Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LNT9

Protein Details
Accession A0A4Q9LNT9    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-27TRDYRDTVKERKNDINKRSFTHydrophilic
375-398PEIKQISKHRFLPKKLRNEMKDTHHydrophilic
401-421YKADERKKALYEEKRNLKKERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-408KK
413-421EKRNLKKER
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MKINTITRDYRDTVKERKNDINKRSFTKDSLHHPFSKEREYIRALNATKIERLFAKPFLYALSDHKEGIKGIELHGDSVISYSFDNSAILWSLNEKRKIWTFDMEKTILSADINDRGMCITQGNELFYYSKIKEDESIKKEIKVKHKFSCDGMFNCVKLQEELCCATTNGLEIFDFEKKKSAIQLGKESFHGCFLSNKQPNIILCTFSNEIYLFDKRENKSVGKIENGIKTNEICCNQMRENVFISANEDTNLYLHDLRYLSKPTTTYRNHVNSVLSVDFKPNGEEFISGSYDKTIRIFRTDDCRSRDVYYNQRMQNVYGVRYSECGMFVVSGSDDGSLRVWKSNASHKEGKLTRREKESLKYSEILKEKFSDFPEIKQISKHRFLPKKLRNEMKDTHFHYKADERKKALYEEKRNLKKER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.64
4 0.72
5 0.75
6 0.78
7 0.81
8 0.81
9 0.79
10 0.78
11 0.79
12 0.73
13 0.66
14 0.63
15 0.6
16 0.59
17 0.62
18 0.61
19 0.59
20 0.58
21 0.62
22 0.61
23 0.61
24 0.56
25 0.49
26 0.5
27 0.51
28 0.51
29 0.49
30 0.52
31 0.45
32 0.46
33 0.47
34 0.43
35 0.41
36 0.37
37 0.34
38 0.29
39 0.33
40 0.31
41 0.31
42 0.3
43 0.27
44 0.27
45 0.26
46 0.25
47 0.21
48 0.22
49 0.25
50 0.24
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.23
55 0.23
56 0.24
57 0.18
58 0.17
59 0.23
60 0.22
61 0.22
62 0.21
63 0.2
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.11
79 0.19
80 0.26
81 0.31
82 0.3
83 0.34
84 0.4
85 0.45
86 0.44
87 0.45
88 0.43
89 0.45
90 0.5
91 0.46
92 0.4
93 0.35
94 0.32
95 0.24
96 0.19
97 0.14
98 0.1
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.07
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.18
116 0.15
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.21
121 0.26
122 0.35
123 0.34
124 0.42
125 0.4
126 0.43
127 0.49
128 0.51
129 0.55
130 0.55
131 0.59
132 0.58
133 0.64
134 0.62
135 0.59
136 0.59
137 0.54
138 0.46
139 0.44
140 0.39
141 0.32
142 0.31
143 0.28
144 0.22
145 0.17
146 0.16
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.24
169 0.24
170 0.26
171 0.35
172 0.34
173 0.35
174 0.35
175 0.34
176 0.27
177 0.24
178 0.21
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.24
183 0.27
184 0.27
185 0.27
186 0.28
187 0.28
188 0.31
189 0.28
190 0.2
191 0.16
192 0.2
193 0.2
194 0.17
195 0.18
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.12
201 0.14
202 0.21
203 0.2
204 0.25
205 0.27
206 0.25
207 0.29
208 0.32
209 0.31
210 0.26
211 0.3
212 0.29
213 0.32
214 0.32
215 0.28
216 0.24
217 0.23
218 0.23
219 0.23
220 0.2
221 0.16
222 0.16
223 0.2
224 0.2
225 0.24
226 0.24
227 0.22
228 0.22
229 0.22
230 0.22
231 0.17
232 0.18
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.15
247 0.17
248 0.16
249 0.17
250 0.19
251 0.19
252 0.28
253 0.3
254 0.3
255 0.36
256 0.41
257 0.41
258 0.41
259 0.39
260 0.31
261 0.31
262 0.29
263 0.22
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.16
269 0.12
270 0.13
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.12
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.14
282 0.16
283 0.15
284 0.19
285 0.21
286 0.22
287 0.31
288 0.39
289 0.43
290 0.45
291 0.46
292 0.45
293 0.46
294 0.5
295 0.47
296 0.49
297 0.51
298 0.54
299 0.54
300 0.56
301 0.53
302 0.47
303 0.47
304 0.4
305 0.34
306 0.27
307 0.26
308 0.22
309 0.22
310 0.23
311 0.17
312 0.15
313 0.13
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.15
330 0.19
331 0.28
332 0.34
333 0.4
334 0.46
335 0.45
336 0.55
337 0.58
338 0.62
339 0.63
340 0.63
341 0.61
342 0.62
343 0.66
344 0.61
345 0.64
346 0.66
347 0.61
348 0.59
349 0.56
350 0.5
351 0.53
352 0.55
353 0.48
354 0.41
355 0.38
356 0.36
357 0.37
358 0.37
359 0.38
360 0.33
361 0.34
362 0.42
363 0.41
364 0.4
365 0.42
366 0.48
367 0.47
368 0.53
369 0.58
370 0.59
371 0.65
372 0.73
373 0.78
374 0.79
375 0.81
376 0.84
377 0.86
378 0.81
379 0.8
380 0.79
381 0.76
382 0.76
383 0.72
384 0.72
385 0.65
386 0.59
387 0.57
388 0.58
389 0.6
390 0.61
391 0.61
392 0.57
393 0.6
394 0.64
395 0.66
396 0.67
397 0.68
398 0.68
399 0.71
400 0.77
401 0.8