKVKKSATATTGYTGTARPKPGASSSKSSSARNGKPQPPLRAGGLLGPPKSSRRSREDDYDEDLDDFIEYDDEDEPDPRGRGYGYGYDSDGSSDMEAGLSDIDEEEARATREAIQEDKREQELEEKLRRQKEERKKRLNQGHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.12
4 0.15
5 0.21
6 0.26
7 0.31
8 0.33
9 0.38
10 0.42
11 0.44
12 0.49
13 0.51
14 0.53
15 0.52
16 0.57
17 0.59
18 0.6
19 0.61
20 0.57
21 0.58
22 0.52
23 0.49
24 0.42
25 0.37
26 0.37
27 0.33
28 0.31
29 0.27
30 0.32
31 0.36
32 0.44
33 0.46
34 0.46
35 0.46
36 0.5
37 0.49
38 0.44
39 0.41
40 0.37
41 0.36
42 0.35
43 0.34
44 0.3
45 0.26
46 0.28
47 0.27
48 0.24
49 0.27
50 0.23
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.18
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.21
68 0.29
69 0.32
70 0.36
71 0.42
72 0.46
73 0.51
74 0.6
75 0.64
76 0.65
77 0.68
78 0.7
79 0.68
80 0.69
81 0.65
82 0.63
83 0.54
84 0.46
85 0.47
86 0.43
87 0.42
88 0.41
89 0.41
90 0.39
91 0.41
92 0.44
93 0.44
94 0.46
95 0.5
96 0.47
97 0.46
98 0.41
99 0.36
100 0.34
101 0.28
102 0.24
103 0.19
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.16
112 0.2
113 0.18
114 0.2
115 0.24
116 0.28
117 0.31
118 0.35
119 0.34
120 0.31
121 0.34
122 0.35
123 0.35
124 0.34
125 0.37
126 0.39
127 0.46
128 0.46
129 0.44
130 0.46
131 0.47
132 0.46
133 0.41
134 0.37
135 0.36
136 0.38
137 0.39
138 0.34
139 0.31
140 0.34
141 0.37
142 0.34
143 0.32
144 0.33
145 0.34
146 0.35
147 0.37
148 0.38
149 0.37
150 0.39
151 0.35
152 0.36
153 0.35
154 0.33
155 0.3
156 0.25
157 0.3
158 0.34
159 0.33
160 0.31
161 0.31
162 0.34
163 0.34
164 0.34
165 0.27
166 0.22
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.13
174 0.13
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.12
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.17
192 0.17
193 0.22
194 0.3
195 0.36
196 0.35
197 0.38
198 0.45
199 0.5
200 0.5
201 0.48
202 0.45
203 0.46
204 0.49
205 0.48
206 0.43
207 0.37
208 0.36
209 0.35
210 0.35
211 0.29
212 0.25
213 0.24
214 0.26
215 0.32
216 0.32
217 0.34
218 0.29
219 0.28
220 0.28
221 0.28
222 0.25
223 0.16
224 0.15
225 0.12
226 0.17
227 0.16
228 0.17
229 0.2
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.21
234 0.17
235 0.22
236 0.25
237 0.3
238 0.27
239 0.26
240 0.26
241 0.26
242 0.27
243 0.24
244 0.2
245 0.14
246 0.24
247 0.31
248 0.36
249 0.37
250 0.37
251 0.37
252 0.42
253 0.41
254 0.34
255 0.32
256 0.28
257 0.33
258 0.33
259 0.32
260 0.33
261 0.33
262 0.32
263 0.32
264 0.31
265 0.25
266 0.31
267 0.36
268 0.35
269 0.37
270 0.37
271 0.34
272 0.34
273 0.31
274 0.26
275 0.21
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.2
280 0.2
281 0.22
282 0.28
283 0.33
284 0.32
285 0.35
286 0.37
287 0.44
288 0.46
289 0.45
290 0.47
291 0.5
292 0.51
293 0.54
294 0.6
295 0.57
296 0.65
297 0.71
298 0.7
299 0.65
300 0.62
301 0.54
302 0.46
303 0.41
304 0.35
305 0.34
306 0.31
307 0.27
308 0.26
309 0.26
310 0.28
311 0.34
312 0.36
313 0.37
314 0.4
315 0.48
316 0.51
317 0.6
318 0.63
319 0.6
320 0.6
321 0.55
322 0.49
323 0.41
324 0.36
325 0.26
326 0.19
327 0.15
328 0.09
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.14
338 0.15
339 0.13
340 0.14
341 0.13
342 0.14
343 0.17
344 0.22
345 0.22
346 0.23
347 0.24
348 0.24
349 0.23
350 0.23
351 0.19
352 0.14
353 0.11
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.15
372 0.2
373 0.22
374 0.27
375 0.33
376 0.37
377 0.4
378 0.44
379 0.42
380 0.39
381 0.37
382 0.38
383 0.4
384 0.44
385 0.49
386 0.53
387 0.59
388 0.65
389 0.7
390 0.71
391 0.73
392 0.75
393 0.77
394 0.8
395 0.83
396 0.85
397 0.91