Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q9LHV3

Protein Details
Accession A0A4Q9LHV3    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39IKFKYKNLEKRETLRQKDKIHydrophilic
41-67NIYLIKILKKKFKKIKEKIYKSIKYCIHydrophilic
165-192YLKSFCSRAKIRKNKKIKNKKIENEQEIHydrophilic
308-333RCEICKNKKIRGRKEFFKHFKQPEHLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-58LKKKFKKIKEK
173-185AKIRKNKKIKNKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16837  SF3A3  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
Amino Acid Sequences MKNIRNVYKILKLIEKASEIKFKYKNLEKRETLRQKDKIVNIYLIKILKKKFKKIKEKIYKSIKYCIIGEVNTVVYDFYEDIEWLKSKKEKIKIFNEIENKISDKIENIFSKEERYGRCVDLKSIFEKYRSIMKFTEYKEILEDFLCVEKYNFSYISYLKELNEYLKSFCSRAKIRKNKKIKNKKIENEQEIELRVFFDSRTFCEGCNKIIMTKMVCFHIKGKRHMKNISCNLLNIKYEEIYKFEKEIKIFTKIFKDEIKLSKSLCNVIEIECISNEEISGTKKFAVEKNEEIPSWLKKYYGLDITFRCEICKNKKIRGRKEFFKHFKQPEHLENLKTHNIEYCDLFYGITTFSGIEYMKTRIFLDQNIFIEEVEDEEGNVYDKKTFEDLKKMGII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.4
4 0.4
5 0.45
6 0.41
7 0.47
8 0.48
9 0.48
10 0.54
11 0.59
12 0.63
13 0.64
14 0.71
15 0.7
16 0.72
17 0.79
18 0.79
19 0.79
20 0.8
21 0.78
22 0.76
23 0.77
24 0.77
25 0.73
26 0.67
27 0.64
28 0.55
29 0.51
30 0.47
31 0.43
32 0.4
33 0.39
34 0.4
35 0.44
36 0.5
37 0.58
38 0.64
39 0.71
40 0.78
41 0.83
42 0.88
43 0.89
44 0.91
45 0.9
46 0.91
47 0.89
48 0.81
49 0.8
50 0.73
51 0.65
52 0.57
53 0.51
54 0.44
55 0.36
56 0.33
57 0.26
58 0.21
59 0.18
60 0.17
61 0.12
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.17
73 0.21
74 0.27
75 0.35
76 0.43
77 0.48
78 0.56
79 0.65
80 0.7
81 0.7
82 0.71
83 0.69
84 0.62
85 0.56
86 0.49
87 0.42
88 0.33
89 0.3
90 0.22
91 0.17
92 0.18
93 0.23
94 0.22
95 0.23
96 0.25
97 0.25
98 0.28
99 0.3
100 0.32
101 0.27
102 0.29
103 0.3
104 0.29
105 0.34
106 0.32
107 0.32
108 0.31
109 0.32
110 0.31
111 0.34
112 0.33
113 0.28
114 0.28
115 0.26
116 0.31
117 0.3
118 0.3
119 0.25
120 0.27
121 0.32
122 0.33
123 0.41
124 0.32
125 0.31
126 0.3
127 0.29
128 0.27
129 0.2
130 0.18
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.12
142 0.13
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.19
151 0.16
152 0.15
153 0.17
154 0.18
155 0.17
156 0.18
157 0.23
158 0.25
159 0.34
160 0.44
161 0.52
162 0.61
163 0.7
164 0.8
165 0.82
166 0.87
167 0.89
168 0.89
169 0.89
170 0.89
171 0.86
172 0.86
173 0.86
174 0.79
175 0.71
176 0.62
177 0.52
178 0.43
179 0.36
180 0.25
181 0.16
182 0.12
183 0.09
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.21
192 0.22
193 0.2
194 0.22
195 0.21
196 0.16
197 0.18
198 0.19
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.2
206 0.26
207 0.3
208 0.37
209 0.46
210 0.51
211 0.57
212 0.62
213 0.62
214 0.65
215 0.66
216 0.64
217 0.54
218 0.48
219 0.44
220 0.41
221 0.36
222 0.27
223 0.2
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.21
232 0.23
233 0.22
234 0.26
235 0.26
236 0.29
237 0.3
238 0.3
239 0.33
240 0.32
241 0.34
242 0.32
243 0.32
244 0.31
245 0.36
246 0.37
247 0.32
248 0.32
249 0.33
250 0.33
251 0.33
252 0.27
253 0.23
254 0.21
255 0.2
256 0.21
257 0.17
258 0.17
259 0.13
260 0.14
261 0.12
262 0.11
263 0.09
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.16
272 0.2
273 0.25
274 0.28
275 0.31
276 0.35
277 0.36
278 0.35
279 0.34
280 0.33
281 0.31
282 0.3
283 0.26
284 0.22
285 0.21
286 0.24
287 0.27
288 0.31
289 0.29
290 0.3
291 0.31
292 0.36
293 0.37
294 0.34
295 0.31
296 0.28
297 0.34
298 0.38
299 0.45
300 0.46
301 0.51
302 0.59
303 0.68
304 0.75
305 0.78
306 0.78
307 0.79
308 0.84
309 0.86
310 0.87
311 0.86
312 0.86
313 0.82
314 0.81
315 0.79
316 0.76
317 0.71
318 0.72
319 0.66
320 0.59
321 0.56
322 0.54
323 0.52
324 0.46
325 0.39
326 0.35
327 0.33
328 0.32
329 0.3
330 0.26
331 0.23
332 0.22
333 0.22
334 0.17
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.1
339 0.07
340 0.07
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.12
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.19
349 0.22
350 0.24
351 0.27
352 0.3
353 0.33
354 0.33
355 0.34
356 0.33
357 0.28
358 0.27
359 0.22
360 0.18
361 0.13
362 0.12
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.16
372 0.21
373 0.28
374 0.31
375 0.4
376 0.41