Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4T3B4

Protein Details
Accession A0A4Q4T3B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-142IDNYGFSKRHDKKPKIRAPGKHSAKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-142KRHDKKPKIRAPGKHSAKI
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MNRDTGLEEDDDFINAPPESSDDEEINLPAAGPSQDLLSDSDGEPPRRDIRPTQFGKENQPPSSQASNTRKSTRGINKTSEKSSFPGASSQSQGPSRSNGSKRPREEGAPESSSHLIDNYGFSKRHDKKPKIRAPGKHSAKIHGYGKSSQKYSQKSPPGSSTPQRDVREIKLYDASESPEKKPTPSKSTLRIPSSLDSSPNGTPRKPNLRLHSITSDDSPQNGGIRLFDSDGPALGFEATSPDQQTARPERSTRSRGRAEINVLESSPCDSPDGFSQKPVFKLPDDTDDLDSPIDYDGKAIVGSGLGWDNNNEDDTLLLAAERPKEARCPMCHEPVDPELLEKHSDRGRMNIRKQAAFCRLHKRRAALDSGTEKGYPKIDWSTIESRFVSHERFLREILEGSRPSHYASILRDKVESGEDRTLLKTKDSVTPGYYGPKGLHVMTEYIMRRFSPVLRKRAVEDRLISARSYTAYVQGVLVPELAARLVMEDMDVGEGEARDILRDSIEVGELLHEEAGDVIANMSEDENT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.12
6 0.15
7 0.18
8 0.2
9 0.18
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.2
14 0.16
15 0.12
16 0.1
17 0.11
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.14
28 0.22
29 0.27
30 0.29
31 0.3
32 0.33
33 0.37
34 0.38
35 0.43
36 0.43
37 0.47
38 0.55
39 0.59
40 0.61
41 0.63
42 0.64
43 0.69
44 0.7
45 0.67
46 0.6
47 0.58
48 0.54
49 0.52
50 0.54
51 0.47
52 0.47
53 0.49
54 0.54
55 0.57
56 0.6
57 0.56
58 0.52
59 0.6
60 0.6
61 0.62
62 0.6
63 0.62
64 0.66
65 0.69
66 0.72
67 0.66
68 0.58
69 0.5
70 0.49
71 0.43
72 0.34
73 0.34
74 0.31
75 0.31
76 0.32
77 0.32
78 0.31
79 0.32
80 0.33
81 0.3
82 0.3
83 0.33
84 0.39
85 0.41
86 0.46
87 0.53
88 0.6
89 0.62
90 0.64
91 0.61
92 0.57
93 0.57
94 0.53
95 0.51
96 0.44
97 0.4
98 0.38
99 0.35
100 0.31
101 0.26
102 0.21
103 0.14
104 0.12
105 0.14
106 0.13
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.3
111 0.36
112 0.46
113 0.54
114 0.62
115 0.67
116 0.78
117 0.85
118 0.85
119 0.86
120 0.85
121 0.83
122 0.84
123 0.82
124 0.78
125 0.7
126 0.65
127 0.61
128 0.58
129 0.54
130 0.48
131 0.43
132 0.42
133 0.48
134 0.47
135 0.45
136 0.45
137 0.48
138 0.49
139 0.52
140 0.55
141 0.56
142 0.56
143 0.57
144 0.57
145 0.55
146 0.56
147 0.56
148 0.54
149 0.52
150 0.56
151 0.55
152 0.53
153 0.5
154 0.49
155 0.51
156 0.44
157 0.39
158 0.35
159 0.34
160 0.31
161 0.29
162 0.27
163 0.25
164 0.27
165 0.27
166 0.29
167 0.29
168 0.3
169 0.37
170 0.41
171 0.42
172 0.48
173 0.51
174 0.52
175 0.6
176 0.65
177 0.6
178 0.56
179 0.5
180 0.44
181 0.43
182 0.36
183 0.29
184 0.22
185 0.22
186 0.22
187 0.26
188 0.26
189 0.23
190 0.26
191 0.33
192 0.42
193 0.45
194 0.49
195 0.5
196 0.56
197 0.57
198 0.57
199 0.54
200 0.47
201 0.41
202 0.36
203 0.33
204 0.25
205 0.23
206 0.19
207 0.15
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.03
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.16
233 0.19
234 0.22
235 0.24
236 0.25
237 0.28
238 0.36
239 0.43
240 0.43
241 0.45
242 0.45
243 0.46
244 0.48
245 0.47
246 0.42
247 0.37
248 0.34
249 0.27
250 0.23
251 0.2
252 0.16
253 0.15
254 0.12
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.13
260 0.19
261 0.17
262 0.19
263 0.23
264 0.24
265 0.26
266 0.27
267 0.24
268 0.19
269 0.23
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.24
274 0.24
275 0.23
276 0.22
277 0.18
278 0.16
279 0.12
280 0.09
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.13
313 0.18
314 0.23
315 0.24
316 0.31
317 0.35
318 0.42
319 0.42
320 0.39
321 0.39
322 0.35
323 0.35
324 0.26
325 0.22
326 0.16
327 0.16
328 0.18
329 0.14
330 0.17
331 0.17
332 0.21
333 0.21
334 0.27
335 0.35
336 0.42
337 0.47
338 0.5
339 0.52
340 0.51
341 0.52
342 0.53
343 0.52
344 0.48
345 0.49
346 0.53
347 0.56
348 0.6
349 0.62
350 0.58
351 0.56
352 0.54
353 0.54
354 0.44
355 0.44
356 0.4
357 0.39
358 0.36
359 0.3
360 0.27
361 0.23
362 0.23
363 0.17
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.23
369 0.28
370 0.28
371 0.32
372 0.29
373 0.26
374 0.28
375 0.29
376 0.26
377 0.23
378 0.26
379 0.26
380 0.28
381 0.28
382 0.26
383 0.24
384 0.24
385 0.22
386 0.25
387 0.22
388 0.22
389 0.24
390 0.23
391 0.23
392 0.22
393 0.21
394 0.18
395 0.21
396 0.3
397 0.31
398 0.31
399 0.3
400 0.29
401 0.3
402 0.31
403 0.28
404 0.23
405 0.23
406 0.24
407 0.24
408 0.27
409 0.3
410 0.26
411 0.25
412 0.23
413 0.22
414 0.28
415 0.3
416 0.3
417 0.27
418 0.29
419 0.29
420 0.32
421 0.3
422 0.24
423 0.22
424 0.23
425 0.23
426 0.21
427 0.21
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.23
432 0.21
433 0.21
434 0.22
435 0.2
436 0.21
437 0.22
438 0.27
439 0.31
440 0.37
441 0.44
442 0.48
443 0.5
444 0.52
445 0.59
446 0.57
447 0.53
448 0.48
449 0.46
450 0.47
451 0.47
452 0.42
453 0.34
454 0.31
455 0.25
456 0.25
457 0.18
458 0.17
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.18
463 0.17
464 0.16
465 0.15
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.06
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.05
475 0.06
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06