Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q2D0C1

Protein Details
Accession A0A4Q2D0C1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-200VPRSKGRPFASKRRIRSKRHIFNTAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-193MVPRSKGRPFASKRRIRSKR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 7.833, mito 6.5, cyto_mito 5.833, cyto 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
Amino Acid Sequences MSDFCCDVKTWAPQTNSLVPFLTTRQLVPSLVAKHTKPTLALTENHQKNLYIVYNGREIGIFLTWPEAQAQITGYSNNSYEGFTHPENARIMWAWVLDNEAWGQVGGGSRPSAQQIAEYKAKEAEHGFGGVPGFTRPSAPLLSQAPPLLSSAEPMPGSSKQKGKQVAREPSTPMVPRSKGRPFASKRRIRSKRHIFNTAINPGATAPGSTREASCCHFVQHNTGRPTFTLPVASSFRAPASFSPIANSKRCQVGTVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.49
4 0.43
5 0.38
6 0.32
7 0.31
8 0.29
9 0.27
10 0.19
11 0.18
12 0.2
13 0.21
14 0.2
15 0.2
16 0.24
17 0.24
18 0.28
19 0.32
20 0.29
21 0.32
22 0.35
23 0.34
24 0.29
25 0.29
26 0.3
27 0.3
28 0.31
29 0.32
30 0.4
31 0.42
32 0.43
33 0.4
34 0.34
35 0.31
36 0.34
37 0.29
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.23
42 0.23
43 0.23
44 0.18
45 0.16
46 0.14
47 0.12
48 0.09
49 0.06
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.16
70 0.15
71 0.19
72 0.18
73 0.21
74 0.21
75 0.21
76 0.19
77 0.15
78 0.15
79 0.11
80 0.11
81 0.08
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.11
102 0.13
103 0.17
104 0.21
105 0.2
106 0.2
107 0.22
108 0.22
109 0.2
110 0.18
111 0.15
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.12
128 0.13
129 0.15
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.14
144 0.18
145 0.21
146 0.27
147 0.28
148 0.34
149 0.42
150 0.44
151 0.5
152 0.55
153 0.61
154 0.58
155 0.58
156 0.55
157 0.49
158 0.5
159 0.42
160 0.36
161 0.32
162 0.31
163 0.31
164 0.35
165 0.4
166 0.43
167 0.45
168 0.52
169 0.53
170 0.61
171 0.7
172 0.71
173 0.73
174 0.76
175 0.82
176 0.8
177 0.84
178 0.84
179 0.84
180 0.83
181 0.83
182 0.74
183 0.73
184 0.73
185 0.66
186 0.57
187 0.46
188 0.38
189 0.31
190 0.29
191 0.21
192 0.13
193 0.09
194 0.11
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.19
200 0.21
201 0.24
202 0.21
203 0.21
204 0.25
205 0.26
206 0.33
207 0.4
208 0.45
209 0.46
210 0.48
211 0.46
212 0.42
213 0.47
214 0.39
215 0.32
216 0.27
217 0.23
218 0.27
219 0.29
220 0.3
221 0.26
222 0.25
223 0.25
224 0.22
225 0.23
226 0.18
227 0.23
228 0.24
229 0.23
230 0.26
231 0.32
232 0.37
233 0.4
234 0.42
235 0.38
236 0.43
237 0.44