Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TRJ6

Protein Details
Accession A0A4Q4TRJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-152EVVRDSQKRKRRSGSPQPSPEDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-141RKRR
522-557RPPHRERERRRGLAGGRRGGGGGRGGGGPRRGGGGP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034257  Acinus_RRM  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02037  SAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50800  SAP  
CDD cd12432  RRM_ACINU  
Amino Acid Sequences MATDYNKLKVVDLKAELKNRGLPQNGLKAELVARLEAAEAEAESESAQPTSTEDPAEVTTQDVAQDVSDDVEKSEETPGPVEPAASNESVQDQLPDPPTAQETPTTTIDAQGQAASLPQSTDVTPAPLAEVVRDSQKRKRRSGSPQPSPEDIARKRVRQDDQEIAPEGTSDLARGQDVDMEGVRGDVSVEQDGRESTDETRVVQTSRDDVQGGNSSGISGTAAPSSPKRALTTANEALPDQEPRVDLPTEMERDIEPAIHPATSALYIKNFMRPLRPQAVQDHLLDLATPSGASIEESTIVDFYLDTIRTHAFVVFNSVSAASRVRTALHDRIWPDETNRKPLWVDFIPPERFSDWVDMEQESSGGRGSASRYEVTYENDGDGSVTARLQETGAAPPTTKQPPSQPPQPERRMSIPSGPSRPFPGVEGAPLGPRGFQQGGRGPAVHPSRLERLSEQSLTTRAYPNISYKPVSEDLAERRLSILSEAKTRDYDRDFGKEYKRYYFENGDYLVDRGPEIFLGIRPPHRERERRRGLAGGRRGGGGGRGGGGPRRGGGGPPLYHGVPRGGDRFRPQDPSGSGYNGRSRYGDDRGGDRYRGGTYNRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.53
4 0.5
5 0.53
6 0.51
7 0.53
8 0.49
9 0.47
10 0.48
11 0.55
12 0.52
13 0.48
14 0.43
15 0.37
16 0.35
17 0.34
18 0.28
19 0.18
20 0.17
21 0.14
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.08
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.1
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.16
42 0.17
43 0.19
44 0.16
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.14
79 0.12
80 0.16
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.18
85 0.22
86 0.21
87 0.21
88 0.2
89 0.2
90 0.23
91 0.24
92 0.26
93 0.22
94 0.23
95 0.24
96 0.22
97 0.19
98 0.15
99 0.13
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.19
120 0.24
121 0.27
122 0.35
123 0.43
124 0.51
125 0.57
126 0.64
127 0.66
128 0.72
129 0.79
130 0.81
131 0.83
132 0.84
133 0.81
134 0.75
135 0.69
136 0.62
137 0.6
138 0.51
139 0.51
140 0.48
141 0.47
142 0.5
143 0.54
144 0.56
145 0.53
146 0.58
147 0.56
148 0.53
149 0.53
150 0.5
151 0.42
152 0.36
153 0.29
154 0.22
155 0.15
156 0.12
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.17
198 0.19
199 0.19
200 0.16
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.09
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.12
213 0.14
214 0.15
215 0.16
216 0.17
217 0.21
218 0.24
219 0.31
220 0.3
221 0.29
222 0.28
223 0.26
224 0.27
225 0.24
226 0.2
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.1
256 0.14
257 0.16
258 0.15
259 0.19
260 0.21
261 0.27
262 0.31
263 0.32
264 0.3
265 0.31
266 0.35
267 0.33
268 0.31
269 0.25
270 0.2
271 0.18
272 0.15
273 0.12
274 0.07
275 0.04
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.08
300 0.07
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.1
314 0.15
315 0.19
316 0.2
317 0.23
318 0.23
319 0.26
320 0.28
321 0.26
322 0.25
323 0.29
324 0.29
325 0.33
326 0.32
327 0.3
328 0.28
329 0.28
330 0.31
331 0.23
332 0.24
333 0.2
334 0.27
335 0.28
336 0.28
337 0.3
338 0.24
339 0.24
340 0.22
341 0.22
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.09
350 0.08
351 0.06
352 0.05
353 0.04
354 0.05
355 0.07
356 0.09
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.14
361 0.16
362 0.18
363 0.19
364 0.17
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.1
370 0.08
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.1
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.18
385 0.21
386 0.21
387 0.21
388 0.27
389 0.35
390 0.42
391 0.49
392 0.53
393 0.56
394 0.65
395 0.7
396 0.66
397 0.62
398 0.6
399 0.56
400 0.5
401 0.49
402 0.46
403 0.45
404 0.47
405 0.45
406 0.41
407 0.4
408 0.4
409 0.33
410 0.27
411 0.25
412 0.19
413 0.18
414 0.19
415 0.16
416 0.15
417 0.16
418 0.15
419 0.11
420 0.1
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.18
425 0.23
426 0.27
427 0.28
428 0.28
429 0.24
430 0.3
431 0.32
432 0.29
433 0.24
434 0.25
435 0.3
436 0.31
437 0.33
438 0.27
439 0.3
440 0.33
441 0.33
442 0.3
443 0.26
444 0.27
445 0.26
446 0.27
447 0.24
448 0.2
449 0.21
450 0.23
451 0.26
452 0.29
453 0.31
454 0.3
455 0.27
456 0.32
457 0.31
458 0.3
459 0.26
460 0.26
461 0.27
462 0.32
463 0.31
464 0.26
465 0.25
466 0.24
467 0.23
468 0.21
469 0.22
470 0.18
471 0.24
472 0.26
473 0.27
474 0.3
475 0.31
476 0.34
477 0.32
478 0.35
479 0.33
480 0.37
481 0.39
482 0.42
483 0.49
484 0.49
485 0.49
486 0.52
487 0.51
488 0.48
489 0.5
490 0.51
491 0.45
492 0.43
493 0.42
494 0.36
495 0.34
496 0.32
497 0.27
498 0.19
499 0.17
500 0.13
501 0.11
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.15
507 0.19
508 0.23
509 0.3
510 0.34
511 0.43
512 0.51
513 0.61
514 0.64
515 0.71
516 0.77
517 0.77
518 0.76
519 0.74
520 0.72
521 0.72
522 0.71
523 0.66
524 0.57
525 0.51
526 0.48
527 0.4
528 0.34
529 0.26
530 0.18
531 0.13
532 0.13
533 0.14
534 0.18
535 0.19
536 0.18
537 0.17
538 0.2
539 0.19
540 0.19
541 0.23
542 0.27
543 0.26
544 0.28
545 0.31
546 0.29
547 0.29
548 0.29
549 0.27
550 0.22
551 0.25
552 0.28
553 0.28
554 0.33
555 0.39
556 0.44
557 0.45
558 0.5
559 0.47
560 0.49
561 0.48
562 0.47
563 0.44
564 0.42
565 0.41
566 0.39
567 0.45
568 0.4
569 0.39
570 0.36
571 0.37
572 0.38
573 0.41
574 0.42
575 0.37
576 0.39
577 0.45
578 0.48
579 0.45
580 0.4
581 0.37
582 0.34
583 0.36