FuNGI

A0A4Q9L6S4

Protein Details

Accession

A0A4Q9L6S4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
987-1006	LNKYKFKSSKRIRSHSVQEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 10.833, mito 4.5, cyto_mito 4.166, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

VIRECKNDQGIPQPSSYTPSTIINNISIPPSEANTNTKVCLLNTIPSPSNPMHSSTVTPRPDIAASWPNLCTIPISERLVVLRSILRSIEAERQEFIRCVFFAVQTRFDRMPRNGWKEIQSYYNEKFSCTETIDVLKRMAHNKTEEEIRQEENGERRRIATCLAEPCSLTDATRFISLREKYLSNIKKISEEEIGKVVVRTRKLPNELVDSTVLDLINRIVGEYADSHVPMTITDVARIIQTAQVCYDDETRKERPRSAWKESIESKISVLKLSKDILEKARRREELSSSQTKSLKKIMREFNLDLNKTNDLSEAVVKKNELITVYEKKLTMYESRKQFRKENRMFELFRGRYYRGLSERVESEHVVNRDEIVSFWSTMWNKNNEIVTYDEYLIPFVPDTHQATFPSLDEFVDIINWLPNWKAAGIDGIYNFYIKKLTTLHKYLYDIVKAICFEGTPQANWFYHGLTYLIPKSVPQKGSDYRPITCMSNLYKLTTKCVTKVVQLEVERRGLLADNQLGAVRGVQGAKEQALLNVAINKEYGNNLKATWIDVKKAYDSIDHAYLTQVIENLNLPDWILKFIKVTISKWKIDISVGSEKIMNKKIDKGILLGDSLSPLLFVLCMDPLSRKLNEEYAKVTIQTEDASHSTNHLLFIDDLKLLAKDGTTLEKMTEEVKMFMKNIGLEINREKSATNDSCCENTATLLEGIGVYKYLGIIEDSRGIPTRKSFEEVQTKLIARVERLCRTRLNARNLFQAINQHAISLINYHIGVLRLEPGDFSKLDDAVRAVLVKNKIHLRPGCKERLYLPRTELGRGLHSVEFKSEHMLLQLLDCLEKSKETSTRRAAILKVENDNKTHLALIKDFLQVKYGMAEEVTKNKLDEAQLANLYNEIEKRKLHSKLYNARNNELVSVNDSSRWLKKGSVRPRDEAVFCYIQDRNVFWGAEGVCQHCNTSRKTVDHLATRCEKMLGHDYTRRHNEVVRCIHLLLLNKYKFKSSKRIRSHSVQEILDNEYAEIRVDTRIKTDVKIRNNRPDIFVLDKRRNKITLIEVGITSQDSLQIYDLLANELGLIYKCSVEIIPYVITWDGIVTKYHKTYLKRLQIPINVEAYIQSIVLKKTVEMISFDRRRGIDASLSVIIGAEMHKQPTPPLKEVKNEEDSVKQVNSKNILPLILDDVTRPEEPTIDINDKSDVEKENKVVKVMEEIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.4
3	0.38
4	0.3
5	0.25
6	0.27
7	0.28
8	0.29
9	0.3
10	0.27
11	0.27
12	0.26
13	0.26
14	0.22
15	0.21
16	0.19
17	0.19
18	0.2
19	0.22
20	0.25
21	0.28
22	0.3
23	0.28
24	0.3
25	0.3
26	0.26
27	0.31
28	0.28
29	0.28
30	0.3
31	0.35
32	0.34
33	0.33
34	0.38
35	0.32
36	0.36
37	0.32
38	0.32
39	0.31
40	0.3
41	0.34
42	0.36
43	0.45
44	0.41
45	0.41
46	0.37
47	0.36
48	0.35
49	0.31
50	0.31
51	0.3
52	0.29
53	0.31
54	0.31
55	0.29
56	0.29
57	0.28
58	0.23
59	0.17
60	0.2
61	0.22
62	0.26
63	0.25
64	0.26
65	0.27
66	0.28
67	0.25
68	0.23
69	0.21
70	0.18
71	0.19
72	0.18
73	0.18
74	0.18
75	0.21
76	0.27
77	0.28
78	0.28
79	0.28
80	0.3
81	0.31
82	0.31
83	0.29
84	0.24
85	0.19
86	0.22
87	0.22
88	0.24
89	0.29
90	0.32
91	0.38
92	0.36
93	0.42
94	0.41
95	0.42
96	0.47
97	0.43
98	0.49
99	0.52
100	0.57
101	0.57
102	0.59
103	0.62
104	0.57
105	0.56
106	0.52
107	0.46
108	0.45
109	0.43
110	0.47
111	0.41
112	0.39
113	0.38
114	0.35
115	0.34
116	0.3
117	0.28
118	0.22
119	0.29
120	0.31
121	0.31
122	0.29
123	0.28
124	0.3
125	0.34
126	0.36
127	0.35
128	0.35
129	0.37
130	0.4
131	0.45
132	0.43
133	0.43
134	0.41
135	0.38
136	0.36
137	0.34
138	0.35
139	0.37
140	0.42
141	0.4
142	0.38
143	0.38
144	0.38
145	0.37
146	0.35
147	0.31
148	0.29
149	0.32
150	0.35
151	0.34
152	0.33
153	0.33
154	0.33
155	0.28
156	0.23
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.2
161	0.19
162	0.17
163	0.26
164	0.27
165	0.29
166	0.31
167	0.3
168	0.28
169	0.38
170	0.43
171	0.4
172	0.43
173	0.4
174	0.41
175	0.42
176	0.44
177	0.41
178	0.36
179	0.33
180	0.31
181	0.3
182	0.26
183	0.25
184	0.26
185	0.24
186	0.24
187	0.28
188	0.33
189	0.4
190	0.45
191	0.49
192	0.48
193	0.51
194	0.49
195	0.46
196	0.4
197	0.33
198	0.28
199	0.26
200	0.21
201	0.13
202	0.12
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.08
207	0.06
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.09
218	0.11
219	0.15
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.15
226	0.13
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.12
232	0.13
233	0.15
234	0.21
235	0.21
236	0.24
237	0.29
238	0.35
239	0.43
240	0.47
241	0.5
242	0.52
243	0.6
244	0.65
245	0.68
246	0.68
247	0.62
248	0.66
249	0.65
250	0.63
251	0.55
252	0.47
253	0.39
254	0.36
255	0.33
256	0.29
257	0.26
258	0.22
259	0.22
260	0.22
261	0.25
262	0.23
263	0.26
264	0.32
265	0.4
266	0.43
267	0.49
268	0.56
269	0.55
270	0.56
271	0.56
272	0.54
273	0.53
274	0.56
275	0.56
276	0.5
277	0.53
278	0.55
279	0.52
280	0.49
281	0.48
282	0.46
283	0.44
284	0.5
285	0.53
286	0.55
287	0.6
288	0.59
289	0.59
290	0.62
291	0.56
292	0.5
293	0.43
294	0.39
295	0.32
296	0.3
297	0.22
298	0.15
299	0.15
300	0.18
301	0.18
302	0.19
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.2
307	0.2
308	0.16
309	0.15
310	0.19
311	0.24
312	0.27
313	0.28
314	0.27
315	0.26
316	0.27
317	0.26
318	0.28
319	0.28
320	0.33
321	0.4
322	0.48
323	0.53
324	0.57
325	0.63
326	0.65
327	0.7
328	0.71
329	0.7
330	0.7
331	0.71
332	0.68
333	0.64
334	0.65
335	0.54
336	0.5
337	0.45
338	0.39
339	0.35
340	0.36
341	0.38
342	0.3
343	0.34
344	0.31
345	0.3
346	0.31
347	0.3
348	0.3
349	0.24
350	0.23
351	0.24
352	0.24
353	0.22
354	0.2
355	0.18
356	0.17
357	0.16
358	0.14
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.15
364	0.16
365	0.21
366	0.26
367	0.26
368	0.26
369	0.3
370	0.31
371	0.26
372	0.27
373	0.25
374	0.22
375	0.21
376	0.21
377	0.18
378	0.16
379	0.16
380	0.14
381	0.12
382	0.09
383	0.07
384	0.07
385	0.1
386	0.13
387	0.15
388	0.17
389	0.18
390	0.19
391	0.2
392	0.19
393	0.17
394	0.14
395	0.12
396	0.1
397	0.1
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.08
412	0.08
413	0.1
414	0.09
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.08
420	0.09
421	0.07
422	0.09
423	0.12
424	0.17
425	0.23
426	0.26
427	0.28
428	0.3
429	0.32
430	0.34
431	0.33
432	0.28
433	0.24
434	0.21
435	0.2
436	0.17
437	0.15
438	0.11
439	0.08
440	0.08
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.13
445	0.16
446	0.16
447	0.17
448	0.17
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.09
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.1
458	0.11
459	0.15
460	0.2
461	0.21
462	0.2
463	0.25
464	0.29
465	0.35
466	0.42
467	0.41
468	0.36
469	0.37
470	0.37
471	0.32
472	0.28
473	0.26
474	0.2
475	0.24
476	0.23
477	0.23
478	0.26
479	0.25
480	0.29
481	0.3
482	0.29
483	0.23
484	0.28
485	0.27
486	0.26
487	0.29
488	0.27
489	0.28
490	0.29
491	0.31
492	0.28
493	0.28
494	0.24
495	0.2
496	0.18
497	0.13
498	0.12
499	0.12
500	0.1
501	0.09
502	0.09
503	0.1
504	0.09
505	0.09
506	0.08
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.05
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.08
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.1
521	0.1
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.11
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.11
533	0.12
534	0.17
535	0.16
536	0.17
537	0.18
538	0.19
539	0.18
540	0.19
541	0.18
542	0.13
543	0.14
544	0.15
545	0.15
546	0.14
547	0.13
548	0.12
549	0.13
550	0.12
551	0.1
552	0.08
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.06
558	0.06
559	0.05
560	0.06
561	0.06
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.14
568	0.15
569	0.16
570	0.23
571	0.27
572	0.28
573	0.28
574	0.29
575	0.24
576	0.23
577	0.22
578	0.18
579	0.2
580	0.19
581	0.19
582	0.2
583	0.2
584	0.24
585	0.28
586	0.25
587	0.19
588	0.23
589	0.25
590	0.25
591	0.25
592	0.21
593	0.18
594	0.17
595	0.16
596	0.12
597	0.1
598	0.08
599	0.07
600	0.06
601	0.04
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.04
609	0.04
610	0.05
611	0.08
612	0.11
613	0.11
614	0.12
615	0.13
616	0.19
617	0.21
618	0.21
619	0.21
620	0.21
621	0.21
622	0.2
623	0.19
624	0.13
625	0.12
626	0.11
627	0.09
628	0.08
629	0.09
630	0.1
631	0.09
632	0.1
633	0.11
634	0.11
635	0.11
636	0.09
637	0.09
638	0.08
639	0.09
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.07
644	0.07
645	0.06
646	0.06
647	0.05
648	0.05
649	0.06
650	0.08
651	0.09
652	0.09
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.1
657	0.12
658	0.09
659	0.1
660	0.12
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.13
665	0.11
666	0.11
667	0.12
668	0.11
669	0.12
670	0.15
671	0.17
672	0.16
673	0.17
674	0.16
675	0.14
676	0.22
677	0.23
678	0.21
679	0.21
680	0.22
681	0.22
682	0.23
683	0.23
684	0.15
685	0.12
686	0.11
687	0.1
688	0.08
689	0.07
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.05
694	0.05
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.04
701	0.05
702	0.06
703	0.09
704	0.09
705	0.11
706	0.13
707	0.14
708	0.14
709	0.16
710	0.19
711	0.17
712	0.21
713	0.22
714	0.26
715	0.35
716	0.36
717	0.36
718	0.36
719	0.35
720	0.33
721	0.34
722	0.27
723	0.19
724	0.24
725	0.27
726	0.3
727	0.32
728	0.33
729	0.32
730	0.36
731	0.44
732	0.45
733	0.49
734	0.49
735	0.49
736	0.53
737	0.53
738	0.49
739	0.4
740	0.38
741	0.3
742	0.27
743	0.25
744	0.18
745	0.17
746	0.17
747	0.16
748	0.11
749	0.1
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.07
757	0.09
758	0.08
759	0.09
760	0.09
761	0.09
762	0.11
763	0.11
764	0.12
765	0.1
766	0.11
767	0.11
768	0.11
769	0.11
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.08
774	0.12
775	0.16
776	0.15
777	0.2
778	0.25
779	0.26
780	0.33
781	0.36
782	0.38
783	0.43
784	0.5
785	0.53
786	0.48
787	0.48
788	0.47
789	0.54
790	0.5
791	0.45
792	0.4
793	0.37
794	0.38
795	0.37
796	0.34
797	0.25
798	0.25
799	0.23
800	0.24
801	0.2
802	0.2
803	0.19
804	0.18
805	0.18
806	0.16
807	0.18
808	0.15
809	0.13
810	0.12
811	0.13
812	0.11
813	0.1
814	0.11
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.09
819	0.08
820	0.09
821	0.1
822	0.13
823	0.2
824	0.24
825	0.32
826	0.36
827	0.4
828	0.42
829	0.43
830	0.4
831	0.4
832	0.43
833	0.39
834	0.4
835	0.41
836	0.41
837	0.39
838	0.41
839	0.35
840	0.28
841	0.26
842	0.22
843	0.18
844	0.17
845	0.18
846	0.18
847	0.21
848	0.23
849	0.21
850	0.2
851	0.18
852	0.18
853	0.17
854	0.14
855	0.1
856	0.08
857	0.11
858	0.1
859	0.15
860	0.17
861	0.16
862	0.16
863	0.17
864	0.19
865	0.18
866	0.21
867	0.19
868	0.21
869	0.23
870	0.24
871	0.23
872	0.21
873	0.2
874	0.16
875	0.16
876	0.15
877	0.15
878	0.15
879	0.2
880	0.28
881	0.33
882	0.38
883	0.42
884	0.49
885	0.56
886	0.66
887	0.69
888	0.65
889	0.62
890	0.59
891	0.53
892	0.45
893	0.37
894	0.27
895	0.23
896	0.21
897	0.2
898	0.17
899	0.18
900	0.19
901	0.21
902	0.22
903	0.2
904	0.22
905	0.3
906	0.39
907	0.48
908	0.56
909	0.57
910	0.59
911	0.62
912	0.63
913	0.56
914	0.48
915	0.43
916	0.35
917	0.3
918	0.3
919	0.27
920	0.24
921	0.25
922	0.23
923	0.21
924	0.22
925	0.22
926	0.17
927	0.21
928	0.19
929	0.2
930	0.21
931	0.2
932	0.18
933	0.19
934	0.2
935	0.21
936	0.25
937	0.25
938	0.32
939	0.36
940	0.36
941	0.42
942	0.48
943	0.48
944	0.52
945	0.51
946	0.49
947	0.49
948	0.48
949	0.43
950	0.37
951	0.31
952	0.27
953	0.34
954	0.32
955	0.32
956	0.36
957	0.39
958	0.47
959	0.53
960	0.52
961	0.45
962	0.46
963	0.46
964	0.49
965	0.53
966	0.48
967	0.44
968	0.41
969	0.41
970	0.38
971	0.38
972	0.34
973	0.36
974	0.36
975	0.38
976	0.38
977	0.43
978	0.46
979	0.47
980	0.52
981	0.53
982	0.6
983	0.67
984	0.75
985	0.75
986	0.78
987	0.8
988	0.78
989	0.74
990	0.64
991	0.56
992	0.5
993	0.47
994	0.4
995	0.32
996	0.23
997	0.16
998	0.15
999	0.14
1000	0.12
1001	0.09
1002	0.12
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.17
1006	0.22
1007	0.23
1008	0.26
1009	0.34
1010	0.38
1011	0.46
1012	0.56
1013	0.61
1014	0.67
1015	0.73
1016	0.72
1017	0.67
1018	0.62
1019	0.57
1020	0.54
1021	0.54
1022	0.52
1023	0.55
1024	0.59
1025	0.59
1026	0.61
1027	0.58
1028	0.51
1029	0.5
1030	0.47
1031	0.45
1032	0.42
1033	0.4
1034	0.35
1035	0.34
1036	0.33
1037	0.27
1038	0.21
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.1
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.1
1046	0.12
1047	0.13
1048	0.12
1049	0.11
1050	0.1
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.1
1054	0.08
1055	0.09
1056	0.08
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.09
1060	0.09
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.12
1065	0.11
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.12
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.12
1074	0.13
1075	0.18
1076	0.2
1077	0.26
1078	0.31
1079	0.35
1080	0.44
1081	0.52
1082	0.6
1083	0.62
1084	0.66
1085	0.69
1086	0.69
1087	0.69
1088	0.64
1089	0.56
1090	0.46
1091	0.38
1092	0.33
1093	0.26
1094	0.2
1095	0.15
1096	0.13
1097	0.13
1098	0.14
1099	0.16
1100	0.16
1101	0.14
1102	0.2
1103	0.23
1104	0.22
1105	0.23
1106	0.27
1107	0.36
1108	0.41
1109	0.42
1110	0.41
1111	0.38
1112	0.4
1113	0.38
1114	0.36
1115	0.31
1116	0.27
1117	0.31
1118	0.26
1119	0.26
1120	0.22
1121	0.2
1122	0.17
1123	0.12
1124	0.11
1125	0.12
1126	0.13
1127	0.15
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.23
1131	0.32
1132	0.38
1133	0.39
1134	0.46
1135	0.49
1136	0.56
1137	0.63
1138	0.66
1139	0.63
1140	0.59
1141	0.56
1142	0.52
1143	0.49
1144	0.46
1145	0.41
1146	0.39
1147	0.36
1148	0.41
1149	0.42
1150	0.4
1151	0.42
1152	0.39
1153	0.37
1154	0.32
1155	0.29
1156	0.27
1157	0.24
1158	0.22
1159	0.17
1160	0.19
1161	0.22
1162	0.22
1163	0.22
1164	0.18
1165	0.17
1166	0.19
1167	0.23
1168	0.26
1169	0.27
1170	0.27
1171	0.27
1172	0.29
1173	0.29
1174	0.29
1175	0.29
1176	0.28
1177	0.28
1178	0.32
1179	0.36
1180	0.41
1181	0.42
1182	0.43
1183	0.4
1184	0.36

A0A4Q9L6S4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer