FuNGI

A0A4Q9KSS9

Protein Details

Accession

A0A4Q9KSS9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
221-248	LKILFKNTHKKCKKCKQKTPQITHHKHL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1

Amino Acid Sequences

MNINGFPTKISFSTYNHQQIKELSKIKITTSTPFDTLGNPIKNGLYDTSLGPLTNKETCTSCHLNFFECPGHFGYIELPMCVYNPMHFDSLLKILRNSCLNCHTLKEKLVFSKRRNNNIDIDNGENGDIDHSDIDNTNIDYTNIDYTNIDNTDTYHTDTYHTDTYHTNNIPHNIPHNIPNTSINNNILNTSINNNIPHNIPNTSINNNIPNNNNHFTVDPLKILFKNTHKKCKKCKQKTPQITHHKHLYILINNTPTPLLQIQTHISKLYLKENHHPFLNPNIFFLINIPVTPNKFRPLSYINGKTFEHPQNVILSKIIKVSEELKEATSNSISTRDISNSGDKDRDGDMDRDGDKDSNSNKDSNKDSNKDSISNNTRDNIRDISNNTSNNTNNIIDNTNNIRDNTNNIRDNTNNTNNTNNTNNTKDIIDTITPLVSSLQLSVNMYYDSSCVRVKGKTLLIGLKQLLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.51
3	0.53
4	0.53
5	0.51
6	0.54
7	0.56
8	0.57
9	0.53
10	0.46
11	0.46
12	0.47
13	0.46
14	0.48
15	0.43
16	0.41
17	0.41
18	0.43
19	0.38
20	0.38
21	0.36
22	0.3
23	0.34
24	0.36
25	0.33
26	0.29
27	0.29
28	0.28
29	0.28
30	0.28
31	0.24
32	0.18
33	0.16
34	0.16
35	0.18
36	0.18
37	0.17
38	0.16
39	0.16
40	0.18
41	0.2
42	0.21
43	0.2
44	0.21
45	0.24
46	0.31
47	0.35
48	0.33
49	0.36
50	0.37
51	0.38
52	0.37
53	0.39
54	0.37
55	0.3
56	0.31
57	0.26
58	0.27
59	0.23
60	0.22
61	0.2
62	0.21
63	0.21
64	0.18
65	0.16
66	0.14
67	0.15
68	0.16
69	0.15
70	0.1
71	0.12
72	0.15
73	0.15
74	0.15
75	0.16
76	0.16
77	0.23
78	0.25
79	0.23
80	0.23
81	0.23
82	0.27
83	0.32
84	0.31
85	0.28
86	0.3
87	0.31
88	0.3
89	0.32
90	0.32
91	0.3
92	0.33
93	0.33
94	0.32
95	0.39
96	0.48
97	0.52
98	0.56
99	0.63
100	0.66
101	0.73
102	0.74
103	0.69
104	0.66
105	0.6
106	0.58
107	0.51
108	0.45
109	0.36
110	0.31
111	0.27
112	0.2
113	0.16
114	0.12
115	0.09
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.09
128	0.1
129	0.12
130	0.11
131	0.12
132	0.11
133	0.11
134	0.15
135	0.15
136	0.14
137	0.11
138	0.12
139	0.16
140	0.17
141	0.18
142	0.16
143	0.15
144	0.17
145	0.18
146	0.2
147	0.19
148	0.18
149	0.17
150	0.18
151	0.21
152	0.26
153	0.27
154	0.26
155	0.25
156	0.28
157	0.28
158	0.28
159	0.28
160	0.24
161	0.24
162	0.27
163	0.27
164	0.26
165	0.25
166	0.28
167	0.28
168	0.27
169	0.28
170	0.24
171	0.22
172	0.22
173	0.21
174	0.17
175	0.14
176	0.13
177	0.13
178	0.14
179	0.14
180	0.15
181	0.15
182	0.16
183	0.16
184	0.17
185	0.17
186	0.15
187	0.14
188	0.17
189	0.2
190	0.21
191	0.23
192	0.23
193	0.26
194	0.27
195	0.28
196	0.26
197	0.26
198	0.3
199	0.3
200	0.29
201	0.24
202	0.23
203	0.22
204	0.23
205	0.21
206	0.16
207	0.14
208	0.15
209	0.15
210	0.16
211	0.18
212	0.22
213	0.32
214	0.37
215	0.47
216	0.53
217	0.6
218	0.7
219	0.76
220	0.8
221	0.8
222	0.86
223	0.86
224	0.89
225	0.92
226	0.9
227	0.91
228	0.9
229	0.85
230	0.78
231	0.73
232	0.63
233	0.53
234	0.47
235	0.4
236	0.33
237	0.3
238	0.28
239	0.24
240	0.23
241	0.23
242	0.2
243	0.15
244	0.13
245	0.11
246	0.1
247	0.08
248	0.1
249	0.12
250	0.14
251	0.15
252	0.13
253	0.13
254	0.14
255	0.15
256	0.21
257	0.24
258	0.25
259	0.33
260	0.39
261	0.4
262	0.39
263	0.38
264	0.32
265	0.36
266	0.4
267	0.32
268	0.27
269	0.26
270	0.25
271	0.24
272	0.23
273	0.17
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.14
279	0.17
280	0.18
281	0.19
282	0.2
283	0.2
284	0.24
285	0.25
286	0.3
287	0.35
288	0.41
289	0.39
290	0.41
291	0.41
292	0.38
293	0.42
294	0.4
295	0.36
296	0.28
297	0.28
298	0.3
299	0.3
300	0.29
301	0.23
302	0.19
303	0.16
304	0.18
305	0.17
306	0.12
307	0.12
308	0.16
309	0.17
310	0.19
311	0.19
312	0.18
313	0.19
314	0.19
315	0.19
316	0.17
317	0.14
318	0.12
319	0.14
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.15
324	0.16
325	0.18
326	0.23
327	0.23
328	0.25
329	0.25
330	0.24
331	0.24
332	0.23
333	0.24
334	0.22
335	0.2
336	0.19
337	0.22
338	0.23
339	0.22
340	0.22
341	0.2
342	0.17
343	0.21
344	0.22
345	0.25
346	0.27
347	0.31
348	0.31
349	0.35
350	0.4
351	0.45
352	0.51
353	0.47
354	0.49
355	0.52
356	0.53
357	0.52
358	0.48
359	0.49
360	0.48
361	0.48
362	0.47
363	0.43
364	0.43
365	0.41
366	0.42
367	0.36
368	0.31
369	0.31
370	0.31
371	0.36
372	0.39
373	0.39
374	0.37
375	0.39
376	0.37
377	0.35
378	0.36
379	0.29
380	0.24
381	0.24
382	0.25
383	0.21
384	0.25
385	0.28
386	0.29
387	0.3
388	0.3
389	0.29
390	0.27
391	0.34
392	0.38
393	0.42
394	0.42
395	0.42
396	0.46
397	0.46
398	0.51
399	0.53
400	0.53
401	0.5
402	0.46
403	0.51
404	0.49
405	0.51
406	0.51
407	0.47
408	0.44
409	0.42
410	0.42
411	0.37
412	0.36
413	0.32
414	0.28
415	0.27
416	0.22
417	0.2
418	0.2
419	0.18
420	0.17
421	0.17
422	0.15
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.13
428	0.15
429	0.15
430	0.16
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.14
437	0.15
438	0.16
439	0.19
440	0.21
441	0.24
442	0.31
443	0.34
444	0.36
445	0.4
446	0.44
447	0.44
448	0.47

A0A4Q9KSS9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer