Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XFD4

Protein Details
Accession A0A4V1XFD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-442LRSWKANRRGTYHRKRRRWARIRHVVDGTBasic
575-595AEGKVEARGKTRPRKRKAVESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-435ANRRGTYHRKRRRWARI
575-592AEGKVEARGKTRPRKRKA
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MNGRTISLGKYGSFPSNLIIQRPYHLTYELEDRRETENFNRLRVVPASELYSDILSSGTSSTSPGTATPAPEDDDGETATPMGVEYSLVDPDSGAVVAKTDRAQLDASARQTLSMEEIEQLKRDATDAGKDLIAKLMLSHTAMDQKTQYSLAKYKLLKTRKYIRRFCVLPLDVPMLGNWLLEEKDPAKILEMREEIIALLGCWANVHFGGKDRCENGEPDADGENKPESELTPGRWLVVDDTGGLLVAAMAERMGVLYPAEAGDSAAAKPQPTSPQMRKGELVGQVEPNTNVTAKGAQLATEQDASKQTETQEGEQAVVKATQPPKKRHAGDKHRHDDMHVPYARSNTLTLIHANSQPNLSYLRYFDFDHTNPNQGLDHPLARHLMTLSWLQLLEPELDSAYSATPPQATPEELRSWKANRRGTYHRKRRRWARIRHVVDGTRGGGFSGLVVASAMDPISVLRHTVPLLAGGAPVAVYSQAIEPLTALADCYSVSRRAAWVADPPAEAAGRSAEELERWPGTDEFPLNPSLLLGASIQTSRVRRWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYVFTAWRVKPAEGKVEARGKTRPRKRKAVES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.28
4 0.29
5 0.29
6 0.3
7 0.27
8 0.3
9 0.34
10 0.35
11 0.29
12 0.29
13 0.27
14 0.26
15 0.35
16 0.37
17 0.36
18 0.34
19 0.34
20 0.37
21 0.38
22 0.39
23 0.35
24 0.38
25 0.37
26 0.39
27 0.41
28 0.37
29 0.4
30 0.38
31 0.36
32 0.3
33 0.29
34 0.3
35 0.26
36 0.27
37 0.23
38 0.21
39 0.16
40 0.13
41 0.11
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.22
58 0.22
59 0.23
60 0.19
61 0.18
62 0.17
63 0.15
64 0.13
65 0.11
66 0.1
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.04
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.22
93 0.24
94 0.26
95 0.26
96 0.25
97 0.24
98 0.24
99 0.22
100 0.19
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.12
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.18
134 0.2
135 0.2
136 0.18
137 0.23
138 0.25
139 0.31
140 0.32
141 0.38
142 0.44
143 0.5
144 0.51
145 0.55
146 0.62
147 0.64
148 0.73
149 0.74
150 0.71
151 0.72
152 0.68
153 0.63
154 0.63
155 0.54
156 0.46
157 0.4
158 0.38
159 0.29
160 0.27
161 0.24
162 0.15
163 0.14
164 0.12
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.1
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.16
176 0.17
177 0.21
178 0.21
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.16
183 0.14
184 0.13
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.11
196 0.15
197 0.17
198 0.2
199 0.21
200 0.23
201 0.23
202 0.24
203 0.21
204 0.22
205 0.2
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.09
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.1
258 0.13
259 0.16
260 0.23
261 0.25
262 0.35
263 0.38
264 0.39
265 0.38
266 0.35
267 0.36
268 0.33
269 0.32
270 0.23
271 0.21
272 0.21
273 0.21
274 0.19
275 0.15
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.16
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.17
304 0.12
305 0.12
306 0.1
307 0.12
308 0.17
309 0.23
310 0.29
311 0.34
312 0.39
313 0.47
314 0.51
315 0.56
316 0.61
317 0.67
318 0.7
319 0.75
320 0.75
321 0.71
322 0.67
323 0.58
324 0.55
325 0.47
326 0.46
327 0.37
328 0.33
329 0.3
330 0.31
331 0.3
332 0.24
333 0.21
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.18
341 0.19
342 0.18
343 0.17
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.11
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.19
355 0.19
356 0.25
357 0.25
358 0.27
359 0.25
360 0.25
361 0.24
362 0.19
363 0.22
364 0.17
365 0.18
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.16
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.18
399 0.24
400 0.24
401 0.27
402 0.28
403 0.31
404 0.37
405 0.44
406 0.46
407 0.44
408 0.49
409 0.58
410 0.64
411 0.71
412 0.75
413 0.77
414 0.81
415 0.86
416 0.9
417 0.91
418 0.9
419 0.9
420 0.9
421 0.9
422 0.86
423 0.83
424 0.78
425 0.69
426 0.62
427 0.54
428 0.44
429 0.33
430 0.27
431 0.21
432 0.15
433 0.12
434 0.09
435 0.07
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.09
451 0.09
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.03
465 0.04
466 0.05
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.08
479 0.11
480 0.12
481 0.13
482 0.14
483 0.15
484 0.17
485 0.19
486 0.18
487 0.22
488 0.24
489 0.26
490 0.25
491 0.24
492 0.23
493 0.22
494 0.2
495 0.14
496 0.12
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.1
501 0.11
502 0.13
503 0.16
504 0.15
505 0.16
506 0.18
507 0.18
508 0.19
509 0.23
510 0.22
511 0.2
512 0.22
513 0.22
514 0.19
515 0.19
516 0.17
517 0.13
518 0.11
519 0.09
520 0.08
521 0.07
522 0.09
523 0.09
524 0.11
525 0.15
526 0.18
527 0.2
528 0.28
529 0.33
530 0.36
531 0.4
532 0.49
533 0.54
534 0.59
535 0.63
536 0.61
537 0.63
538 0.6
539 0.56
540 0.47
541 0.43
542 0.39
543 0.35
544 0.33
545 0.25
546 0.28
547 0.27
548 0.25
549 0.2
550 0.18
551 0.17
552 0.16
553 0.15
554 0.12
555 0.19
556 0.19
557 0.24
558 0.26
559 0.25
560 0.3
561 0.35
562 0.43
563 0.42
564 0.45
565 0.47
566 0.53
567 0.54
568 0.51
569 0.55
570 0.57
571 0.62
572 0.7
573 0.72
574 0.73
575 0.81