Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TMI8

Protein Details
Accession A0A4Q4TMI8    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-36MDPRHQPPQHQHQHQQQLQHQHQQHQHQHQHHQPHPHydrophilic
739-762HAPEPPAKPARKRRKAKSDEDGKGBasic
1080-1101AAPQSRLRGRARRERIHKAMSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
743-758PPAKPARKRRKAKSDE
772-780PAGRAKRAK
1089-1092RARR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MDPRHQPPQHQHQHQQQLQHQHQQHQHQHQHHQPHPAQHPFTRATNVTSPPPSSSSFARSPFPPGPNASYPPPSHHPPASASPAAAYADHQQRASETSQPYYPQHSQQSRPPPSYAPDPTPHPNPTHSRHRSSSSVGTPMVNRNMPPPSPPQQHPHPHQVAHFGAPPAPRGPPMNIGPPNAFPSGRELPPLNAGRAGSAGGGMSISAMLGNAAGAPGPREPTPGGHPSFAPPPTSAPVSGPAYTSSVHASPRLQTASAEFNNPYTRRPQTPDQVRPFDARDPRGSAAGSPPQQPMYGTPEVARFGTPQAYQGRGPPMPLADERREPPGRILAGSMPPRPSSQPRALGGVGSRSVDLGRGPAPAEVVYGRREDVRPGQMEFHPEGPPRTMPYEEHRRFASEREVKEHMEREAEFREREFRESQFRERERVQMEEQRFMAERSRMVEAEREREMRMRNRRERTTSDPTRQAQHPADFGPQGPPRQPPPYARPDPRDPRDPREPRDVRDSRDPRDPGSWPQPGYDRPAGPPGPYDHPYPPRPNDFPSTTAGPYGTHPAYAQHPPDRFPPVGPPPAHAIPTSQPGPPPVHPYDSPERQRLGLPHAQHQIQQGAHRARPGEEGPPPPSVAYNGGPGPGFHDARPRPADDGPIHNAQARSLLAVHEMNRKGRVSPLPQAVQGAQPQLQGPADEPRIKSEFGRMFSGIGSGVRGIGAPSPVPGGAQLAHTNASLARRDDNEASHEHAPEPPAKPARKRRKAKSDEDGKGEEDSTGRSTPAGRAKRAKTLGHHHHHHHHHHHHHAPERTSSPLQVGNAVLKNLKTNTPVPPPAGVGKELALTHHHQPPRSTAIQPSKPAVITPTIVPKPKKRVSSQAVLESVADRPRKHLGDVIYRVQLKPAGLHAPHSKHGFASTPVPLPKDRISNNENSTLTVKVPRAHLTPAAREEITSRRAIWGTDVYTDDSDVVAACIHAGWIRGEWGEDVDPDLLDLRKSDSSKSQNRAPPASIEEKHQEVLTSPPPTGPVQVPVGRDLHVTVLILPSLEKYTGSTRFGISSREWGGVYNGHRSEHDGISFMIWSIRWVDGAAPQSRLRGRARRERIHKAMSEVLRSQIVNVGEKELLAKKANAGPGDRIVEVDKENRPVVVDAKGTTGVAPDQEVKEKSPERDTAKNSTGETEDRVAAEMASDNANAEKREPNQVQTVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.8
3 0.75
4 0.75
5 0.73
6 0.74
7 0.69
8 0.67
9 0.71
10 0.72
11 0.75
12 0.75
13 0.78
14 0.76
15 0.8
16 0.79
17 0.82
18 0.77
19 0.78
20 0.72
21 0.72
22 0.73
23 0.73
24 0.7
25 0.63
26 0.65
27 0.59
28 0.57
29 0.54
30 0.47
31 0.43
32 0.44
33 0.44
34 0.44
35 0.44
36 0.43
37 0.39
38 0.41
39 0.38
40 0.35
41 0.35
42 0.35
43 0.37
44 0.38
45 0.38
46 0.37
47 0.41
48 0.45
49 0.45
50 0.43
51 0.41
52 0.45
53 0.47
54 0.5
55 0.48
56 0.47
57 0.46
58 0.48
59 0.5
60 0.49
61 0.49
62 0.48
63 0.45
64 0.43
65 0.48
66 0.49
67 0.44
68 0.38
69 0.32
70 0.31
71 0.29
72 0.24
73 0.19
74 0.2
75 0.26
76 0.29
77 0.28
78 0.27
79 0.27
80 0.31
81 0.31
82 0.3
83 0.26
84 0.27
85 0.3
86 0.34
87 0.35
88 0.39
89 0.41
90 0.41
91 0.49
92 0.52
93 0.54
94 0.59
95 0.67
96 0.68
97 0.67
98 0.62
99 0.56
100 0.54
101 0.58
102 0.55
103 0.5
104 0.46
105 0.49
106 0.52
107 0.55
108 0.54
109 0.48
110 0.49
111 0.51
112 0.54
113 0.59
114 0.6
115 0.61
116 0.62
117 0.65
118 0.62
119 0.61
120 0.61
121 0.54
122 0.52
123 0.45
124 0.42
125 0.4
126 0.42
127 0.42
128 0.36
129 0.32
130 0.32
131 0.35
132 0.34
133 0.34
134 0.35
135 0.39
136 0.44
137 0.48
138 0.5
139 0.55
140 0.64
141 0.67
142 0.7
143 0.67
144 0.62
145 0.6
146 0.6
147 0.52
148 0.45
149 0.42
150 0.33
151 0.3
152 0.29
153 0.29
154 0.24
155 0.23
156 0.22
157 0.22
158 0.24
159 0.27
160 0.29
161 0.36
162 0.37
163 0.39
164 0.39
165 0.38
166 0.39
167 0.35
168 0.32
169 0.23
170 0.27
171 0.3
172 0.28
173 0.29
174 0.27
175 0.26
176 0.35
177 0.37
178 0.31
179 0.27
180 0.26
181 0.23
182 0.22
183 0.21
184 0.12
185 0.1
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.05
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.23
210 0.29
211 0.3
212 0.29
213 0.29
214 0.3
215 0.35
216 0.33
217 0.29
218 0.23
219 0.24
220 0.25
221 0.27
222 0.24
223 0.19
224 0.23
225 0.25
226 0.24
227 0.22
228 0.2
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.22
239 0.23
240 0.2
241 0.19
242 0.21
243 0.26
244 0.26
245 0.27
246 0.22
247 0.24
248 0.3
249 0.31
250 0.3
251 0.28
252 0.32
253 0.35
254 0.4
255 0.45
256 0.48
257 0.58
258 0.66
259 0.68
260 0.69
261 0.67
262 0.64
263 0.59
264 0.57
265 0.53
266 0.47
267 0.42
268 0.41
269 0.4
270 0.38
271 0.35
272 0.29
273 0.27
274 0.3
275 0.29
276 0.27
277 0.28
278 0.27
279 0.27
280 0.26
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.2
285 0.2
286 0.21
287 0.22
288 0.22
289 0.2
290 0.14
291 0.14
292 0.17
293 0.16
294 0.19
295 0.21
296 0.23
297 0.23
298 0.26
299 0.3
300 0.26
301 0.27
302 0.23
303 0.21
304 0.21
305 0.24
306 0.26
307 0.24
308 0.28
309 0.29
310 0.36
311 0.37
312 0.35
313 0.34
314 0.34
315 0.31
316 0.27
317 0.27
318 0.22
319 0.26
320 0.3
321 0.3
322 0.26
323 0.26
324 0.27
325 0.3
326 0.33
327 0.34
328 0.37
329 0.41
330 0.4
331 0.43
332 0.41
333 0.38
334 0.33
335 0.29
336 0.23
337 0.17
338 0.15
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.17
359 0.21
360 0.26
361 0.26
362 0.27
363 0.3
364 0.29
365 0.33
366 0.31
367 0.28
368 0.25
369 0.25
370 0.25
371 0.23
372 0.23
373 0.21
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.27
378 0.37
379 0.36
380 0.38
381 0.36
382 0.37
383 0.36
384 0.37
385 0.39
386 0.35
387 0.35
388 0.37
389 0.4
390 0.38
391 0.41
392 0.4
393 0.31
394 0.27
395 0.26
396 0.24
397 0.25
398 0.27
399 0.23
400 0.22
401 0.28
402 0.26
403 0.29
404 0.28
405 0.27
406 0.33
407 0.37
408 0.43
409 0.46
410 0.46
411 0.47
412 0.47
413 0.5
414 0.43
415 0.43
416 0.41
417 0.38
418 0.39
419 0.37
420 0.36
421 0.31
422 0.29
423 0.26
424 0.25
425 0.19
426 0.18
427 0.17
428 0.19
429 0.17
430 0.17
431 0.22
432 0.2
433 0.23
434 0.25
435 0.24
436 0.23
437 0.26
438 0.31
439 0.35
440 0.43
441 0.49
442 0.55
443 0.62
444 0.67
445 0.69
446 0.7
447 0.69
448 0.69
449 0.67
450 0.64
451 0.64
452 0.59
453 0.59
454 0.54
455 0.52
456 0.45
457 0.39
458 0.34
459 0.28
460 0.28
461 0.24
462 0.23
463 0.23
464 0.22
465 0.22
466 0.22
467 0.24
468 0.26
469 0.29
470 0.32
471 0.31
472 0.35
473 0.43
474 0.48
475 0.51
476 0.53
477 0.59
478 0.66
479 0.65
480 0.68
481 0.63
482 0.62
483 0.67
484 0.67
485 0.62
486 0.64
487 0.62
488 0.55
489 0.61
490 0.57
491 0.51
492 0.55
493 0.55
494 0.48
495 0.53
496 0.51
497 0.43
498 0.43
499 0.41
500 0.35
501 0.38
502 0.38
503 0.3
504 0.31
505 0.32
506 0.29
507 0.33
508 0.32
509 0.25
510 0.22
511 0.28
512 0.27
513 0.24
514 0.24
515 0.22
516 0.23
517 0.24
518 0.25
519 0.25
520 0.31
521 0.35
522 0.39
523 0.4
524 0.41
525 0.41
526 0.41
527 0.42
528 0.38
529 0.35
530 0.32
531 0.31
532 0.26
533 0.24
534 0.21
535 0.16
536 0.15
537 0.17
538 0.14
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.15
543 0.18
544 0.2
545 0.2
546 0.21
547 0.23
548 0.26
549 0.29
550 0.26
551 0.23
552 0.26
553 0.26
554 0.32
555 0.3
556 0.29
557 0.29
558 0.3
559 0.3
560 0.24
561 0.21
562 0.16
563 0.2
564 0.2
565 0.15
566 0.15
567 0.16
568 0.19
569 0.19
570 0.24
571 0.21
572 0.23
573 0.23
574 0.28
575 0.32
576 0.37
577 0.4
578 0.36
579 0.36
580 0.33
581 0.35
582 0.31
583 0.3
584 0.26
585 0.23
586 0.26
587 0.28
588 0.28
589 0.28
590 0.28
591 0.25
592 0.22
593 0.23
594 0.24
595 0.23
596 0.24
597 0.23
598 0.23
599 0.2
600 0.22
601 0.21
602 0.18
603 0.19
604 0.21
605 0.22
606 0.23
607 0.22
608 0.2
609 0.19
610 0.16
611 0.14
612 0.12
613 0.12
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.11
618 0.12
619 0.13
620 0.13
621 0.11
622 0.2
623 0.2
624 0.25
625 0.27
626 0.26
627 0.25
628 0.25
629 0.29
630 0.23
631 0.27
632 0.25
633 0.25
634 0.25
635 0.24
636 0.24
637 0.19
638 0.19
639 0.14
640 0.11
641 0.09
642 0.09
643 0.08
644 0.1
645 0.12
646 0.17
647 0.18
648 0.19
649 0.22
650 0.22
651 0.21
652 0.24
653 0.27
654 0.24
655 0.29
656 0.33
657 0.32
658 0.32
659 0.32
660 0.29
661 0.26
662 0.23
663 0.18
664 0.14
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.12
669 0.1
670 0.1
671 0.12
672 0.15
673 0.17
674 0.17
675 0.2
676 0.22
677 0.22
678 0.22
679 0.25
680 0.26
681 0.25
682 0.27
683 0.24
684 0.22
685 0.22
686 0.22
687 0.14
688 0.1
689 0.08
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.07
706 0.08
707 0.08
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.11
713 0.11
714 0.12
715 0.13
716 0.14
717 0.17
718 0.18
719 0.18
720 0.19
721 0.18
722 0.21
723 0.21
724 0.2
725 0.18
726 0.18
727 0.18
728 0.2
729 0.2
730 0.22
731 0.28
732 0.31
733 0.39
734 0.49
735 0.59
736 0.65
737 0.73
738 0.77
739 0.81
740 0.86
741 0.85
742 0.85
743 0.84
744 0.78
745 0.74
746 0.66
747 0.55
748 0.48
749 0.39
750 0.3
751 0.19
752 0.16
753 0.13
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.11
758 0.15
759 0.24
760 0.27
761 0.3
762 0.37
763 0.4
764 0.48
765 0.52
766 0.5
767 0.48
768 0.53
769 0.58
770 0.58
771 0.61
772 0.58
773 0.62
774 0.66
775 0.68
776 0.67
777 0.67
778 0.66
779 0.69
780 0.7
781 0.67
782 0.67
783 0.65
784 0.58
785 0.53
786 0.47
787 0.44
788 0.38
789 0.33
790 0.28
791 0.24
792 0.22
793 0.19
794 0.18
795 0.17
796 0.17
797 0.18
798 0.17
799 0.14
800 0.17
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.2
805 0.25
806 0.3
807 0.33
808 0.31
809 0.31
810 0.3
811 0.3
812 0.28
813 0.23
814 0.17
815 0.15
816 0.16
817 0.14
818 0.14
819 0.14
820 0.15
821 0.19
822 0.25
823 0.27
824 0.27
825 0.29
826 0.32
827 0.36
828 0.36
829 0.33
830 0.35
831 0.42
832 0.46
833 0.47
834 0.45
835 0.4
836 0.37
837 0.35
838 0.29
839 0.22
840 0.17
841 0.16
842 0.23
843 0.25
844 0.3
845 0.34
846 0.39
847 0.47
848 0.52
849 0.58
850 0.54
851 0.6
852 0.61
853 0.66
854 0.63
855 0.6
856 0.55
857 0.48
858 0.44
859 0.34
860 0.31
861 0.27
862 0.26
863 0.19
864 0.21
865 0.27
866 0.28
867 0.29
868 0.3
869 0.3
870 0.36
871 0.41
872 0.42
873 0.41
874 0.41
875 0.4
876 0.37
877 0.34
878 0.24
879 0.21
880 0.2
881 0.2
882 0.19
883 0.24
884 0.3
885 0.31
886 0.36
887 0.37
888 0.34
889 0.28
890 0.3
891 0.27
892 0.22
893 0.23
894 0.22
895 0.24
896 0.26
897 0.28
898 0.27
899 0.29
900 0.31
901 0.34
902 0.33
903 0.35
904 0.38
905 0.44
906 0.46
907 0.49
908 0.45
909 0.4
910 0.39
911 0.33
912 0.3
913 0.27
914 0.26
915 0.22
916 0.25
917 0.26
918 0.27
919 0.28
920 0.33
921 0.32
922 0.35
923 0.35
924 0.36
925 0.32
926 0.3
927 0.3
928 0.3
929 0.29
930 0.26
931 0.23
932 0.22
933 0.23
934 0.23
935 0.23
936 0.22
937 0.2
938 0.21
939 0.22
940 0.21
941 0.2
942 0.2
943 0.17
944 0.13
945 0.11
946 0.09
947 0.07
948 0.05
949 0.05
950 0.04
951 0.04
952 0.04
953 0.05
954 0.06
955 0.07
956 0.07
957 0.09
958 0.09
959 0.1
960 0.1
961 0.11
962 0.11
963 0.1
964 0.12
965 0.11
966 0.1
967 0.1
968 0.11
969 0.1
970 0.09
971 0.1
972 0.12
973 0.16
974 0.17
975 0.2
976 0.27
977 0.36
978 0.45
979 0.5
980 0.55
981 0.56
982 0.61
983 0.62
984 0.55
985 0.5
986 0.47
987 0.5
988 0.42
989 0.42
990 0.4
991 0.38
992 0.37
993 0.33
994 0.28
995 0.21
996 0.25
997 0.26
998 0.24
999 0.21
1000 0.21
1001 0.23
1002 0.24
1003 0.26
1004 0.22
1005 0.19
1006 0.24
1007 0.27
1008 0.28
1009 0.28
1010 0.28
1011 0.26
1012 0.25
1013 0.22
1014 0.17
1015 0.14
1016 0.13
1017 0.11
1018 0.11
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.1
1024 0.1
1025 0.09
1026 0.11
1027 0.17
1028 0.22
1029 0.24
1030 0.24
1031 0.24
1032 0.27
1033 0.28
1034 0.29
1035 0.25
1036 0.27
1037 0.27
1038 0.27
1039 0.26
1040 0.24
1041 0.25
1042 0.27
1043 0.27
1044 0.29
1045 0.28
1046 0.27
1047 0.28
1048 0.32
1049 0.34
1050 0.31
1051 0.3
1052 0.23
1053 0.21
1054 0.21
1055 0.21
1056 0.16
1057 0.13
1058 0.1
1059 0.1
1060 0.11
1061 0.11
1062 0.1
1063 0.1
1064 0.11
1065 0.15
1066 0.21
1067 0.23
1068 0.24
1069 0.25
1070 0.31
1071 0.33
1072 0.38
1073 0.41
1074 0.43
1075 0.5
1076 0.57
1077 0.66
1078 0.71
1079 0.77
1080 0.82
1081 0.82
1082 0.82
1083 0.76
1084 0.71
1085 0.69
1086 0.63
1087 0.59
1088 0.51
1089 0.45
1090 0.4
1091 0.37
1092 0.32
1093 0.28
1094 0.26
1095 0.25
1096 0.24
1097 0.24
1098 0.21
1099 0.21
1100 0.24
1101 0.23
1102 0.25
1103 0.23
1104 0.23
1105 0.24
1106 0.3
1107 0.34
1108 0.33
1109 0.32
1110 0.32
1111 0.35
1112 0.37
1113 0.33
1114 0.29
1115 0.27
1116 0.26
1117 0.27
1118 0.29
1119 0.28
1120 0.29
1121 0.3
1122 0.29
1123 0.29
1124 0.28
1125 0.28
1126 0.27
1127 0.25
1128 0.21
1129 0.24
1130 0.24
1131 0.22
1132 0.2
1133 0.19
1134 0.15
1135 0.13
1136 0.15
1137 0.17
1138 0.19
1139 0.25
1140 0.27
1141 0.28
1142 0.36
1143 0.41
1144 0.43
1145 0.45
1146 0.5
1147 0.5
1148 0.57
1149 0.6
1150 0.6
1151 0.6
1152 0.59
1153 0.53
1154 0.49
1155 0.46
1156 0.4
1157 0.38
1158 0.33
1159 0.29
1160 0.25
1161 0.26
1162 0.22
1163 0.18
1164 0.17
1165 0.14
1166 0.12
1167 0.12
1168 0.12
1169 0.11
1170 0.14
1171 0.17
1172 0.17
1173 0.18
1174 0.23
1175 0.25
1176 0.36
1177 0.38
1178 0.39