Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q7JMH4

Protein Details
Accession A0A4Q7JMH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-322ISGSHGKKQRERERKVKQTIDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-182RGGYGARVRGGRGSRRPR
306-314KKQRERERK
329-362ERTRGAPRGRGGRGGRGGERGGDRGRGGNFRGGR
Subcellular Location(s) extr 18, E.R. 3, golg 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MGRPPVNQSTADLTSGPVNCVVNAIAIAVGFIASALKFSLITGAVPLVLPTFMSPDLTVSPSLVRTFLAANPLELPDTVLFGIANAGNDDSGEDKPIAPVKTVDKATARTTKRNVEPQAPAAPTRGTGNRRGGPRGNEGAFRDRGAGSDRNHARSTDEASRDGPRGGYGARVRGGRGSRRPRENDDRHTSRTGVHPGSEKQAAQSWGANEGEAELKDEQAGEAIAQSEKKDALAEDAAGEEPAEPEDKSVSYADYLAQQAEKKLSLEGGFKVREANEGSKLDKKWAGAKALEKAEDEDFISGSHGKKQRERERKVKQTIDFDPRFVEPERTRGAPRGRGGRGGRGGERGGDRGRGGNFRGGRGGAANINTKDESAFPSLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.24
4 0.2
5 0.19
6 0.17
7 0.18
8 0.17
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.03
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.06
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.08
39 0.08
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.12
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.18
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.15
62 0.16
63 0.1
64 0.12
65 0.11
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.18
87 0.2
88 0.26
89 0.27
90 0.28
91 0.26
92 0.28
93 0.33
94 0.39
95 0.4
96 0.41
97 0.45
98 0.5
99 0.53
100 0.59
101 0.57
102 0.54
103 0.54
104 0.51
105 0.52
106 0.45
107 0.4
108 0.33
109 0.29
110 0.23
111 0.23
112 0.25
113 0.22
114 0.27
115 0.34
116 0.37
117 0.39
118 0.44
119 0.45
120 0.43
121 0.46
122 0.45
123 0.39
124 0.37
125 0.37
126 0.38
127 0.34
128 0.3
129 0.26
130 0.2
131 0.2
132 0.21
133 0.23
134 0.2
135 0.28
136 0.31
137 0.33
138 0.34
139 0.33
140 0.31
141 0.27
142 0.31
143 0.28
144 0.27
145 0.24
146 0.25
147 0.28
148 0.27
149 0.25
150 0.2
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.21
161 0.24
162 0.25
163 0.34
164 0.41
165 0.46
166 0.53
167 0.57
168 0.6
169 0.67
170 0.68
171 0.68
172 0.67
173 0.65
174 0.61
175 0.59
176 0.52
177 0.43
178 0.39
179 0.36
180 0.27
181 0.23
182 0.22
183 0.22
184 0.25
185 0.25
186 0.2
187 0.16
188 0.19
189 0.19
190 0.17
191 0.17
192 0.14
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.16
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.21
259 0.2
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.28
266 0.32
267 0.32
268 0.33
269 0.32
270 0.3
271 0.31
272 0.34
273 0.35
274 0.33
275 0.36
276 0.39
277 0.4
278 0.4
279 0.34
280 0.32
281 0.28
282 0.25
283 0.22
284 0.16
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.19
291 0.24
292 0.29
293 0.35
294 0.46
295 0.55
296 0.63
297 0.71
298 0.74
299 0.79
300 0.85
301 0.88
302 0.86
303 0.81
304 0.79
305 0.79
306 0.78
307 0.69
308 0.59
309 0.52
310 0.45
311 0.42
312 0.36
313 0.36
314 0.28
315 0.33
316 0.36
317 0.36
318 0.38
319 0.43
320 0.48
321 0.47
322 0.52
323 0.54
324 0.52
325 0.58
326 0.58
327 0.59
328 0.58
329 0.56
330 0.52
331 0.46
332 0.45
333 0.41
334 0.4
335 0.36
336 0.32
337 0.3
338 0.29
339 0.29
340 0.32
341 0.32
342 0.32
343 0.36
344 0.36
345 0.35
346 0.37
347 0.33
348 0.3
349 0.27
350 0.27
351 0.23
352 0.24
353 0.29
354 0.27
355 0.3
356 0.3
357 0.28
358 0.26
359 0.24
360 0.25
361 0.23