Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q2CXD5

Protein Details
Accession A0A4Q2CXD5    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-45VYEPDPDDPNPKKKRKCFLFLPPNRDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-179LKERNKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MERWAAVQEDDVHLATLRVYEPDPDDPNPKKKRKCFLFLPPNRDPINAPVNVPSQPSSKARSSRFTPASTAGPISLVHPEVRDWPNFAPHPYHPIDKPYKNLPTTGRDEPDIFELEVYDTELENHIVVASREKKQTRGAPGYHPRARTSMVTARIKTRAFVKRVMSASYRRSLKERNKKAQAPRQLVKPIDLWEAKKAQVTLNTRPSGTSRSPPQSDFVTSKQGKTKERMVRLPRNEILDTLFDLFKKKSRWSIKDLREVTQQPEAYLKQILPVMAFSHQKGEFRYLWELNPDFAAKAQPGVLIKEWKSSPSDSANPVNKEEEVEQEVCNDDDDWEEVPTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.13
8 0.17
9 0.23
10 0.27
11 0.28
12 0.37
13 0.42
14 0.52
15 0.6
16 0.66
17 0.7
18 0.75
19 0.82
20 0.82
21 0.84
22 0.82
23 0.83
24 0.85
25 0.84
26 0.84
27 0.78
28 0.76
29 0.69
30 0.61
31 0.52
32 0.47
33 0.45
34 0.38
35 0.33
36 0.3
37 0.31
38 0.31
39 0.31
40 0.27
41 0.22
42 0.25
43 0.28
44 0.29
45 0.34
46 0.41
47 0.43
48 0.48
49 0.5
50 0.56
51 0.57
52 0.53
53 0.49
54 0.45
55 0.43
56 0.38
57 0.34
58 0.24
59 0.2
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.19
68 0.22
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.28
73 0.29
74 0.31
75 0.28
76 0.26
77 0.32
78 0.32
79 0.34
80 0.29
81 0.36
82 0.43
83 0.41
84 0.44
85 0.45
86 0.5
87 0.47
88 0.5
89 0.46
90 0.43
91 0.46
92 0.47
93 0.41
94 0.35
95 0.35
96 0.32
97 0.3
98 0.25
99 0.19
100 0.14
101 0.12
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.12
116 0.15
117 0.19
118 0.25
119 0.26
120 0.29
121 0.35
122 0.41
123 0.42
124 0.45
125 0.44
126 0.48
127 0.56
128 0.62
129 0.6
130 0.55
131 0.48
132 0.43
133 0.43
134 0.34
135 0.31
136 0.28
137 0.31
138 0.34
139 0.34
140 0.35
141 0.38
142 0.37
143 0.32
144 0.34
145 0.34
146 0.32
147 0.36
148 0.35
149 0.36
150 0.37
151 0.39
152 0.34
153 0.31
154 0.32
155 0.33
156 0.33
157 0.28
158 0.3
159 0.37
160 0.44
161 0.51
162 0.57
163 0.6
164 0.66
165 0.72
166 0.78
167 0.77
168 0.77
169 0.74
170 0.67
171 0.64
172 0.61
173 0.55
174 0.47
175 0.41
176 0.33
177 0.3
178 0.29
179 0.24
180 0.23
181 0.24
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.18
186 0.22
187 0.26
188 0.3
189 0.36
190 0.36
191 0.34
192 0.34
193 0.34
194 0.33
195 0.3
196 0.29
197 0.28
198 0.33
199 0.36
200 0.36
201 0.37
202 0.33
203 0.34
204 0.32
205 0.28
206 0.31
207 0.3
208 0.32
209 0.36
210 0.39
211 0.4
212 0.41
213 0.49
214 0.47
215 0.53
216 0.59
217 0.62
218 0.66
219 0.67
220 0.71
221 0.64
222 0.61
223 0.54
224 0.46
225 0.38
226 0.3
227 0.26
228 0.2
229 0.18
230 0.13
231 0.15
232 0.16
233 0.19
234 0.22
235 0.24
236 0.32
237 0.41
238 0.46
239 0.53
240 0.62
241 0.65
242 0.72
243 0.71
244 0.65
245 0.63
246 0.59
247 0.54
248 0.51
249 0.43
250 0.33
251 0.35
252 0.32
253 0.26
254 0.26
255 0.22
256 0.17
257 0.18
258 0.18
259 0.13
260 0.14
261 0.13
262 0.16
263 0.18
264 0.16
265 0.21
266 0.22
267 0.24
268 0.25
269 0.29
270 0.27
271 0.29
272 0.35
273 0.31
274 0.31
275 0.36
276 0.35
277 0.3
278 0.3
279 0.26
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.13
284 0.14
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.18
289 0.21
290 0.25
291 0.26
292 0.31
293 0.31
294 0.31
295 0.33
296 0.32
297 0.33
298 0.33
299 0.38
300 0.37
301 0.45
302 0.51
303 0.5
304 0.51
305 0.49
306 0.42
307 0.4
308 0.36
309 0.32
310 0.29
311 0.28
312 0.25
313 0.24
314 0.25
315 0.22
316 0.22
317 0.17
318 0.12
319 0.12
320 0.14
321 0.14