FuNGI

A0A4Q9LJL0

Protein Details

Accession

A0A4Q9LJL0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-31	SEEQIFNRRRISKKHLKTEKKDLENLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036860 SH2_dom_sf IPR035420 Spt6_SH2 IPR017072 TF_Spt6
Gene Ontology	GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14633 SH2_2

Amino Acid Sequences

MSDSSEEQIFNRRRISKKHLKTEKKDLENLFNEDEEDITDFVEDDQIEYAEYNKEEMNTIFYEIFGTGDEYMYVLEENEEISAEKNVSESSSESSFEIQEHFDLEEIVQWIQIRKEYPKKELDFFIQSLLENDFVHYILFHSLGVKFGIEEAYEIIDLYNEFKEFIKIKNMLLSKVNADELRNLNKFTKLNEVRDFSKYIFLKEKLSRFYDPCCETDLILSPNDFFENLLNKEKINEIQSENIPLDLFLETKGISKEYFKNYHSERLSILPIFQPFILEYCLKNGKFDEDLIHNLDIAKINDSDVLIEYDFENLLNEISKFYCIGTEDQWNKLRKEIISDVIKKIDIKEIIKSYFIDEIKTKIKKNLFVNVIDRIINGGIERPKYQQHVFGVSNDFKNVKVSVVNHKGESVESKTLGMNQNQDWLELYEKYAPICIGVSGSDYNIKNIFFRLKEIIPDANIILVENDIFKILSSDTSNFCYNIGLRILYPEILIMKMLKSNLFCEFVKNQNYLNNDEIKKQVIRGLLTAISIVGIDINLVIENKNCHFLLETILGPKKTSKFLKFTNENGFIEKLSVLDDKKIFNSVEFKNISTYFRIFPDLHEFDTENVSDIIDSLSIHPTNYSYAKIFCTNLLKEQEIDDKQTQISLKKFVEDKKEVLDWGLAHVNTDDTTSRAMFYISECILEPKRPIFEGSPDILIFNNLFPLHEKLINKIFEGRVVKVGDAFCIVSVVTENNNFSVFASKSNEVFVNQFLKVKIEDINCSTLSFKGSLFVEEIKKVERLKFIEHSLFKNLNAKEAEKYLIDEKKPLIIRKSSRGNYAVITLKIFKDVFIHLRVDEIIENNKIFYILLGKKYDELDEILSTFIKSLLFNSKMIQEHDKYFDNEFDAQKYLKDSFDGVKVHYCFYFSRKYPGKVVFAYIGPNKILKEEFINLFEQLEFDNRKFNDIDEFLVYRKKRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.69
3	0.7
4	0.75
5	0.81
6	0.84
7	0.87
8	0.88
9	0.91
10	0.91
11	0.88
12	0.85
13	0.79
14	0.78
15	0.72
16	0.69
17	0.6
18	0.5
19	0.43
20	0.35
21	0.3
22	0.21
23	0.17
24	0.12
25	0.1
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.11
30	0.1
31	0.09
32	0.1
33	0.1
34	0.1
35	0.1
36	0.12
37	0.12
38	0.13
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.16
43	0.17
44	0.19
45	0.17
46	0.19
47	0.17
48	0.16
49	0.17
50	0.15
51	0.14
52	0.11
53	0.11
54	0.09
55	0.09
56	0.09
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.06
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.12
76	0.12
77	0.14
78	0.15
79	0.16
80	0.16
81	0.18
82	0.18
83	0.17
84	0.17
85	0.14
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.11
90	0.11
91	0.1
92	0.12
93	0.12
94	0.12
95	0.11
96	0.12
97	0.14
98	0.16
99	0.19
100	0.19
101	0.27
102	0.36
103	0.41
104	0.47
105	0.54
106	0.57
107	0.59
108	0.6
109	0.57
110	0.53
111	0.48
112	0.44
113	0.35
114	0.31
115	0.27
116	0.25
117	0.2
118	0.14
119	0.14
120	0.12
121	0.11
122	0.11
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.08
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.15
151	0.16
152	0.19
153	0.25
154	0.25
155	0.26
156	0.33
157	0.34
158	0.32
159	0.33
160	0.33
161	0.27
162	0.27
163	0.29
164	0.24
165	0.23
166	0.26
167	0.28
168	0.34
169	0.33
170	0.34
171	0.32
172	0.37
173	0.37
174	0.33
175	0.39
176	0.38
177	0.43
178	0.47
179	0.49
180	0.47
181	0.49
182	0.49
183	0.39
184	0.41
185	0.35
186	0.33
187	0.36
188	0.34
189	0.39
190	0.43
191	0.47
192	0.44
193	0.48
194	0.49
195	0.44
196	0.47
197	0.48
198	0.45
199	0.4
200	0.39
201	0.35
202	0.3
203	0.3
204	0.29
205	0.22
206	0.2
207	0.19
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.13
212	0.09
213	0.11
214	0.15
215	0.18
216	0.24
217	0.24
218	0.23
219	0.24
220	0.26
221	0.27
222	0.24
223	0.25
224	0.21
225	0.25
226	0.26
227	0.28
228	0.26
229	0.23
230	0.2
231	0.16
232	0.15
233	0.1
234	0.1
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.1
239	0.11
240	0.1
241	0.11
242	0.15
243	0.21
244	0.28
245	0.33
246	0.32
247	0.38
248	0.4
249	0.49
250	0.46
251	0.41
252	0.35
253	0.32
254	0.35
255	0.28
256	0.26
257	0.2
258	0.19
259	0.19
260	0.17
261	0.14
262	0.11
263	0.12
264	0.14
265	0.12
266	0.11
267	0.16
268	0.22
269	0.22
270	0.23
271	0.22
272	0.23
273	0.23
274	0.23
275	0.22
276	0.18
277	0.2
278	0.22
279	0.21
280	0.18
281	0.17
282	0.18
283	0.17
284	0.15
285	0.14
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.09
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.11
312	0.12
313	0.2
314	0.22
315	0.27
316	0.34
317	0.37
318	0.36
319	0.37
320	0.38
321	0.3
322	0.34
323	0.31
324	0.32
325	0.36
326	0.39
327	0.38
328	0.36
329	0.36
330	0.31
331	0.29
332	0.27
333	0.22
334	0.2
335	0.23
336	0.26
337	0.26
338	0.26
339	0.26
340	0.22
341	0.24
342	0.23
343	0.2
344	0.17
345	0.2
346	0.27
347	0.3
348	0.3
349	0.31
350	0.34
351	0.39
352	0.42
353	0.46
354	0.42
355	0.41
356	0.43
357	0.39
358	0.37
359	0.3
360	0.26
361	0.19
362	0.16
363	0.12
364	0.09
365	0.1
366	0.11
367	0.13
368	0.14
369	0.15
370	0.18
371	0.23
372	0.24
373	0.25
374	0.24
375	0.28
376	0.28
377	0.28
378	0.31
379	0.29
380	0.28
381	0.24
382	0.23
383	0.17
384	0.18
385	0.16
386	0.12
387	0.12
388	0.14
389	0.22
390	0.29
391	0.31
392	0.29
393	0.29
394	0.29
395	0.26
396	0.27
397	0.21
398	0.15
399	0.14
400	0.14
401	0.14
402	0.18
403	0.21
404	0.2
405	0.19
406	0.18
407	0.24
408	0.23
409	0.23
410	0.19
411	0.17
412	0.17
413	0.14
414	0.15
415	0.11
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.1
420	0.09
421	0.08
422	0.07
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.12
434	0.13
435	0.16
436	0.12
437	0.14
438	0.16
439	0.15
440	0.16
441	0.18
442	0.18
443	0.15
444	0.15
445	0.13
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.06
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.03
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.07
461	0.08
462	0.1
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.12
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.08
472	0.07
473	0.08
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.1
488	0.12
489	0.15
490	0.14
491	0.17
492	0.19
493	0.23
494	0.26
495	0.26
496	0.25
497	0.25
498	0.27
499	0.27
500	0.26
501	0.27
502	0.25
503	0.25
504	0.25
505	0.24
506	0.22
507	0.2
508	0.21
509	0.16
510	0.16
511	0.15
512	0.15
513	0.13
514	0.13
515	0.12
516	0.09
517	0.06
518	0.06
519	0.05
520	0.03
521	0.02
522	0.02
523	0.02
524	0.02
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.04
529	0.06
530	0.07
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.11
535	0.11
536	0.13
537	0.14
538	0.13
539	0.14
540	0.17
541	0.17
542	0.16
543	0.19
544	0.18
545	0.22
546	0.28
547	0.29
548	0.32
549	0.38
550	0.47
551	0.48
552	0.51
553	0.53
554	0.52
555	0.48
556	0.45
557	0.4
558	0.3
559	0.26
560	0.21
561	0.13
562	0.1
563	0.11
564	0.1
565	0.13
566	0.14
567	0.14
568	0.15
569	0.18
570	0.16
571	0.15
572	0.21
573	0.18
574	0.24
575	0.24
576	0.24
577	0.24
578	0.26
579	0.26
580	0.22
581	0.23
582	0.18
583	0.18
584	0.21
585	0.18
586	0.19
587	0.26
588	0.25
589	0.24
590	0.24
591	0.23
592	0.2
593	0.22
594	0.2
595	0.12
596	0.11
597	0.1
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.05
602	0.05
603	0.06
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.1
609	0.12
610	0.13
611	0.13
612	0.12
613	0.13
614	0.15
615	0.17
616	0.17
617	0.17
618	0.22
619	0.21
620	0.26
621	0.27
622	0.26
623	0.24
624	0.26
625	0.3
626	0.25
627	0.3
628	0.25
629	0.23
630	0.23
631	0.25
632	0.24
633	0.22
634	0.23
635	0.24
636	0.23
637	0.26
638	0.3
639	0.32
640	0.39
641	0.38
642	0.38
643	0.35
644	0.36
645	0.32
646	0.29
647	0.26
648	0.17
649	0.16
650	0.18
651	0.14
652	0.13
653	0.13
654	0.13
655	0.11
656	0.12
657	0.1
658	0.07
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.09
663	0.09
664	0.08
665	0.09
666	0.13
667	0.11
668	0.12
669	0.12
670	0.15
671	0.17
672	0.18
673	0.19
674	0.17
675	0.19
676	0.19
677	0.22
678	0.2
679	0.23
680	0.25
681	0.25
682	0.24
683	0.22
684	0.22
685	0.19
686	0.19
687	0.14
688	0.1
689	0.11
690	0.09
691	0.09
692	0.11
693	0.15
694	0.16
695	0.2
696	0.21
697	0.22
698	0.29
699	0.3
700	0.28
701	0.29
702	0.27
703	0.29
704	0.31
705	0.28
706	0.27
707	0.27
708	0.26
709	0.25
710	0.25
711	0.19
712	0.17
713	0.16
714	0.1
715	0.1
716	0.1
717	0.06
718	0.07
719	0.07
720	0.08
721	0.1
722	0.1
723	0.11
724	0.12
725	0.12
726	0.11
727	0.15
728	0.14
729	0.15
730	0.2
731	0.21
732	0.21
733	0.23
734	0.23
735	0.2
736	0.21
737	0.2
738	0.19
739	0.19
740	0.21
741	0.19
742	0.2
743	0.19
744	0.2
745	0.22
746	0.2
747	0.23
748	0.23
749	0.27
750	0.25
751	0.25
752	0.25
753	0.2
754	0.2
755	0.17
756	0.14
757	0.14
758	0.14
759	0.15
760	0.16
761	0.19
762	0.2
763	0.21
764	0.22
765	0.2
766	0.24
767	0.25
768	0.28
769	0.3
770	0.3
771	0.34
772	0.38
773	0.41
774	0.46
775	0.46
776	0.45
777	0.46
778	0.45
779	0.4
780	0.44
781	0.38
782	0.36
783	0.35
784	0.34
785	0.29
786	0.3
787	0.3
788	0.23
789	0.26
790	0.27
791	0.31
792	0.3
793	0.31
794	0.29
795	0.35
796	0.39
797	0.41
798	0.4
799	0.42
800	0.47
801	0.53
802	0.62
803	0.58
804	0.6
805	0.57
806	0.53
807	0.45
808	0.45
809	0.41
810	0.32
811	0.31
812	0.27
813	0.25
814	0.28
815	0.27
816	0.21
817	0.19
818	0.22
819	0.24
820	0.24
821	0.26
822	0.21
823	0.23
824	0.23
825	0.22
826	0.19
827	0.18
828	0.19
829	0.2
830	0.2
831	0.19
832	0.18
833	0.17
834	0.15
835	0.13
836	0.17
837	0.19
838	0.24
839	0.27
840	0.27
841	0.29
842	0.31
843	0.32
844	0.25
845	0.22
846	0.19
847	0.18
848	0.17
849	0.16
850	0.15
851	0.14
852	0.12
853	0.11
854	0.1
855	0.09
856	0.12
857	0.2
858	0.21
859	0.22
860	0.24
861	0.29
862	0.31
863	0.35
864	0.39
865	0.34
866	0.36
867	0.41
868	0.43
869	0.39
870	0.39
871	0.37
872	0.34
873	0.35
874	0.32
875	0.3
876	0.29
877	0.27
878	0.26
879	0.28
880	0.26
881	0.22
882	0.21
883	0.21
884	0.22
885	0.28
886	0.28
887	0.26
888	0.32
889	0.32
890	0.33
891	0.31
892	0.3
893	0.25
894	0.29
895	0.36
896	0.3
897	0.39
898	0.45
899	0.49
900	0.55
901	0.6
902	0.61
903	0.53
904	0.55
905	0.48
906	0.41
907	0.44
908	0.39
909	0.36
910	0.3
911	0.31
912	0.27
913	0.27
914	0.27
915	0.22
916	0.24
917	0.27
918	0.29
919	0.29
920	0.3
921	0.27
922	0.27
923	0.25
924	0.21
925	0.16
926	0.2
927	0.22
928	0.2
929	0.28
930	0.27
931	0.31
932	0.31
933	0.31
934	0.32
935	0.29
936	0.32
937	0.28
938	0.3
939	0.28
940	0.36

A0A4Q9LJL0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer