FuNGI

A0A4Q2D9R1

Protein Details

Accession

A0A4Q2D9R1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
963-984	EEMEKKEKAKLKKKAKAAKGLA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
968-983	KKEKAKLKKKAKAAKG

Subcellular Location(s)

mito 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLARTSRRLETTLLLSRQSLPRPARLVPRAYSTPSKPAHSPATATAAQPLPSHDYPPYLPASGPSSLSSTSNDFLKPFLQRTQSFTILPAPLPKDEHKNDPIFTDTVTQDKLAVMDACLHNLYSVPRAKTLFNRLRHEKQSVLSTNIYNRVMSSYLQMAAQEESNRVMWVSEAWEVYRAMVSGNEGVLPDHQTYALALNAWRQFSDIPEGADYKTILFHITTDSRKISLLDIVAHPCIPTQEDAADITKALARIALEKQDIDTVNILAKAASIASGDNLKIPEAVTALKHTTDESGKVVSEVPFNIQNLRDHLANVAYARQVLPDDMVARQRHLELSAYDMAAERLKFQHDKMNERGLDNRYQDKVLQEYMYSWHSKLSERLAKEIKIIEQEEANKIFRNSATELTPYLSLVAPDRLSMITILEAMRLTGTGGISNGMKTTRAMVTIGKAVENEYKARMCKTNGISLPSVTRPDETVFTEFGYSNLHQRRLAAARQMTVGGVLLECLMDIAEITRSAKDRKTGEVVYDTQPAFYHGYEFVRGNKLGVIKVNTAVSERIAKDPLGGVVHPRLLPMLIPPKPWVGPSDGAYLFSKASLMRFKESVEQQKYLEAAVRSGNVELVMEGLNVLGRTPWKINKQVFDVVIQIWNSGERVGKIPPAQYDEAEPQAPVDESDLSARSIWLQKHKLWQQNVANNHSDRCSVNYKIEIARVYADETIYFPHNLDFRGRAYPIPPHLNHMGDDLSRGLLQFATTKPLGERGFRWLKIHLANLCGFDKADFDERVEWVHERVDQIKESAHNPLGGSRWWMKADDPWQCLAVCFELTAALESGDPLNFQSSLPVHQDGTCNGLQHYAAMGGDSQGAAQVNLAPVDRPSDVYTFVGKKVERLVDEDAKNGNVHAIALQGKITRKVVKQTVMTTVYGVTFVGARDQLHKQLSDXGGYSGGAVLAFDPERFERRVVKQQEEMEKKEKAKLKKKAKAAKGLAASSSSSKAKAVVAAEDLEEGEEDEGRSKKPFAVPMAKMKKEQMTSVIWTTALGLPIVQPYRKSARRQVMTNLQSVYISDPNVPSEVNTMKQASAFPPNFVHSLDATHMILTAIECSSRNLTFAAVHDSYWTHACDIDQMSAIIRDTFINLHASDMLKRLSAEFKERYKNYRIPVMHLERQTSLNKKLVAAGARVKMSPEQAATYKALGTLIEVTEETSEQAKVVESDLAGLDGVVVTSSPKKDSDLPSAADLAKDILASLKEGEDASTSAEAAEEAPEAQKGSALKEENLEYLMNKFVDVTELLPPLPEKGSFDVNDIRKSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.37
3	0.4
4	0.44
5	0.44
6	0.45
7	0.4
8	0.45
9	0.48
10	0.52
11	0.56
12	0.57
13	0.59
14	0.53
15	0.57
16	0.54
17	0.56
18	0.58
19	0.52
20	0.55
21	0.53
22	0.54
23	0.49
24	0.51
25	0.52
26	0.47
27	0.46
28	0.4
29	0.42
30	0.4
31	0.37
32	0.36
33	0.32
34	0.3
35	0.28
36	0.28
37	0.29
38	0.28
39	0.31
40	0.26
41	0.28
42	0.27
43	0.31
44	0.31
45	0.24
46	0.23
47	0.23
48	0.26
49	0.24
50	0.24
51	0.22
52	0.21
53	0.21
54	0.22
55	0.22
56	0.22
57	0.22
58	0.23
59	0.23
60	0.21
61	0.21
62	0.24
63	0.27
64	0.27
65	0.32
66	0.37
67	0.38
68	0.45
69	0.5
70	0.49
71	0.44
72	0.42
73	0.41
74	0.35
75	0.34
76	0.34
77	0.3
78	0.29
79	0.33
80	0.36
81	0.39
82	0.41
83	0.48
84	0.5
85	0.52
86	0.5
87	0.48
88	0.48
89	0.39
90	0.36
91	0.32
92	0.26
93	0.25
94	0.25
95	0.22
96	0.19
97	0.19
98	0.18
99	0.15
100	0.15
101	0.11
102	0.17
103	0.17
104	0.19
105	0.19
106	0.18
107	0.16
108	0.17
109	0.18
110	0.19
111	0.25
112	0.24
113	0.28
114	0.3
115	0.34
116	0.4
117	0.49
118	0.5
119	0.52
120	0.59
121	0.64
122	0.71
123	0.74
124	0.71
125	0.64
126	0.6
127	0.61
128	0.56
129	0.52
130	0.46
131	0.43
132	0.43
133	0.45
