Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XDS2

Protein Details
Accession A0A4V1XDS2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-89NSEFHNRSNKKKNNGRSANARKGKGHydrophilic
118-146KDCPEPQKDKNGKGKKGKRGQNGDQRQGNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-91NKKKNNGRSANARKGKGNN
127-136KNGKGKKGKR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MLRTLRRTYAATGKSRQRSFWKELNKVTYDGGNPVQFTTKFQKLLRKSVLRQTDYSFQQLIDDFNSEFHNRSNKKKNNGRSANARKGKGNNTRDGKPAWNKDGQPLCFNCGKYGHMAKDCPEPQKDKNGKGKKGKRGQNGDQRQGNNSGNSSQNNRSNSSRNTRSGGQSEEQFIPEGLRDLYRSDGKTFSAHIEDQQLQDLMRWYDEMIQRADSTVASVIESAEAVEATEAAAADCTDCAETDSPERPELQMTNSPELQAIQSPKLQGTDCPELRLQVTERTEPQVADCPEATKATVVGSAMLLHVHSSTEDDRDKLLWDSGANVNITNNIGDFERDSILDIKSKGIHIMTGGGPVAATSIGTVKWPLRGPHGENNEVTVKYTLHISDFPLKVFSGEIFYRRGGYLDRNTLVGPDGTELTTINVPRRGFFLWLHGKPEPTVRGPESLNDNHQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.68
4 0.68
5 0.68
6 0.69
7 0.69
8 0.7
9 0.69
10 0.74
11 0.75
12 0.68
13 0.62
14 0.56
15 0.52
16 0.43
17 0.39
18 0.36
19 0.3
20 0.27
21 0.26
22 0.3
23 0.26
24 0.3
25 0.33
26 0.35
27 0.38
28 0.41
29 0.5
30 0.51
31 0.6
32 0.65
33 0.66
34 0.65
35 0.69
36 0.75
37 0.69
38 0.66
39 0.61
40 0.6
41 0.54
42 0.53
43 0.44
44 0.34
45 0.32
46 0.3
47 0.27
48 0.2
49 0.19
50 0.15
51 0.15
52 0.19
53 0.18
54 0.18
55 0.2
56 0.29
57 0.31
58 0.4
59 0.5
60 0.55
61 0.64
62 0.73
63 0.79
64 0.8
65 0.85
66 0.82
67 0.82
68 0.84
69 0.84
70 0.83
71 0.75
72 0.7
73 0.68
74 0.71
75 0.7
76 0.66
77 0.65
78 0.63
79 0.64
80 0.62
81 0.59
82 0.57
83 0.56
84 0.57
85 0.53
86 0.54
87 0.51
88 0.56
89 0.61
90 0.54
91 0.52
92 0.46
93 0.44
94 0.42
95 0.41
96 0.35
97 0.29
98 0.28
99 0.27
100 0.32
101 0.33
102 0.32
103 0.33
104 0.33
105 0.41
106 0.44
107 0.43
108 0.42
109 0.42
110 0.42
111 0.51
112 0.56
113 0.55
114 0.62
115 0.66
116 0.7
117 0.75
118 0.81
119 0.81
120 0.83
121 0.83
122 0.82
123 0.82
124 0.83
125 0.83
126 0.83
127 0.8
128 0.77
129 0.7
130 0.63
131 0.59
132 0.52
133 0.42
134 0.34
135 0.29
136 0.26
137 0.27
138 0.29
139 0.3
140 0.33
141 0.34
142 0.36
143 0.37
144 0.4
145 0.44
146 0.48
147 0.48
148 0.46
149 0.47
150 0.47
151 0.47
152 0.43
153 0.41
154 0.34
155 0.3
156 0.3
157 0.27
158 0.25
159 0.21
160 0.18
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.11
169 0.14
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.1
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.02
215 0.02
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.09
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.2
240 0.22
241 0.22
242 0.22
243 0.2
244 0.2
245 0.17
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.16
253 0.16
254 0.14
255 0.18
256 0.25
257 0.24
258 0.26
259 0.25
260 0.25
261 0.25
262 0.25
263 0.2
264 0.18
265 0.2
266 0.2
267 0.22
268 0.24
269 0.25
270 0.23
271 0.23
272 0.24
273 0.22
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.17
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.08
297 0.12
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.17
303 0.16
304 0.16
305 0.12
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.17
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.11
316 0.09
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.15
334 0.15
335 0.12
336 0.15
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.06
345 0.05
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.09
351 0.09
352 0.14
353 0.18
354 0.19
355 0.26
356 0.32
357 0.37
358 0.44
359 0.5
360 0.5
361 0.46
362 0.49
363 0.46
364 0.39
365 0.35
366 0.28
367 0.21
368 0.17
369 0.2
370 0.16
371 0.15
372 0.16
373 0.18
374 0.25
375 0.26
376 0.26
377 0.25
378 0.25
379 0.23
380 0.22
381 0.18
382 0.15
383 0.16
384 0.18
385 0.19
386 0.2
387 0.22
388 0.21
389 0.22
390 0.19
391 0.25
392 0.3
393 0.35
394 0.35
395 0.34
396 0.34
397 0.33
398 0.32
399 0.25
400 0.18
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.13
407 0.16
408 0.18
409 0.21
410 0.25
411 0.25
412 0.25
413 0.29
414 0.28
415 0.28
416 0.26
417 0.32
418 0.36
419 0.39
420 0.44
421 0.43
422 0.43
423 0.42
424 0.48
425 0.44
426 0.38
427 0.42
428 0.38
429 0.4
430 0.4
431 0.43
432 0.44