Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XF48

Protein Details
Accession A0A4V1XF48    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MTRTKRRWKLQKNKPKVKALHAAEHydrophilic
49-71DEIIAKKSKKAKKMSKEQPSEDTHydrophilic
106-129TEESSNKPSKKRRKSKTTTASTPAHydrophilic
273-292NTGHRRDKIRAKNAKLNEERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-17KRRWKLQKNKPKV
54-62KKSKKAKKM
112-121KPSKKRRKSK
238-250QGRGGKGGKGQKG
275-311GHRRDKIRAKNAKLNEERARRAAAEAQERAAKKQKKQ
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTRTKRRWKLQKNKPKVKALHAAEGDEATTKPQVIQEEDVETAEAADGDEIIAKKSKKAKKMSKEQPSEDTEPTESSTQDAGSSRKKRKHEDNDAAEYHAPQQAATEESSNKPSKKRRKSKTTTASTPAAATSTDGAEEANAEDAAEDADPDAISKKNSRFIVFVGNLPYSATQADIASHFAAVHPTSIRLLHSRTDPRKSRGIAFVEFARYDHMKTCLKTLHHSTMRVGAAAPDGKQGRGGKGGKGQKGQGEEGRFEERKINVELTAGGGGNTGHRRDKIRAKNAKLNEERARRAAAEAQERAAKKQKKQNGDAGKDEGESKEEADIHPSRRAQVLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.88
4 0.85
5 0.84
6 0.78
7 0.76
8 0.67
9 0.59
10 0.5
11 0.44
12 0.36
13 0.27
14 0.21
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.14
20 0.17
21 0.19
22 0.23
23 0.23
24 0.24
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.18
29 0.14
30 0.11
31 0.09
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.07
37 0.07
38 0.09
39 0.14
40 0.14
41 0.2
42 0.3
43 0.37
44 0.43
45 0.54
46 0.63
47 0.68
48 0.79
49 0.84
50 0.85
51 0.87
52 0.83
53 0.79
54 0.76
55 0.7
56 0.61
57 0.53
58 0.44
59 0.36
60 0.33
61 0.28
62 0.2
63 0.17
64 0.16
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.17
69 0.25
70 0.34
71 0.41
72 0.48
73 0.55
74 0.61
75 0.7
76 0.77
77 0.78
78 0.8
79 0.79
80 0.79
81 0.73
82 0.67
83 0.56
84 0.46
85 0.37
86 0.29
87 0.2
88 0.13
89 0.13
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.12
95 0.14
96 0.21
97 0.25
98 0.26
99 0.32
100 0.42
101 0.5
102 0.6
103 0.68
104 0.73
105 0.79
106 0.85
107 0.89
108 0.9
109 0.88
110 0.83
111 0.78
112 0.69
113 0.58
114 0.5
115 0.39
116 0.29
117 0.2
118 0.14
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.11
143 0.13
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.22
149 0.28
150 0.25
151 0.25
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.18
181 0.27
182 0.32
183 0.4
184 0.45
185 0.47
186 0.52
187 0.52
188 0.49
189 0.47
190 0.46
191 0.38
192 0.34
193 0.32
194 0.28
195 0.26
196 0.22
197 0.19
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.24
205 0.25
206 0.26
207 0.3
208 0.34
209 0.39
210 0.39
211 0.4
212 0.38
213 0.39
214 0.38
215 0.33
216 0.27
217 0.18
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.2
225 0.21
226 0.2
227 0.27
228 0.28
229 0.26
230 0.34
231 0.41
232 0.41
233 0.43
234 0.43
235 0.39
236 0.41
237 0.41
238 0.38
239 0.34
240 0.3
241 0.31
242 0.35
243 0.32
244 0.3
245 0.32
246 0.28
247 0.29
248 0.3
249 0.28
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.17
254 0.17
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.12
260 0.15
261 0.16
262 0.18
263 0.22
264 0.26
265 0.33
266 0.44
267 0.5
268 0.57
269 0.65
270 0.69
271 0.75
272 0.78
273 0.81
274 0.77
275 0.75
276 0.74
277 0.72
278 0.69
279 0.63
280 0.59
281 0.49
282 0.46
283 0.43
284 0.41
285 0.41
286 0.38
287 0.37
288 0.41
289 0.41
290 0.43
291 0.47
292 0.47
293 0.48
294 0.56
295 0.62
296 0.66
297 0.72
298 0.76
299 0.77
300 0.77
301 0.73
302 0.69
303 0.62
304 0.53
305 0.48
306 0.39
307 0.3
308 0.24
309 0.2
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.22
314 0.27
315 0.28
316 0.35
317 0.35
318 0.34