FuNGI

A0A4Q2CXJ8

Protein Details

Accession

A0A4Q2CXJ8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
251-271	ASHSKDTKGGKKKKTEYHCTI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSPGSDAVNLSKLYRLKEDGSNWAAYRDRTTDHLKGKGLRSHLNGRVKKPIEIVERFNNSTNAIQYFQPSDAAFATPLTDDDIEKFEVAACEYDKNEGIGSDVLNNTLPTSIYREIQTYKTLAEKWSALSSMFEHRGNVVQFDILARLQNARYQGGSMRSFLSQLTEWRNQLLDNDYTLSDSQFVTYITSSLAPNTEYRTLISAIEGAAEISNASLTSEVLKRRLIAEHEARNGINSNATTSASGSTALAASHSKDTKGGKKKKTEYHCTICNVNGHSKERCYAEGGGRHDQAPEWYKKKQAERLAQEPKNANAATTSTAAKSSYTCVVEGFPRSFNPIALSASKTPDNYQGIILDCGASDHFTPYRHLLTNFVELREHTRVADNRATFVEGRGTMVVEIPMGNGQPSTTLTLTNVYCVPSFVFTLISTTRMDLAGYGILQKGGMATITAPDNTTIGRVPLTRGLYRVTDPLGGSDGSGPLRANSITMSLMDFHIVMGHRSFGDLKRMIEGGMVEGIKVKDLSGAPPICRTCVEAKAIRKPFKESKSPHPTVYAQEISSDVWGPASVESIGRKNYFVLFIDRFSHETLVYFLRNKSDTFDAYQQYEAWVRVQRDASIKVLRSDRGGEYLGAEFTSHLKHKGTIRKLTTHDSPQSNGIAERAMGVHVSTARALLIQSKLPTFLWAEAIRFSVWLHNRQFTTSVPTLKTPYEIVTGSKPNLSTLHPWGAKVLVKDLKAGKLQSRVREGRYLGPDEESLGSRIYWEGKRSITVEREVFFNIPDAGSVSVEGETGSDNEDDEFVYLFNDSTSNNRQPQPALHFPQEDDDQPGEYAADDDVAPPPSPPPNPPPSQPSFDYGEEDGDERDTPRSIKLSTNPVFHARTKHIDIHFHFIRQTITSRDLQLVYCPTDAMVADIMTKQLARVKFTKFRKMMGVFGPEELVTSDARIEGEC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.32
3	0.32
4	0.39
5	0.42
6	0.45
7	0.46
8	0.47
9	0.42
10	0.42
11	0.41
12	0.36
13	0.36
14	0.31
15	0.29
16	0.3
17	0.37
18	0.41
19	0.45
20	0.5
21	0.51
22	0.55
23	0.6
24	0.61
25	0.59
26	0.57
27	0.57
28	0.6
29	0.63
30	0.67
31	0.66
32	0.65
33	0.7
34	0.65
35	0.62
36	0.57
37	0.57
38	0.55
39	0.54
40	0.56
41	0.55
42	0.58
43	0.58
44	0.56
45	0.49
46	0.43
47	0.4
48	0.37
49	0.31
50	0.26
51	0.24
52	0.24
53	0.26
54	0.24
55	0.24
56	0.2
57	0.19
58	0.18
59	0.19
60	0.16
61	0.13
62	0.14
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.16
70	0.16
71	0.16
72	0.16
73	0.14
74	0.14
75	0.15
76	0.15
77	0.13
78	0.15
79	0.16
80	0.18
81	0.17
82	0.17
83	0.16
84	0.14
85	0.15
86	0.13
87	0.13
88	0.14
89	0.14
90	0.14
91	0.14
92	0.14
93	0.13
94	0.12
95	0.12
96	0.1
97	0.16
98	0.17
99	0.18
100	0.2
101	0.23
102	0.26
103	0.28
104	0.3
105	0.25
106	0.24
107	0.27
108	0.27
109	0.25
110	0.26
111	0.24
112	0.24
113	0.25
114	0.24
115	0.2
116	0.19
117	0.2
118	0.24
119	0.26
120	0.24
121	0.22
122	0.23
123	0.28
124	0.27
125	0.26
126	0.19
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.15
131	0.11
132	0.12
133	0.11
134	0.14
135	0.14
136	0.17
137	0.19
138	0.18
139	0.18
140	0.18
141	0.21
142	0.25
143	0.26
144	0.25
145	0.24
146	0.23
147	0.23
148	0.21
149	0.21
150	0.16
151	0.2
152	0.25
153	0.29
154	0.29
155	0.3
156	0.3
157	0.27
158	0.28
159	0.27
160	0.21
161	0.18
162	0.19
163	0.17
164	0.19
165	0.19
166	0.16
167	0.13
168	0.12
169	0.11
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.1
178	0.1
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.16
183	0.18
184	0.16
185	0.17
186	0.19
187	0.19
188	0.18
189	0.17
190	0.13
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.07
205	0.12
206	0.14
207	0.16
208	0.18
209	0.18
210	0.2
211	0.24
212	0.24
213	0.28
214	0.34
215	0.38
216	0.4
217	0.42
218	0.4
219	0.37
220	0.35
221	0.27
222	0.22
223	0.16
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.13
