Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q2DI76

Protein Details
Accession A0A4Q2DI76    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-365PNSGKGRKGKSKKGGDKKGPSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-363GKGRKGKSKKGGDKKGP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd13154  KOW_Mtr4  
cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MPTDLFSFLDDNNDDSIQGQDEPMDVEEVKTSQQPLKRKAASPIDTSNAGEDTKEDAEEDALPLKRLKINVPKPIVLDDFETEAKREVAASAGLTGGTVESGSRLELRHQVRHQVAVPPGYNYIPISQHVPPAKPDREYKFELDPFQRVSVYAIQRNESVLVSAHTSAGKTVVAEYAIAQCLNRKQRVIYTSPIKVLFPFHAWATKAFTVLDVGSKSMLYRGSEIMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIILLPHTVRYVFLSATIPNAMQFAEWIVKSHEQPCHVVYTDFRPTPLQHYLFPAGGEGIYLVVNEKSEFREDNFAKAMGKIQDKMGDDPADPNSGKGRKGKSKKGGDKKGPSDISKIIKMIMIKNYNPVIVFSFSKRECEGYALTLSKFEFTDQAEQDLITNIFNNAIENLSQEDRQLPQITNLLPLLRRGIGFHHGGLLPILKEVIEILFQEGLIKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTATRKFDGXDFRNISGGEYIQMSGRAGRRGLDDRGVVIMMCDEKLDAPAAKGMLKGEADRLDSAFHLGYNMILNLMKVEGISPEFMLERCFFQFQSSAGIPKLEEELSAELEAQNAITIPEENLVAQYYDYRQQLDRMAADFREVVTHPAYSLPFMRSGRLVXVKHQKLDYGWGVVVNFQKRLAPKASSLVLXNSXPXSYITXRXDLALRSTYFXLMSIKDRDAVSAAPEGILPCPAGTKGSPQVVPVLLSTIDSISHLRIVLPKDLRPEPTRETVWKSVLEVQRRFPQGIALLDPIENMGIKDEKFQELIKVNIHTFPILPRLPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.14
5 0.14
6 0.12
7 0.1
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.13
15 0.13
16 0.15
17 0.16
18 0.19
19 0.22
20 0.28
21 0.37
22 0.43
23 0.52
24 0.57
25 0.58
26 0.64
27 0.69
28 0.68
29 0.65
30 0.63
31 0.57
32 0.52
33 0.49
34 0.42
35 0.33
36 0.28
37 0.21
38 0.17
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.24
53 0.26
54 0.33
55 0.38
56 0.46
57 0.54
58 0.58
59 0.58
60 0.56
61 0.59
62 0.52
63 0.43
64 0.37
65 0.29
66 0.27
67 0.26
68 0.25
69 0.22
70 0.21
71 0.2
72 0.17
73 0.16
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.08
91 0.09
92 0.12
93 0.21
94 0.26
95 0.34
96 0.37
97 0.45
98 0.46
99 0.49
100 0.49
101 0.47
102 0.46
103 0.43
104 0.41
105 0.34
106 0.33
107 0.29
108 0.27
109 0.22
110 0.21
111 0.17
112 0.17
113 0.2
114 0.19
115 0.26
116 0.29
117 0.29
118 0.32
119 0.39
120 0.42
121 0.42
122 0.49
123 0.49
124 0.51
125 0.54
126 0.53
127 0.52
128 0.52
129 0.54
130 0.5
131 0.47
132 0.43
133 0.4
134 0.36
135 0.28
136 0.28
137 0.29
138 0.31
139 0.32
140 0.31
141 0.31
142 0.32
143 0.32
144 0.3
145 0.23
146 0.17
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.13
168 0.2
169 0.28
170 0.3
171 0.29
172 0.3
173 0.37
174 0.42
175 0.43
176 0.43
177 0.43
178 0.43
179 0.45
180 0.44
181 0.38
182 0.34
183 0.32
184 0.27
185 0.22
186 0.2
187 0.17
188 0.2
189 0.2
190 0.21
191 0.24
192 0.23
193 0.21
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.16
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.18
212 0.17
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.11
267 0.14
268 0.16
269 0.21
270 0.23
271 0.22
272 0.24
273 0.24
274 0.25
275 0.23
276 0.22
277 0.18
278 0.22
279 0.26
280 0.24
281 0.24
282 0.23
283 0.23
284 0.27
285 0.33
286 0.29
287 0.23
288 0.27
289 0.29
290 0.27
291 0.26
292 0.21
293 0.14
294 0.12
295 0.1
296 0.06
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.2
310 0.2
311 0.23
312 0.23
313 0.22
314 0.21
315 0.21
316 0.23
317 0.18
318 0.19
319 0.17
320 0.17
321 0.21
322 0.22
323 0.23
324 0.23
325 0.2
326 0.18
327 0.19
328 0.19
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.18
333 0.19
334 0.22
335 0.25
336 0.31
337 0.37
338 0.45
339 0.54
340 0.58
341 0.66
342 0.74
343 0.79
344 0.82
345 0.82
346 0.82
347 0.77
348 0.75
349 0.68
350 0.59
351 0.52
352 0.47
353 0.41
354 0.34
355 0.31
356 0.23
357 0.21
358 0.21
359 0.2
360 0.22
361 0.22
362 0.21
363 0.24
364 0.24
365 0.23
366 0.22
367 0.2
368 0.15
369 0.13
370 0.14
371 0.12
372 0.17
373 0.16
374 0.18
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.13
381 0.15
382 0.14
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.11
387 0.11
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.14
392 0.13
393 0.15
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.07
400 0.07
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.12
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.14
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.13
434 0.14
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.11
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.1
477 0.11
478 0.14
479 0.17
480 0.18
481 0.18
482 0.19
483 0.23
484 0.24
485 0.27
486 0.26
487 0.25
488 0.26
489 0.26
490 0.25
491 0.2
492 0.16
493 0.12
494 0.1
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.1
500 0.12
501 0.13
502 0.13
503 0.14
504 0.17
505 0.21
506 0.22
507 0.22
508 0.2
509 0.19
510 0.19
511 0.18
512 0.14
513 0.1
514 0.09
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.09
526 0.09
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.14
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.11
541 0.09
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.07
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.1
563 0.1
564 0.11
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.16
570 0.14
571 0.19
572 0.18
573 0.18
574 0.17
575 0.18
576 0.16
577 0.15
578 0.17
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.12
585 0.12
586 0.09
587 0.1
588 0.09
589 0.07
590 0.06
591 0.04
592 0.04
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.08
604 0.1
605 0.15
606 0.16
607 0.18
608 0.18
609 0.2
610 0.24
611 0.25
612 0.24
613 0.21
614 0.22
615 0.2
616 0.21
617 0.19
618 0.16
619 0.15
620 0.14
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.13
625 0.15
626 0.15
627 0.14
628 0.16
629 0.15
630 0.2
631 0.2
632 0.22
633 0.2
634 0.22
635 0.27
636 0.29
637 0.34
638 0.38
639 0.46
640 0.5
641 0.49
642 0.51
643 0.45
644 0.46
645 0.41
646 0.35
647 0.27
648 0.22
649 0.22
650 0.21
651 0.26
652 0.23
653 0.21
654 0.19
655 0.23
656 0.23
657 0.28
658 0.29
659 0.26
660 0.26
661 0.3
662 0.33
663 0.32
664 0.32
665 0.31
666 0.31
667 0.28
668 0.27
669 0.23
670 0.21
671 0.22
672 0.22
673 0.18
674 0.15
675 0.17
676 0.18
677 0.2
678 0.21
679 0.19
680 0.2
681 0.21
682 0.2
683 0.18
684 0.18
685 0.18
686 0.19
687 0.21
688 0.21
689 0.22
690 0.22
691 0.21
692 0.21
693 0.19
694 0.18
695 0.18
696 0.17
697 0.13
698 0.14
699 0.14
700 0.13
701 0.13
702 0.11
703 0.08
704 0.09
705 0.09
706 0.11
707 0.11
708 0.17
709 0.22
710 0.27
711 0.28
712 0.27
713 0.31
714 0.29
715 0.3
716 0.24
717 0.2
718 0.14
719 0.14
720 0.14
721 0.11
722 0.1
723 0.1
724 0.11
725 0.1
726 0.12
727 0.11
728 0.12
729 0.16
730 0.2
731 0.27
732 0.29
733 0.31
734 0.37
735 0.41
736 0.46
737 0.45
738 0.48
739 0.46
740 0.49
741 0.51
742 0.5
743 0.53
744 0.53
745 0.53
746 0.48
747 0.45
748 0.47
749 0.49
750 0.52
751 0.48
752 0.49
753 0.53
754 0.56
755 0.54
756 0.45
757 0.43
758 0.39
759 0.38
760 0.35
761 0.28
762 0.26
763 0.25
764 0.25
765 0.2
766 0.16
767 0.13
768 0.1
769 0.11
770 0.13
771 0.13
772 0.19
773 0.22
774 0.24
775 0.25
776 0.26
777 0.3
778 0.31
779 0.34
780 0.33
781 0.35
782 0.34
783 0.35
784 0.36
785 0.29
786 0.26
787 0.26
788 0.29
789 0.27