Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XDN7

Protein Details
Accession A0A4V1XDN7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-103LSEKGIPRLRRKARELKFKGKGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-101KGIPRLRRKARELKFKGK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MAARTAASQSSPQRPPPPSNDIDDYDVDDDIFAESGGDESAQKNGQSKKRKDVASLGIDEEIAVAKKIRAPMVKLDENRLLSEKGIPRLRRKARELKFKGKGHEFSDAARLLSFYQLWLDDLFPKAKFLDALVMVEKAGHKKHMHMKRMEWINEGKPKPHRDDDDEDIFGKSNQPEEREASRFPARVAPIFQNRASQRPKTPTRDDLSGDEDIYDATPRAPRITRAAGVPDGGKSAQPGEMPDDDDLDALMAEGEARRTAPTNSIFGSGTVSRPRDQVDQDDLDALMAEAEAQANLSKKNDGTAHKPRPSAEADEEDDLDALMAEAEASSSNPQQRDPAEGAGLLPQEEQSSKGQVADADEEEAMAEMDGLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.63
4 0.65
5 0.59
6 0.61
7 0.59
8 0.54
9 0.52
10 0.46
11 0.41
12 0.34
13 0.3
14 0.23
15 0.18
16 0.14
17 0.11
18 0.1
19 0.06
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.2
31 0.28
32 0.37
33 0.47
34 0.53
35 0.6
36 0.66
37 0.68
38 0.66
39 0.66
40 0.65
41 0.62
42 0.58
43 0.49
44 0.41
45 0.37
46 0.32
47 0.24
48 0.17
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.11
54 0.14
55 0.19
56 0.22
57 0.24
58 0.32
59 0.4
60 0.46
61 0.45
62 0.48
63 0.49
64 0.47
65 0.46
66 0.4
67 0.32
68 0.25
69 0.31
70 0.3
71 0.32
72 0.38
73 0.41
74 0.47
75 0.57
76 0.65
77 0.66
78 0.7
79 0.73
80 0.75
81 0.81
82 0.81
83 0.81
84 0.82
85 0.78
86 0.77
87 0.74
88 0.7
89 0.61
90 0.6
91 0.5
92 0.41
93 0.43
94 0.36
95 0.28
96 0.24
97 0.21
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.16
127 0.15
128 0.21
129 0.31
130 0.39
131 0.46
132 0.47
133 0.49
134 0.52
135 0.59
136 0.55
137 0.48
138 0.43
139 0.41
140 0.46
141 0.44
142 0.4
143 0.39
144 0.43
145 0.45
146 0.47
147 0.45
148 0.43
149 0.48
150 0.48
151 0.46
152 0.42
153 0.37
154 0.32
155 0.28
156 0.22
157 0.19
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.2
164 0.24
165 0.24
166 0.24
167 0.25
168 0.26
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.22
173 0.2
174 0.22
175 0.23
176 0.25
177 0.28
178 0.27
179 0.29
180 0.29
181 0.35
182 0.37
183 0.35
184 0.35
185 0.41
186 0.48
187 0.49
188 0.53
189 0.53
190 0.52
191 0.52
192 0.48
193 0.42
194 0.39
195 0.32
196 0.27
197 0.2
198 0.16
199 0.13
200 0.11
201 0.09
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.08
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.18
210 0.21
211 0.22
212 0.21
213 0.24
214 0.21
215 0.21
216 0.2
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.08
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.09
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.2
252 0.2
253 0.18
254 0.21
255 0.17
256 0.18
257 0.21
258 0.22
259 0.21
260 0.22
261 0.25
262 0.26
263 0.28
264 0.3
265 0.31
266 0.31
267 0.3
268 0.29
269 0.26
270 0.21
271 0.19
272 0.13
273 0.07
274 0.05
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.11
284 0.13
285 0.12
286 0.17
287 0.23
288 0.25
289 0.33
290 0.43
291 0.52
292 0.55
293 0.58
294 0.54
295 0.54
296 0.53
297 0.5
298 0.45
299 0.4
300 0.37
301 0.37
302 0.36
303 0.32
304 0.27
305 0.21
306 0.16
307 0.1
308 0.07
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.05
316 0.08
317 0.12
318 0.17
319 0.18
320 0.2
321 0.24
322 0.25
323 0.31
324 0.31
325 0.3
326 0.26
327 0.25
328 0.25
329 0.23
330 0.22
331 0.17
332 0.14
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.15
337 0.14
338 0.18
339 0.18
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.22
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.19
348 0.18
349 0.17
350 0.15
351 0.12
352 0.07