Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XFS1

Protein Details
Accession A0A4V1XFS1    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-54LKFFHKLPKGTKPKEPEREPBasic
299-322ATEEKRRRREYRQMQKERFKRPEPBasic
596-619STSLAYRKSPDKTRQRLPPPAPVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-63KLPKGTKPKEPEREPSPPAPKRPP
302-320EKRRRREYRQMQKERFKRP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MADVESSELSSLSSLSPAPSEDEGDVELKQDKGILKFFHKLPKGTKPKEPEREPSPPAPKRPPSPPHDYVLADNPDIAFIVMFRSRFNDAFPKSVPNFGPQELERDVTESVPGQRAEQFLCAVLGLLLNRKQDVKPGHYNRALEDAISSHKNQWPRAWEEKNPLSGGNTFTTMNPTQRLTLLRTLILWTLSSSEVVKGIINKSYKQNRHEDDLNQPLSVQPWGSDSDKRRYYLIEGLDDTAFRVYRESNPQGFNRTWWSVAGNIEELNALVDKLQTVDGGPKAKKLAQKMLAAIPRFEATEEKRRRREYRQMQKERFKRPEPGFSMYEGRTRGKRIKYTYSDDEDFLTDSSNRRSTRNTGTHTPAEPAGPVTTASGRQVKAPSRMTVDASNNIVTTSPDGDNETVRSKESSVGPTGRPRRSAAVNHGTNGWSSAKTRGRGYNSMDEDEDEDESEPDLGDDEEEDHVPDETEDEDEDDLSGDEEMADDEVDDNSRKSHIVTMKVPTKAGAEDKESALNLDDYRYNGSESKPKSAKSAETAENNAPEERNEESIAAVPTKKRAGAAPSSAQASGGEKNAEASADEPQLRPTTPGPLQSTSLAYRKSPDKTRQRLPPPAPVDVGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.15
14 0.17
15 0.15
16 0.14
17 0.17
18 0.19
19 0.21
20 0.27
21 0.29
22 0.32
23 0.39
24 0.44
25 0.5
26 0.52
27 0.54
28 0.55
29 0.62
30 0.67
31 0.66
32 0.7
33 0.7
34 0.76
35 0.8
36 0.8
37 0.77
38 0.74
39 0.77
40 0.75
41 0.75
42 0.75
43 0.71
44 0.73
45 0.75
46 0.75
47 0.73
48 0.77
49 0.76
50 0.72
51 0.75
52 0.7
53 0.65
54 0.62
55 0.57
56 0.5
57 0.49
58 0.45
59 0.36
60 0.32
61 0.27
62 0.22
63 0.21
64 0.17
65 0.09
66 0.05
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.15
72 0.19
73 0.2
74 0.24
75 0.29
76 0.29
77 0.34
78 0.35
79 0.4
80 0.37
81 0.43
82 0.4
83 0.36
84 0.37
85 0.34
86 0.37
87 0.29
88 0.33
89 0.29
90 0.29
91 0.24
92 0.23
93 0.22
94 0.17
95 0.18
96 0.15
97 0.16
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.2
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.11
114 0.14
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.19
119 0.25
120 0.31
121 0.34
122 0.41
123 0.48
124 0.55
125 0.58
126 0.58
127 0.53
128 0.52
129 0.45
130 0.34
131 0.27
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.23
138 0.28
139 0.3
140 0.33
141 0.35
142 0.4
143 0.49
144 0.5
145 0.52
146 0.56
147 0.58
148 0.57
149 0.51
150 0.44
151 0.37
152 0.33
153 0.31
154 0.23
155 0.2
156 0.16
157 0.16
158 0.21
159 0.2
160 0.21
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.22
165 0.24
166 0.22
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.18
174 0.14
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.16
187 0.17
188 0.19
189 0.28
190 0.37
191 0.43
192 0.45
193 0.53
194 0.51
195 0.55
196 0.57
197 0.52
198 0.5
199 0.52
200 0.47
201 0.38
202 0.35
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.15
207 0.07
208 0.08
209 0.11
210 0.13
211 0.19
212 0.22
213 0.3
214 0.34
215 0.35
216 0.34
217 0.32
218 0.33
219 0.33
220 0.3
221 0.24
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.2
226 0.17
227 0.13
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.12
233 0.2
234 0.25
235 0.28
236 0.32
237 0.33
238 0.37
239 0.36
240 0.33
241 0.31
242 0.27
243 0.23
244 0.2
245 0.2
246 0.17
247 0.18
248 0.17
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.07
265 0.09
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.21
271 0.24
272 0.25
273 0.3
274 0.31
275 0.33
276 0.33
277 0.37
278 0.38
279 0.35
280 0.31
281 0.24
282 0.19
283 0.17
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.24
288 0.32
289 0.39
290 0.45
291 0.51
292 0.57
293 0.61
294 0.68
295 0.69
296 0.71
297 0.75
298 0.79
299 0.81
300 0.85
301 0.86
302 0.84
303 0.8
304 0.72
305 0.7
306 0.63
307 0.64
308 0.59
309 0.56
310 0.47
311 0.42
312 0.43
313 0.34
314 0.34
315 0.27
316 0.25
317 0.22
318 0.25
319 0.29
320 0.3
321 0.36
322 0.38
323 0.44
324 0.48
325 0.53
326 0.54
327 0.53
328 0.49
329 0.43
330 0.39
331 0.31
332 0.26
333 0.19
334 0.14
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.18
339 0.18
340 0.19
341 0.23
342 0.27
343 0.35
344 0.41
345 0.43
346 0.42
347 0.46
348 0.48
349 0.46
350 0.42
351 0.33
352 0.26
353 0.21
354 0.17
355 0.12
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.11
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.21
366 0.24
367 0.3
368 0.32
369 0.31
370 0.32
371 0.33
372 0.32
373 0.32
374 0.31
375 0.27
376 0.26
377 0.24
378 0.2
379 0.18
380 0.16
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.15
390 0.16
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.17
396 0.19
397 0.2
398 0.21
399 0.24
400 0.26
401 0.34
402 0.41
403 0.41
404 0.4
405 0.39
406 0.39
407 0.42
408 0.44
409 0.44
410 0.45
411 0.44
412 0.42
413 0.41
414 0.37
415 0.32
416 0.3
417 0.22
418 0.13
419 0.13
420 0.21
421 0.24
422 0.27
423 0.31
424 0.35
425 0.4
426 0.44
427 0.48
428 0.49
429 0.47
430 0.46
431 0.42
432 0.36
433 0.32
434 0.28
435 0.22
436 0.14
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.17
484 0.21
485 0.27
486 0.31
487 0.38
488 0.44
489 0.46
490 0.45
491 0.39
492 0.35
493 0.32
494 0.32
495 0.27
496 0.25
497 0.26
498 0.27
499 0.28
500 0.26
501 0.24
502 0.2
503 0.19
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.14
508 0.18
509 0.18
510 0.19
511 0.19
512 0.22
513 0.28
514 0.3
515 0.38
516 0.39
517 0.39
518 0.43
519 0.45
520 0.46
521 0.44
522 0.48
523 0.45
524 0.45
525 0.49
526 0.47
527 0.45
528 0.43
529 0.38
530 0.31
531 0.26
532 0.24
533 0.21
534 0.21
535 0.18
536 0.17
537 0.16
538 0.19
539 0.2
540 0.2
541 0.21
542 0.2
543 0.23
544 0.26
545 0.26
546 0.24
547 0.26
548 0.3
549 0.34
550 0.39
551 0.39
552 0.39
553 0.41
554 0.39
555 0.35
556 0.3
557 0.26
558 0.22
559 0.19
560 0.17
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.16
565 0.14
566 0.12
567 0.14
568 0.18
569 0.2
570 0.19
571 0.22
572 0.25
573 0.25
574 0.27
575 0.24
576 0.27
577 0.29
578 0.36
579 0.38
580 0.38
581 0.4
582 0.39
583 0.42
584 0.38
585 0.41
586 0.36
587 0.32
588 0.34
589 0.39
590 0.45
591 0.5
592 0.56
593 0.61
594 0.68
595 0.76
596 0.81
597 0.84
598 0.87
599 0.83
600 0.83
601 0.77
602 0.72