Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LIP9

Protein Details
Accession A0A4Q9LIP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
914-938WEDSEEEEKPKKRKRVGRGDVGVGMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
922-931KPKKRKRVGR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029149  Creatin/AminoP/Spt16_NTD  
IPR036005  Creatinase/aminopeptidase-like  
IPR029148  FACT-Spt16_Nlobe  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR000994  Pept_M24  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF14826  FACT-Spt16_Nlob  
PF00557  Peptidase_M24  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MSEIQLNIQRFKKNIQRLREYIPPSSTLFVILGKPEDEQPFDTNSAVFLFLFGYEFPETILLINDSNMTIITSPRKACILEQLYPHTSLTLLVRRKDNSNLNEIKEKISTFPCINVVEKEGLKGSFEQNFDISSYVDIKPQLLHVFKIKDDYQLESIQIASHLASYFVDQAKTFIINSFTNSLKKTHLEISNFLEEIMDKPININLPENLHFEQDKLEFAFTPFIQSGEAINISSFTENPFESSYLELPFVIIKIGVRYDGYCSEISRTFLINPNQERIDYLDSLYKLRDFISSKILPGSDSSVLKKNISEFINSCDISLDGSVFYSIGLLINEGFCINLFDEINEDFKIEKNMTFVININSKNMILSDTIQILDDKIIFLTSKKTKENFILNILLKEGRLKVNEKLGFRVRSKEKEVEKNIQRKEHQKDLMNDLIEEMLEKYKKIKKDNIGDSEIKEEIFIPYKKENLIPRERKLKVDFKHDSILIPVYGYLIPFHISLVKNISKNEDGSFSFLRINFSTESNLQKTEFLKSLTYKGNTHHIGDLFREINELKKDFLIRKEEKKNFKDVIEQDTLVEIKGKKNVLSDVLVKTDFKMGSKKMKPSNLEIHQNGFKYTGDISLEILFSNVKHCFYQEGTLENRTILHFNLNSPVIVNYLNSSKKTKNFQFFKEVGVNSAHDTFKLKNDEFMEMMLDKEEQEKRKLVNDEFKKFCNKLEEYGLVVQILLKNGFYGVPYKESVLLSPTMECLVNLTEFPFFILTLKEVEVVNFERMIFGVKTFDMVFVMKDKINLQTVSIFSVDSSESLNLKDWLDSNNIVFIETSVNLQWNNLLKSILKDPLSFYENGGWVELMENRSESEEESEEESSTVSSVSTVDEEVLSDVSVISSESEVVGEEESDFDSGEEYGASEEDDWEDSEEEEKPKKRKRVGRGDVGVGMWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.69
4 0.69
5 0.74
6 0.74
7 0.7
8 0.65
9 0.6
10 0.53
11 0.46
12 0.43
13 0.36
14 0.29
15 0.24
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.18
22 0.21
23 0.24
24 0.25
25 0.26
26 0.26
27 0.29
28 0.29
29 0.29
30 0.23
31 0.21
32 0.19
33 0.17
34 0.14
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.08
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.11
58 0.17
59 0.22
60 0.23
61 0.24
62 0.27
63 0.27
64 0.28
65 0.35
66 0.35
67 0.34
68 0.38
69 0.43
70 0.43
71 0.44
72 0.42
73 0.32
74 0.26
75 0.23
76 0.24
77 0.25
78 0.28
79 0.32
80 0.37
81 0.4
82 0.44
83 0.5
84 0.54
85 0.5
86 0.54
87 0.55
88 0.54
89 0.59
90 0.56
91 0.51
92 0.44
93 0.41
94 0.35
95 0.32
96 0.33
97 0.27
98 0.28
99 0.29
100 0.29
101 0.3
102 0.28
103 0.28
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.24
108 0.22
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.24
114 0.24
115 0.22
116 0.22
117 0.22
118 0.2
119 0.16
120 0.13
121 0.15
122 0.14
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.19
128 0.23
129 0.21
130 0.23
131 0.27
132 0.29
133 0.29
134 0.34
135 0.32
136 0.32
137 0.33
138 0.34
139 0.31
140 0.3
141 0.3
142 0.24
143 0.24
144 0.17
145 0.16
146 0.12
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.13
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.13
162 0.15
163 0.15
164 0.18
165 0.2
166 0.21
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.24
171 0.26
172 0.27
173 0.31
174 0.34
175 0.34
176 0.36
177 0.4
178 0.4
179 0.38
180 0.34
181 0.27
182 0.21
183 0.19
184 0.21
185 0.16
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.17
190 0.18
191 0.18
192 0.15
193 0.19
194 0.22
195 0.25
196 0.24
197 0.24
198 0.23
199 0.22
200 0.23
201 0.2
202 0.19
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.18
208 0.14
209 0.17
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.23
258 0.28
259 0.32
260 0.32
261 0.35
262 0.34
263 0.33
264 0.31
265 0.28
266 0.27
267 0.21
268 0.19
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.17
274 0.14
275 0.14
276 0.17
277 0.16
278 0.17
279 0.24
280 0.24
281 0.24
282 0.25
283 0.25
284 0.2
285 0.19
286 0.2
287 0.16
288 0.17
289 0.19
290 0.23
291 0.25
292 0.25
293 0.25
294 0.23
295 0.26
296 0.25
297 0.26
298 0.2
299 0.23
300 0.28
301 0.27
302 0.25
303 0.2
304 0.19
305 0.16
306 0.15
307 0.11
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.09
333 0.1
334 0.08
335 0.09
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.15
352 0.12
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.12
369 0.17
370 0.22
371 0.26
372 0.27
373 0.29
374 0.34
375 0.4
376 0.35
377 0.34
378 0.35
379 0.32
380 0.31
381 0.29
382 0.25
383 0.18
384 0.18
385 0.16
386 0.12
387 0.14
388 0.16
389 0.17
390 0.26
391 0.3
392 0.29
393 0.32
394 0.35
395 0.38
396 0.37
397 0.43
398 0.39
399 0.41
400 0.45
401 0.47
402 0.48
403 0.52
404 0.56
405 0.58
406 0.6
407 0.63
408 0.62
409 0.61
410 0.59
411 0.58
412 0.59
413 0.58
414 0.55
415 0.53
416 0.52
417 0.51
418 0.51
419 0.42
420 0.36
421 0.28
422 0.22
423 0.16
424 0.13
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.12
430 0.17
431 0.22
432 0.27
433 0.33
434 0.38
435 0.48
436 0.56
437 0.56
438 0.57
439 0.54
440 0.49
441 0.45
442 0.37
443 0.27
444 0.19
445 0.14
446 0.1
447 0.14
448 0.13
449 0.14
450 0.15
451 0.16
452 0.17
453 0.21
454 0.25
455 0.27
456 0.37
457 0.4
458 0.43
459 0.52
460 0.52
461 0.52
462 0.53
463 0.54
464 0.47
465 0.51
466 0.49
467 0.43
468 0.44
469 0.4
470 0.35
471 0.28
472 0.25
473 0.15
474 0.12
475 0.09
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.16
488 0.19
489 0.19
490 0.2
491 0.23
492 0.2
493 0.21
494 0.21
495 0.18
496 0.15
497 0.18
498 0.18
499 0.16
500 0.16
501 0.16
502 0.18
503 0.15
504 0.17
505 0.14
506 0.14
507 0.16
508 0.16
509 0.19
510 0.18
511 0.19
512 0.17
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.18
517 0.16
518 0.17
519 0.17
520 0.21
521 0.23
522 0.25
523 0.23
524 0.24
525 0.3
526 0.29
527 0.29
528 0.27
529 0.24
530 0.23
531 0.22
532 0.24
533 0.17
534 0.15
535 0.15
536 0.12
537 0.15
538 0.17
539 0.17
540 0.15
541 0.15
542 0.19
543 0.2
544 0.25
545 0.3
546 0.32
547 0.41
548 0.5
549 0.57
550 0.63
551 0.63
552 0.66
553 0.6
554 0.56
555 0.55
556 0.47
557 0.46
558 0.39
559 0.36
560 0.29
561 0.27
562 0.26
563 0.17
564 0.18
565 0.13
566 0.12
567 0.16
568 0.17
569 0.16
570 0.18
571 0.19
572 0.18
573 0.2
574 0.22
575 0.19
576 0.21
577 0.2
578 0.19
579 0.18
580 0.2
581 0.18
582 0.15
583 0.19
584 0.2
585 0.29
586 0.35
587 0.41
588 0.44
589 0.5
590 0.51
591 0.53
592 0.59
593 0.55
594 0.58
595 0.51
596 0.49
597 0.47
598 0.44
599 0.38
600 0.3
601 0.24
602 0.17
603 0.17
604 0.14
605 0.11
606 0.11
607 0.12
608 0.11
609 0.11
610 0.1
611 0.1
612 0.08
613 0.07
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.11
619 0.13
620 0.14
621 0.19
622 0.17
623 0.19
624 0.21
625 0.23
626 0.23
627 0.2
628 0.2
629 0.16
630 0.16
631 0.13
632 0.15
633 0.13
634 0.14
635 0.18
636 0.17
637 0.16
638 0.16
639 0.15
640 0.12
641 0.12
642 0.11
643 0.09
644 0.13
645 0.16
646 0.18
647 0.22
648 0.25
649 0.31
650 0.4
651 0.46
652 0.51
653 0.55
654 0.57
655 0.61
656 0.57
657 0.57
658 0.54
659 0.46
660 0.38
661 0.34
662 0.3
663 0.23
664 0.26
665 0.21
666 0.15
667 0.18
668 0.17
669 0.21
670 0.28
671 0.26
672 0.27
673 0.29
674 0.31
675 0.29
676 0.28
677 0.24
678 0.17
679 0.17
680 0.13
681 0.11
682 0.09
683 0.14
684 0.19
685 0.2
686 0.24
687 0.27
688 0.28
689 0.35
690 0.41
691 0.4
692 0.45
693 0.51
694 0.56
695 0.56
696 0.57
697 0.57
698 0.52
699 0.51
700 0.49
701 0.42
702 0.37
703 0.4
704 0.38
705 0.34
706 0.35
707 0.32
708 0.23
709 0.21
710 0.18
711 0.14
712 0.14
713 0.11
714 0.09
715 0.08
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.11
720 0.11
721 0.14
722 0.15
723 0.16
724 0.18
725 0.18
726 0.18
727 0.17
728 0.17
729 0.15
730 0.14
731 0.14
732 0.12
733 0.12
734 0.11
735 0.1
736 0.1
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.1
743 0.09
744 0.08
745 0.08
746 0.09
747 0.09
748 0.1
749 0.1
750 0.11
751 0.11
752 0.11
753 0.14
754 0.15
755 0.16
756 0.15
757 0.14
758 0.13
759 0.13
760 0.16
761 0.13
762 0.11
763 0.12
764 0.11
765 0.13
766 0.13
767 0.13
768 0.11
769 0.11
770 0.11
771 0.12
772 0.15
773 0.14
774 0.15
775 0.16
776 0.19
777 0.23
778 0.22
779 0.21
780 0.22
781 0.22
782 0.23
783 0.22
784 0.17
785 0.13
786 0.14
787 0.13
788 0.09
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.12
793 0.15
794 0.15
795 0.15
796 0.16
797 0.16
798 0.16
799 0.2
800 0.2
801 0.18
802 0.2
803 0.2
804 0.19
805 0.17
806 0.15
807 0.14
808 0.13
809 0.14
810 0.11
811 0.13
812 0.13
813 0.13
814 0.17
815 0.19
816 0.21
817 0.2
818 0.21
819 0.2
820 0.24
821 0.28
822 0.3
823 0.26
824 0.26
825 0.28
826 0.31
827 0.34
828 0.31
829 0.28
830 0.28
831 0.28
832 0.28
833 0.25
834 0.2
835 0.16
836 0.17
837 0.19
838 0.15
839 0.13
840 0.13
841 0.13
842 0.15
843 0.16
844 0.15
845 0.16
846 0.16
847 0.17
848 0.2
849 0.2
850 0.18
851 0.18
852 0.17
853 0.13
854 0.12
855 0.1
856 0.06
857 0.06
858 0.06
859 0.07
860 0.08
861 0.08
862 0.09
863 0.08
864 0.09
865 0.1
866 0.1
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.06
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.07
879 0.08
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.08
884 0.09
885 0.09
886 0.08
887 0.07
888 0.08
889 0.08
890 0.08
891 0.07
892 0.06
893 0.07
894 0.07
895 0.07
896 0.07
897 0.08
898 0.09
899 0.1
900 0.11
901 0.12
902 0.13
903 0.13
904 0.14
905 0.17
906 0.21
907 0.28
908 0.35
909 0.42
910 0.51
911 0.61
912 0.69
913 0.75
914 0.81
915 0.84
916 0.87
917 0.88
918 0.85
919 0.8
920 0.73