Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XEM4

Protein Details
Accession A0A4V1XEM4    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-70VALKSSTKGKEKPSKKSKKVETESESEHydrophilic
104-125ESEDDKKKKKTAPKANGTAKPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-62DSPKAKSKKLAKEVALKSSTKGKEKPSKKSKK
109-137KKKKKTAPKANGTAKPVAKPAAVNGKAKK
186-193AAKDKKKA
235-242EEPSKKRK
454-507RPPREGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGGRGGFGDRGGRGGGRGGRGGPS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKVKQANGKAAKAANPLSAVKNAGVTKAADSPKAKSKKLAKEVALKSSTKGKEKPSKKSKKVETESESESESESESDDSEDSESEASSDSSEDDSDDSASSSESEDDKKKKKTAPKANGTAKPVAKPAAVNGKAKKAADSDSSDSSDSSDEEEDDDSDDSEDSEDDAATKAKAKPAAAAAAATAAAKDKKKAKAESSDEDSDEDSDDSEDSDSSDDSDASESEDEEKPEAKEKEEPSKKRKAEEETSTPFKKSKSDASEEEQSSVLFVGNLGWGITDDSLYEAFKDCEGLSNARVVTDKAMQRSRGFGYVDFDTAENAQAALEKMNGFELEGRPLRLDPSKPRPADDASPNARATQRAQQHGDSVSPESDTLFVGNLPFDADDDMVSEFFGEVCEVKSLRLPTDPESGNRKGFGYVTFNSVEDAKSVFNAKNGAYIGEGRSGRPVRLDFASARPPREGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGGRGGFGDRGGRGGGRGGRGGPSFQGKKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.37
4 0.37
5 0.34
6 0.33
7 0.3
8 0.25
9 0.28
10 0.26
11 0.24
12 0.23
13 0.21
14 0.21
15 0.27
16 0.28
17 0.29
18 0.31
19 0.34
20 0.42
21 0.49
22 0.48
23 0.5
24 0.58
25 0.62
26 0.69
27 0.73
28 0.7
29 0.72
30 0.76
31 0.76
32 0.71
33 0.61
34 0.53
35 0.54
36 0.54
37 0.51
38 0.51
39 0.52
40 0.58
41 0.66
42 0.75
43 0.76
44 0.82
45 0.84
46 0.89
47 0.89
48 0.9
49 0.89
50 0.88
51 0.82
52 0.77
53 0.72
54 0.63
55 0.54
56 0.43
57 0.36
58 0.26
59 0.21
60 0.15
61 0.12
62 0.11
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.1
91 0.1
92 0.15
93 0.22
94 0.3
95 0.38
96 0.45
97 0.5
98 0.56
99 0.64
100 0.7
101 0.74
102 0.77
103 0.79
104 0.82
105 0.85
106 0.84
107 0.79
108 0.75
109 0.66
110 0.58
111 0.5
112 0.42
113 0.33
114 0.28
115 0.27
116 0.3
117 0.32
118 0.35
119 0.36
120 0.4
121 0.43
122 0.43
123 0.41
124 0.32
125 0.32
126 0.3
127 0.33
128 0.3
129 0.29
130 0.31
131 0.29
132 0.27
133 0.24
134 0.2
135 0.15
136 0.13
137 0.11
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.11
158 0.12
159 0.15
160 0.18
161 0.18
162 0.19
163 0.21
164 0.23
165 0.18
166 0.17
167 0.14
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.09
174 0.1
175 0.14
176 0.21
177 0.28
178 0.35
179 0.39
180 0.43
181 0.5
182 0.55
183 0.57
184 0.57
185 0.52
186 0.46
187 0.42
188 0.37
189 0.27
190 0.22
191 0.16
192 0.09
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.09
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.19
217 0.19
218 0.18
219 0.22
220 0.25
221 0.35
222 0.43
223 0.49
224 0.49
225 0.58
226 0.59
227 0.57
228 0.6
229 0.56
230 0.54
231 0.54
232 0.55
233 0.5
234 0.55
235 0.52
236 0.47
237 0.41
238 0.35
239 0.31
240 0.26
241 0.29
242 0.28
243 0.31
244 0.34
245 0.37
246 0.43
247 0.41
248 0.39
249 0.31
250 0.25
251 0.21
252 0.18
253 0.13
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.09
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.11
284 0.12
285 0.16
286 0.18
287 0.2
288 0.24
289 0.26
290 0.26
291 0.29
292 0.28
293 0.26
294 0.25
295 0.2
296 0.2
297 0.19
298 0.19
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.09
317 0.09
318 0.13
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.18
324 0.19
325 0.23
326 0.26
327 0.35
328 0.43
329 0.43
330 0.45
331 0.46
332 0.46
333 0.47
334 0.44
335 0.43
336 0.39
337 0.42
338 0.41
339 0.39
340 0.36
341 0.32
342 0.3
343 0.29
344 0.31
345 0.34
346 0.37
347 0.35
348 0.38
349 0.37
350 0.35
351 0.29
352 0.24
353 0.18
354 0.15
355 0.14
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.13
386 0.15
387 0.16
388 0.2
389 0.22
390 0.23
391 0.31
392 0.32
393 0.33
394 0.38
395 0.4
396 0.38
397 0.37
398 0.34
399 0.28
400 0.27
401 0.26
402 0.25
403 0.22
404 0.23
405 0.23
406 0.22
407 0.22
408 0.22
409 0.18
410 0.13
411 0.13
412 0.1
413 0.1
414 0.14
415 0.14
416 0.15
417 0.17
418 0.16
419 0.2
420 0.2
421 0.19
422 0.17
423 0.18
424 0.18
425 0.22
426 0.23
427 0.19
428 0.27
429 0.28
430 0.27
431 0.3
432 0.3
433 0.27
434 0.28
435 0.32
436 0.26
437 0.3
438 0.4
439 0.39
440 0.4
441 0.38
442 0.36
443 0.34
444 0.35
445 0.3
446 0.25
447 0.26
448 0.25
449 0.25
450 0.26
451 0.25
452 0.21
453 0.2
454 0.18
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.11
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.15
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.15
476 0.13
477 0.14
478 0.17
479 0.15
480 0.16
481 0.17
482 0.16
483 0.15
484 0.19
485 0.22
486 0.22
487 0.24
488 0.23
489 0.27
490 0.28
491 0.29
492 0.27
493 0.33
494 0.34
495 0.35