Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V2JVT7

Protein Details
Accession A0A4V2JVT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-37KKNTTEQKKENHPSKNSPHKPDQKKAIEPPKQEKRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-35SPHKPDQKKAIEPPKQEK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MKKNTTEQKKENHPSKNSPHKPDQKKAIEPPKQEKRTPAEVWQNAARLLETKKKEPPKKVLLTFEYPEIQKKLSQLKAKKEENSTVKTGNSHSFTSAEIENAIIYRTFFHITDKTNTDTPQHQNTSHTSSNTNLFHDPLFYTKLDIDTLFFIFYCQPNTVHQYFAAKQLKNYSWRFHTKYHTWFQRLEEPKIITESYEQGIFLFFDYDVTWTNRKKKDFTFEYKYLENIEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.82
3 0.84
4 0.82
5 0.8
6 0.82
7 0.83
8 0.86
9 0.85
10 0.85
11 0.82
12 0.82
13 0.83
14 0.83
15 0.81
16 0.8
17 0.81
18 0.82
19 0.8
20 0.74
21 0.72
22 0.68
23 0.68
24 0.64
25 0.62
26 0.61
27 0.57
28 0.58
29 0.54
30 0.48
31 0.4
32 0.37
33 0.29
34 0.22
35 0.24
36 0.27
37 0.28
38 0.31
39 0.39
40 0.49
41 0.57
42 0.62
43 0.67
44 0.69
45 0.73
46 0.74
47 0.73
48 0.68
49 0.65
50 0.58
51 0.52
52 0.45
53 0.36
54 0.35
55 0.29
56 0.25
57 0.2
58 0.23
59 0.29
60 0.32
61 0.4
62 0.43
63 0.51
64 0.59
65 0.63
66 0.64
67 0.61
68 0.62
69 0.6
70 0.58
71 0.5
72 0.43
73 0.38
74 0.35
75 0.33
76 0.29
77 0.26
78 0.22
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.19
83 0.17
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.13
98 0.16
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.24
106 0.25
107 0.28
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.3
112 0.34
113 0.31
114 0.28
115 0.23
116 0.22
117 0.27
118 0.26
119 0.25
120 0.19
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.12
126 0.13
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.23
150 0.23
151 0.32
152 0.36
153 0.31
154 0.32
155 0.38
156 0.41
157 0.44
158 0.47
159 0.43
160 0.42
161 0.51
162 0.53
163 0.51
164 0.55
165 0.55
166 0.59
167 0.63
168 0.65
169 0.6
170 0.59
171 0.58
172 0.6
173 0.59
174 0.55
175 0.51
176 0.44
177 0.42
178 0.42
179 0.38
180 0.29
181 0.25
182 0.23
183 0.19
184 0.17
185 0.16
186 0.13
187 0.14
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.12
196 0.16
197 0.22
198 0.27
199 0.37
200 0.43
201 0.48
202 0.53
203 0.57
204 0.64
205 0.67
206 0.7
207 0.7
208 0.69
209 0.7
210 0.65
211 0.59