134	0.43
135	0.33
136	0.29
137	0.27
138	0.25
139	0.22
140	0.2
141	0.16
142	0.16
143	0.17
144	0.16
145	0.15
146	0.15
147	0.17
148	0.16
149	0.14
150	0.16
151	0.16
152	0.16
153	0.14
154	0.13
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.12
159	0.13
160	0.13
161	0.15
162	0.15
163	0.15
164	0.15
165	0.12
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.11
175	0.14
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.11
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.1
184	0.09
185	0.15
186	0.18
187	0.19
188	0.18
189	0.18
190	0.18
191	0.19
192	0.26
193	0.21
194	0.19
195	0.21
196	0.22
197	0.21
198	0.23
199	0.21
200	0.14
201	0.13
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.13
207	0.19
208	0.21
209	0.24
210	0.25
211	0.25
212	0.26
213	0.26
214	0.22
215	0.2
216	0.19
217	0.18
218	0.19
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.19
223	0.16
224	0.15
225	0.14
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.13
231	0.15
232	0.14
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.1
238	0.1
239	0.09
240	0.12
241	0.15
242	0.19
243	0.18
244	0.19
245	0.2
246	0.23
247	0.23
248	0.21
249	0.19
250	0.15
251	0.16
252	0.16
253	0.15
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.07
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.08
263	0.08
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.1
273	0.12
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.16
282	0.16
283	0.15
284	0.16
285	0.17
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.15
290	0.17
291	0.18
292	0.2
293	0.2
294	0.21
295	0.22
296	0.24
297	0.22
298	0.19
299	0.2
300	0.18
301	0.16
302	0.15
303	0.13
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.11
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.19
318	0.2
319	0.19
320	0.19
321	0.19
322	0.13
323	0.17
324	0.18
325	0.16
326	0.16
327	0.15
328	0.15
329	0.15
330	0.15
331	0.12
332	0.11
333	0.16
334	0.17
335	0.18
336	0.25
337	0.27
338	0.34
339	0.37
340	0.44
341	0.42
342	0.42
343	0.47
344	0.43
345	0.45
346	0.42
347	0.42
348	0.35
349	0.35
350	0.34
351	0.31
352	0.3
353	0.25
354	0.22
355	0.17
356	0.16
357	0.18
358	0.2
359	0.19
360	0.16
361	0.16
362	0.17
363	0.19
364	0.21
365	0.27
366	0.3
367	0.29
368	0.36
369	0.38
370	0.37
371	0.38
372	0.37
373	0.3
374	0.29
375	0.29
376	0.23
377	0.22
378	0.23
379	0.25
380	0.25
381	0.24
382	0.21
383	0.2
384	0.21
385	0.19
386	0.2
387	0.19
388	0.19
389	0.19
390	0.19
391	0.19
392	0.19
393	0.18
394	0.14
395	0.13
396	0.11
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.08
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.11
432	0.13
433	0.16
434	0.16
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.16
439	0.17
440	0.16
441	0.15
442	0.17
443	0.18
444	0.21
445	0.22
446	0.21
447	0.27
448	0.29
449	0.34
450	0.34
451	0.36
452	0.35
453	0.32
454	0.33
455	0.27
456	0.27
457	0.19
458	0.18
459	0.15
460	0.16
461	0.17
462	0.17
463	0.17
464	0.15
465	0.15
466	0.16
467	0.14
468	0.13
469	0.15
470	0.13
471	0.18
472	0.22
473	0.24
474	0.23
475	0.23
476	0.28
477	0.28
478	0.3
479	0.29
480	0.26
481	0.25
482	0.25
483	0.25
484	0.2
485	0.16
486	0.14
487	0.07
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.02
496	0.02
497	0.03
498	0.03
499	0.04
500	0.05
501	0.06
502	0.09
503	0.11
504	0.13
505	0.18
506	0.2
507	0.23
508	0.27
509	0.27
510	0.27
511	0.28
512	0.29
513	0.27
514	0.3
515	0.26
516	0.21
517	0.2
518	0.2
519	0.18
520	0.15
521	0.14
522	0.11
523	0.12
524	0.13
525	0.14
526	0.14
527	0.17
528	0.17
529	0.15
530	0.16
531	0.16
532	0.15
533	0.17
534	0.17
535	0.15
536	0.16
537	0.16
538	0.14
539	0.14
540	0.13
541	0.12
542	0.13
543	0.14
544	0.14
545	0.15
546	0.14
547	0.14
548	0.14
549	0.14
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.12
555	0.11
556	0.11
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.1
561	0.17
562	0.16
563	0.18
564	0.19
565	0.2
566	0.21
567	0.21
568	0.19
569	0.15
570	0.16
571	0.17
572	0.21
573	0.19
574	0.21
575	0.2
576	0.2
577	0.16
578	0.14
579	0.13
580	0.07
581	0.1
582	0.12
583	0.14
584	0.15
585	0.15
586	0.16
587	0.21
588	0.26
589	0.33
590	0.32
591	0.32
592	0.31
593	0.31
594	0.31
595	0.26
596	0.24
597	0.14
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.1
604	0.07
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.03
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.03
616	0.04
617	0.06
618	0.08
619	0.13
620	0.17
621	0.25
622	0.27
623	0.3
624	0.33
625	0.35
626	0.33
627	0.29
628	0.26
629	0.19
630	0.19
631	0.16
632	0.12
633	0.09
634	0.08
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.07
640	0.08
641	0.1
642	0.11
643	0.13
644	0.13
645	0.17
646	0.17
647	0.16
648	0.17
649	0.17
650	0.17
651	0.16
652	0.14
653	0.1
654	0.1
655	0.1
656	0.07
657	0.07
658	0.05
659	0.05
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.08
666	0.12
667	0.13
668	0.19
669	0.22
670	0.24
671	0.32
672	0.39
673	0.44
674	0.42
675	0.48
676	0.47
677	0.5
678	0.52
679	0.48
680	0.45
681	0.38
682	0.37
683	0.3
684	0.26
685	0.2
686	0.2
687	0.2
688	0.18
689	0.19
690	0.2
691	0.21
692	0.2
693	0.22
694	0.19
695	0.15
696	0.14
697	0.13
698	0.13
699	0.11
700	0.1
701	0.08
702	0.08
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.08
707	0.09
708	0.1
709	0.11
710	0.12
711	0.12
712	0.13
713	0.15
714	0.16
715	0.15
716	0.15
717	0.19
718	0.22
719	0.27
720	0.25
721	0.26
722	0.28
723	0.28
724	0.27
725	0.25
726	0.21
727	0.14
728	0.15
729	0.11
730	0.09
731	0.08
732	0.08
733	0.06
734	0.05
735	0.06
736	0.07
737	0.07
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.11
742	0.17
743	0.18
744	0.18
745	0.18
746	0.22
747	0.29
748	0.29
749	0.31
750	0.26
751	0.29
752	0.29
753	0.33
754	0.26
755	0.23
756	0.23
757	0.24
758	0.23
759	0.19
760	0.17
761	0.13
762	0.12
763	0.11
764	0.14
765	0.11
766	0.12
767	0.13
768	0.13
769	0.14
770	0.15
771	0.14
772	0.11
773	0.11
774	0.12
775	0.12
776	0.15
777	0.16
778	0.15
779	0.15
780	0.16
781	0.17
782	0.16
783	0.19
784	0.17
785	0.15
786	0.15
787	0.16
788	0.16
789	0.14
790	0.17
791	0.16
792	0.17
793	0.17
794	0.18
795	0.17
796	0.2
797	0.27
798	0.3
799	0.29
800	0.28
801	0.28
802	0.27
803	0.27
804	0.23
805	0.17
806	0.1
807	0.08
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.07
812	0.06
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.06
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.09
824	0.09
825	0.12
826	0.14
827	0.15
828	0.15
829	0.16
830	0.18
831	0.15
832	0.19
833	0.18
834	0.16
835	0.14
836	0.15
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.08
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.05
845	0.05
846	0.05
847	0.04
848	0.05
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.06
853	0.06
854	0.07
855	0.07
856	0.06
857	0.06
858	0.09
859	0.09
860	0.1
861	0.11
862	0.12
863	0.13
864	0.14
865	0.18
866	0.17
867	0.18
868	0.21
869	0.19
870	0.2
871	0.23
872	0.25
873	0.22
874	0.24
875	0.28
876	0.31
877	0.32
878	0.33
879	0.29
880	0.27
881	0.26
882	0.22
883	0.17
884	0.09
885	0.09
886	0.07
887	0.08
888	0.08
889	0.08
890	0.1
891	0.12
892	0.14
893	0.16
894	0.19
895	0.22
896	0.23
897	0.3
898	0.34
899	0.37
900	0.39
901	0.38
902	0.42
903	0.39
904	0.37
905	0.31
906	0.26
907	0.21
908	0.17
909	0.15
910	0.08
911	0.06
912	0.06
913	0.07
914	0.08
915	0.08
916	0.12
917	0.14
918	0.19
919	0.21
920	0.21
921	0.2
922	0.25
923	0.25
924	0.22
925	0.21
926	0.16
927	0.14
928	0.14
929	0.13
930	0.07
931	0.06
932	0.05
933	0.04
934	0.05
935	0.06
936	0.06
937	0.08
938	0.09
939	0.13
940	0.14
941	0.16
942	0.22
943	0.28
944	0.38
945	0.42
946	0.45
947	0.48
948	0.53
949	0.61
950	0.6
951	0.6
952	0.55
953	0.55
954	0.52
955	0.53
956	0.53
957	0.53
958	0.57
959	0.62
960	0.68
961	0.7
962	0.79
963	0.81
964	0.82
965	0.83
966	0.77
967	0.74
968	0.68
969	0.61
970	0.52
971	0.44
972	0.37
973	0.28
974	0.27
975	0.2
976	0.16
977	0.15
978	0.16
979	0.15
980	0.17
981	0.16
982	0.14
983	0.14
984	0.14
985	0.14
986	0.13
987	0.12
988	0.09
989	0.08
990	0.07
991	0.06
992	0.06
993	0.06
994	0.09
995	0.11
996	0.12
997	0.14
998	0.14
999	0.18
1000	0.21
1001	0.26
1002	0.3
1003	0.37
1004	0.41
1005	0.5
1006	0.58
1007	0.57
1008	0.55
1009	0.54
1010	0.53
1011	0.46
1012	0.43
1013	0.37
1014	0.31
1015	0.32
1016	0.32
1017	0.29
1018	0.23
1019	0.21
1020	0.21
1021	0.19
1022	0.15
1023	0.11
1024	0.09
1025	0.09
1026	0.14
1027	0.17
1028	0.15
1029	0.14
1030	0.19
1031	0.29
1032	0.35
1033	0.41
1034	0.46
1035	0.54
1036	0.59
1037	0.62
1038	0.65
1039	0.66
1040	0.63
1041	0.61
1042	0.52
1043	0.42
1044	0.36
1045	0.33
1046	0.29
1047	0.2
1048	0.18
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.16
1052	0.17
1053	0.16
1054	0.13
1055	0.15
1056	0.17
1057	0.17
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.19
1061	0.2
1062	0.21
1063	0.19
1064	0.27
1065	0.25
1066	0.25
1067	0.26
1068	0.28
1069	0.28
1070	0.27
1071	0.26
1072	0.17
1073	0.18
1074	0.17
1075	0.18
1076	0.16
1077	0.14
1078	0.14
1079	0.12
1080	0.12
1081	0.1
1082	0.09
1083	0.07
1084	0.08
1085	0.08
1086	0.1
1087	0.14
1088	0.14
1089	0.14
1090	0.13
1091	0.14
1092	0.15
1093	0.16
1094	0.21
1095	0.18
1096	0.18
1097	0.18
1098	0.19
1099	0.19
1100	0.2
1101	0.19
1102	0.12
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.16
1106	0.18
1107	0.17
1108	0.16
1109	0.15
1110	0.16
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.12
1114	0.11
1115	0.09
1116	0.1
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.13
1120	0.12
1121	0.13
1122	0.15
1123	0.16
1124	0.16
1125	0.18
1126	0.18
1127	0.16
1128	0.16
1129	0.17
1130	0.21
1131	0.23
1132	0.29
1133	0.33
1134	0.4
1135	0.49
1136	0.52
1137	0.56
1138	0.58
1139	0.61
1140	0.58
1141	0.61
1142	0.55
1143	0.51
1144	0.58
1145	0.6
1146	0.59
1147	0.56
1148	0.55
1149	0.47
1150	0.5
1151	0.51
1152	0.47
1153	0.44
1154	0.42
1155	0.4
1156	0.38
1157	0.39
1158	0.4
1159	0.36
1160	0.35
1161	0.36
1162	0.35
1163	0.35
1164	0.35
1165	0.33
1166	0.3
1167	0.3
1168	0.28
1169	0.23
1170	0.22
1171	0.22
1172	0.26
1173	0.26
1174	0.24
1175	0.22
1176	0.19
1177	0.18
1178	0.14
1179	0.14
1180	0.13
1181	0.11
1182	0.11
1183	0.11
1184	0.11
1185	0.12
1186	0.12
1187	0.12
1188	0.11
1189	0.1
1190	0.09
1191	0.1
1192	0.1
1193	0.1
1194	0.11
1195	0.11
1196	0.1
1197	0.11
1198	0.11
1199	0.11
1200	0.1
1201	0.09
1202	0.07
1203	0.05
1204	0.05
1205	0.04
1206	0.04
1207	0.05
1208	0.1
1209	0.12
1210	0.14
1211	0.15
1212	0.19
1213	0.26
1214	0.32
1215	0.39
1216	0.4
1217	0.41
1218	0.41
1219	0.44
1220	0.41
1221	0.34
1222	0.29
1223	0.21
1224	0.16
1225	0.13
1226	0.11
1227	0.1
1228	0.1
1229	0.11
1230	0.12
1231	0.11
1232	0.12
1233	0.12
1234	0.13
1235	0.12
1236	0.11
1237	0.13
1238	0.12
1239	0.12
1240	0.1
1241	0.1
1242	0.1
1243	0.09
1244	0.09
1245	0.07
1246	0.07
1247	0.08
1248	0.09
1249	0.1
1250	0.1
1251	0.12
1252	0.12
1253	0.15
1254	0.21
1255	0.23
1256	0.24
1257	0.27
1258	0.29
1259	0.27
1260	0.28
1261	0.25
1262	0.19
1263	0.19
1264	0.22
1265	0.18
1266	0.16
1267	0.15
1268	0.13
1269	0.15
1270	0.15
1271	0.15
1272	0.15
1273	0.17
1274	0.17
1275	0.18
1276	0.18
1277	0.18
1278	0.19
1279	0.18
1280	0.17
1281	0.19
1282	0.26
1283	0.26
1284	0.3
1285	0.36
1286	0.39
1287	0.42
1288	0.4
1289	0.39
1290	0.34

A0A4Q2D9R1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer