FuNGI

A0A4V1Q4H8

Protein Details

Accession

A0A4V1Q4H8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
142-162	SATGTNKRKRRWDVAEPNDEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
177-180	KKRR

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 12.5, nucl 7.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSPPGSPRLVDSFTAPREVLQEFADLAEEENVDPFAETASKRQIASRQSDYHNRRFGRVAVESADAFKQGADGQESEEGGYKEAMRLTRLEQEEQRVRRAIEDKQRKEREDEKMKMDLDKTPPAAELDAVERELEAARDLASATGTNKRKRRWDVAEPNDENADPNKKEDAAEGAPKKRRSRWDATPAEVAATDAPKRSRWDQAPAVQDTPMQPIIMNAPGIMQEDKHNRYLSDEELDALLPTQGYAIVTPPPGYATMAPRKFAAPSVTQIEGFHIQESSDAAALAAAAGLAPELPTEIPGVGNLSFFKPEDAQYFAKILKEEDETELSVDEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKAREFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAVLPHLRNLVDCVAHGLSDEQQKVRTMTALALAALAEASAPYGIESFDNVLKPLWLGIRLHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTVILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTAQYIKQDILPDFFKAFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKAGVSEIVGRVVNELKDEAEPYRKMVMETITKVVATLGASDIDERLEVRLIDGIIYAFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGVRVKPYLTQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKGIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALSFVFEYVGPQSAFYVNSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASTIVKHLALGVAGLGCEDSMMHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMEAIEAMRVALGPGVLLSYTLQGLFHPARKVREVYWRVYNALYLGASDALVPFFPDLGELSEGQNVYDRHPLQVFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.34
3	0.29
4	0.29
5	0.29
6	0.25
7	0.19
8	0.18
9	0.14
10	0.15
11	0.15
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.1
17	0.11
18	0.11
19	0.1
20	0.1
21	0.08
22	0.08
23	0.11
24	0.12
25	0.16
26	0.24
27	0.27
28	0.28
29	0.32
30	0.38
31	0.42
32	0.49
33	0.52
34	0.51
35	0.55
36	0.65
37	0.69
38	0.72
39	0.73
40	0.67
41	0.63
42	0.59
43	0.56
44	0.53
45	0.48
46	0.42
47	0.36
48	0.36
49	0.33
50	0.32
51	0.29
52	0.22
53	0.18
54	0.15
55	0.13
56	0.11
57	0.14
58	0.14
59	0.14
60	0.16
61	0.18
62	0.19
63	0.18
64	0.21
65	0.19
66	0.17
67	0.18
68	0.16
69	0.16
70	0.19
71	0.2
72	0.17
73	0.19
74	0.21
75	0.28
76	0.31
77	0.35
78	0.35
79	0.44
80	0.51
81	0.52
82	0.55
83	0.5
84	0.47
85	0.48
86	0.48
87	0.48
88	0.5
89	0.58
90	0.61
91	0.68
92	0.76
93	0.72
94	0.75
95	0.75
96	0.75
97	0.74
98	0.71
99	0.66
100	0.64
101	0.62
102	0.59
103	0.53
104	0.49
105	0.44
106	0.45
107	0.41
108	0.35
109	0.35
110	0.32
111	0.3
112	0.24
113	0.2
114	0.16
115	0.16
116	0.15
117	0.14
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.11
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.11
131	0.19
132	0.26
133	0.35
134	0.42
135	0.48
136	0.57
137	0.64
138	0.72
139	0.72
140	0.76
141	0.79
142	0.81
143	0.85
144	0.78
145	0.72
146	0.63
147	0.54
148	0.45
149	0.38
150	0.36
151	0.26
152	0.27
153	0.27
154	0.26
155	0.26
156	0.26
157	0.28
158	0.24
159	0.33
160	0.37
161	0.43
162	0.49
163	0.56
164	0.61
165	0.62
166	0.67
167	0.67
168	0.69
169	0.71
170	0.74
171	0.73
172	0.72
173	0.69
174	0.59
175	0.51
176	0.43
177	0.33
178	0.24
179	0.2
180	0.17
181	0.16
182	0.18
183	0.2
184	0.26
185	0.29
186	0.36
187	0.37
188	0.44
189	0.48
190	0.53
191	0.57
192	0.56
193	0.53
194	0.44
195	0.42
196	0.35
197	0.32
198	0.26
199	0.19
200	0.15
201	0.14
202	0.16
203	0.16
204	0.15
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.16
212	0.24
213	0.27
214	0.31
215	0.32
216	0.3
217	0.33
218	0.35
219	0.31
220	0.26
221	0.23
222	0.2
223	0.19
224	0.19
225	0.15
226	0.12
227	0.1
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.08
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.19
244	0.28
245	0.29
246	0.3
247	0.3
248	0.3
249	0.3
250	0.3
251	0.27
252	0.2
253	0.22
254	0.25
255	0.26
256	0.25
257	0.25
258	0.25
259	0.24
260	0.22
261	0.18
262	0.14
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.11
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.03
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.02
279	0.02
280	0.02
281	0.03
282	0.03
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.08
289	0.07
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.15
299	0.19
300	0.19
301	0.19
302	0.21
303	0.2
304	0.21
305	0.2
306	0.18
307	0.16
308	0.17
309	0.17
310	0.18
311	0.19
312	0.17
313	0.17
314	0.16
315	0.14
316	0.13
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.16
322	0.16
323	0.18
324	0.21
325	0.26
326	0.28
327	0.36
328	0.43
329	0.45
330	0.51
331	0.51
332	0.49
333	0.51
334	0.5
335	0.47
336	0.47
337	0.45
338	0.45
339	0.47
340	0.46
341	0.44
342	0.5
343	0.52
344	0.48
345	0.46
346	0.46
347	0.5
348	0.56
349	0.53
350	0.44
351	0.36
352	0.33
353	0.31
354	0.29
355	0.24
356	0.18
357	0.17
358	0.16
359	0.17
360	0.16
361	0.15
362	0.11
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.12
371	0.12
372	0.14
373	0.13
374	0.13
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.14
379	0.15
380	0.14
381	0.18
382	0.2
383	0.18
384	0.19
385	0.19
386	0.19
387	0.19
388	0.19
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.15
393	0.16
394	0.18
395	0.17
396	0.18
397	0.2
398	0.2
399	0.18
400	0.16
401	0.14
402	0.14
403	0.15
404	0.14
405	0.13
406	0.1
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.06
411	0.05
412	0.04
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.08
421	0.1
422	0.12
423	0.12
424	0.14
425	0.15
426	0.15
427	0.15
428	0.13
429	0.11
430	0.08
431	0.08
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.08
445	0.11
446	0.12
447	0.11
448	0.14
449	0.14
450	0.16
451	0.17
452	0.15
453	0.12
454	0.12
455	0.13
456	0.12
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.1
464	0.08
465	0.08
466	0.06
467	0.05
468	0.04
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.09
477	0.14
478	0.19
479	0.25
480	0.29
481	0.32
482	0.39
483	0.48
484	0.54
485	0.59
486	0.6
487	0.61
488	0.64
489	0.68
490	0.63
491	0.57
492	0.5
493	0.45
494	0.41
495	0.34
496	0.28
497	0.21
498	0.19
499	0.15
500	0.12
501	0.07
502	0.05
503	0.04
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.04
508	0.04
509	0.05
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.09
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.11
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.09
523	0.13
524	0.14
525	0.12
526	0.13
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.13
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.04
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.04
551	0.05
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.1
563	0.2
564	0.21
565	0.22
566	0.22
567	0.22
568	0.2
569	0.21
570	0.22
571	0.13
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.1
577	0.09
578	0.06
579	0.04
580	0.03
581	0.04
582	0.03
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.09
600	0.09
601	0.12
602	0.12
603	0.12
604	0.13
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.15
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.13
613	0.14
614	0.12
615	0.14
616	0.14
617	0.16
618	0.22
619	0.27
620	0.3
621	0.29
622	0.29
623	0.27
624	0.27
625	0.24
626	0.18
627	0.13
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.1
637	0.1
638	0.13
639	0.13
640	0.13
641	0.14
642	0.13
643	0.14
644	0.14
645	0.15
646	0.16
647	0.19
648	0.18
649	0.2
650	0.27
651	0.3
652	0.35
653	0.42
654	0.45
655	0.47
656	0.53
657	0.51
658	0.45
659	0.45
660	0.39
661	0.35
662	0.3
663	0.25
664	0.2
665	0.21
666	0.2
667	0.15
668	0.14
669	0.1
670	0.08
671	0.08
672	0.06
673	0.04
674	0.04
675	0.05
676	0.05
677	0.07
678	0.07
679	0.06
680	0.07
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.1
688	0.1
689	0.14
690	0.14
691	0.16
692	0.18
693	0.18
694	0.18
695	0.18
696	0.2
697	0.19
698	0.21
699	0.21
700	0.18
701	0.17
702	0.17
703	0.15
704	0.13
705	0.08
706	0.07
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.05
715	0.05
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.07
732	0.09
733	0.09
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.06
740	0.04
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.03
748	0.03
749	0.05
750	0.06
751	0.07
752	0.08
753	0.08
754	0.09
755	0.12
756	0.17
757	0.15
758	0.16
759	0.15
760	0.18
761	0.18
762	0.18
763	0.17
764	0.14
765	0.16
766	0.17
767	0.19
768	0.24
769	0.29
770	0.31
771	0.38
772	0.43
773	0.49
774	0.54
775	0.56
776	0.49
777	0.49
778	0.5
779	0.43
780	0.42
781	0.33
782	0.27
783	0.23
784	0.21
785	0.16
786	0.14
787	0.12
788	0.09
789	0.13
790	0.13
791	0.14
792	0.14
793	0.15
794	0.16
795	0.15
796	0.15
797	0.13
798	0.14
799	0.13
800	0.13
801	0.13
802	0.12
803	0.12
804	0.1
805	0.09
806	0.07
807	0.07
808	0.07
809	0.06
810	0.07
811	0.07
812	0.07
813	0.06
814	0.06
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.03
824	0.03
825	0.03
826	0.03
827	0.03
828	0.02
829	0.02
830	0.02
831	0.02
832	0.02
833	0.03
834	0.04
835	0.05
836	0.11
837	0.13
838	0.13
839	0.15
840	0.17
841	0.18
842	0.21
843	0.22
844	0.23
845	0.23
846	0.24
847	0.27
848	0.28
849	0.33
850	0.36
851	0.44
852	0.44
853	0.5
854	0.52
855	0.58
856	0.58
857	0.57
858	0.53
859	0.52
860	0.49
861	0.43
862	0.41
863	0.35
864	0.32
865	0.27
866	0.24
867	0.15
868	0.12
869	0.12
870	0.1
871	0.08
872	0.08
873	0.1
874	0.09
875	0.13
876	0.12
877	0.12
878	0.13
879	0.15
880	0.16
881	0.18
882	0.18
883	0.16
884	0.22
885	0.22
886	0.22
887	0.19
888	0.18
889	0.2
890	0.2
891	0.21
892	0.15
893	0.18
894	0.21
895	0.21
896	0.24
897	0.21
898	0.26
899	0.32
900	0.42
901	0.47
902	0.46
903	0.51
904	0.56
905	0.61
906	0.56
907	0.49
908	0.41
909	0.33
910	0.3
911	0.25
912	0.18
913	0.12
914	0.12
915	0.13
916	0.12
917	0.13
918	0.12
919	0.12
920	0.12
921	0.12
922	0.1
923	0.09
924	0.08
925	0.09
926	0.1
927	0.1
928	0.13
929	0.14
930	0.15
931	0.17
932	0.26
933	0.31
934	0.37
935	0.41
936	0.41
937	0.41
938	0.41
939	0.4
940	0.32
941	0.29
942	0.23
943	0.19
944	0.14
945	0.12
946	0.12
947	0.11
948	0.1
949	0.05
950	0.05
951	0.05
952	0.07
953	0.07
954	0.08
955	0.1
956	0.11
957	0.11
958	0.13
959	0.18
960	0.19
961	0.2
962	0.22
963	0.22
964	0.22
965	0.23
966	0.22
967	0.21
968	0.21
969	0.24
970	0.22
971	0.22
972	0.22
973	0.21
974	0.2
975	0.18
976	0.16
977	0.13
978	0.14
979	0.16
980	0.16
981	0.16
982	0.16
983	0.14
984	0.16
985	0.15
986	0.17
987	0.14
988	0.13
989	0.14
990	0.14
991	0.14
992	0.14
993	0.14
994	0.1
995	0.11
996	0.11
997	0.09
998	0.08
999	0.08
1000	0.08
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.07
1008	0.11
1009	0.14
1010	0.16
1011	0.2
1012	0.2
1013	0.2
1014	0.21
1015	0.28
1016	0.28
1017	0.26
1018	0.27
1019	0.25
1020	0.25
1021	0.24
1022	0.23
1023	0.17
1024	0.13
1025	0.11
1026	0.09
1027	0.07
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.05
1031	0.04
1032	0.04
1033	0.04
1034	0.04
1035	0.06
1036	0.07
1037	0.07
1038	0.08
1039	0.08
1040	0.14
1041	0.2
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.21
1046	0.22
1047	0.22
1048	0.18
1049	0.19
1050	0.26
1051	0.27
1052	0.26
1053	0.24
1054	0.22
1055	0.22
1056	0.22
1057	0.17
1058	0.09
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.06
1062	0.06
1063	0.06
1064	0.05
1065	0.03
1066	0.03
1067	0.04
1068	0.05
1069	0.04
1070	0.04
1071	0.04
1072	0.05
1073	0.05
1074	0.05
1075	0.06
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.07
1081	0.14
1082	0.18
1083	0.23
1084	0.29
1085	0.33
1086	0.38
1087	0.43
1088	0.46
1089	0.44
1090	0.51
1091	0.51
1092	0.5
1093	0.55
1094	0.53
1095	0.5
1096	0.48
1097	0.44
1098	0.34
1099	0.31
1100	0.25
1101	0.15
1102	0.14
1103	0.12
1104	0.11
1105	0.1
1106	0.1
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.08
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.07
1114	0.08
1115	0.1
1116	0.13
1117	0.13
1118	0.14
1119	0.18
1120	0.18
1121	0.17
1122	0.22
1123	0.2
1124	0.21
1125	0.29
1126	0.28
1127	0.29

A0A4V1Q4H8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer