FuNGI

A0A4Q4U838

Protein Details

Accession

A0A4Q4U838

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
417-445	LVVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGSLDVH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-435	GFTKEKNKKKRG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAKKSKKTEKPKVTPAAPAVNNQAPPTQLMDLVESFLSDQGFNNAHREFQKHRAKNGWNSDGSTKRDNKGHTSLVSVFQAWETFSSKDGAAAPKQQAIDRVTRVSSSSSSSSDSYSSSDESSDSDSDGDDVPMADAPAAKAESSDSSDSSSCSSSSSDSDSDSDSDSDSDSDSNDEAAPTKAKPPASKALRTTNPLKRKAESDSEASSSESDSDEDMSDSSSEDERPRAKKAKTADSSDESSSESSDSDSSSDDSSSDDEAAKPYASNKAQAAGSSSSSSSSESDSSSSDSNSDSDSEGDTTAVASKVPLPESDSSSSSSDSESDDEDAKPVSKDVTMNGTGSDTSATLDKTSPQFQEAPLPPDPVKTNNRGKNGAKTAKTQNQPFSRIRQDVAIDPRLSSNAYVSHSWGDKAHEDLVVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGSLDVHQVRSIKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.75
3	0.73
4	0.64
5	0.58
6	0.54
7	0.5
8	0.48
9	0.42
10	0.38
11	0.29
12	0.29
13	0.29
14	0.23
15	0.19
16	0.18
17	0.2
18	0.18
19	0.19
20	0.17
21	0.13
22	0.13
23	0.13
24	0.12
25	0.1
26	0.1
27	0.13
28	0.16
29	0.17
30	0.21
31	0.2
32	0.24
33	0.27
34	0.32
35	0.33
36	0.41
37	0.51
38	0.52
39	0.58
40	0.63
41	0.69
42	0.73
43	0.77
44	0.75
45	0.66
46	0.64
47	0.65
48	0.62
49	0.59
50	0.58
51	0.53
52	0.5
53	0.53
54	0.53
55	0.53
56	0.52
57	0.53
58	0.45
59	0.45
60	0.42
61	0.4
62	0.38
63	0.31
64	0.25
65	0.2
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.13
70	0.13
71	0.13
72	0.15
73	0.14
74	0.15
75	0.18
76	0.2
77	0.21
78	0.26
79	0.27
80	0.29
81	0.3
82	0.3
83	0.32
84	0.31
85	0.34
86	0.31
87	0.31
88	0.28
89	0.28
90	0.28
91	0.25
92	0.23
93	0.21
94	0.2
95	0.19
96	0.21
97	0.21
98	0.21
99	0.19
100	0.19
101	0.17
102	0.16
103	0.16
104	0.14
105	0.13
106	0.12
107	0.13
108	0.15
109	0.13
110	0.12
111	0.11
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.1
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.06
128	0.08
129	0.09
130	0.12
131	0.13
132	0.12
133	0.14
134	0.14
135	0.15
136	0.15
137	0.14
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.11
143	0.14
144	0.13
145	0.14
146	0.14
147	0.15
148	0.15
149	0.15
150	0.14
151	0.11
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.1
166	0.09
167	0.12
168	0.15
169	0.17
170	0.19
171	0.23
172	0.32
173	0.36
174	0.4
175	0.41
176	0.46
177	0.48
178	0.51
179	0.54
180	0.53
181	0.56
182	0.58
183	0.56
184	0.49
185	0.48
186	0.49
187	0.47
188	0.4
189	0.36
190	0.31
191	0.3
192	0.29
193	0.26
194	0.22
195	0.16
196	0.13
197	0.1
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.06
209	0.07
210	0.08
211	0.11
212	0.16
213	0.18
214	0.23
215	0.29
216	0.3
217	0.33
218	0.37
219	0.44
220	0.44
221	0.47
222	0.46
223	0.42
224	0.44
225	0.4
226	0.35
227	0.26
228	0.22
229	0.17
230	0.13
231	0.09
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.14
253	0.15
254	0.17
255	0.16
256	0.18
257	0.18
258	0.18
259	0.21
260	0.15
261	0.16
262	0.14
263	0.14
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.08
294	0.1
295	0.11
296	0.11
297	0.13
298	0.15
299	0.19
300	0.22
301	0.21
302	0.22
303	0.22
304	0.23
305	0.2
306	0.18
307	0.15
308	0.13
309	0.13
310	0.12
311	0.12
312	0.13
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.11
319	0.1
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.17
324	0.17
325	0.17
326	0.17
327	0.17
328	0.15
329	0.15
330	0.14
331	0.08
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.13
338	0.16
339	0.2
340	0.21
341	0.22
342	0.23
343	0.23
344	0.32
345	0.32
346	0.34
347	0.32
348	0.35
349	0.32
350	0.34
351	0.36
352	0.33
353	0.36
354	0.39
355	0.47
356	0.51
357	0.57
358	0.61
359	0.62
360	0.64
361	0.68
362	0.68
363	0.61
364	0.61
365	0.64
366	0.66
367	0.7
368	0.66
369	0.66
370	0.64
371	0.68
372	0.65
373	0.63
374	0.63
375	0.59
376	0.53
377	0.48
378	0.44
379	0.44
380	0.47
381	0.46
382	0.38
383	0.36
384	0.36
385	0.33
386	0.31
387	0.24
388	0.19
389	0.16
390	0.19
391	0.19
392	0.2
393	0.23
394	0.24
395	0.25
396	0.24
397	0.24
398	0.23
399	0.25
400	0.25
401	0.21
402	0.21
403	0.21
404	0.24
405	0.24
406	0.22
407	0.21
408	0.21
409	0.21
410	0.27
411	0.31
412	0.37
413	0.44
414	0.55
415	0.64
416	0.73
417	0.82
418	0.85
419	0.9
420	0.91
421	0.9
422	0.9
423	0.88
424	0.87
425	0.86
426	0.83
427	0.73
428	0.65
429	0.64
430	0.58
431	0.52
432	0.44
433	0.38
434	0.32

A0A4Q4U838

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer