Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TUM4

Protein Details
Accession A0A4Q4TUM4    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-103DRDSYREDRNRDKDRRRRSRSRSPRSDRRDRHRSPSRNRRDRDRDRDHDRQRTRRDDRDRYRERERDBasic
256-275GAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-110REDRNRDKDRRRRSRSRSPRSDRRDRHRSPSRNRRDRDRDRDHDRQRTRRDDRDRYRERERDRRRDEAV
113-141FSKSRRQTARDRESRRSTSPPARDPPAKL
152-160ARPKDDRPR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MVDLPRRGRNRPDSRQMWDESDRRNRHGPDARDRRDDRDSYREDRNRDKDRRRRSRSRSPRSDRRDRHRSPSRNRRDRDRDRDHDRQRTRRDDRDRYRERERDRRRDEAVEDFSKSRRQTARDRESRRSTSPPARDPPAKLDRSPLDSPLPARPKDDRPRSRGTGTPLSFKVGKHEDGESRRRDDRSKSYDAKDSPRPEERNGASTAQGNAMDVDDAEDDEDVEVVDDGLAAMQAMMGFGGFGTTKGTHIPGNNVGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.77
3 0.72
4 0.67
5 0.65
6 0.61
7 0.59
8 0.63
9 0.61
10 0.6
11 0.64
12 0.6
13 0.62
14 0.65
15 0.64
16 0.64
17 0.71
18 0.72
19 0.74
20 0.74
21 0.7
22 0.69
23 0.66
24 0.61
25 0.6
26 0.59
27 0.54
28 0.62
29 0.62
30 0.6
31 0.65
32 0.69
33 0.7
34 0.74
35 0.8
36 0.79
37 0.84
38 0.9
39 0.89
40 0.9
41 0.89
42 0.9
43 0.91
44 0.92
45 0.92
46 0.91
47 0.92
48 0.9
49 0.92
50 0.9
51 0.89
52 0.89
53 0.83
54 0.83
55 0.84
56 0.84
57 0.84
58 0.86
59 0.87
60 0.86
61 0.85
62 0.85
63 0.86
64 0.86
65 0.86
66 0.85
67 0.83
68 0.81
69 0.87
70 0.86
71 0.85
72 0.83
73 0.82
74 0.81
75 0.82
76 0.81
77 0.8
78 0.81
79 0.82
80 0.82
81 0.84
82 0.83
83 0.79
84 0.82
85 0.8
86 0.78
87 0.78
88 0.78
89 0.78
90 0.76
91 0.75
92 0.7
93 0.66
94 0.6
95 0.56
96 0.52
97 0.43
98 0.39
99 0.34
100 0.31
101 0.33
102 0.3
103 0.29
104 0.27
105 0.3
106 0.37
107 0.47
108 0.56
109 0.6
110 0.67
111 0.69
112 0.72
113 0.72
114 0.67
115 0.61
116 0.57
117 0.56
118 0.56
119 0.53
120 0.5
121 0.5
122 0.49
123 0.45
124 0.47
125 0.46
126 0.42
127 0.36
128 0.37
129 0.34
130 0.37
131 0.37
132 0.31
133 0.24
134 0.23
135 0.25
136 0.27
137 0.31
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.36
142 0.45
143 0.54
144 0.54
145 0.55
146 0.62
147 0.63
148 0.62
149 0.56
150 0.53
151 0.51
152 0.45
153 0.44
154 0.37
155 0.36
156 0.35
157 0.31
158 0.31
159 0.25
160 0.25
161 0.22
162 0.24
163 0.27
164 0.32
165 0.39
166 0.37
167 0.38
168 0.41
169 0.42
170 0.43
171 0.44
172 0.48
173 0.48
174 0.52
175 0.53
176 0.53
177 0.57
178 0.57
179 0.56
180 0.55
181 0.52
182 0.5
183 0.53
184 0.53
185 0.48
186 0.53
187 0.48
188 0.44
189 0.42
190 0.37
191 0.3
192 0.29
193 0.27
194 0.21
195 0.18
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.07
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.02
227 0.04
228 0.03
229 0.04
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.11
234 0.13
235 0.15
236 0.17
237 0.22
238 0.24
239 0.26
240 0.28
241 0.28
242 0.27
243 0.29
244 0.35
245 0.35
246 0.35
247 0.37
248 0.41
249 0.5
250 0.59
251 0.65
252 0.67
253 0.72
254 0.76
255 0.8
256 0.82
257 0.78
258 0.72
259 0.65
260 0.57
261 0.54
262 0.5
263 0.45
264 0.4