Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Q4UAR0

Protein Details
Accession A0A4Q4UAR0    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30REDKYQQKTRSSKSSRSTNVHydrophilic
68-104ETKPGRWSTKKPDPLDPPKRQKNKPPKGVARSNPDDSHydrophilic
106-132SSSSDSSGGPPKKKKNRHSSPSSSSSSHydrophilic
381-405KDCPEPQKDKNGKGKKGKRGQNSGQBasic
1024-1062RSLPQPVQKRLRHRQDQETKQIKPRRGRPKKTVPELYTLHydrophilic
1131-1150NLSLRYRKLDEKHPHKKYNDBasic
1198-1225SALKWVTKTQMTRRKRHIRLEYHYVRQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-95GRWSTKKPDPLDPPKRQKNKPPKG
115-122PPKKKKNR
337-357NKKKNNGRSANARKGKGNTRD
390-399KNGKGKKGKR
1043-1054KQIKPRRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd09272  RNase_HI_RT_Ty1  
Amino Acid Sequences MSGIRRDVRAREDKYQQKTRSSKSSRSTNVQPKALESAPPEVKAGGSKEVLIALESDVEEINPLREGETKPGRWSTKKPDPLDPPKRQKNKPPKGVARSNPDDSDSSSSDSSGGPPKKKKNRHSSPSSSSSSSDSFSESGLGLKDSKKSSDEDSKLRWKRFDFSLDKENHLAGWANWELWSNALSLTMEEIGYVDGMKLGQLDQLRLAKAITKTCKRAPLELITGIKKGTKMLRTFRRTYAATGKSRQRSLWKELNKVTYDGGDPVQFTTKFQKLLREVKGCGMRLGTEEQITMFLTAVEDRAGSWCKTIQSVLRQTDYSFQQLIDDFNSEFHDRSNKKKNNGRSANARKGKGNTRDGKPAWNKDGQPLCFNCGKYGHMAKDCPEPQKDKNGKGKKGKRGQNSGQGNNSGNSSQNNRSNSSRNTHSGGQSEEQFIPEGLRDLYRLDGKTFSAHIEDQQLQDLMRWYDKMIQKADTTVASVLESAEAAEATEAVAADCTNCTEIKSPKSPELQAIQSPEPQGTDYPELRLQATESPGPQAIKRPEVTKADCVKPQVADCPKATKATVMGSAMLLHVHSSMENDRDKLLWDLGANVNITNNIGDFERDSILDIRSKGIHIMTGGGPVAATSIGIVKWPLRGPHGENNEVTVKYTLHISDFPLKGYGLGGPFGEKDSGASDLRVTLLGALRDGKVFMTDEVMKKIILWHRRLCHPSTKRLIWTIKRFTGIDLDPSDVKSLPCTACDEGKIRKIPSTNPQRRATYVGEIIWCDVGAVKPVSIENNGYFGLITDDLSRYREYYSFRTKDEVQESLCTYITRIIKRLETLPPDTEGKKRMVQILRLDGGKEFGVTKIENFCAVEGIELIISSAYNQYQNGVAERGIQFLQDEARATTAQMRIPTCFWDLVMEVTTHTVNRTGQSIVRDMTPIECFEDAFESDPRRSHRPDNSHLRIFGSRCTVLIDKNYRTRSEKLAARGAKGVLLGYQGTHNYKVWLLEGGKLLTTPHVTIYKDLEEPGQPPSPKDIIRSLPQPVQKRLRHRQDQETKQIKPRRGRPKKTVPELYTLEAPDEAPELMHELKLALTQKGDDLDNSVNPYPYPFHFHPLLTDVDDEDGYRLHREYIKRLPRYLNGTTNLSLRYRKLDEKHPHKKYNDLSLFGAMDTNFADRAGTAAAEAAGIRNFLTELKLMPKGPIPILEDNTSALKWVTKTQMTRRKRHIRLEYHYVRQEVQEGNISFQYVKSKDNPADGLTKPLDRADFERFVANLGLKRIQND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.79
3 0.75
4 0.76
5 0.79
6 0.78
7 0.79
8 0.78
9 0.77
10 0.76
11 0.81
12 0.78
13 0.77
14 0.8
15 0.79
16 0.79
17 0.76
18 0.68
19 0.6
20 0.59
21 0.52
22 0.46
23 0.39
24 0.39
25 0.37
26 0.37
27 0.35
28 0.29
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.24
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.21
37 0.2
38 0.16
39 0.14
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.16
53 0.18
54 0.26
55 0.35
56 0.37
57 0.41
58 0.49
59 0.55
60 0.56
61 0.63
62 0.64
63 0.66
64 0.72
65 0.71
66 0.73
67 0.76
68 0.81
69 0.83
70 0.84
71 0.84
72 0.85
73 0.91
74 0.89
75 0.9
76 0.9
77 0.9
78 0.9
79 0.9
80 0.89
81 0.89
82 0.91
83 0.89
84 0.87
85 0.83
86 0.78
87 0.69
88 0.61
89 0.53
90 0.46
91 0.44
92 0.36
93 0.32
94 0.27
95 0.25
96 0.23
97 0.22
98 0.22
99 0.26
100 0.31
101 0.36
102 0.45
103 0.55
104 0.65
105 0.75
106 0.82
107 0.84
108 0.88
109 0.9
110 0.91
111 0.9
112 0.88
113 0.85
114 0.8
115 0.71
116 0.61
117 0.55
118 0.46
119 0.38
120 0.3
121 0.25
122 0.2
123 0.18
124 0.18
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.15
131 0.21
132 0.22
133 0.25
134 0.25
135 0.27
136 0.33
137 0.4
138 0.44
139 0.45
140 0.51
141 0.59
142 0.65
143 0.67
144 0.66
145 0.59
146 0.59
147 0.58
148 0.6
149 0.55
150 0.53
151 0.58
152 0.55
153 0.56
154 0.52
155 0.46
156 0.36
157 0.31
158 0.26
159 0.17
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.16
164 0.17
165 0.15
166 0.14
167 0.15
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.15
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.21
196 0.24
197 0.31
198 0.36
199 0.4
200 0.46
201 0.5
202 0.59
203 0.56
204 0.58
205 0.56
206 0.53
207 0.51
208 0.5
209 0.5
210 0.44
211 0.42
212 0.37
213 0.33
214 0.26
215 0.25
216 0.26
217 0.29
218 0.33
219 0.42
220 0.52
221 0.58
222 0.62
223 0.63
224 0.63
225 0.57
226 0.56
227 0.56
228 0.54
229 0.53
230 0.56
231 0.6
232 0.6
233 0.61
234 0.59
235 0.59
236 0.57
237 0.59
238 0.61
239 0.59
240 0.61
241 0.64
242 0.67
243 0.6
244 0.54
245 0.47
246 0.39
247 0.33
248 0.27
249 0.23
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.19
254 0.17
255 0.18
256 0.24
257 0.26
258 0.3
259 0.31
260 0.38
261 0.4
262 0.48
263 0.55
264 0.52
265 0.5
266 0.53
267 0.58
268 0.5
269 0.44
270 0.36
271 0.28
272 0.25
273 0.27
274 0.22
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.12
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.09
290 0.12
291 0.11
292 0.13
293 0.15
294 0.15
295 0.17
296 0.19
297 0.21
298 0.27
299 0.35
300 0.37
301 0.37
302 0.37
303 0.37
304 0.4
305 0.37
306 0.32
307 0.25
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.16
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.23
321 0.23
322 0.32
323 0.42
324 0.46
325 0.54
326 0.61
327 0.7
328 0.71
329 0.77
330 0.75
331 0.75
332 0.78
333 0.8
334 0.8
335 0.72
336 0.65
337 0.63
338 0.66
339 0.64
340 0.63
341 0.61
342 0.58
343 0.65
344 0.62
345 0.65
346 0.64
347 0.62
348 0.58
349 0.56
350 0.52
351 0.51
352 0.58
353 0.5
354 0.48
355 0.42
356 0.41
357 0.39
358 0.39
359 0.33
360 0.27
361 0.26
362 0.25
363 0.29
364 0.3
365 0.29
366 0.3
367 0.3
368 0.38
369 0.41
370 0.4
371 0.39
372 0.4
373 0.39
374 0.49
375 0.54
376 0.53
377 0.6
378 0.64
379 0.69
380 0.74
381 0.8
382 0.8
383 0.83
384 0.82
385 0.81
386 0.81
387 0.78
388 0.77
389 0.77
390 0.71
391 0.65
392 0.6
393 0.52
394 0.43
395 0.38
396 0.28
397 0.21
398 0.19
399 0.21
400 0.23
401 0.28
402 0.3
403 0.32
404 0.35
405 0.4
406 0.42
407 0.42
408 0.41
409 0.39
410 0.4
411 0.4
412 0.39
413 0.35
414 0.34
415 0.31
416 0.27
417 0.27
418 0.23
419 0.2
420 0.18
421 0.16
422 0.13
423 0.11
424 0.11
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.1
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.17
442 0.18
443 0.17
444 0.17
445 0.17
446 0.14
447 0.15
448 0.16
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.18
454 0.21
455 0.24
456 0.24
457 0.25
458 0.25
459 0.26
460 0.26
461 0.19
462 0.17
463 0.13
464 0.11
465 0.09
466 0.09
467 0.07
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.11
489 0.15
490 0.2
491 0.26
492 0.28
493 0.32
494 0.36
495 0.36
496 0.35
497 0.35
498 0.33
499 0.29
500 0.31
501 0.27
502 0.25
503 0.25
504 0.21
505 0.18
506 0.16
507 0.14
508 0.12
509 0.15
510 0.14
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.17
515 0.17
516 0.15
517 0.13
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.13
522 0.15
523 0.15
524 0.15
525 0.19
526 0.2
527 0.22
528 0.23
529 0.24
530 0.27
531 0.32
532 0.34
533 0.35
534 0.38
535 0.37
536 0.38
537 0.38
538 0.35
539 0.31
540 0.29
541 0.28
542 0.27
543 0.27
544 0.26
545 0.28
546 0.28
547 0.28
548 0.27
549 0.2
550 0.18
551 0.16
552 0.17
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.06
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.07
566 0.1
567 0.11
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.13
573 0.12
574 0.09
575 0.08
576 0.1
577 0.1
578 0.12
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.06
585 0.05
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.09
603 0.09
604 0.07
605 0.08
606 0.07
607 0.08
608 0.08
609 0.06
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.03
614 0.03
615 0.02
616 0.03
617 0.03
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.07
622 0.08
623 0.09
624 0.1
625 0.13
626 0.17
627 0.24
628 0.28
629 0.28
630 0.27
631 0.29
632 0.29
633 0.27
634 0.24
635 0.17
636 0.13
637 0.11
638 0.12
639 0.09
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.16
644 0.16
645 0.16
646 0.16
647 0.16
648 0.15
649 0.14
650 0.13
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.07
669 0.05
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.08
677 0.07
678 0.06
679 0.07
680 0.06
681 0.08
682 0.11
683 0.12
684 0.13
685 0.14
686 0.13
687 0.12
688 0.17
689 0.19
690 0.23
691 0.27
692 0.31
693 0.34
694 0.41
695 0.44
696 0.43
697 0.48
698 0.46
699 0.5
700 0.51
701 0.5
702 0.46
703 0.49
704 0.53
705 0.51
706 0.55
707 0.52
708 0.48
709 0.47
710 0.45
711 0.39
712 0.37
713 0.3
714 0.25
715 0.2
716 0.19
717 0.17
718 0.17
719 0.18
720 0.13
721 0.13
722 0.1
723 0.13
724 0.11
725 0.12
726 0.15
727 0.15
728 0.15
729 0.18
730 0.2
731 0.2
732 0.26
733 0.29
734 0.27
735 0.28
736 0.29
737 0.31
738 0.37
739 0.45
740 0.48
741 0.52
742 0.57
743 0.56
744 0.56
745 0.57
746 0.5
747 0.42
748 0.35
749 0.28
750 0.24
751 0.22
752 0.2
753 0.15
754 0.12
755 0.08
756 0.07
757 0.05
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.07
762 0.07
763 0.09
764 0.09
765 0.11
766 0.09
767 0.11
768 0.11
769 0.1
770 0.1
771 0.09
772 0.1
773 0.08
774 0.08
775 0.07
776 0.08
777 0.09
778 0.11
779 0.11
780 0.1
781 0.11
782 0.14
783 0.16
784 0.23
785 0.32
786 0.33
787 0.34
788 0.37
789 0.38
790 0.41
791 0.41
792 0.36
793 0.28
794 0.28
795 0.28
796 0.25
797 0.24
798 0.18
799 0.15
800 0.18
801 0.21
802 0.2
803 0.22
804 0.22
805 0.23
806 0.25
807 0.28
808 0.28
809 0.28
810 0.3
811 0.28
812 0.29
813 0.3
814 0.31
815 0.31
816 0.28
817 0.27
818 0.27
819 0.28
820 0.33
821 0.33
822 0.37
823 0.38
824 0.41
825 0.4
826 0.36
827 0.35
828 0.27
829 0.25
830 0.2
831 0.15
832 0.1
833 0.08
834 0.1
835 0.1
836 0.11
837 0.13
838 0.13
839 0.14
840 0.13
841 0.13
842 0.11
843 0.11
844 0.1
845 0.07
846 0.06
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.04
851 0.04
852 0.04
853 0.05
854 0.06
855 0.07
856 0.07
857 0.08
858 0.1
859 0.1
860 0.11
861 0.11
862 0.11
863 0.14
864 0.14
865 0.16
866 0.14
867 0.13
868 0.12
869 0.11
870 0.13
871 0.09
872 0.1
873 0.08
874 0.1
875 0.1
876 0.1
877 0.14
878 0.15
879 0.17
880 0.2
881 0.2
882 0.2
883 0.21
884 0.23
885 0.21
886 0.18
887 0.16
888 0.14
889 0.13
890 0.13
891 0.13
892 0.1
893 0.09
894 0.1
895 0.1
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.1
900 0.11
901 0.13
902 0.13
903 0.15
904 0.17
905 0.19
906 0.18
907 0.18
908 0.17
909 0.16
910 0.17
911 0.15
912 0.14
913 0.13
914 0.12
915 0.12
916 0.12
917 0.13
918 0.12
919 0.13
920 0.15
921 0.16
922 0.17
923 0.21
924 0.25
925 0.28
926 0.32
927 0.38
928 0.44
929 0.5
930 0.58
931 0.65
932 0.69
933 0.67
934 0.64
935 0.59
936 0.55
937 0.47
938 0.41
939 0.36
940 0.28
941 0.24
942 0.27
943 0.25
944 0.22
945 0.29
946 0.33
947 0.33
948 0.41
949 0.44
950 0.44
951 0.48
952 0.49
953 0.48
954 0.48
955 0.48
956 0.46
957 0.51
958 0.49
959 0.46
960 0.46
961 0.4
962 0.33
963 0.28
964 0.22
965 0.14
966 0.13
967 0.11
968 0.09
969 0.1
970 0.12
971 0.14
972 0.16
973 0.16
974 0.16
975 0.17
976 0.17
977 0.16
978 0.18
979 0.17
980 0.18
981 0.2
982 0.19
983 0.18
984 0.18
985 0.17
986 0.14
987 0.15
988 0.12
989 0.13
990 0.16
991 0.17
992 0.19
993 0.22
994 0.23
995 0.22
996 0.23
997 0.21
998 0.19
999 0.2
1000 0.22
1001 0.25
1002 0.23
1003 0.23
1004 0.28
1005 0.31
1006 0.3
1007 0.33
1008 0.34
1009 0.32
1010 0.37
1011 0.4
1012 0.39
1013 0.4
1014 0.46
1015 0.5
1016 0.52
1017 0.57
1018 0.59
1019 0.66
1020 0.71
1021 0.76
1022 0.8
1023 0.8
1024 0.82
1025 0.83
1026 0.86
1027 0.86
1028 0.84
1029 0.78
1030 0.78
1031 0.78
1032 0.75
1033 0.74
1034 0.75
1035 0.75
1036 0.78
1037 0.82
1038 0.83
1039 0.87
1040 0.9
1041 0.9
1042 0.9
1043 0.82
1044 0.79
1045 0.73
1046 0.65
1047 0.58
1048 0.47
1049 0.38
1050 0.28
1051 0.25
1052 0.18
1053 0.15
1054 0.12
1055 0.08
1056 0.08
1057 0.1
1058 0.1
1059 0.1
1060 0.1
1061 0.09
1062 0.09
1063 0.13
1064 0.15
1065 0.13
1066 0.13
1067 0.14
1068 0.15
1069 0.17
1070 0.18
1071 0.14
1072 0.16
1073 0.17
1074 0.18
1075 0.22
1076 0.22
1077 0.21
1078 0.2
1079 0.22
1080 0.21
1081 0.2
1082 0.26
1083 0.23
1084 0.27
1085 0.29
1086 0.3
1087 0.3
1088 0.3
1089 0.31
1090 0.24
1091 0.23
1092 0.18
1093 0.17
1094 0.17
1095 0.15
1096 0.12
1097 0.11
1098 0.11
1099 0.12
1100 0.12
1101 0.14
1102 0.2
1103 0.23
1104 0.3
1105 0.4
1106 0.49
1107 0.52
1108 0.58
1109 0.6
1110 0.61
1111 0.65
1112 0.64
1113 0.6
1114 0.55
1115 0.54
1116 0.5
1117 0.47
1118 0.43
1119 0.39
1120 0.36
1121 0.31
1122 0.34
1123 0.35
1124 0.41
1125 0.43
1126 0.51
1127 0.58
1128 0.66
1129 0.75
1130 0.78
1131 0.81
1132 0.76
1133 0.8
1134 0.76
1135 0.76
1136 0.71
1137 0.64
1138 0.56
1139 0.5
1140 0.48
1141 0.39
1142 0.34
1143 0.23
1144 0.17
1145 0.14
1146 0.13
1147 0.1
1148 0.1
1149 0.1
1150 0.07
1151 0.09
1152 0.08
1153 0.07
1154 0.06
1155 0.07
1156 0.07
1157 0.07
1158 0.07
1159 0.07
1160 0.07
1161 0.07
1162 0.07
1163 0.07
1164 0.08
1165 0.08
1166 0.1
1167 0.09
1168 0.11
1169 0.16
1170 0.21
1171 0.21
1172 0.23
1173 0.26
1174 0.28
1175 0.29
1176 0.31
1177 0.32
1178 0.33
1179 0.37
1180 0.37
1181 0.34
1182 0.32
1183 0.33
1184 0.28
1185 0.23
1186 0.17
1187 0.16
1188 0.16
1189 0.21
1190 0.26
1191 0.3
1192 0.38
1193 0.48
1194 0.58
1195 0.64
1196 0.72
1197 0.77
1198 0.81
1199 0.84
1200 0.87
1201 0.87
1202 0.87
1203 0.86
1204 0.87
1205 0.84
1206 0.82
1207 0.79
1208 0.71
1209 0.62
1210 0.53
1211 0.5
1212 0.41
1213 0.36
1214 0.35
1215 0.3
1216 0.31
1217 0.3
1218 0.3
1219 0.25
1220 0.25
1221 0.3
1222 0.23
1223 0.27
1224 0.29
1225 0.36
1226 0.39
1227 0.44
1228 0.45
1229 0.4
1230 0.45
1231 0.41
1232 0.43
1233 0.38
1234 0.37
1235 0.33
1236 0.34
1237 0.32
1238 0.29
1239 0.33
1240 0.33
1241 0.33
1242 0.32
1243 0.35
1244 0.32
1245 0.32
1246 0.32
1247 0.31
1248 0.27
1249 0.27
1250 0.32