Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1V9

Protein Details
Accession C4R1V9    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-158SYIECRNKLYKDKKRRTNGAGSATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
IPR026216  HDA3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0426  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MDLLRILDTTPEPPIIDPSHFNLEYDVRNGDYRLITPLSDFQKELIDQIVSLHYSDILKFYERIGQDEKNQLESTQDQVILDSLETLLLNTQLVVNHPYLLITHYMPKSLVTRDISQLLSATSGKFKILGYLMESYIECRNKLYKDKKRRTNGAGSATSSPPETHIVVVSRPGKTVDLLEGFLTSFKVNIRKYHGTKPRDMNRKLHNVTVHLIPSKKEEMNKEMMKELLENRISVCFLFDITCLNNSGQDQDMNDFILALLFNKREARSSPAPMVRLVPINTVDHIAIYFREKSNSNRDSLTRYLKPMIAAIVVLRDRVGVIPSELRPIYATNLSYLNDWLSSLDTDKILDWPLPQLPSIPEFTSLDVEMSLLTEVRYDPEEDQKVNEHDDVELVLRNMVKKQREQQHILYYELKRLVQDYLTNPLKIRNVAFVIGIHNMNDASPLQSRLLTHTLIHQFGVHSMVLRTRNDHLRTFDCITKIRNTDVLTVYQQMSKIADDINVIQRKMNYLDARIGKASKIAKSFEGIFTCLKNEVVSLPVNNSQVTVYSEFYNFQALVKGMRHRKTNLINESTYLKEQIDEAIKSTNDSHQKLEVLHANLRMESMCVSGLNYRPHGKLDKDEELSSLKDEVSRLTCLQEKQSNRIGLILGKINDTHLRARLNKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.24
4 0.26
5 0.28
6 0.35
7 0.34
8 0.34
9 0.32
10 0.32
11 0.32
12 0.32
13 0.28
14 0.22
15 0.23
16 0.24
17 0.24
18 0.22
19 0.2
20 0.23
21 0.22
22 0.2
23 0.21
24 0.27
25 0.28
26 0.29
27 0.28
28 0.24
29 0.29
30 0.29
31 0.28
32 0.24
33 0.19
34 0.16
35 0.17
36 0.19
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.22
49 0.21
50 0.26
51 0.29
52 0.31
53 0.35
54 0.43
55 0.43
56 0.41
57 0.41
58 0.36
59 0.35
60 0.33
61 0.3
62 0.25
63 0.24
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.16
68 0.14
69 0.11
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.19
91 0.18
92 0.2
93 0.2
94 0.22
95 0.23
96 0.23
97 0.28
98 0.25
99 0.28
100 0.3
101 0.33
102 0.31
103 0.28
104 0.26
105 0.2
106 0.18
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.16
123 0.22
124 0.22
125 0.2
126 0.2
127 0.25
128 0.28
129 0.38
130 0.47
131 0.51
132 0.61
133 0.72
134 0.79
135 0.84
136 0.88
137 0.85
138 0.84
139 0.81
140 0.78
141 0.71
142 0.63
143 0.57
144 0.49
145 0.42
146 0.33
147 0.25
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.22
156 0.24
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.2
162 0.21
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.08
172 0.07
173 0.09
174 0.16
175 0.18
176 0.22
177 0.3
178 0.38
179 0.43
180 0.52
181 0.59
182 0.57
183 0.63
184 0.69
185 0.7
186 0.72
187 0.71
188 0.69
189 0.68
190 0.73
191 0.67
192 0.62
193 0.55
194 0.47
195 0.46
196 0.41
197 0.35
198 0.28
199 0.27
200 0.23
201 0.25
202 0.27
203 0.27
204 0.28
205 0.29
206 0.31
207 0.38
208 0.4
209 0.37
210 0.34
211 0.32
212 0.28
213 0.27
214 0.23
215 0.22
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.15
254 0.22
255 0.24
256 0.28
257 0.33
258 0.33
259 0.34
260 0.32
261 0.32
262 0.26
263 0.25
264 0.22
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.18
281 0.28
282 0.29
283 0.29
284 0.28
285 0.29
286 0.32
287 0.34
288 0.37
289 0.29
290 0.29
291 0.29
292 0.28
293 0.27
294 0.23
295 0.19
296 0.12
297 0.1
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.04
308 0.05
309 0.08
310 0.08
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.2
372 0.21
373 0.21
374 0.21
375 0.15
376 0.13
377 0.12
378 0.12
379 0.09
380 0.09
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.12
386 0.17
387 0.19
388 0.23
389 0.31
390 0.4
391 0.46
392 0.51
393 0.53
394 0.56
395 0.55
396 0.54
397 0.52
398 0.43
399 0.4
400 0.37
401 0.32
402 0.23
403 0.22
404 0.2
405 0.15
406 0.17
407 0.15
408 0.22
409 0.24
410 0.24
411 0.24
412 0.26
413 0.27
414 0.25
415 0.24
416 0.19
417 0.18
418 0.18
419 0.18
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.14
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.11
434 0.12
435 0.13
436 0.16
437 0.18
438 0.17
439 0.16
440 0.21
441 0.24
442 0.23
443 0.23
444 0.19
445 0.17
446 0.17
447 0.19
448 0.12
449 0.09
450 0.09
451 0.14
452 0.17
453 0.17
454 0.19
455 0.22
456 0.3
457 0.33
458 0.36
459 0.36
460 0.35
461 0.4
462 0.41
463 0.4
464 0.35
465 0.34
466 0.34
467 0.36
468 0.35
469 0.31
470 0.32
471 0.3
472 0.32
473 0.31
474 0.3
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.23
479 0.21
480 0.17
481 0.16
482 0.14
483 0.13
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.13
488 0.21
489 0.24
490 0.24
491 0.24
492 0.24
493 0.26
494 0.27
495 0.31
496 0.24
497 0.23
498 0.3
499 0.32
500 0.34
501 0.33
502 0.32
503 0.25
504 0.29
505 0.3
506 0.27
507 0.28
508 0.28
509 0.26
510 0.29
511 0.31
512 0.3
513 0.28
514 0.26
515 0.24
516 0.22
517 0.23
518 0.21
519 0.19
520 0.14
521 0.13
522 0.11
523 0.12
524 0.13
525 0.13
526 0.15
527 0.19
528 0.2
529 0.2
530 0.19
531 0.17
532 0.16
533 0.19
534 0.18
535 0.15
536 0.16
537 0.17
538 0.17
539 0.18
540 0.19
541 0.15
542 0.13
543 0.15
544 0.13
545 0.16
546 0.19
547 0.27
548 0.33
549 0.39
550 0.44
551 0.44
552 0.52
553 0.58
554 0.64
555 0.65
556 0.62
557 0.58
558 0.54
559 0.55
560 0.49
561 0.41
562 0.33
563 0.24
564 0.19
565 0.18
566 0.22
567 0.23
568 0.2
569 0.2
570 0.23
571 0.23
572 0.24
573 0.26
574 0.28
575 0.31
576 0.33
577 0.34
578 0.33
579 0.35
580 0.34
581 0.38
582 0.37
583 0.33
584 0.35
585 0.36
586 0.34
587 0.31
588 0.31
589 0.26
590 0.2
591 0.16
592 0.13
593 0.1
594 0.09
595 0.11
596 0.15
597 0.2
598 0.25
599 0.28
600 0.32
601 0.33
602 0.37
603 0.42
604 0.41
605 0.44
606 0.47
607 0.51
608 0.5
609 0.5
610 0.47
611 0.44
612 0.42
613 0.35
614 0.28
615 0.2
616 0.18
617 0.18
618 0.2
619 0.2
620 0.23
621 0.22
622 0.25
623 0.3
624 0.31
625 0.39
626 0.42
627 0.44
628 0.46
629 0.54
630 0.53
631 0.48
632 0.47
633 0.41
634 0.35
635 0.35
636 0.35
637 0.27
638 0.26
639 0.25
640 0.27
641 0.3
642 0.3
643 0.3
644 0.29
645 0.36