Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q7JH16

Protein Details
Accession A0A4Q7JH16    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-42STPISPPRKSQRRELGRLASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MDGPRKRQRVDGEEQGDRLRSLSTPISPPRKSQRRELGRLASPWQLTWIRDLPEDLNRDAVTLKDLLGDPLISECWEFNYLHDIPFLMDAFDQDTRHLVDVHVVHGFWKREDANRLALTMEASEYSNVKLHVAPMPEMFGTHHSKMIVLFRHDDTAEVIIHTANMIPKDWTNMTNAVWRSPRLSKLPAESKKSPEYLSLQIGSGERFGADLLNYLRAYDSRRITCGPLVDKLSQYDFSNVKGALIASVPGKHDIHDLSDTAYGWSAARRYLSSVPCKEGNAEIVTQVSSIATLGAKDTWLQKTLFDTLAISKKKTLSRPKFKVVFPTADEIRKSLDGYASGASIHTKIQSPQQAQQLTYLRPIFCHWANDSKDGTVPSTETGASNGGRDRAAPHIKTYIRYNAEGSIDWAMLTSANISKQAWGEAAKPSGEVRVASWEIGVLVWPELFGPKASMVGTFQSDTPNEKSIPKSDDDEVLIGIRIPYSIPLQGYGAGEVPWVATMNHSEPDHLGRRWIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.58
3 0.5
4 0.42
5 0.35
6 0.26
7 0.19
8 0.2
9 0.22
10 0.23
11 0.29
12 0.38
13 0.47
14 0.48
15 0.56
16 0.63
17 0.68
18 0.68
19 0.7
20 0.72
21 0.73
22 0.79
23 0.8
24 0.78
25 0.73
26 0.73
27 0.66
28 0.61
29 0.51
30 0.43
31 0.41
32 0.35
33 0.3
34 0.32
35 0.34
36 0.29
37 0.3
38 0.32
39 0.29
40 0.33
41 0.36
42 0.3
43 0.3
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.22
48 0.17
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.1
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.17
73 0.16
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.13
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.16
92 0.21
93 0.22
94 0.17
95 0.21
96 0.22
97 0.26
98 0.32
99 0.34
100 0.35
101 0.35
102 0.35
103 0.3
104 0.28
105 0.23
106 0.18
107 0.15
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.13
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.2
128 0.19
129 0.21
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.25
134 0.25
135 0.21
136 0.24
137 0.23
138 0.25
139 0.25
140 0.24
141 0.19
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.11
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.23
162 0.23
163 0.23
164 0.24
165 0.23
166 0.25
167 0.26
168 0.3
169 0.28
170 0.31
171 0.3
172 0.36
173 0.46
174 0.48
175 0.52
176 0.52
177 0.53
178 0.53
179 0.51
180 0.45
181 0.37
182 0.35
183 0.31
184 0.3
185 0.25
186 0.21
187 0.21
188 0.2
189 0.18
190 0.14
191 0.1
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.15
205 0.18
206 0.22
207 0.2
208 0.23
209 0.24
210 0.25
211 0.26
212 0.26
213 0.22
214 0.21
215 0.23
216 0.22
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.19
221 0.17
222 0.18
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.1
257 0.16
258 0.2
259 0.27
260 0.28
261 0.3
262 0.31
263 0.31
264 0.29
265 0.24
266 0.21
267 0.16
268 0.14
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.06
284 0.09
285 0.1
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.16
290 0.18
291 0.17
292 0.14
293 0.13
294 0.15
295 0.22
296 0.23
297 0.21
298 0.21
299 0.25
300 0.3
301 0.38
302 0.45
303 0.49
304 0.58
305 0.64
306 0.71
307 0.72
308 0.69
309 0.7
310 0.63
311 0.56
312 0.47
313 0.46
314 0.4
315 0.37
316 0.36
317 0.27
318 0.25
319 0.22
320 0.2
321 0.15
322 0.14
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.17
336 0.24
337 0.26
338 0.31
339 0.38
340 0.38
341 0.37
342 0.43
343 0.41
344 0.35
345 0.37
346 0.35
347 0.28
348 0.26
349 0.28
350 0.26
351 0.24
352 0.26
353 0.23
354 0.29
355 0.31
356 0.35
357 0.34
358 0.3
359 0.3
360 0.27
361 0.26
362 0.18
363 0.16
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.2
378 0.27
379 0.27
380 0.28
381 0.34
382 0.36
383 0.39
384 0.42
385 0.42
386 0.38
387 0.39
388 0.38
389 0.33
390 0.33
391 0.3
392 0.27
393 0.21
394 0.17
395 0.15
396 0.13
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.16
411 0.18
412 0.2
413 0.19
414 0.19
415 0.18
416 0.19
417 0.18
418 0.16
419 0.13
420 0.18
421 0.19
422 0.18
423 0.17
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.14
443 0.16
444 0.16
445 0.16
446 0.18
447 0.19
448 0.23
449 0.25
450 0.27
451 0.26
452 0.29
453 0.32
454 0.34
455 0.37
456 0.36
457 0.36
458 0.35
459 0.37
460 0.35
461 0.32
462 0.27
463 0.23
464 0.2
465 0.16
466 0.14
467 0.1
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.11
472 0.13
473 0.13
474 0.15
475 0.16
476 0.18
477 0.19
478 0.18
479 0.17
480 0.14
481 0.13
482 0.11
483 0.11
484 0.08
485 0.08
486 0.07
487 0.08
488 0.12
489 0.15
490 0.2
491 0.2
492 0.21
493 0.22
494 0.3
495 0.35
496 0.31