228	0.13
229	0.13
230	0.1
231	0.11
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.09
239	0.13
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.23
244	0.31
245	0.41
246	0.49
247	0.53
248	0.62
249	0.7
250	0.76
251	0.81
252	0.81
253	0.8
254	0.78
255	0.76
256	0.69
257	0.62
258	0.56
259	0.5
260	0.43
261	0.4
262	0.38
263	0.36
264	0.35
265	0.34
266	0.35
267	0.33
268	0.31
269	0.28
270	0.26
271	0.27
272	0.31
273	0.34
274	0.36
275	0.35
276	0.34
277	0.31
278	0.28
279	0.27
280	0.28
281	0.31
282	0.3
283	0.31
284	0.37
285	0.43
286	0.49
287	0.53
288	0.55
289	0.57
290	0.6
291	0.67
292	0.72
293	0.68
294	0.66
295	0.61
296	0.53
297	0.49
298	0.42
299	0.32
300	0.23
301	0.21
302	0.18
303	0.17
304	0.17
305	0.11
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.12
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.14
315	0.15
316	0.17
317	0.19
318	0.19
319	0.15
320	0.15
321	0.19
322	0.19
323	0.18
324	0.17
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.19
329	0.17
330	0.19
331	0.2
332	0.19
333	0.19
334	0.23
335	0.24
336	0.21
337	0.2
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.17
342	0.11
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.09
350	0.1
351	0.12
352	0.14
353	0.17
354	0.19
355	0.19
356	0.2
357	0.21
358	0.28
359	0.28
360	0.26
361	0.23
362	0.21
363	0.26
364	0.25
365	0.23
366	0.16
367	0.2
368	0.21
369	0.26
370	0.31
371	0.26
372	0.25
373	0.25
374	0.26
375	0.2
376	0.19
377	0.17
378	0.12
379	0.12
380	0.11
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.12
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.06
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.07
421	0.07
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.07
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.12
448	0.14
449	0.14
450	0.15
451	0.16
452	0.17
453	0.17
454	0.17
455	0.14
456	0.12
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.08
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.06
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.09
489	0.08
490	0.14
491	0.15
492	0.15
493	0.16
494	0.17
495	0.16
496	0.15
497	0.14
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.06
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.08
508	0.08
509	0.09
510	0.14
511	0.16
512	0.16
513	0.2
514	0.21
515	0.19
516	0.19
517	0.2
518	0.17
519	0.19
520	0.23
521	0.24
522	0.28
523	0.37
524	0.44
525	0.46
526	0.45
527	0.48
528	0.52
529	0.53
530	0.57
531	0.53
532	0.56
533	0.61
534	0.63
535	0.57
536	0.53
537	0.49
538	0.42
539	0.43
540	0.34
541	0.24
542	0.22
543	0.21
544	0.17
545	0.16
546	0.14
547	0.08
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.05
552	0.06
553	0.05
554	0.06
555	0.08
556	0.1
557	0.13
558	0.13
559	0.13
560	0.13
561	0.14
562	0.15
563	0.14
564	0.17
565	0.16
566	0.17
567	0.19
568	0.2
569	0.2
570	0.19
571	0.19
572	0.14
573	0.13
574	0.13
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.14
579	0.16
580	0.17
581	0.17
582	0.18
583	0.19
584	0.19
585	0.2
586	0.25
587	0.23
588	0.24
589	0.24
590	0.21
591	0.2
592	0.2
593	0.17
594	0.15
595	0.17
596	0.17
597	0.2
598	0.21
599	0.22
600	0.24
601	0.25
602	0.27
603	0.27
604	0.27
605	0.27
606	0.29
607	0.27
608	0.25
609	0.26
610	0.23
611	0.21
612	0.21
613	0.17
614	0.16
615	0.16
616	0.14
617	0.11
618	0.1
619	0.08
620	0.08
621	0.11
622	0.11
623	0.12
624	0.13
625	0.17
626	0.24
627	0.33
628	0.39
629	0.44
630	0.47
631	0.52
632	0.54
633	0.56
634	0.54
635	0.52
636	0.52
637	0.46
638	0.43
639	0.39
640	0.37
641	0.32
642	0.27
643	0.2
644	0.14
645	0.11
646	0.1
647	0.08
648	0.07
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.08
654	0.07
655	0.07
656	0.06
657	0.07
658	0.07
659	0.09
660	0.1
661	0.12
662	0.13
663	0.14
664	0.15
665	0.15
666	0.17
667	0.15
668	0.14
669	0.16
670	0.16
671	0.16
672	0.16
673	0.17
674	0.15
675	0.14
676	0.14
677	0.16
678	0.18
679	0.25
680	0.27
681	0.31
682	0.31
683	0.33
684	0.34
685	0.28
686	0.33
687	0.29
688	0.3
689	0.27
690	0.29
691	0.3
692	0.29
693	0.29
694	0.22
695	0.2
696	0.19
697	0.18
698	0.18
699	0.2
700	0.24
701	0.23
702	0.24
703	0.22
704	0.21
705	0.22
706	0.23
707	0.22
708	0.23
709	0.31
710	0.3
711	0.3
712	0.29
713	0.3
714	0.3
715	0.26
716	0.28
717	0.24
718	0.24
719	0.28
720	0.3
721	0.31
722	0.33
723	0.34
724	0.32
725	0.37
726	0.41
727	0.43
728	0.5
729	0.5
730	0.5
731	0.53
732	0.51
733	0.49
734	0.5
735	0.48
736	0.39
737	0.37
738	0.33
739	0.29
740	0.29
741	0.22
742	0.17
743	0.14
744	0.13
745	0.11
746	0.13
747	0.16
748	0.17
749	0.19
750	0.21
751	0.22
752	0.25
753	0.26
754	0.31
755	0.3
756	0.33
757	0.33
758	0.3
759	0.31
760	0.3
761	0.29
762	0.23
763	0.21
764	0.16
765	0.12
766	0.12
767	0.11
768	0.1
769	0.1
770	0.09
771	0.08
772	0.08
773	0.08
774	0.07
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.08
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.08
783	0.08
784	0.08
785	0.08
786	0.06
787	0.06
788	0.07
789	0.06
790	0.06
791	0.07
792	0.07
793	0.13
794	0.2
795	0.27
796	0.32
797	0.35
798	0.37
799	0.39
800	0.45
801	0.48
802	0.5
803	0.49
804	0.49
805	0.48
806	0.46
807	0.48
808	0.44
809	0.37
810	0.32
811	0.27
812	0.23
813	0.21
814	0.21
815	0.16
816	0.13
817	0.13
818	0.08
819	0.08
820	0.06
821	0.07
822	0.1
823	0.12
824	0.12
825	0.11
826	0.14
827	0.19
828	0.21
829	0.25
830	0.31
831	0.37
832	0.41
833	0.45
834	0.51
835	0.51
836	0.55
837	0.52
838	0.48
839	0.46
840	0.43
841	0.42
842	0.35
843	0.31
844	0.26
845	0.24
846	0.21
847	0.17
848	0.16
849	0.14
850	0.15
851	0.15
852	0.15
853	0.18
854	0.21
855	0.22
856	0.27
857	0.32
858	0.4
859	0.44
860	0.47
861	0.47
862	0.5
863	0.52
864	0.49
865	0.5
866	0.46
867	0.48
868	0.49
869	0.53
870	0.51
871	0.56
872	0.55
873	0.57
874	0.54
875	0.49
876	0.44
877	0.38
878	0.36
879	0.3
880	0.3
881	0.26
882	0.28
883	0.3
884	0.31
885	0.33
886	0.32
887	0.3
888	0.32
889	0.31
890	0.29
891	0.26
892	0.24
893	0.2
894	0.2
895	0.2
896	0.16
897	0.13
898	0.1
899	0.11
900	0.11
901	0.12
902	0.11
903	0.11
904	0.11
905	0.16
906	0.18
907	0.23
908	0.28
909	0.36
910	0.44
911	0.52
912	0.62
913	0.58
914	0.6
915	0.64
916	0.62
917	0.6
918	0.57
919	0.56
920	0.46
921	0.44
922	0.42
923	0.32
924	0.29
925	0.24
926	0.18
927	0.11
928	0.11
929	0.1
930	0.1

A0A4Q2CXJ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer