FuNGI

A0A4Q9LGA6

Protein Details

Accession

A0A4Q9LGA6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
563-597	LSSANRVSKKEKKNGTKNTKEKPKKPNPVSSKDNL	Hydrophilic
662-682	QNTTRKQPTAPKNSKFKNNHL	Hydrophilic
719-773	KDEKILKSKIENKKTNNKKKPNNKSKKDVSDKKCKNLNKTKNNKNKSVDDKDKEK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
570-588	SKKEKKNGTKNTKEKPKKP
724-765	LKSKIENKKTNNKKKPNNKSKKDVSDKKCKNLNKTKNNKNKS

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC

Amino Acid Sequences

MKEILEKCTELIRAVNSTIARTNRYQMNDSSLNENNSIAESITKISELLNKFDENFFDKTTARIDHILCNLNKQPVHSKIIKIIKDKKVIFYFGDGNAKPLNVEFPILNLNCTHLLKKSDFLELENNFYFKTWFSKSKGKQFVPTTEFLHVNYTPIFINSSAQISFIEEAIKSEKIICVDVKQHTFRSFRGYTTYLLLLSPSHSFIIDAVTLQYEIPKLSFLNCSIKKIVPNTNCLEILKRDFNLEMGCVYNLENDNNYRSVIVDWRINPLTEELYDFAFEKIFNSIIKIKEDLSENDCEGRSSFRITPITEEGIDMATINNLTPIKTGISEIDEKELARIFSTKYNFYNDGELLGKILKLRYFIAKSEDESLQFVMTDEQVQNVVVNKPSNIEQFFSCFDRISPLVRIHISDFLLTIKEKKSGFDIDKLKSLKTNENTDLETKEFMNSKTKISDSSNNFGPETKKTCFDLQDSQNRDCNNIKSDEDFSINSSNLDGNLDKELNTFKISNDDLTSQNNYSLNMNESTQQMSLDVKKSNFSEVIAGLNINEQSIETEIQNESALSSANRVSKKEKKNGTKNTKEKPKKPNPVSSKDNLNTQKSSKNISSETLPVNKSSSNTINNSDKSKHNKVTDQNSNIDKNSKVKNNKISTVDSKKSTVSQNTTRKQPTAPKNSKFKNNHLIFADSDDKKEISTDKIQNKNLKDIPQSTATSNKNDIKDEKILKSKIENKKTNNKKKPNNKSKKDVSDKKCKNLNKTKNNKNKSVDDKDKEKMSKNEKEDVKKQKDENPFDSLKNILDRNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.27
3	0.23
4	0.25
5	0.3
6	0.3
7	0.32
8	0.31
9	0.37
10	0.39
11	0.43
12	0.44
13	0.4
14	0.45
15	0.46
16	0.46
17	0.46
18	0.44
19	0.42
20	0.38
21	0.36
22	0.29
23	0.24
24	0.23
25	0.17
26	0.13
27	0.11
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.11
32	0.12
33	0.19
34	0.2
35	0.23
36	0.25
37	0.26
38	0.28
39	0.29
40	0.31
41	0.28
42	0.29
43	0.26
44	0.26
45	0.25
46	0.25
47	0.28
48	0.27
49	0.26
50	0.28
51	0.28
52	0.31
53	0.36
54	0.42
55	0.38
56	0.42
57	0.44
58	0.45
59	0.44
60	0.42
61	0.45
62	0.43
63	0.5
64	0.48
65	0.46
66	0.49
67	0.57
68	0.59
69	0.59
70	0.63
71	0.64
72	0.69
73	0.68
74	0.68
75	0.64
76	0.61
77	0.53
78	0.48
79	0.43
80	0.38
81	0.44
82	0.36
83	0.34
84	0.32
85	0.3
86	0.26
87	0.22
88	0.21
89	0.13
90	0.15
91	0.12
92	0.12
93	0.2
94	0.2
95	0.2
96	0.17
97	0.19
98	0.22
99	0.24
100	0.24
101	0.2
102	0.25
103	0.26
104	0.3
105	0.3
106	0.32
107	0.31
108	0.32
109	0.36
110	0.32
111	0.37
112	0.34
113	0.32
114	0.25
115	0.25
116	0.23
117	0.16
118	0.21
119	0.2
120	0.25
121	0.31
122	0.41
123	0.48
124	0.58
125	0.67
126	0.64
127	0.67
128	0.67
129	0.7
130	0.65
131	0.61
132	0.54
133	0.47
134	0.45
135	0.37
136	0.36
137	0.27
138	0.24
139	0.21
140	0.19
141	0.15
142	0.15
143	0.16
144	0.11
145	0.12
146	0.11
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.11
154	0.11
155	0.09
156	0.11
157	0.13
158	0.13
159	0.12
160	0.12
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.15
165	0.16
166	0.21
167	0.27
168	0.32
169	0.33
170	0.36
171	0.39
172	0.41
173	0.39
174	0.41
175	0.37
176	0.32
177	0.35
178	0.33
179	0.28
180	0.29
181	0.29
182	0.21
183	0.19
184	0.18
185	0.13
186	0.13
187	0.12
188	0.11
189	0.1
190	0.09
191	0.1
192	0.09
193	0.11
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.12
208	0.14
209	0.23
210	0.25
211	0.28
212	0.3
213	0.32
214	0.35
215	0.37
216	0.44
217	0.37
218	0.41
219	0.41
220	0.41
221	0.4
222	0.37
223	0.35
224	0.29
225	0.31
226	0.28
227	0.25
228	0.23
229	0.22
230	0.23
231	0.2
232	0.18
233	0.13
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.09
238	0.11
239	0.12
240	0.12
241	0.13
242	0.13
243	0.16
244	0.16
245	0.16
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.14
250	0.15
251	0.17
252	0.17
253	0.23
254	0.23
255	0.23
256	0.22
257	0.2
258	0.19
259	0.14
260	0.15
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.1
273	0.14
274	0.15
275	0.17
276	0.18
277	0.17
278	0.19
279	0.22
280	0.21
281	0.2
282	0.21
283	0.19
284	0.21
285	0.2
286	0.18
287	0.15
288	0.16
289	0.13
290	0.15
291	0.16
292	0.18
293	0.21
294	0.21
295	0.24
296	0.24
297	0.25
298	0.21
299	0.2
300	0.15
301	0.13
302	0.12
303	0.09
304	0.06
305	0.05
306	0.04
307	0.04
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.07
317	0.1
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.14
322	0.13
323	0.14
324	0.14
325	0.11
326	0.09
327	0.1
328	0.09
329	0.14
330	0.17
331	0.18
332	0.19
333	0.23
334	0.24
335	0.24
336	0.26
337	0.2
338	0.2
339	0.18
340	0.16
341	0.12
342	0.11
343	0.1
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.09
348	0.1
349	0.14
350	0.16
351	0.16
352	0.2
353	0.2
354	0.21
355	0.23
356	0.23
357	0.18
358	0.18
359	0.17
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.07
364	0.06
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.12
378	0.14
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.14
383	0.15
384	0.16
385	0.15
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.14
393	0.15
394	0.16
395	0.17
396	0.15
397	0.17
398	0.15
399	0.12
400	0.11
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.09
406	0.13
407	0.13
408	0.14
409	0.16
410	0.21
411	0.22
412	0.28
413	0.32
414	0.29
415	0.35
416	0.36
417	0.33
418	0.31
419	0.32
420	0.32
421	0.3
422	0.34
423	0.31
424	0.33
425	0.34
426	0.32
427	0.31
428	0.24
429	0.21
430	0.16
431	0.15
432	0.14
433	0.14
434	0.2
435	0.19
436	0.2
437	0.21
438	0.21
439	0.22
440	0.25
441	0.31
442	0.29
443	0.32
444	0.34
445	0.33
446	0.33
447	0.32
448	0.3
449	0.27
450	0.27
451	0.25
452	0.23
453	0.24
454	0.27
455	0.27
456	0.29
457	0.32
458	0.34
459	0.41
460	0.43
461	0.43
462	0.44
463	0.42
464	0.41
465	0.36
466	0.33
467	0.27
468	0.26
469	0.24
470	0.23
471	0.26
472	0.24
473	0.23
474	0.2
475	0.19
476	0.18
477	0.17
478	0.15
479	0.13
480	0.11
481	0.1
482	0.11
483	0.09
484	0.08
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.12
490	0.11
491	0.13
492	0.13
493	0.1
494	0.15
495	0.15
496	0.16
497	0.16
498	0.17
499	0.16
500	0.19
501	0.21
502	0.17
503	0.19
504	0.18
505	0.18
506	0.16
507	0.16
508	0.16
509	0.14
510	0.14
511	0.13
512	0.14
513	0.15
514	0.14
515	0.12
516	0.11
517	0.12
518	0.14
519	0.16
520	0.19
521	0.18
522	0.2
523	0.21
524	0.23
525	0.21
526	0.19
527	0.17
528	0.15
529	0.15
530	0.13
531	0.12
532	0.09
533	0.1
534	0.1
535	0.07
536	0.07
537	0.05
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.07
542	0.09
543	0.09
544	0.1
545	0.1
546	0.09
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.06
551	0.07
552	0.1
553	0.15
554	0.17
555	0.2
556	0.28
557	0.37
558	0.46
559	0.53
560	0.6
561	0.65
562	0.74
563	0.83
564	0.86
565	0.87
566	0.87
567	0.88
568	0.9
569	0.89
570	0.87
571	0.87
572	0.88
573	0.88
574	0.86
575	0.87
576	0.84
577	0.83
578	0.81
579	0.74
580	0.73
581	0.63
582	0.65
583	0.61
584	0.57
585	0.52
586	0.48
587	0.49
588	0.41
589	0.46
590	0.39
591	0.37
592	0.34
593	0.33
594	0.32
595	0.31
596	0.34
597	0.34
598	0.32
599	0.28
600	0.28
601	0.27
602	0.25
603	0.26
604	0.27
605	0.27
606	0.29
607	0.34
608	0.39
609	0.4
610	0.44
611	0.42
612	0.44
613	0.48
614	0.54
615	0.55
616	0.54
617	0.58
618	0.62
619	0.68
620	0.71
621	0.67
622	0.65
623	0.63
624	0.61
625	0.55
626	0.5
627	0.43
628	0.39
629	0.42
630	0.45
631	0.48
632	0.53
633	0.61
634	0.64
635	0.68
636	0.66
637	0.65
638	0.65
639	0.67
640	0.63
641	0.56
642	0.52
643	0.47
644	0.47
645	0.47
646	0.45
647	0.43
648	0.48
649	0.55
650	0.59
651	0.66
652	0.66
653	0.62
654	0.6
655	0.63
656	0.63
657	0.64
658	0.69
659	0.68
660	0.74
661	0.79
662	0.84
663	0.81
664	0.79
665	0.79
666	0.72
667	0.7
668	0.62
669	0.58
670	0.48
671	0.47
672	0.46
673	0.36
674	0.34
675	0.3
676	0.27
677	0.25
678	0.26
679	0.23
680	0.2
681	0.28
682	0.36
683	0.43
684	0.51
685	0.58
686	0.64
687	0.65
688	0.69
689	0.65
690	0.62
691	0.59
692	0.54
693	0.51
694	0.5
695	0.49
696	0.42
697	0.46
698	0.42
699	0.4
700	0.44
701	0.47
702	0.44
703	0.47
704	0.47
705	0.44
706	0.5
707	0.51
708	0.51
709	0.54
710	0.53
711	0.51
712	0.57
713	0.61
714	0.63
715	0.67
716	0.68
717	0.68
718	0.77
719	0.85
720	0.88
721	0.89
722	0.89
723	0.89
724	0.92
725	0.95
726	0.95
727	0.95
728	0.93
729	0.93
730	0.92
731	0.92
732	0.93
733	0.92
734	0.89
735	0.89
736	0.88
737	0.87
738	0.86
739	0.82
740	0.81
741	0.82
742	0.84
743	0.84
744	0.86
745	0.88
746	0.9
747	0.91
748	0.9
749	0.86
750	0.85
751	0.84
752	0.84
753	0.84
754	0.8
755	0.79
756	0.76
757	0.78
758	0.73
759	0.72
760	0.7
761	0.69
762	0.71
763	0.7
764	0.73
765	0.72
766	0.76
767	0.77
768	0.79
769	0.78
770	0.77
771	0.77
772	0.76
773	0.78
774	0.78
775	0.73
776	0.7
777	0.64
778	0.57
779	0.54
780	0.48
781	0.41
782	0.38

A0A4Q9LGA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer