FuNGI

A0A4Q9LHC2

Protein Details

Accession

A0A4Q9LHC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
164-188	FIEKVESKDKKHKRIKKAHFLDGSE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
171-180	KDKKHKRIKK

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 13, nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR045209 Rrp5 IPR022967 S1_dom IPR003029 S1_domain IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006364 P:rRNA processing
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1

Amino Acid Sequences

MEIFGVSKTYIYGLIKNNTLTIPHKQCSFETEFCIPQPIPLLFDEKYKIFYKNKIFNSYVLSEEENVYLLYSVDNKTTMVDKKVILESNTIYTFNITNENEFTRRVELYENNEMFPGIVLKGQVFNDTVMTKYGNGKCIFLDNHPNQKIISVLLYKISGKTYNFIEKVESKDKKHKRIKKAHFLDGSEFKVVAECKNFYLVEKERIRGILLKDMIKNYVNDFVKIKVKDQEWGYVFTRYEIGTSKSKNTELYEGMVGKGVIAKICNFGAIVSVNGFKGRLVVSEISSNYIKNWKSHLENIISEKNELTGIIYNVDFEKNRFDFSLKKYELQEKENELNSGIKLQVPFNDKQNIKETEIEVKINEKNKDLSLKSEENKKVDFCTETKRDILKTEEDYLMEIKNMPKSALPIIKYISFKIERNEDVREFYKEFIKKMEGKEKMDLCVSYINYLIFINEENIINEIKRCYTICDKSKNIDFIDIVIQNIKEIKNDLLKLECFKYYFKIKETNKSFKILVEFLLKNGKMEEGCEIIKKNINYNSIGIDLLYKYKTKDLRVRIENLVCGVDGWVSYLKNEWNDIEYVRRLFQRVVDMDWKIKEIVIFYKLWIEFEEENGGDVEVVKSIAREHAERLKIKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.33
3	0.33
4	0.34
5	0.31
6	0.33
7	0.31
8	0.34
9	0.38
10	0.38
11	0.42
12	0.43
13	0.43
14	0.46
15	0.5
16	0.43
17	0.41
18	0.42
19	0.4
20	0.38
21	0.43
22	0.35
23	0.29
24	0.32
25	0.26
26	0.24
27	0.23
28	0.27
29	0.22
30	0.26
31	0.28
32	0.24
33	0.28
34	0.28
35	0.34
36	0.34
37	0.42
38	0.48
39	0.53
40	0.6
41	0.63
42	0.62
43	0.57
44	0.59
45	0.53
46	0.45
47	0.38
48	0.32
49	0.26
50	0.26
51	0.23
52	0.17
53	0.15
54	0.13
55	0.1
56	0.09
57	0.08
58	0.1
59	0.11
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.13
64	0.19
65	0.22
66	0.23
67	0.25
68	0.25
69	0.29
70	0.34
71	0.36
72	0.31
73	0.31
74	0.29
75	0.3
76	0.31
77	0.27
78	0.22
79	0.2
80	0.2
81	0.18
82	0.23
83	0.19
84	0.19
85	0.21
86	0.25
87	0.25
88	0.25
89	0.26
90	0.22
91	0.22
92	0.21
93	0.23
94	0.24
95	0.3
96	0.39
97	0.37
98	0.35
99	0.34
100	0.33
101	0.28
102	0.24
103	0.18
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.12
109	0.12
110	0.14
111	0.13
112	0.13
113	0.14
114	0.15
115	0.15
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.21
120	0.24
121	0.28
122	0.28
123	0.28
124	0.28
125	0.32
126	0.32
127	0.28
128	0.35
129	0.35
130	0.44
131	0.45
132	0.45
133	0.4
134	0.38
135	0.35
136	0.26
137	0.23
138	0.15
139	0.14
140	0.14
141	0.16
142	0.16
143	0.16
144	0.18
145	0.17
146	0.16
147	0.18
148	0.21
149	0.28
150	0.28
151	0.27
152	0.29
153	0.29
154	0.35
155	0.43
156	0.44
157	0.41
158	0.51
159	0.6
160	0.66
161	0.73
162	0.76
163	0.77
164	0.83
165	0.88
166	0.89
167	0.88
168	0.86
169	0.81
170	0.74
171	0.69
172	0.62
173	0.54
174	0.44
175	0.36
176	0.27
177	0.24
178	0.22
179	0.19
180	0.17
181	0.15
182	0.15
183	0.18
184	0.18
185	0.16
186	0.23
187	0.24
188	0.3
189	0.32
190	0.32
191	0.3
192	0.31
193	0.31
194	0.28
195	0.27
196	0.25
197	0.25
198	0.27
199	0.28
200	0.29
201	0.3
202	0.27
203	0.26
204	0.2
205	0.25
206	0.22
207	0.22
208	0.22
209	0.23
210	0.28
211	0.28
212	0.29
213	0.27
214	0.27
215	0.3
216	0.31
217	0.35
218	0.29
219	0.33
220	0.32
221	0.3
222	0.29
223	0.24
224	0.24
225	0.17
226	0.17
227	0.14
228	0.16
229	0.18
230	0.19
231	0.23
232	0.24
233	0.25
234	0.27
235	0.27
236	0.27
237	0.22
238	0.23
239	0.21
240	0.19
241	0.18
242	0.16
243	0.14
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.13
271	0.13
272	0.14
273	0.15
274	0.14
275	0.12
276	0.17
277	0.18
278	0.16
279	0.19
280	0.2
281	0.23
282	0.27
283	0.3
284	0.28
285	0.29
286	0.32
287	0.33
288	0.29
289	0.27
290	0.23
291	0.19
292	0.15
293	0.13
294	0.1
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.08
303	0.07
304	0.13
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.18
310	0.22
311	0.32
312	0.27
313	0.3
314	0.31
315	0.39
316	0.41
317	0.38
318	0.38
319	0.32
320	0.35
321	0.34
322	0.31
323	0.24
324	0.22
325	0.19
326	0.17
327	0.12
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.14
332	0.17
333	0.18
334	0.21
335	0.29
336	0.28
337	0.3
338	0.36
339	0.35
340	0.32
341	0.34
342	0.31
343	0.3
344	0.31
345	0.29
346	0.22
347	0.22
348	0.24
349	0.27
350	0.27
351	0.22
352	0.22
353	0.23
354	0.29
355	0.26
356	0.27
357	0.27
358	0.31
359	0.33
360	0.41
361	0.42
362	0.39
363	0.4
364	0.37
365	0.32
366	0.29
367	0.29
368	0.21
369	0.26
370	0.27
371	0.28
372	0.31
373	0.31
374	0.3
375	0.3
376	0.31
377	0.27
378	0.26
379	0.28
380	0.25
381	0.23
382	0.23
383	0.21
384	0.18
385	0.14
386	0.13
387	0.11
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.14
393	0.19
394	0.22
395	0.22
396	0.21
397	0.22
398	0.26
399	0.27
400	0.25
401	0.26
402	0.25
403	0.25
404	0.27
405	0.3
406	0.28
407	0.3
408	0.34
409	0.29
410	0.31
411	0.31
412	0.31
413	0.28
414	0.26
415	0.31
416	0.28
417	0.28
418	0.27
419	0.3
420	0.31
421	0.36
422	0.44
423	0.42
424	0.44
425	0.5
426	0.48
427	0.44
428	0.42
429	0.35
430	0.27
431	0.26
432	0.23
433	0.17
434	0.16
435	0.14
436	0.13
437	0.13
438	0.12
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.09
444	0.08
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.12
452	0.12
453	0.16
454	0.24
455	0.33
456	0.39
457	0.46
458	0.49
459	0.52
460	0.58
461	0.57
462	0.49
463	0.44
464	0.36
465	0.29
466	0.31
467	0.26
468	0.21
469	0.18
470	0.17
471	0.15
472	0.18
473	0.17
474	0.12
475	0.14
476	0.17
477	0.21
478	0.22
479	0.23
480	0.24
481	0.26
482	0.29
483	0.29
484	0.28
485	0.23
486	0.23
487	0.27
488	0.31
489	0.33
490	0.33
491	0.41
492	0.44
493	0.53
494	0.6
495	0.65
496	0.6
497	0.6
498	0.56
499	0.49
500	0.49
501	0.4
502	0.34
503	0.32
504	0.29
505	0.27
506	0.35
507	0.32
508	0.27
509	0.27
510	0.26
511	0.19
512	0.19
513	0.2
514	0.15
515	0.16
516	0.19
517	0.2
518	0.21
519	0.26
520	0.26
521	0.31
522	0.33
523	0.35
524	0.35
525	0.34
526	0.33
527	0.29
528	0.28
529	0.21
530	0.17
531	0.15
532	0.16
533	0.16
534	0.16
535	0.16
536	0.23
537	0.28
538	0.34
539	0.42
540	0.48
541	0.56
542	0.61
543	0.65
544	0.66
545	0.64
546	0.58
547	0.51
548	0.42
549	0.32
550	0.26
551	0.21
552	0.13
553	0.1
554	0.1
555	0.11
556	0.1
557	0.11
558	0.14
559	0.17
560	0.18
561	0.21
562	0.2
563	0.2
564	0.21
565	0.23
566	0.26
567	0.27
568	0.27
569	0.29
570	0.3
571	0.3
572	0.3
573	0.32
574	0.35
575	0.33
576	0.36
577	0.39
578	0.39
579	0.42
580	0.42
581	0.4
582	0.31
583	0.3
584	0.25
585	0.22
586	0.23
587	0.22
588	0.21
589	0.2
590	0.27
591	0.26
592	0.26
593	0.25
594	0.25
595	0.22
596	0.24
597	0.29
598	0.21
599	0.22
600	0.21
601	0.2
602	0.14
603	0.15
604	0.12
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.14
611	0.17
612	0.18
613	0.23
614	0.32
615	0.4

A0A4Q9LHC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer